Protein
View in Explore- Genbank accession
- AXY81643.1 [GenBank]
- Protein name
- tail tubular protein B
- RBP type
-
TSPTSP
- Protein sequence
-
MGLISQSIKNLKSGISQQPDILRFPEQGEAQVNGWSSETKGLMKRPPTIFDRALDVSSSVGAKPLVHAINRDENEKYHIIFTGSGIQALTMKGERVPVNIDAGMQSYITTPNPRDDLRMVTVADYTFITNTNVVVRSANAINDPGFNELNDALVYVKGGQYGRTFTVIINGNVGSFTTPDGVGEDGREVAAMVKQTDAQYIVQRLIEDLRRQSGLAGWTFGEGAGFIHCIAPNNGSITEITVRDGFAGQLASAVTHQVQSFSKLPLEAPNNYIVKVVGDTSKSTDAFYVRFDARAKIWKEVLGWKSQARIDANTMPHVLIRQADGSFRFTTYSWWDKTCGDDSTNPFPSFVDSTIRDIFFFRNRLGFLSGENIILSRTGGYSRFFPASVANLSNDDPIDVAVSHNRISVLKYAVPFSEQLLLWSDSAQFVLSASDSVLSAKSVSLDLSTEFDVSWRARPCGLGRGVYYTSPRAAYSTINRYYAVQDVSDVKNSEDITSHCPSYIENGVFSIQGSTTENYVSVLTEGAKNRIYMYKFLYLDETVRQQSWSHWEFPADVEILAATPIGSTLYILARNAVHFYACHVNFTKDTIDFVGEPYQLYMDLKTPYTIPAGNYDADKYRTKISFGDVYKMLIRYGTIMLVDTTGATYYFKAPNADGRWPGDNPELWMDGDWSNKQVFIGRAIPFYYQFSKFLIKTTDQNGFVQTQDLGRLQLRRSWLNYVESGSFDVEVTNASRTFTYNMTGKKLGDRHMVLGNLNVATGQFRFPCPGEANSLTVAIRSEAPTALNVVGCGWEGNFINRAQGI
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 805 AA molecular weight: 89752,85870 Da isoelectric point: 6,07344 aromaticity: 0,11801 hydropathy: -0,25453
Domains
Domains [InterPro]
IPR058003
1–805
1–805
1
805
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Dickeya phage Dagda_B1 [NCBI] |
2320189 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AXY81643.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
MH807810
[NCBI]
CDS location
range 23733 -> 26150
strand +
strand +
CDS
ATGGGCCTTATTTCACAGTCAATTAAAAACCTTAAGTCTGGCATTAGTCAGCAGCCGGATATCCTTCGGTTCCCAGAGCAGGGAGAAGCTCAGGTCAATGGGTGGTCAAGTGAGACAAAAGGACTCATGAAGAGACCTCCAACTATCTTTGATAGAGCACTTGACGTTAGTTCATCAGTAGGAGCCAAGCCTTTGGTTCACGCTATCAATCGCGATGAGAACGAAAAGTACCATATCATCTTTACTGGTAGTGGTATTCAGGCACTGACCATGAAGGGTGAGCGTGTTCCTGTTAATATTGATGCAGGAATGCAATCTTATATCACCACTCCAAATCCACGAGATGACCTGAGGATGGTCACCGTGGCGGACTATACGTTCATCACTAACACTAACGTTGTGGTACGGTCAGCTAACGCTATCAATGACCCAGGATTTAATGAGCTTAATGATGCCTTAGTGTATGTCAAAGGTGGTCAATATGGCCGAACCTTTACGGTCATTATTAATGGTAACGTTGGTTCCTTTACGACTCCAGATGGTGTTGGTGAGGATGGTAGAGAGGTTGCCGCAATGGTGAAGCAGACGGATGCTCAGTATATCGTTCAGCGTCTCATTGAGGACCTTAGACGTCAATCAGGACTTGCAGGTTGGACATTTGGAGAGGGTGCTGGATTTATCCACTGCATCGCCCCTAACAATGGGTCAATCACAGAGATTACTGTGCGTGATGGCTTTGCGGGCCAGTTGGCTTCCGCCGTGACTCATCAGGTTCAGAGCTTCTCTAAGCTCCCTCTTGAGGCTCCTAATAACTATATCGTTAAGGTTGTTGGAGACACCTCAAAGAGCACTGATGCATTCTACGTTAGGTTTGATGCTCGTGCTAAAATCTGGAAGGAAGTATTAGGGTGGAAGTCTCAGGCTCGCATTGATGCTAACACTATGCCTCACGTTCTTATTCGTCAGGCTGATGGCTCATTTAGATTCACTACGTACTCATGGTGGGATAAGACCTGTGGTGATGATTCAACTAACCCATTCCCAAGCTTTGTGGACAGTACCATTCGTGATATCTTTTTCTTCAGGAACCGCTTAGGGTTCTTGAGCGGTGAGAATATCATCTTGAGTCGTACTGGTGGTTATAGTCGATTCTTCCCGGCCTCAGTGGCTAACCTGTCTAATGATGACCCTATTGATGTGGCTGTATCACATAACCGTATCTCAGTCCTGAAGTACGCTGTACCATTCTCAGAGCAGCTCCTGCTGTGGTCTGACTCAGCTCAGTTTGTGCTCTCAGCGTCTGACTCAGTGCTGTCCGCTAAGTCTGTCTCATTGGACCTCTCAACGGAGTTTGATGTTAGCTGGAGGGCCAGACCTTGTGGATTAGGACGTGGTGTTTACTATACGAGTCCACGAGCTGCTTACTCTACCATCAACCGTTACTATGCGGTGCAAGATGTGAGTGACGTCAAGAACTCTGAGGATATTACAAGCCACTGTCCGAGCTACATTGAGAATGGGGTGTTCAGTATCCAAGGGTCAACTACTGAGAACTATGTGTCTGTGCTGACTGAGGGCGCTAAGAACCGTATCTACATGTACAAGTTCCTGTATCTGGATGAGACTGTTCGTCAGCAGTCATGGAGTCATTGGGAGTTCCCAGCAGACGTTGAGATTCTTGCAGCTACACCTATTGGCTCAACTCTATATATTCTGGCTCGTAATGCTGTTCACTTCTATGCTTGCCATGTGAACTTCACTAAGGACACTATCGACTTTGTGGGAGAACCTTATCAGCTCTATATGGACCTCAAGACTCCATATACCATTCCAGCAGGTAACTATGATGCTGATAAGTACCGGACCAAGATTTCATTTGGTGACGTCTATAAGATGCTCATTAGGTACGGCACTATTATGTTGGTAGATACCACTGGAGCTACCTATTACTTCAAGGCTCCTAACGCTGATGGCAGATGGCCCGGTGATAACCCTGAGTTATGGATGGATGGTGATTGGTCAAACAAGCAAGTGTTCATTGGGAGGGCCATTCCGTTCTATTATCAGTTCTCTAAGTTCCTCATTAAGACAACTGACCAGAATGGATTCGTTCAGACGCAGGATTTAGGACGCCTACAGCTTCGGCGCTCATGGCTGAACTATGTGGAGTCAGGTAGCTTTGACGTTGAGGTTACCAATGCATCACGGACGTTCACCTACAATATGACCGGTAAGAAACTTGGAGACCGACACATGGTCTTAGGTAATCTTAATGTTGCCACAGGTCAGTTCAGGTTCCCTTGTCCGGGTGAGGCTAACAGTCTTACTGTGGCTATCCGCTCAGAGGCCCCTACAGCTCTAAATGTGGTTGGTTGTGGCTGGGAAGGTAACTTTATCAACAGAGCACAAGGTATCTAA
Tertiary structure
PDB ID
266e6f6dd8c3276756fb88af98609531c5232d8f83e964354deb1a28512e3911
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50