Protein
View in Explore- Genbank accession
- QQO96691.1 [GenBank]
- Protein name
- long distal tail fiber subunit
- RBP type
-
TSPTSPTFTF
- Protein sequence
-
MALDPNINRIKHLRSSTAGAVPAPSLLDEGEIAVNLVDRTIFSKNGANVVELGFGKGGTVTGPINVTGGNAVSASQFNGALNGNAATASRLLTGRKINDVVFDGTRDITIEDSTKLYKENVLTESGDSRVIRDVATIRAMGTVNGALIIHLPKAARNASTMMKIIVQGFDYSSGLSSQGPWSVNLTGYNYSGPTWHSYQAVSTGSKAPFEHVRYGQAADHNVIILGGTSGDASIPTSSWTYYNISIEKIYLTAGNTTLYNNPADPIYLTIEDSLTPYSVQVTLPLEGVNMAESLRTKRTFTFTGDATGSLAFDGTANVSTALTINSATTGQAGLVKLNNTLTSTSVTEALTAAQGKALQDTKVNRSGDTISGRLVVTQGITTPSISNDVTVPISFLGPSVNNSNAGGIRVRNLEVNNQYGAATRAFGIFSKEGIIAGDSASYASLADIGTGNNIPFKVNNTNVVTTYGFVPFLGGNVQSSLGYMNVVSIGVYRPDPRWDNSGMYMSIGANDNYSTEAFLFKNGRTIENTNGPIILKGNADSATKLQTPRTINGVAFDGTSNIRIQQLAEGIPANADLNTYLTEGFYYCDTNAVAQTIKNGPFTGGAFCLLVERTAGVKQTFTIYSPSSSRTWIRNIYGGTTGAWREVAYTDAPTFTGAGRFTGALTVNGITNTTGLNNSGDLRSSGSSYLGNQTELGTIGTASQVYIDFHSGASNIDYDARIMSSGGTTAIGNGALSYIAASHTFNGSIGAGTISAASISVSTGLGIANTSNTVLAGLSLYGGAQSGKPNYGITFAGTGNAGTGKHGDLDNASWAVYLTCATAGAEKRGWIFQRSDNNTNVASISTNGVLSTNGNIQTLNDNTMINVGNDKDLALVKKRGSKGFIGVGADTPFSVSKSNANWVDPTHTFTELFTVSSAGVANAVGGFTGTFSGTFNGTISGTLTGSLNGNASTATTLQTARAIGITGSGASGSVSFDGSGNVNIPLSVATQATATNNTTIATTAFVQNVNVAETGAAAYALRLKTPRTFQVTGGITTNAVAFDGQQNVTLTANAVDGSKVSGVVPEAVKAQTVMVNGQPGARLAAMWSGTTWNRNFTRDAVYSSASSITIEIGDSGDGANDDRMNNIKVGSLLHLIFAVSTGGIWSGQLSTGTITAVSINRSTKSIILTVNIPHNISPGSKTSARILGITYSSIGCKYVGCVTLFAKGDIGGSEFSQVLQLDAPVNNAVMTTSVSGDVSRYHNLFPYGAFLSHRNAVSMSATMVNNTMANFICTDNDNDVPASVGMANIQIWDVV
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1295 AA molecular weight: 134434,87240 Da isoelectric point: 6,69173 aromaticity: 0,07490 hydropathy: -0,05073
Domains
Domains [InterPro]
IPR054500
339–364
339–364
1
1295
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Acinetobacter phage Mokit [NCBI] |
2801816 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QQO96691.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
MW388002
[NCBI]
CDS location
range 157161 -> 161048
strand +
strand +
CDS
ATGGCATTAGATCCAAATATTAACAGAATTAAACATCTAAGATCGAGCACTGCCGGTGCAGTGCCTGCACCGTCTTTATTGGATGAAGGCGAAATAGCGGTAAACTTAGTTGATCGTACAATATTTTCAAAGAATGGTGCAAATGTAGTAGAACTCGGTTTTGGAAAGGGTGGTACTGTAACAGGTCCAATCAATGTTACAGGCGGCAATGCAGTATCAGCTTCACAATTCAACGGCGCTCTAAATGGCAATGCTGCAACTGCATCAAGACTCCTTACTGGGAGAAAAATTAATGATGTAGTTTTTGATGGTACACGAGATATTACCATTGAAGATTCAACTAAACTTTATAAAGAAAATGTATTAACAGAATCAGGCGATTCTCGTGTTATCCGTGATGTTGCTACTATTAGAGCGATGGGTACAGTAAATGGTGCACTTATTATCCATTTACCTAAGGCAGCTCGTAATGCATCAACAATGATGAAAATTATTGTTCAAGGTTTTGACTATTCTTCTGGGCTCTCTTCTCAAGGACCGTGGAGTGTGAACCTTACAGGATATAATTATTCTGGGCCAACTTGGCACTCGTATCAAGCTGTGTCTACCGGATCAAAGGCGCCATTTGAACATGTGAGATATGGGCAAGCGGCAGACCACAACGTAATAATTTTAGGTGGCACAAGCGGGGATGCTAGCATCCCTACATCATCTTGGACATATTACAATATATCAATTGAAAAAATTTATTTAACTGCGGGTAACACTACTCTTTATAATAATCCCGCAGATCCGATTTATCTCACTATTGAAGATTCATTGACTCCGTACAGTGTTCAAGTTACACTGCCTCTTGAAGGTGTTAACATGGCAGAGTCTTTGCGCACAAAACGTACATTCACTTTTACCGGTGATGCTACAGGTTCTTTAGCATTTGATGGCACAGCAAATGTTTCTACCGCGTTAACAATTAATTCTGCAACTACAGGACAAGCTGGTTTAGTTAAATTAAACAACACATTAACTTCTACGTCTGTCACAGAAGCATTAACTGCTGCTCAAGGTAAAGCACTTCAAGACACTAAAGTCAATAGAAGTGGAGATACCATTTCAGGACGTTTAGTCGTTACTCAAGGTATTACTACTCCTAGCATTAGTAATGATGTCACCGTACCAATTAGCTTTTTAGGGCCTAGTGTTAATAATTCAAATGCAGGTGGAATACGCGTAAGAAATTTAGAAGTAAATAACCAATATGGCGCAGCGACACGTGCATTTGGGATTTTTTCTAAAGAAGGTATAATCGCAGGCGATTCCGCATCATATGCTTCTTTAGCAGATATAGGCACTGGCAACAATATCCCATTTAAAGTAAACAACACCAATGTTGTTACAACATATGGCTTTGTGCCTTTCCTTGGAGGTAATGTACAGAGCTCATTGGGGTATATGAATGTCGTTTCTATTGGCGTCTATCGTCCAGATCCCCGATGGGATAATTCAGGGATGTACATGTCTATAGGAGCGAATGACAACTATTCAACAGAAGCTTTCTTGTTCAAAAACGGAAGAACTATTGAAAACACAAATGGGCCTATTATACTTAAAGGTAATGCAGATTCTGCTACTAAACTCCAAACACCTAGAACTATCAATGGTGTTGCTTTTGATGGAACTAGTAACATTCGAATACAGCAATTAGCTGAAGGTATTCCAGCTAATGCGGATTTGAATACATACTTAACTGAAGGTTTTTACTACTGCGACACAAACGCAGTGGCTCAAACGATCAAAAATGGACCTTTTACTGGTGGTGCATTCTGCTTATTGGTAGAAAGAACTGCTGGCGTTAAACAAACATTTACGATCTATAGTCCTAGTTCTAGTAGAACATGGATCCGTAATATCTACGGCGGTACTACAGGAGCTTGGAGAGAAGTGGCATATACAGATGCACCAACTTTCACAGGAGCTGGAAGATTTACCGGTGCTTTAACCGTAAATGGAATTACAAACACAACGGGATTAAATAATTCTGGCGATTTGAGAAGTTCCGGATCTAGTTATTTAGGTAATCAAACAGAATTAGGTACAATTGGTACTGCATCTCAAGTGTATATTGATTTCCATTCAGGCGCTAGTAATATAGATTATGATGCAAGAATTATGTCTTCTGGCGGAACTACTGCTATAGGAAATGGAGCATTGTCATATATTGCTGCTTCTCATACATTTAATGGCTCAATAGGCGCAGGAACTATTTCTGCTGCTAGTATTAGTGTATCTACTGGATTAGGTATTGCTAATACTTCTAATACAGTTTTAGCGGGTTTAAGTTTATATGGTGGCGCTCAATCTGGTAAACCAAATTACGGCATTACTTTCGCTGGTACCGGTAATGCAGGAACTGGTAAACATGGTGATCTAGACAATGCGTCATGGGCAGTATATTTAACTTGTGCCACTGCCGGTGCCGAAAAACGTGGTTGGATTTTCCAACGAAGTGACAACAACACAAATGTAGCATCTATTTCTACTAATGGTGTGTTATCGACAAACGGCAATATCCAAACATTAAACGACAATACAATGATTAATGTCGGCAATGATAAAGATCTTGCGCTTGTCAAGAAAAGGGGTTCTAAAGGATTTATCGGCGTCGGGGCAGATACTCCATTTAGTGTATCTAAATCTAATGCAAATTGGGTTGATCCAACACATACATTTACAGAATTGTTTACAGTAAGTTCTGCAGGTGTCGCTAATGCAGTTGGAGGATTCACCGGTACGTTCAGTGGTACATTCAACGGTACTATTAGCGGAACACTTACTGGTTCGCTCAATGGTAATGCATCTACTGCAACTACACTACAAACTGCTCGAGCAATTGGTATCACTGGTTCTGGTGCATCAGGTTCTGTGAGTTTTGATGGATCAGGTAATGTTAATATTCCTTTAAGCGTTGCTACACAGGCTACTGCAACCAACAACACAACAATTGCTACTACTGCATTTGTTCAAAATGTTAACGTTGCTGAGACTGGTGCTGCAGCTTATGCACTGAGACTCAAAACTCCTAGAACTTTCCAAGTTACTGGTGGCATAACTACAAATGCGGTTGCATTTGACGGGCAACAAAACGTTACATTGACTGCAAACGCAGTTGATGGTTCTAAAGTATCAGGTGTGGTTCCTGAGGCGGTTAAAGCTCAGACTGTTATGGTAAATGGACAACCAGGTGCAAGACTTGCGGCTATGTGGTCTGGTACTACTTGGAATAGAAATTTCACCCGTGATGCGGTCTATTCATCAGCATCTTCAATAACTATTGAGATAGGTGATAGCGGTGATGGAGCAAATGACGATAGAATGAATAACATTAAAGTTGGAAGTTTATTGCATCTTATATTTGCGGTTTCTACGGGAGGTATTTGGTCTGGGCAGTTATCTACAGGAACAATTACCGCTGTATCGATAAATAGAAGCACCAAATCTATTATTTTAACAGTTAATATTCCACATAATATAAGCCCAGGAAGTAAAACATCTGCTCGTATTCTTGGTATAACTTATAGCTCTATTGGATGTAAATATGTTGGATGCGTTACATTATTTGCTAAAGGTGATATAGGCGGTTCAGAATTCTCTCAAGTGTTGCAATTAGATGCTCCGGTAAATAATGCAGTTATGACAACTAGTGTCTCCGGAGATGTTTCGAGATATCATAATTTATTTCCATATGGGGCCTTTCTTTCACATCGAAATGCGGTATCTATGTCAGCGACAATGGTTAATAATACTATGGCTAATTTTATCTGTACAGATAATGATAATGACGTACCTGCATCAGTAGGTATGGCAAATATACAAATCTGGGATGTCGTATAA
Tertiary structure
PDB ID
3d7a8ded8f4c0fad9ffa3a58e6cf496cec9098f59b427657c6e3cde347c1a501
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50
Literature
| Title | Authors | Date | PMID | Source |
|---|---|---|---|---|
| Complete genome sequence of Acinetobacter baumannii phage Mokit | Acevedo Ugarriza,L., Hernandez-Morales,A., Liu,M. and Gill,J. | 2019-09-26 | — | GenBank |