Protein
View in Explore- Genbank accession
- XOD32010.1 [GenBank]
- Protein name
- long-tail fiber proximal subunit
- RBP type
-
TFTF
- Protein sequence
-
MAEIKRKFRAEDGLDAGGDKIINVALADRTVGTDGVNVDYLIQENTVQQYDPTRGYLKDFVIIYDNRFWAAINDIPKPAGAFNSVRWRALRTDANWTTVSSGPYQLKSGESISVDTAAGNDITFTLPTSPIDGDTIVLQDIGGKPGVNQVLIVAPVQSIVNFRGEQVRSVLMTHPKSQIVLIFSNRLWQMYVADYSREAVVVTPASLYQAQSNDFIVRRFTSAAPINIKLPRFANHGDIINFVDLDKLNPLYHTIVTTYDETTSVQEVGTHSIEGRTSIDGFLMYDDNEKLWRLFDGDSKARLRIITTNSNIRPNEEVMVFGANNGTTQTIELQLPTNISVGDTVKISMNYMRKGQTVKIKAAGEDKIASSVQLLQFPKRSEYPPEAEWVTVQELVFNGETNYVPVLQLAYIEDSDGKYWVVQQNVPTVERVDSLNDSTRARLGVIALATQAQANVDLENSPQKELAITPETLANRTATETRRGIARIATTAQVNQNTTFSFADDIIITPKKLNERTATETRRGVAEIATQQETNAGTDDTTIITPKKLQARQGSESLSGIVTFVSTAGATPASSRELNGTNVYNKNTNNLVVSPKALDQYKATPTQQGAVILAVESEVIAGQSQEGWANAVVTPETLHKKTSTDGRIGLIEIATQSEVNTGTDYTRAVTPKTLNDRKATESLSGIAEIATQVEFDAGVDDTRISTPLKIKTRFDSTDRTSVVALSGLVESGTLWDHYTLNILEANETQRGTLRVATQVEAAAGTLDNVLITPKKLLGTKSTEAQEGVIKVATQSETVTGTSANTAVSPKNLKWIVQSEPTWAATTAIRGFVKTSSGSITFVGNDTVGSTQSLEL
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 855 AA molecular weight: 93228,32660 Da isoelectric point: 5,19380 aromaticity: 0,06316 hydropathy: -0,29251
Taxonomy
Host
Shigella flexneri
[NCBI]
· taxon 623
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XOD32010.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
PQ666540
[NCBI]
CDS location
range 151695 -> 154262
strand +
strand +
CDS
ATGGCCGAGATTAAAAGAAAGTTCAGAGCAGAAGATGGTCTGGACGCAGGTGGCGATAAAATAATCAACGTAGCTTTAGCTGATCGTACCGTAGGAACTGACGGTGTTAACGTTGATTACCTAATTCAAGAAAACACAGTTCAACAATACGATCCAACTCGTGGATATTTAAAAGATTTTGTAATCATTTATGATAACCGCTTTTGGGCTGCTATAAATGATATTCCAAAACCGGCAGGAGCTTTTAATAGCGTGCGCTGGAGAGCATTACGTACTGATGCAAACTGGACAACTGTTTCATCAGGACCTTATCAATTAAAATCAGGTGAATCAATTTCAGTTGATACTGCAGCTGGTAATGACATTACATTTACTTTACCAACTTCTCCAATTGATGGAGATACTATCGTTCTTCAAGATATTGGTGGAAAACCCGGAGTTAATCAAGTTTTAATTGTAGCTCCAGTGCAAAGCATTGTAAATTTTAGAGGTGAACAAGTACGTTCAGTACTAATGACACATCCAAAATCACAGATAGTTTTAATTTTTAGTAATCGTCTGTGGCAAATGTATGTGGCTGATTATAGCAGAGAAGCGGTAGTTGTGACGCCAGCAAGTCTCTACCAGGCGCAGTCAAACGATTTTATCGTGCGCAGATTTACTTCTGCTGCACCGATAAATATTAAACTTCCGAGATTTGCTAATCATGGCGATATTATTAATTTTGTTGATTTAGATAAATTAAATCCTCTTTATCATACAATTGTCACGACATATGATGAAACAACTTCAGTACAAGAAGTTGGAACTCATTCTATTGAAGGCCGTACATCTATTGATGGTTTCTTGATGTATGATGATAATGAGAAATTATGGAGATTATTTGACGGGGACAGTAAAGCACGTTTACGTATCATAACAACTAATTCAAACATTCGTCCAAATGAAGAAGTTATGGTATTTGGTGCGAATAATGGAACAACTCAAACAATTGAGCTTCAGCTTCCAACTAATATTTCTGTTGGTGATACTGTTAAAATTTCCATGAATTACATGAGAAAAGGACAAACAGTTAAAATCAAAGCTGCCGGTGAAGATAAAATTGCTTCTTCAGTTCAATTGCTGCAATTCCCAAAACGTTCAGAGTATCCACCTGAAGCTGAATGGGTAACAGTCCAAGAATTAGTTTTTAACGGTGAAACTAATTATGTTCCAGTTTTACAACTTGCTTATATAGAAGATTCTGATGGAAAATACTGGGTTGTACAACAAAACGTTCCAACCGTAGAAAGAGTTGATTCTTTAAACGATTCTACTAGAGCAAGATTAGGCGTGATTGCTTTAGCTACACAAGCGCAAGCTAATGTCGATTTAGAAAATTCTCCGCAAAAAGAATTAGCAATTACTCCAGAAACATTAGCTAACCGTACTGCTACAGAAACTCGTAGAGGTATCGCAAGAATAGCAACCACTGCTCAAGTGAATCAGAACACCACATTCTCTTTTGCTGATGATATTATCATCACTCCTAAAAAGCTGAATGAAAGAACTGCTACAGAAACTCGTAGAGGTGTTGCTGAAATTGCTACGCAACAGGAAACTAATGCAGGTACTGATGATACTACAATCATCACTCCTAAAAAGCTTCAAGCTCGTCAGGGTTCTGAATCATTATCTGGTATTGTAACCTTTGTATCTACTGCAGGAGCTACTCCAGCTTCTAGTCGTGAATTAAATGGTACAAACGTTTATAATAAAAACACTAATAATTTAGTTGTTTCGCCTAAAGCTCTAGATCAGTATAAAGCTACTCCAACACAACAAGGTGCAGTAATTTTAGCAGTTGAAAGTGAAGTAATTGCTGGACAAAGCCAAGAAGGATGGGCAAATGCGGTTGTAACGCCAGAAACGTTACATAAAAAGACATCAACCGATGGAAGAATTGGTTTAATTGAAATTGCTACGCAAAGTGAAGTTAATACAGGAACTGATTATACTCGTGCAGTCACTCCTAAAACTTTAAATGACCGTAAAGCAACTGAAAGTTTAAGTGGTATAGCTGAAATTGCTACACAAGTTGAATTCGACGCAGGCGTCGACGATACTCGTATCTCTACACCATTAAAAATTAAAACTAGATTTGATAGTACTGATCGTACTTCTGTTGTTGCTCTATCTGGATTAGTTGAATCAGGAACTCTCTGGGACCATTATACCCTTAATATTCTTGAAGCAAATGAGACACAGCGTGGTACACTTCGTGTAGCTACACAAGTTGAAGCTGCTGCAGGAACATTAGATAATGTTTTAATAACTCCTAAAAAGCTTTTAGGTACTAAATCTACTGAAGCACAGGAAGGCGTTATTAAAGTTGCAACCCAGTCTGAAACTGTTACTGGAACGTCAGCAAATACTGCTGTATCTCCAAAAAATTTAAAATGGATTGTGCAGAGTGAACCTACTTGGGCAGCAACTACTGCGATAAGAGGCTTTGTTAAAACTTCATCTGGTTCAATTACATTCGTTGGTAATGATACAGTTGGTTCAACACAGTCGTTAGAATTATAA
Genome Context
Tertiary structure
XOD32010.1
ColabFold structure
Source
ColabFold
pLDDT
30.5
Oligomeric state
monomer