Protein

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Genbank accession
AIM19603.1 [GenBank]
Protein name
putative tail fiber
RBP type
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,71
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,76
Protein sequence
MMHPDFFGGDDIVFKPEPPIDPDGPDLSNYYTKPETNSLLDKKADKIHTHVVADITDLNLDKFATKEETYTKQEIDDKIDEIVPPEINLTDYAKKDAVNIFTKANTFTEAPSVEVDATLDNHVIRKKQFDNNIKEVKDLLSNVFSYKGSKPTYTEIEAIVNKKIGDVWYAEDTGYMYIWNGKTWYDLGKSFDASKFVDITSDQVAINGIKKFTGKLKALTPVDSDDVAILSWTTKQINDKVESVIGDLNSLNNEVSKDNLVNAINSVDDKFKTTAKTNKSNTFTGDQTYVDHILLESVPSERNHAVNLGYILDNPGGIKLPDHTALTQNSVTEITFGYANPVVYSAQQLKNVFLKDIVGNEYKAIMADKTSFTENPSKEMVVILSRTDYTKNIDVKFDITKTVDELKQYELKEGEVRVILSYDTISVYSSGYGYGAMFARNANKKDGDLIYDYYSGSQNDITNNRKVSIKIDKLGINTPDIVSISMTTNGSEKLTVKTDTLDPVENTYESADMTYIHTPVSKIAGDILYSNISQAIKSIHVLENNICSLKPADMELQLVRLKEFKQTINNMLQSMFDESPVTLKNGDYIDVSFSGSASYGTGYCGYVNIKDTIRNITYKAYKVSSNAFDTTSGTKVIAVLTSDNSKTNVTYSDSVSTLESYEVAENEILLEISFSAAKQYSAKYGYGAMLEYWGSVSDLCYDYYMGSNLDMDCPFKITLLKIGSSVKADTIQIGAPTFAGSLVMHLRKNTNDVINFLVSTGMNVTGRDGTESGSVYNLVEKSLKPLKVLTSEAHQSINGITTFNNKVYMNINNEKITDSKQLIHKEYLDKNIADNVAYNISNTPLVPYNDVSSLNTKNICVKISATTDSSNYSSGDTVVVSNFKIKLKGDDEYLKPYGVEVIDRENNKIGLNLIGDDTVYNDNDALLSTRPSDFNSSSVDLSSGSNALVTVKTNGAYDYSGVYDIPNPFREYNKKYSLFLSNDGLKNPYYQVDINSSKQVDNISFQLFGTSATNPFLYSKDCKIELFIENTIVKTFNIKGSSGNNSPVNINIDYKDGMFLISVLDSINYINNRINKNAELLTGSGKPNFSLNPNKVGSLYSDTTNKAVYMCIDNTSGANKWVNIVTGDEIKPNLRKIEITCNVRLRSGQYGGCMSGVKIGFDNGYASTKQIVKGLNSGQILLSLDGLGNLSGYSEVSSLTPSSQDIKVDVDTTGIYNDPSYHCVTNIFKQYLGNADQCSLWSDASVKQLKITLLSKKIPNKILYVGDGYYGQTSVSDVKAIWYYVNDNGDKIEGSIDNDLEISNNDSETNDSSYIYAFNIN
Physico‐chemical
properties
protein length:1321 AA
molecular weight: 146522,20840 Da
isoelectric point:4,93109
aromaticity:0,09463
hydropathy:-0,39341

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Campylobacter phage PC14
[NCBI] 		1541686 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AIM19603.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KM272868 [NCBI]
CDS location
range 131 -> 4096
strand +
CDS
ATGATGCATCCTGATTTTTTTGGTGGGGATGATATTGTATTTAAGCCTGAACCCCCAATTGATCCAGATGGTCCTGATTTATCTAACTATTATACAAAACCAGAAACAAATAGTTTATTAGATAAGAAAGCAGATAAAATTCATACACATGTTGTAGCTGATATAACAGATTTAAATTTGGATAAATTTGCTACAAAAGAAGAAACATATACTAAACAAGAGATAGATGATAAAATAGACGAAATAGTACCACCTGAAATTAATTTAACTGATTATGCAAAGAAAGATGCAGTTAATATTTTTACAAAAGCTAATACTTTTACAGAAGCACCTTCAGTAGAAGTAGATGCAACACTAGATAATCATGTTATTAGAAAGAAACAGTTTGACAATAACATAAAAGAAGTTAAAGATCTACTATCTAATGTATTTTCATATAAAGGATCAAAACCTACATATACAGAAATAGAAGCCATTGTTAATAAAAAGATAGGTGATGTATGGTATGCTGAAGATACTGGATATATGTATATATGGAATGGTAAAACTTGGTATGATTTAGGTAAATCTTTTGATGCTAGTAAATTTGTTGATATAACTTCAGACCAAGTAGCAATAAATGGTATTAAAAAATTCACAGGAAAATTAAAAGCATTAACACCTGTTGATTCTGATGATGTGGCTATTTTGAGCTGGACAACAAAACAAATAAATGACAAAGTTGAATCTGTTATTGGTGATTTAAATTCACTAAATAATGAAGTTTCTAAAGATAATTTAGTTAATGCTATAAATAGTGTAGATGATAAGTTTAAAACAACAGCTAAAACCAATAAATCAAATACATTTACAGGTGATCAAACTTATGTAGATCATATTTTACTAGAATCTGTTCCTTCTGAAAGAAATCATGCAGTTAATTTGGGATACATTTTAGATAATCCTGGAGGTATAAAGCTTCCTGATCATACAGCACTTACACAAAATTCTGTTACAGAAATAACTTTTGGATATGCAAATCCAGTAGTGTACTCTGCACAACAATTAAAAAATGTATTCCTAAAAGATATAGTAGGCAATGAATATAAAGCTATAATGGCAGATAAAACATCATTTACAGAAAATCCTTCAAAGGAAATGGTTGTTATACTTTCTAGAACTGATTATACAAAAAATATAGATGTTAAGTTTGATATAACTAAAACAGTTGATGAGCTTAAACAATATGAGCTTAAAGAAGGAGAAGTTAGAGTTATACTATCTTATGATACTATATCTGTTTATTCTAGTGGATATGGTTATGGAGCCATGTTTGCTAGAAACGCTAATAAAAAAGACGGAGATTTAATATATGATTATTATTCTGGAAGTCAAAATGATATAACAAATAATAGAAAAGTATCTATAAAAATAGATAAACTTGGTATTAATACTCCAGATATTGTAAGTATATCTATGACTACAAATGGTTCTGAAAAATTAACAGTAAAAACAGATACACTAGATCCTGTAGAAAATACATACGAATCTGCGGATATGACTTATATTCATACTCCTGTCAGCAAAATTGCAGGAGATATTCTGTATAGTAATATATCTCAAGCAATTAAATCAATACATGTGTTAGAAAATAATATATGCTCTTTAAAGCCTGCAGATATGGAATTACAACTTGTAAGACTTAAAGAATTTAAACAAACAATAAATAATATGTTGCAATCTATGTTTGATGAGAGCCCTGTAACTCTAAAAAATGGAGATTACATAGATGTTTCATTTAGTGGTAGTGCAAGCTATGGAACAGGATATTGTGGGTATGTTAATATAAAAGATACTATAAGAAATATTACATATAAAGCTTATAAAGTATCTTCAAATGCTTTTGATACAACTAGTGGAACTAAAGTTATTGCAGTTCTAACTTCTGATAACAGTAAAACAAATGTAACTTATTCTGATAGTGTATCAACATTAGAATCTTATGAAGTAGCAGAAAATGAGATATTATTAGAAATATCATTTTCTGCTGCTAAGCAATATTCTGCTAAATACGGGTATGGAGCTATGTTAGAATATTGGGGTTCTGTATCTGATTTATGTTATGATTATTATATGGGTTCAAACCTAGATATGGATTGTCCATTTAAAATAACATTACTCAAAATAGGAAGTTCTGTTAAAGCTGATACTATACAAATAGGTGCTCCTACTTTTGCAGGATCATTAGTTATGCACCTAAGAAAAAATACAAACGATGTTATTAATTTCCTTGTATCTACAGGTATGAATGTAACAGGAAGAGATGGGACTGAAAGTGGATCAGTATATAATTTAGTAGAAAAATCATTGAAACCATTAAAAGTTCTAACATCTGAAGCACATCAATCTATAAATGGTATAACTACTTTTAATAATAAAGTGTATATGAATATAAACAATGAAAAAATTACAGACAGCAAACAACTAATACATAAAGAATACCTAGATAAAAATATTGCAGACAATGTAGCATATAATATTAGTAATACTCCATTAGTACCTTACAATGATGTTAGTTCTTTAAATACAAAAAATATTTGTGTAAAAATATCTGCGACAACTGATAGCTCTAATTATTCATCTGGTGATACAGTAGTAGTTAGTAATTTCAAGATAAAACTTAAAGGAGATGATGAGTACCTTAAACCTTATGGGGTTGAAGTTATTGATAGAGAAAATAATAAAATAGGTTTAAATTTAATAGGAGATGATACAGTATATAATGATAATGATGCTTTATTATCTACAAGACCTTCTGATTTTAATTCATCTAGTGTAGATCTTTCTAGTGGAAGTAACGCCTTAGTAACTGTTAAAACTAATGGAGCTTATGATTATAGTGGAGTTTATGATATACCAAATCCTTTTAGAGAATATAATAAAAAATACTCTTTATTCTTAAGTAATGATGGGTTAAAAAATCCTTATTACCAAGTTGATATAAATAGCTCCAAACAAGTTGATAATATATCTTTTCAATTATTTGGAACTAGTGCTACAAATCCTTTTTTATATTCTAAAGACTGTAAAATTGAATTGTTTATAGAAAATACTATTGTAAAAACCTTCAATATTAAAGGCAGCTCTGGAAATAATAGTCCTGTGAATATTAATATAGATTATAAAGATGGTATGTTTTTAATATCTGTTCTTGATTCTATAAATTACATAAATAATAGAATTAATAAAAATGCAGAATTACTTACAGGGTCAGGCAAACCTAATTTTTCATTAAACCCTAATAAAGTAGGTTCTCTATACTCTGATACAACTAATAAAGCTGTATATATGTGTATAGACAATACTTCTGGTGCTAATAAATGGGTAAATATAGTAACAGGAGATGAAATTAAACCAAACCTTAGAAAAATAGAAATTACTTGTAATGTAAGATTAAGAAGTGGCCAATATGGTGGTTGTATGAGCGGTGTTAAAATAGGATTTGATAACGGATATGCTTCTACAAAACAAATAGTTAAAGGGTTAAATAGTGGTCAAATATTGCTATCTCTAGATGGGTTGGGTAACCTTTCTGGATATTCTGAAGTCAGTTCTTTAACTCCTAGCAGTCAAGATATAAAAGTTGATGTGGATACTACTGGTATATATAATGACCCTTCATATCATTGCGTTACTAATATATTCAAACAATATCTTGGAAATGCTGATCAATGTTCGCTATGGTCTGATGCTAGTGTTAAACAACTTAAAATAACTTTATTATCTAAAAAGATTCCTAATAAAATATTGTATGTAGGAGACGGATATTATGGTCAAACATCTGTTTCTGATGTAAAAGCTATATGGTATTATGTAAATGATAATGGAGACAAAATAGAAGGCAGTATAGATAATGATTTGGAAATAAGCAATAATGACTCTGAAACAAACGATAGTTCTTATATATATGCGTTCAATATAAATTAA

Tertiary structure

PDB ID
d9cf2f8e4e53452420148dfd9afff7c07289411e409b03ccf7f20cd646a0795a
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,4516
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Identification and characterisation of new Campylobacter group III phages of animal origin Janez,N., Kokosin,A., Zaletel,E., Vranac,T., Kovac,J., Vuckovic,D., Smole Mozina,S., Curin Serbec,V., Zhang,Q., Accetto,T., Podgornik,A. and Peterka,M. 2014 25168177 GenBank