Protein

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Genbank accession
AIX42234.1 [GenBank]
Protein name
collagen triple helix repeat protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,85
Seq2Symm
C3 confidence 0,947
C3 0,947
C1 0,551
C2 0,003
Predicted homo-oligomer symmetry (Seq2Symm, per-class probabilities; C1 = monomer, C2 = dimer, C3 = trimer).
Protein sequence
MASIQFPANPKVGDTYYDVDTNITYTWEGEYWFATGPGTGIGATGATGAQGNQGSSGEKGEPGTRGIKGDTGSTGSTGPTGPGGFIGLTGATGPQGSPGGATGATGNIGPLGTTGATGPDGASGATGIQGPIGTPGGATGATGLAGPPGNVGATGPLGPNGTPGGATGPLGPVGSTGATGAGATGSDGATGSTGIQGLQGSPGGATGATGIDGLLGPIGATGTTGATGVDGPIGATGTTGATGETGDTGSTGAAGPTGIPGATGFTGPEGATGSKGDEGSTGSTGPQGSPGGATGATGVDGPVGSTGATAATGATGPDGPTGPAGPTGLLGATGATGDDGSTGATGATGFGATGADGATGSTGSTGPDGPLGSTGATGIAGGVSHVWSPDVSILTANNSFLFTHDVDEDIKILKISKFSSTFTNEEALLNSFAIGDSLRLTSGPATFQYTVRANGGLTVSSGVDVFMLLVSDGFLASGSGTLNGSTVVLQRPTSSTFATFNFGVSTINWPTTDGDVTIDYPFLVNNGPRYVAFNQKDLLGRDDEQFFFEPLVSTDLNSFQFQVKTTNFFKSEIEGGYYYSDIDAYVYLTDITELYSDPSNPVTSVGSPWNVQVVGIASAIPGVAGSPGGATGATGPAGPPSGATGATGDLGPIGPGGPTGPVGVNGSPGSPGGATGATGADGASGATGSTGATGAFVTGSNLVAGIITATTFDGDATSSDKIKTNRSSSAAVNYLTFVSDDNTGGAVSETLKTNLNVSFIPSSGDFIASRITASNNFYLGGTEVNSSASELNVLVGVTDFLDEDNMASDSPTAIPSQQSVKRYVDANAFSGITTVSTLVGAGSSDVYFASSIVPTTNESIDLGSIDYKFRDLYLSDTTIYTNTGELSVGLNTTAPTAKVVLGPALQTIVQQSTDFDDFKIRIAAQSWGG
Physico‐chemical
properties
protein length:929 AA
molecular weight: 89624,83900 Da
isoelectric point:4,05003
aromaticity:0,06781
hydropathy:-0,09559

Taxonomy

Phage
Synechococcus phage ACG-2014f [NCBI] · taxon 1493511
Uroviricota Caudoviricetes Pantevenvirales Kyanoviridae Atlauavirus Atlauavirus tusconc8
Host
Synechococcus sp. WH 7803 [NCBI] · taxon 32051
Cyanobacteriota Cyanophyceae Synechococcales Synechococcaceae Synechococcus Synechococcus sp. WH 7803

Coding sequence (CDS)

Genbank protein accession
AIX42234.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KJ019146 [NCBI]
CDS location
range 13501 -> 16290
strand +
CDS
ATGGCAAGCATTCAATTCCCAGCAAATCCGAAAGTTGGTGATACTTACTACGATGTAGATACAAATATAACTTACACCTGGGAGGGTGAATACTGGTTTGCAACAGGACCAGGCACAGGTATTGGTGCCACTGGAGCAACTGGAGCACAAGGAAATCAAGGTTCTAGTGGTGAAAAGGGTGAGCCAGGAACTCGCGGAATTAAAGGAGATACTGGATCTACTGGTTCTACCGGTCCCACAGGTCCTGGTGGTTTTATTGGATTAACAGGTGCAACTGGTCCTCAAGGTTCTCCCGGTGGTGCTACCGGTGCTACAGGTAATATTGGTCCTTTAGGAACTACTGGTGCAACTGGTCCTGATGGTGCTAGTGGTGCTACAGGTATTCAGGGTCCTATTGGTACTCCAGGTGGTGCAACTGGCGCTACTGGTTTAGCTGGTCCTCCAGGAAATGTTGGTGCTACTGGTCCTCTCGGTCCTAATGGTACTCCAGGTGGTGCTACTGGTCCTCTTGGTCCTGTTGGTTCTACTGGAGCCACTGGTGCTGGTGCTACTGGCTCTGATGGTGCTACTGGTTCTACAGGTATTCAGGGACTACAAGGTTCCCCAGGTGGTGCAACTGGTGCTACTGGTATTGATGGTTTACTAGGTCCTATTGGTGCCACAGGTACTACAGGAGCTACCGGTGTTGATGGTCCTATTGGTGCCACAGGTACTACAGGAGCCACAGGTGAGACAGGTGATACAGGTTCAACCGGTGCTGCTGGTCCTACGGGTATTCCTGGAGCCACTGGTTTCACAGGTCCTGAAGGTGCTACGGGTTCCAAAGGTGATGAAGGTTCTACAGGTAGTACAGGTCCTCAAGGTTCTCCAGGTGGTGCCACTGGTGCTACTGGTGTTGATGGTCCTGTAGGTTCTACAGGTGCCACAGCTGCTACTGGTGCCACTGGTCCTGACGGTCCTACCGGTCCCGCAGGTCCTACAGGTTTATTAGGTGCCACTGGTGCTACTGGTGATGATGGTTCTACCGGAGCCACTGGTGCTACTGGTTTTGGTGCTACAGGTGCTGATGGTGCTACTGGTTCTACAGGTTCTACAGGTCCTGATGGTCCTCTTGGTTCTACTGGTGCCACTGGTATTGCAGGTGGTGTGAGTCATGTATGGTCACCAGATGTTTCTATCCTAACTGCCAACAACTCTTTCCTATTCACCCACGATGTAGACGAAGATATTAAGATCCTAAAGATCTCCAAGTTTAGTTCAACATTCACCAATGAGGAGGCACTACTTAATAGTTTTGCAATCGGTGATTCACTTAGACTAACATCAGGTCCAGCAACATTCCAATATACTGTTAGAGCCAATGGTGGACTCACAGTATCATCTGGTGTTGACGTGTTTATGTTACTCGTCAGTGATGGTTTCTTAGCATCTGGTAGTGGAACACTCAATGGTTCAACAGTTGTTCTTCAACGTCCCACATCATCCACCTTCGCTACATTTAACTTCGGTGTATCCACTATCAACTGGCCTACTACTGATGGTGATGTAACTATTGACTATCCATTCCTAGTAAACAATGGTCCTAGGTATGTTGCATTCAATCAGAAGGATCTACTAGGTAGGGATGATGAGCAGTTCTTCTTTGAACCTTTAGTATCTACAGACCTAAACTCATTCCAGTTCCAGGTTAAGACTACTAACTTCTTCAAATCAGAAATTGAAGGTGGTTACTACTATAGTGATATTGATGCCTATGTGTATCTAACTGATATCACCGAACTATATTCAGATCCAAGTAATCCAGTAACCAGTGTGGGTTCACCTTGGAATGTTCAGGTTGTAGGTATTGCCTCCGCCATTCCTGGTGTTGCTGGTTCTCCAGGTGGTGCAACCGGTGCTACTGGTCCTGCAGGTCCTCCAAGTGGTGCAACTGGTGCTACAGGTGATCTTGGTCCTATTGGTCCCGGTGGTCCTACTGGTCCCGTTGGTGTTAACGGATCCCCAGGTTCACCCGGTGGTGCAACTGGTGCCACTGGCGCTGATGGTGCTAGTGGTGCTACAGGTTCTACAGGTGCCACAGGTGCATTCGTCACTGGTAGTAATCTTGTAGCTGGTATTATCACAGCCACCACATTCGATGGTGATGCTACATCATCTGATAAGATTAAGACTAATCGGTCCAGCAGTGCGGCTGTTAACTATCTAACTTTCGTTTCTGATGATAACACTGGTGGTGCCGTTAGTGAAACTCTCAAGACAAACTTGAATGTAAGTTTCATTCCTTCTTCTGGTGATTTTATCGCTAGTAGGATTACAGCAAGTAACAACTTCTACCTGGGTGGTACTGAGGTCAATTCTTCAGCATCTGAACTAAATGTGTTGGTTGGTGTTACTGACTTCTTAGATGAAGATAATATGGCATCCGATAGTCCTACGGCTATCCCATCACAACAATCAGTTAAGAGGTATGTTGACGCTAACGCTTTCTCTGGTATTACTACAGTTAGTACTCTAGTGGGCGCTGGTTCTAGTGATGTATACTTCGCAAGTTCTATTGTTCCAACTACTAATGAGTCCATTGACTTGGGTAGTATTGACTATAAGTTCAGAGACCTCTACCTATCAGACACAACCATATATACTAACACTGGTGAACTTAGTGTAGGTTTGAATACCACAGCACCAACCGCAAAGGTTGTTCTTGGTCCAGCACTACAAACAATTGTTCAACAGTCCACTGATTTTGATGACTTTAAGATCAGAATCGCAGCACAAAGTTGGGGTGGTTAA

Genome Context

Tertiary structure

AIX42234.1
ESMFold2 structure
Source ESMFold2
pLDDT 47.4
Oligomeric state monomer
Download structure