Protein

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Genbank accession
XYM57738.1 [GenBank]
Protein name
virion structural protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,79
Seq2Symm
C1 confidence 0,999 truncated
C1 0,999
C2 0,004
C3 0,000
Predicted homo-oligomer symmetry (Seq2Symm, per-class probabilities; C1 = monomer, C2 = dimer, C3 = trimer).
Protein sequence
MTQDNQWNTRRPNYQAFSGQYNEGAWSTEMNLYNVGGSDPGGTPGPNRSFSWPITFSNDGRQKFDTAVDDSGVCSIQGYGTQFNLGGFNAWTRRTTSDYIPAGSYIITMTTNNGGGGPWGVAADWVGYDPIPAPSLDQPSVSGLYNGYILRGTSVEVQFRVSYLDAQVSSTSVIDFENGEYSTTTSGRYRYINLSTSSSDTANSYTFEGRTTTSGGTSSINIGTYYLATAISLNQFVITGTTQRIGNDLYADVNSTLSFSWTVNGSVSTVTFDGGSYSASDSVTGTQYTSTSSTKTITFQAVGLAGDSLTETFTVYVNPSYNLVSDYGILLAEDDAFGNSASYSFTFTADGPASGTTYYWDIGYVSTTTNTYDFIQPESGSFSINGSGVGTFNIGIAADLAAEGTETFTVYVRDSAGGTVLKERTLEISDTSVDVAVYDLTTDNSIMVENDTVTATFSCVNIAVGTSFAWYIDHDTSNSQDFVTTNGTFTAPNPTGSNGEQFVDFNISTVNDFSTEGDEFFDVVVTRNSIEVARTPVQVKIEDTSKEAIYDLDPGSLTLTESGFLACQVSTQYVPNNTQLYWTINHITTTAAEFGASQGIFNIQSNSGSFTITPVADSVTENVKTFSIQIRTGGYTGTIVETSAVISLTDGVTYNLTLAEGSSFTFTSSGQVYIPLFTSTIAVDVAAEGGEGATVSGSSYTNNLSGADASIMTLTANGGSAANQNIGGNGGGYQGDGTQSFIGGNGGNGTPGAGGGGAGLAGSGSGFGGVGSAGNTSSYSVGYSYWYFAGNTNNCYSCNCAAYAGEARGCHTAPDPAGCGRPNGWRCICACWKIAYGSNTYYTASGGGGQGGSTRKTYSRSDLSNFGYLDSIQSFSVNDGGNSLNNGYISMVFDYVIPQVTITSADATLINGESSTITWSSTDAVSQSLYTNSVFSGSVNSTGSLVVSPSVTTTYKIESTAYDTPSDDRSAEVTITVYQPPSIALSFNNNPIIRGQNSILTWLVQGDVSTVVFDQAIGSQNLSGDITVAPVETTTYSVTVQGLGGTLTDSITLTVYQLPTLAVIFPSTFAYTYGVDQPITVTTDYANTLVQIQMTYSYQDGTQVVQTTPLTPNSSASVSNPLTQTATPTVPWNSLGPENIAILVQVQGGGGSATSNTVSRAVSIDRTPDSFNIPASLEKEPGEEPIFAPEDDVIVSNPITINDIDIPVEIKANKPIQVRFDDEDPQEPESWHDVRQMGGN
Physico‐chemical
properties
protein length:1240 AA
molecular weight: 130631,18030 Da
isoelectric point:4,05003
aromaticity:0,10565
hydropathy:-0,20032

Taxonomy

Phage
Synechococcus phage Sf-CH3 [NCBI] · taxon 3413214
Synechococcus phage Sf-CH3
Host
Synechococcus [NCBI] · taxon 1129
Cyanobacteriota Cyanophyceae Synechococcales Synechococcaceae Synechococcus

Coding sequence (CDS)

Genbank protein accession
XYM57738.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PV340851 [NCBI]
CDS location
range 37839 -> 41561
strand +
CDS
ATGACACAAGACAATCAATGGAATACTAGAAGACCTAACTACCAAGCATTTAGTGGTCAGTATAACGAAGGTGCTTGGTCCACTGAGATGAACCTATATAACGTCGGTGGTTCCGACCCTGGCGGTACTCCAGGTCCCAACAGATCATTTTCATGGCCAATCACATTTTCTAATGATGGTAGGCAGAAGTTTGATACTGCTGTGGATGATAGTGGGGTGTGTTCTATTCAGGGATATGGCACTCAGTTTAACTTGGGTGGTTTTAATGCATGGACTAGAAGAACAACATCAGATTATATTCCTGCGGGGTCTTATATTATTACAATGACCACCAATAACGGTGGTGGTGGACCATGGGGTGTGGCAGCAGATTGGGTTGGATATGATCCAATCCCAGCACCAAGCTTGGATCAACCTAGTGTCAGTGGTCTTTACAACGGATATATTCTGAGAGGTACGTCTGTTGAAGTTCAGTTTAGAGTATCTTATTTGGATGCTCAGGTTAGTAGTACCAGTGTCATTGACTTTGAAAATGGTGAATATAGTACCACAACATCTGGTAGGTATCGTTATATAAATTTAAGCACTAGCAGTTCAGATACAGCTAATAGTTATACTTTTGAAGGACGCACGACCACCAGTGGAGGAACATCCTCTATTAATATTGGTACGTACTATCTTGCTACTGCAATTTCATTAAATCAATTTGTTATTACTGGAACTACACAAAGAATTGGTAATGATCTATATGCTGATGTTAATAGTACGTTGTCATTTAGTTGGACAGTAAATGGATCTGTTTCCACAGTTACTTTTGATGGTGGTAGTTATAGTGCTAGTGATAGTGTTACTGGAACGCAGTATACTAGTACATCTTCTACTAAGACAATAACATTCCAGGCAGTTGGTCTAGCAGGTGATAGTCTCACTGAAACATTTACTGTATATGTAAATCCATCATATAATTTAGTTTCTGACTACGGTATACTTCTTGCTGAAGATGATGCTTTTGGCAATAGTGCTAGTTATAGTTTTACATTTACAGCAGATGGTCCTGCTTCTGGTACAACATATTATTGGGATATTGGATACGTATCTACAACTACAAATACATATGACTTTATTCAACCTGAAAGTGGTAGTTTCTCAATCAATGGATCAGGAGTAGGAACATTTAACATTGGTATTGCTGCTGACTTAGCAGCAGAAGGAACAGAGACATTTACTGTTTATGTTAGAGATAGTGCTGGTGGTACTGTTCTAAAAGAAAGGACTCTAGAAATTAGTGATACTTCTGTTGACGTTGCAGTCTATGACTTGACAACCGATAACAGTATCATGGTTGAAAATGATACTGTCACTGCTACATTTTCTTGTGTTAACATTGCTGTAGGAACATCATTTGCATGGTATATTGATCATGATACCTCAAATTCTCAGGATTTCGTTACTACCAATGGTACATTTACTGCTCCTAATCCAACAGGATCTAATGGAGAACAGTTTGTAGATTTCAATATCAGTACAGTTAATGATTTCTCTACAGAAGGAGATGAATTCTTTGATGTTGTTGTTACTAGAAATTCAATAGAGGTAGCAAGAACACCAGTTCAAGTTAAGATTGAAGATACTTCTAAAGAAGCAATATATGATCTAGATCCAGGAAGTTTAACACTCACTGAGTCTGGATTTTTGGCATGCCAAGTTTCTACTCAGTACGTACCTAATAATACTCAACTTTATTGGACTATTAATCATATTACTACAACTGCAGCTGAATTTGGTGCAAGTCAGGGAATTTTTAATATTCAAAGTAATTCTGGTTCATTCACAATTACTCCAGTTGCGGATTCTGTAACTGAGAATGTAAAAACATTTTCAATTCAAATTAGGACAGGTGGATATACTGGTACAATTGTAGAAACTTCTGCTGTTATTTCATTAACTGATGGTGTTACTTATAATTTGACATTGGCAGAGGGATCATCATTTACTTTTACTTCATCTGGTCAAGTATACATTCCTTTGTTCACATCAACTATAGCGGTTGACGTTGCTGCTGAAGGTGGTGAAGGTGCTACTGTTAGTGGATCTTCATATACAAATAATTTGAGTGGTGCTGATGCATCTATCATGACATTAACAGCAAACGGAGGTTCTGCTGCTAATCAAAATATTGGTGGTAACGGTGGAGGTTATCAGGGTGATGGAACTCAAAGTTTTATTGGTGGTAACGGTGGCAATGGAACTCCAGGTGCAGGCGGTGGAGGTGCAGGTCTTGCAGGATCTGGTAGTGGATTTGGTGGCGTAGGATCTGCTGGTAATACTAGTTCTTATAGTGTAGGTTATTCTTATTGGTACTTTGCTGGCAATACTAATAACTGTTATAGTTGTAATTGTGCTGCATATGCAGGCGAAGCTCGTGGATGTCATACAGCACCAGATCCTGCTGGATGTGGTAGACCTAATGGTTGGAGATGTATTTGTGCATGTTGGAAGATTGCCTATGGATCTAACACATACTATACTGCATCTGGTGGCGGTGGACAAGGTGGTTCTACCAGAAAAACATATAGCAGGTCTGATCTTTCAAATTTTGGATATCTAGATTCAATTCAATCATTTTCTGTAAATGATGGTGGTAATAGTTTGAATAATGGATACATCAGTATGGTTTTTGATTATGTTATTCCTCAAGTCACTATCACAAGTGCTGATGCTACCCTTATCAATGGAGAATCTAGTACAATTACATGGTCCTCTACAGATGCAGTCAGTCAATCATTGTATACAAATAGTGTCTTTTCTGGTTCGGTTAATAGCACTGGTTCTCTAGTAGTTTCTCCAAGTGTTACCACCACATATAAAATTGAATCTACAGCATATGACACACCTTCAGATGATCGATCTGCAGAAGTTACTATAACTGTATATCAACCACCTTCGATTGCTCTTAGTTTTAATAATAATCCTATTATTAGGGGACAGAATTCTATTCTAACTTGGTTGGTTCAGGGTGATGTATCTACTGTAGTTTTTGATCAAGCTATAGGAAGTCAAAATTTGTCTGGAGATATTACTGTTGCTCCAGTAGAAACAACAACCTATTCAGTAACTGTTCAAGGTCTAGGTGGTACACTAACAGACTCTATTACTCTCACTGTTTATCAATTACCAACACTTGCTGTTATATTCCCAAGTACATTTGCTTATACTTATGGTGTTGATCAACCTATTACAGTAACAACTGATTATGCAAATACTCTTGTTCAAATCCAGATGACTTATAGTTATCAGGATGGTACACAGGTAGTTCAAACTACACCATTAACACCAAATTCTTCTGCATCTGTTAGTAATCCACTAACACAGACTGCTACTCCTACAGTTCCATGGAATAGTTTGGGACCTGAAAATATTGCAATTTTGGTACAAGTTCAAGGTGGTGGAGGTTCTGCAACAAGTAACACTGTATCAAGAGCAGTTAGTATTGACAGAACACCTGATTCTTTCAATATTCCTGCAAGTTTGGAGAAAGAACCAGGCGAAGAACCTATCTTTGCTCCAGAAGATGATGTAATTGTTAGCAATCCAATTACAATTAATGATATAGATATACCAGTAGAGATCAAAGCAAATAAACCTATTCAGGTACGCTTTGACGATGAAGATCCCCAAGAGCCCGAAAGTTGGCACGATGTCAGACAAATGGGAGGTAACTAA

Genome Context

Tertiary structure

XYM57738.1
ESMFold2 structure
Source ESMFold2
pLDDT 67.0
Oligomeric state monomer
Download structure