Protein

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Genbank accession
XYM57738.1 [GenBank]
Protein name
virion structural protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,79
Protein sequence
MTQDNQWNTRRPNYQAFSGQYNEGAWSTEMNLYNVGGSDPGGTPGPNRSFSWPITFSNDGRQKFDTAVDDSGVCSIQGYGTQFNLGGFNAWTRRTTSDYIPAGSYIITMTTNNGGGGPWGVAADWVGYDPIPAPSLDQPSVSGLYNGYILRGTSVEVQFRVSYLDAQVSSTSVIDFENGEYSTTTSGRYRYINLSTSSSDTANSYTFEGRTTTSGGTSSINIGTYYLATAISLNQFVITGTTQRIGNDLYADVNSTLSFSWTVNGSVSTVTFDGGSYSASDSVTGTQYTSTSSTKTITFQAVGLAGDSLTETFTVYVNPSYNLVSDYGILLAEDDAFGNSASYSFTFTADGPASGTTYYWDIGYVSTTTNTYDFIQPESGSFSINGSGVGTFNIGIAADLAAEGTETFTVYVRDSAGGTVLKERTLEISDTSVDVAVYDLTTDNSIMVENDTVTATFSCVNIAVGTSFAWYIDHDTSNSQDFVTTNGTFTAPNPTGSNGEQFVDFNISTVNDFSTEGDEFFDVVVTRNSIEVARTPVQVKIEDTSKEAIYDLDPGSLTLTESGFLACQVSTQYVPNNTQLYWTINHITTTAAEFGASQGIFNIQSNSGSFTITPVADSVTENVKTFSIQIRTGGYTGTIVETSAVISLTDGVTYNLTLAEGSSFTFTSSGQVYIPLFTSTIAVDVAAEGGEGATVSGSSYTNNLSGADASIMTLTANGGSAANQNIGGNGGGYQGDGTQSFIGGNGGNGTPGAGGGGAGLAGSGSGFGGVGSAGNTSSYSVGYSYWYFAGNTNNCYSCNCAAYAGEARGCHTAPDPAGCGRPNGWRCICACWKIAYGSNTYYTASGGGGQGGSTRKTYSRSDLSNFGYLDSIQSFSVNDGGNSLNNGYISMVFDYVIPQVTITSADATLINGESSTITWSSTDAVSQSLYTNSVFSGSVNSTGSLVVSPSVTTTYKIESTAYDTPSDDRSAEVTITVYQPPSIALSFNNNPIIRGQNSILTWLVQGDVSTVVFDQAIGSQNLSGDITVAPVETTTYSVTVQGLGGTLTDSITLTVYQLPTLAVIFPSTFAYTYGVDQPITVTTDYANTLVQIQMTYSYQDGTQVVQTTPLTPNSSASVSNPLTQTATPTVPWNSLGPENIAILVQVQGGGGSATSNTVSRAVSIDRTPDSFNIPASLEKEPGEEPIFAPEDDVIVSNPITINDIDIPVEIKANKPIQVRFDDEDPQEPESWHDVRQMGGN
Physico‐chemical
properties
protein length:1240 AA
molecular weight: 130631,18030 Da
isoelectric point:4,05003
aromaticity:0,10565
hydropathy:-0,20032

Taxonomy

Phage
Synechococcus phage Sf-CH3 [NCBI] · taxon 3413214
Viruses
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Genbank protein accession
XYM57738.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PV340851 [NCBI]
CDS location
range 37839 -> 41561
strand +
CDS
ATGACACAAGACAATCAATGGAATACTAGAAGACCTAACTACCAAGCATTTAGTGGTCAGTATAACGAAGGTGCTTGGTCCACTGAGATGAACCTATATAACGTCGGTGGTTCCGACCCTGGCGGTACTCCAGGTCCCAACAGATCATTTTCATGGCCAATCACATTTTCTAATGATGGTAGGCAGAAGTTTGATACTGCTGTGGATGATAGTGGGGTGTGTTCTATTCAGGGATATGGCACTCAGTTTAACTTGGGTGGTTTTAATGCATGGACTAGAAGAACAACATCAGATTATATTCCTGCGGGGTCTTATATTATTACAATGACCACCAATAACGGTGGTGGTGGACCATGGGGTGTGGCAGCAGATTGGGTTGGATATGATCCAATCCCAGCACCAAGCTTGGATCAACCTAGTGTCAGTGGTCTTTACAACGGATATATTCTGAGAGGTACGTCTGTTGAAGTTCAGTTTAGAGTATCTTATTTGGATGCTCAGGTTAGTAGTACCAGTGTCATTGACTTTGAAAATGGTGAATATAGTACCACAACATCTGGTAGGTATCGTTATATAAATTTAAGCACTAGCAGTTCAGATACAGCTAATAGTTATACTTTTGAAGGACGCACGACCACCAGTGGAGGAACATCCTCTATTAATATTGGTACGTACTATCTTGCTACTGCAATTTCATTAAATCAATTTGTTATTACTGGAACTACACAAAGAATTGGTAATGATCTATATGCTGATGTTAATAGTACGTTGTCATTTAGTTGGACAGTAAATGGATCTGTTTCCACAGTTACTTTTGATGGTGGTAGTTATAGTGCTAGTGATAGTGTTACTGGAACGCAGTATACTAGTACATCTTCTACTAAGACAATAACATTCCAGGCAGTTGGTCTAGCAGGTGATAGTCTCACTGAAACATTTACTGTATATGTAAATCCATCATATAATTTAGTTTCTGACTACGGTATACTTCTTGCTGAAGATGATGCTTTTGGCAATAGTGCTAGTTATAGTTTTACATTTACAGCAGATGGTCCTGCTTCTGGTACAACATATTATTGGGATATTGGATACGTATCTACAACTACAAATACATATGACTTTATTCAACCTGAAAGTGGTAGTTTCTCAATCAATGGATCAGGAGTAGGAACATTTAACATTGGTATTGCTGCTGACTTAGCAGCAGAAGGAACAGAGACATTTACTGTTTATGTTAGAGATAGTGCTGGTGGTACTGTTCTAAAAGAAAGGACTCTAGAAATTAGTGATACTTCTGTTGACGTTGCAGTCTATGACTTGACAACCGATAACAGTATCATGGTTGAAAATGATACTGTCACTGCTACATTTTCTTGTGTTAACATTGCTGTAGGAACATCATTTGCATGGTATATTGATCATGATACCTCAAATTCTCAGGATTTCGTTACTACCAATGGTACATTTACTGCTCCTAATCCAACAGGATCTAATGGAGAACAGTTTGTAGATTTCAATATCAGTACAGTTAATGATTTCTCTACAGAAGGAGATGAATTCTTTGATGTTGTTGTTACTAGAAATTCAATAGAGGTAGCAAGAACACCAGTTCAAGTTAAGATTGAAGATACTTCTAAAGAAGCAATATATGATCTAGATCCAGGAAGTTTAACACTCACTGAGTCTGGATTTTTGGCATGCCAAGTTTCTACTCAGTACGTACCTAATAATACTCAACTTTATTGGACTATTAATCATATTACTACAACTGCAGCTGAATTTGGTGCAAGTCAGGGAATTTTTAATATTCAAAGTAATTCTGGTTCATTCACAATTACTCCAGTTGCGGATTCTGTAACTGAGAATGTAAAAACATTTTCAATTCAAATTAGGACAGGTGGATATACTGGTACAATTGTAGAAACTTCTGCTGTTATTTCATTAACTGATGGTGTTACTTATAATTTGACATTGGCAGAGGGATCATCATTTACTTTTACTTCATCTGGTCAAGTATACATTCCTTTGTTCACATCAACTATAGCGGTTGACGTTGCTGCTGAAGGTGGTGAAGGTGCTACTGTTAGTGGATCTTCATATACAAATAATTTGAGTGGTGCTGATGCATCTATCATGACATTAACAGCAAACGGAGGTTCTGCTGCTAATCAAAATATTGGTGGTAACGGTGGAGGTTATCAGGGTGATGGAACTCAAAGTTTTATTGGTGGTAACGGTGGCAATGGAACTCCAGGTGCAGGCGGTGGAGGTGCAGGTCTTGCAGGATCTGGTAGTGGATTTGGTGGCGTAGGATCTGCTGGTAATACTAGTTCTTATAGTGTAGGTTATTCTTATTGGTACTTTGCTGGCAATACTAATAACTGTTATAGTTGTAATTGTGCTGCATATGCAGGCGAAGCTCGTGGATGTCATACAGCACCAGATCCTGCTGGATGTGGTAGACCTAATGGTTGGAGATGTATTTGTGCATGTTGGAAGATTGCCTATGGATCTAACACATACTATACTGCATCTGGTGGCGGTGGACAAGGTGGTTCTACCAGAAAAACATATAGCAGGTCTGATCTTTCAAATTTTGGATATCTAGATTCAATTCAATCATTTTCTGTAAATGATGGTGGTAATAGTTTGAATAATGGATACATCAGTATGGTTTTTGATTATGTTATTCCTCAAGTCACTATCACAAGTGCTGATGCTACCCTTATCAATGGAGAATCTAGTACAATTACATGGTCCTCTACAGATGCAGTCAGTCAATCATTGTATACAAATAGTGTCTTTTCTGGTTCGGTTAATAGCACTGGTTCTCTAGTAGTTTCTCCAAGTGTTACCACCACATATAAAATTGAATCTACAGCATATGACACACCTTCAGATGATCGATCTGCAGAAGTTACTATAACTGTATATCAACCACCTTCGATTGCTCTTAGTTTTAATAATAATCCTATTATTAGGGGACAGAATTCTATTCTAACTTGGTTGGTTCAGGGTGATGTATCTACTGTAGTTTTTGATCAAGCTATAGGAAGTCAAAATTTGTCTGGAGATATTACTGTTGCTCCAGTAGAAACAACAACCTATTCAGTAACTGTTCAAGGTCTAGGTGGTACACTAACAGACTCTATTACTCTCACTGTTTATCAATTACCAACACTTGCTGTTATATTCCCAAGTACATTTGCTTATACTTATGGTGTTGATCAACCTATTACAGTAACAACTGATTATGCAAATACTCTTGTTCAAATCCAGATGACTTATAGTTATCAGGATGGTACACAGGTAGTTCAAACTACACCATTAACACCAAATTCTTCTGCATCTGTTAGTAATCCACTAACACAGACTGCTACTCCTACAGTTCCATGGAATAGTTTGGGACCTGAAAATATTGCAATTTTGGTACAAGTTCAAGGTGGTGGAGGTTCTGCAACAAGTAACACTGTATCAAGAGCAGTTAGTATTGACAGAACACCTGATTCTTTCAATATTCCTGCAAGTTTGGAGAAAGAACCAGGCGAAGAACCTATCTTTGCTCCAGAAGATGATGTAATTGTTAGCAATCCAATTACAATTAATGATATAGATATACCAGTAGAGATCAAAGCAAATAAACCTATTCAGGTACGCTTTGACGATGAAGATCCCCAAGAGCCCGAAAGTTGGCACGATGTCAGACAAATGGGAGGTAACTAA

Genome Context

Tertiary structure

No tertiary structures available.