Phage RBP Database

UniProt accession

E3SST6 [UniProt]

Protein name

Baseplate wedge initiator

RBP type

TF

Evidence RBPdetect2

Probability 0,64

Protein sequence

MTNSSWRVGSWTTPTTTVSQPPVPSEVSPESRSKISTNIAGQFPSFIRDSFPTFIDFVKEYYKSQELKGYCIDIIQNWSDYYNIDNYGDLVTTTTLISAVTTTSTTIDVASTRDFPDEGLLMVDNEIIYYQSKGATLFQTCARGFNAVKAVGLEDEYQFESTTAAAHTLGTEVVNLNNIFPLYMLGKFKEQFLSTFPKNFATGVTESTVIKRIKDFYSSKGTSRSFQFVIRTLFGVESEISYPRERIFKPSDAFYTSREIIRAVPVSGDPINLVGQVLYQEADPNDPNVGSARIYVKGVVEVFTANGSIYEIDVDTNNSFGTFVTPYKTVLAQDLGGNLTDTVVTVDSTLGWPETNGRFRIEDEIISYTDKTVTQFIGCNRARENTSNVAHDAGQETFAAFKIYGNSNIDGSEIQLKIFGGTRGVVLNGGGKYYLPDSKVTTPAAPGFDSLDSIWDSFIYNVRRALRGVSATLAAPATDGTVRCTIVTKEKHRLVREDSVRILNAPEDLYNNSHTVVGIVDEFTFEFIFTTSPAFGISDFEFYIAREFAFGKSDDTSINLAIKDTTGDVQNTYKSSTDAIVASTGIPTHRIGPFASTDLDPGNQRYLKRIPLTPSIKSQKTATPIGQIGIGANGVPLFSYKSETTKKYGGIKSIERISGGSGYDITNPPTVEFEPEYELDKAYASLTRVTYQGRRYKALNPARSSATVYPVHTAGIQTVGLIDWEYEGISASADVSISGSVTAINVTSGGAGYRTQPSVSIVGGGATSGNQAYATAQITDGIVTGINIVNGGAGYTSVPTITITGGGGIGATAVAVCRGPVDSINITNAGSQYTYEPTINLISGSGAVAYPSIINGKIESIIVTFGGSAYFGPPDVVITGDGIGATAFATVDLTSNIVTGITVSSKGIGYTAGATQVSIVYPGSGASFQTRLTELSINEAATGNELGSSTFVSPKTTDAFGGAVFQGENYLIYGGEYAYLYNPKQLRFLLKDSIGLDNTGALQELPPTLHSPIIGWAYDGHPIYGPYGYEDPENSAPFNAYKRIRTSYRVKTSRDALLSGLTDPLGTYIEDYEYVEGLGDLDRYNGRFCVTPEYPSGTYCYFTTITGTTGFPAFPYFIGSEFYGEADAVNWNGNGLQKNFTEDAIRYRAPFVGVDNITAKRKELDNKVDFFLALEDSTTLIVMETGETLTYIEDGIGYYSYYPFIRGGQADSLIVSSTNKFSSANIDQYLVEGGGKDYKVNDRLLFDNTGTGGDGVSAIVSQVQGVSTNRVQFFGLLYLDRYFGRLHTDAAHYLQVGDTITVSVTDNSYSRTLTTKVINGNYHLSYFTLLSAKLLDPWQATTSITSFDAVHVGNRVYRNRAGTNTTGSSAPTHTSGTATDGTVIWTYEGIRTDGNLFQDGWSSITGGSGYANGTYVNVPLTTNGDGLGAKATIVVSGGAVASVTITNFGYGYDIGDTISANDLNLGNSGGSSFSITLTQVVRQVEFHTNTPHQLKVGALVNVSGISPSSYDKTNYIVTEIITTNRFIAKRNFASTTAANVTTGNNSGPADVYINEPNLSLINGHSYVFDTSDASNSGKVLSFTLDPANTDVFTYKNITNEVRDPITNQQDSITIKMVDLPGIFYYHDVIHENTSPNAYTVTVAAKTTAHPLYNYGSGNGYYITGDKYGSVTESPALSMSRGVTYTFDQTNASNTTHAIYFSESEDAYGGTLRYEKGVVYKINGEPVTWDSYITNFATATSRGVEITPAVDSPNTLYYVCQNHLAMGNAINVKSDVTNSRFMNVVNDPLLGTHTVWFVNGTEVNYEITGGVNYTNSNITIPETGYTTGVSYSTNSIYPSGGVSTITIGDNGRNYQTLPKLSGSTRSGSGATAVATISGGITNVSVSNSGSGYNQSSLPTVVVTLPDFVDLTLENVLGSFIPDEIIIGKGVQDNNTARGKVISWDPITSVLRLQPLQNTRTGAGNKGYIMFNSGKVYNINPSQIDAVGYDDQFEFAVHDVQTGDPVKYTAAATNPISNMVVGETYYAINIGDAGRIKLALTPQLAEVGTAITITNSGTGTQSFNIRSRVYTGGNSVATIASISGTQAVVAPAVSGAGRVSEVTVTTEGTNYRTAPTVVFDDPYYGIISTVSIQSQSATNYGTSQTYTGIIQKSIAGSSATGATFTVVTDGNGTIESVTVTAGGTAYVLGDQLTISGADLGGSDGTHDAVFAVGDGGLIFVDPVSTETLLNASIDSVTVTNSGSGYLSAPTITAQGGNGINAALNSTILNEGVVSIAIEAAGEQFQSAPIINIEQKTGTGASILLKSSDMGEILKIGGENITFNYSHDRTLKPKLNTTYNLQLVRTQIIDYLDVVNGGQNFVATPEIILEGGQGSLFALEPIIQNEIIQAVTVANAGRGFTSAPTVKARISHTFVALASNSTLNFPYNAKIPSGTAITLVEVSGQLPAPLAVNTTYYAVAATTANGLADNQIKLATSLANANTETTIAFTSAPIGDPTTGQTYFTLQSTDLGDNIIAYMKPATFSIGERIYQGASNTSYTAYGFIKDWDPAGRVVSVELIEGDFVVGQPVFGEESAAFGQIHAFDRADAEFVVSPISTSSANWEKTTGFLDLNEQRVYDSNRFQEFSYDVSSSVNISDWKNPLKFAAHPAGFKVVGTQVLLQSVKKEFRPRSTNNLNPSSQFDWWQPNTNSLGTTFNGTTFITPKPSAKNTGKLATINNFALSKPDYTALVPTEVSIFGKQLLDVQKILSCIAYKIDDISDRTLSFDGSSSTIVDLTNNRVTITNHGFVANQKVTYSSGGDRFLDARDLIVTNIDYIVEETIGFLNTQYPTLTYDQAKCARDTRLVIAAWTNDLKYGGNYFSVDAAETYTTGTGIQHVGGEEAETIYAFNKARDLCLLAVTNDLPVGTYTTIVPQTDLSITNDSGGCQDVKSAITTLAAIVTGVISSPSSALPTVDTGNYPNNRSATPIGGLTNGSEYFIRYVDANTIEFSSTLSGNAIDLLSVGGGVGHSLRSFIDGTNDSFKLQTGGIDLGTKLGKTAASSQLMISINGLIANPATYTLSNNIVTFVTPPLSNSKIIAMYYDRSSYTSSFVLDQIGDEIKSFNTGVSGLGTHIFVSGVTNAIQVTGGSQFTAQSGTSYTPSTGLLVIDIGTHSLTTSNTIVIANNGITFTCDADNHASTHSYPRPSDPASGKTLAITAVAGDTITVNVGISNDQENELAGGSGYSDGTYIGIALKNKLGSGVGATADITVSGGSVTNVKLVNPGNGYNPDDVVGLSDPRVGEQLVKQFIPTNGTYAPASGEMVLTIGANHGLQAPSQFTATTATYDPNTGLMVVTVANHGFVNGDQVKFADSSITFSCGFGGATGAAAEKAYPRSTDYASDRWLQVFDVTTNTFTVQILDTIPSTNVDPHTFVSAVTNGIKKAVSTVRIANESLIFSCNYGSGGNAAYPRPTDPIGTQGKMKNVPVEAVSSTTITVNALNGTAPTNTDTHTWVGLSTYQFQPTGIAYTPTDGKMVVTLTNHGMIKGDRIKFATNSLTFTCAKDNNATQHTYPRVGDPAHGAWLTIDESNANDFTVFVGPSSDTSTHTFVSATSTAIQRAVVSYGVYKYSKGADAGDLLRANQNFIATTAYGRMMADNTGFSSIYQTKCIRDTNLLIDAVADNVEFGGNDATYDAANLYVGTAHLSGEEGQSVQVFNHARDICRQVMRNLTVTTNSYTVGTQSKDNTISNDSGSTTYSEACCIDTASTITTLWAIVTQAVGTGAHTWAGGTASNAVQSGGNYAHTFVSAVANGVQSNLGNLNNPVTNVAYTPSTGNMVITSNGHGLSTSNTLTIADNALSFTCVMDGNTATKTYPRSTDPVSGQTITITGTTTNTITVNVGASPIVNHDVTDATYDNSTGVLVLTIGSHTLTAGTSVKIANNSLSFTCANDNNTSVKTYPRPSDPYYDTAINIDSVTTNTITLNVGTNNGNLTGITRTASEQPFFQIGVSDCTFDGVDTTFNMLSGGSAQTLPASDNFLIFLNSTLQFKGNDKAYTYSGDEITFTEAPLAGMDFFGYYFGKLNQLDEIAPYFDNKKKTFTMTENTEPFSLESDNSAVQPQNNLLIFLNGVYQEPGVAYTLTGSIIEFSEAPRAGSDCILFIYTGSSSDVLISNTFQAIDQEDRIQISSEGSDRRVATVSSSTTIDSYEFTGLRPTVAEFTATVTGGQVSQVTITNPGSNYEVPPILLFQGGGGEGATAETTIETGSGRVLSVINLKGGAGYTSAPNVLVVHPLALERKQRDRVLSNSLSLASSYLTSTLSQAGTTINLQNVYFNSTQKIGFPDEGEVLIPFYDTSVTPNRWNVERILYASKNTSGNTLTVATGGRGYDGTTAAAHTVLTGTYTATSPSTTCTVSVGSPHNFTTGQRIYLDCTSGTGFDGLYTVTVTGTQTFTVEFPFPRTASGNVSLLPEVRLRSL

Physico‐chemical properties

protein length:	4454 AA
molecular weight:	473793,91020 Da
isoelectric point:	4,80940
aromaticity:	0,09452
hydropathy:	-0,13610

Domains [InterPro]

Domain ID	Category	Cluster	Start	End	Layer	Name	Pref Zone	Confidence	Evidence	Support
DC_1555	ATT	DC_1555	26	244	Novel HMM	DC_1555	N-terminal	Low	Positional only	41 proteins / 41 hits
DC_1555	ATT	DC_1555	277	415	Novel HMM	DC_1555	N-terminal	Low	Positional only	41 proteins / 41 hits
DC_0155	STR	DC_0155	514	813	Novel HMM	DC_0155	Central	Low	Positional only	112 proteins / 112 hits
DC_0146	STR	DC_0146	835	1201	Novel HMM	DC_0146	Central	Low	Positional only	81 proteins / 81 hits
IPR025924	STR	DC_0819	975	1106	InterPro cluster	YHYH domain	Central	Low	Positional only	112 proteins / 112 hits
DC_1871	RBD	DC_1871	1107	1943	Novel HMM	DC_1871	C-terminal	Low	Positional only	65 proteins / 65 hits
DC_1338	ATT	DC_1338	2190	2350	Novel HMM	DC_1338	N-terminal	Low	Positional only	78 proteins / 78 hits
DC_1338	ATT	DC_1338	2343	2860	Novel HMM	DC_1338	N-terminal	Low	Positional only	78 proteins / 78 hits
DC_1871	RBD	DC_1871	2941	3284	Novel HMM	DC_1871	C-terminal	Low	Positional only	65 proteins / 65 hits
DC_0419	STR	DC_0419	3314	3423	Novel HMM	DC_0419	Central	Low	Positional only	24 proteins / 24 hits
DC_0069	STR	DC_0069	3416	3498	Novel HMM	DC_0069	Central	Low	Positional only	57 proteins / 57 hits
DC_0069	STR	DC_0069	3485	3604	Novel HMM	DC_0069	Central	Low	Positional only	57 proteins / 57 hits
DC_0419	STR	DC_0419	3618	3888	Novel HMM	DC_0419	Central	Low	Positional only	24 proteins / 24 hits
DC_1871	RBD	DC_1871	3881	4454	Novel HMM	DC_1871	C-terminal	Low	Positional only	65 proteins / 65 hits
IPR023366	STR	IPR023366	4373	4444	Merged direct domain	ATP synthase subunit alpha, N-terminal domain-like superfamily	Central	Low	Positional only	44 proteins / 44 hits

	Name	Taxonomy ID	Lineage
Phage	Prochlorococcus phage P-HM2 [NCBI]	445696	Uroviricota > Caudoviricetes > Eurybiavirus >
Host	Prochlorococcus marinus subsp. pastoris str. CCMP1986 [NCBI]	59919	Bacteria > Cyanobacteria > Prochlorales > Prochlorococcaceae > Prochlorococcus > Prochlorococcus marinus

Coding sequence (CDS)

Genbank protein accession

ADO99864.1 [NCBI]

Genbank nucleotide accession

GU075905 [NCBI]

CDS location

range 46318 -> 59682
strand +

CDS

ATGACAAATAGTTCTTGGAGAGTTGGATCGTGGACGACGCCCACTACAACGGTTTCACAACCGCCTGTACCATCAGAAGTCAGTCCAGAGTCCAGATCCAAAATATCAACTAACATAGCAGGACAATTTCCCTCTTTTATAAGGGATAGTTTTCCTACGTTCATTGATTTTGTCAAGGAATACTATAAGTCACAAGAATTAAAGGGATATTGCATTGATATAATTCAAAACTGGTCAGATTATTATAATATTGACAATTATGGAGACTTAGTTACTACTACAACACTAATTTCCGCAGTTACAACTACTTCTACAACGATTGACGTTGCATCTACACGAGATTTCCCTGATGAGGGACTCTTGATGGTTGATAATGAGATAATTTATTACCAAAGTAAGGGAGCAACTCTATTTCAGACTTGTGCAAGAGGATTTAACGCTGTAAAGGCAGTTGGATTGGAAGATGAGTATCAATTTGAGTCAACAACTGCTGCTGCACACACTCTAGGCACTGAAGTTGTCAATTTGAACAATATTTTCCCGCTATACATGCTTGGAAAGTTCAAAGAACAGTTTTTATCAACATTTCCAAAGAATTTTGCAACTGGCGTAACAGAAAGCACTGTTATTAAACGTATTAAGGACTTTTACTCTTCAAAAGGAACAAGTAGGTCATTCCAGTTTGTTATTAGAACACTATTTGGCGTAGAATCGGAAATATCATATCCAAGAGAAAGAATATTCAAACCTAGTGATGCATTTTACACTTCTAGAGAAATTATTCGTGCAGTTCCTGTTTCTGGCGATCCTATTAACTTAGTTGGGCAAGTATTGTACCAAGAAGCGGATCCAAACGATCCAAATGTCGGATCTGCAAGAATTTACGTAAAAGGAGTCGTAGAAGTCTTTACAGCAAACGGATCAATCTACGAAATTGACGTTGACACTAATAATTCATTCGGAACGTTCGTAACTCCGTATAAAACAGTCCTAGCACAAGATTTAGGCGGTAATTTGACAGATACTGTTGTTACAGTCGATTCTACACTTGGATGGCCAGAAACAAATGGTAGATTTAGGATAGAAGACGAAATAATCAGTTATACCGATAAAACAGTCACACAATTCATCGGTTGCAACCGTGCAAGAGAAAATACAAGCAATGTAGCACATGATGCAGGACAAGAAACGTTTGCTGCGTTTAAAATTTATGGTAACTCTAATATTGATGGTTCAGAGATACAATTAAAGATATTTGGTGGTACTAGAGGTGTTGTTCTCAATGGTGGTGGAAAATACTACTTACCAGACTCAAAAGTCACTACACCCGCTGCACCAGGTTTTGATAGTCTTGATTCTATCTGGGATAGTTTTATATACAATGTTAGACGTGCTCTCAGAGGCGTCTCAGCGACCCTAGCAGCACCCGCAACAGATGGAACGGTTAGATGTACCATTGTGACAAAAGAGAAGCATAGATTGGTTAGAGAAGACTCTGTTAGAATATTAAATGCTCCAGAAGACCTTTACAACAATAGTCACACCGTTGTAGGTATTGTTGATGAGTTTACCTTCGAGTTTATCTTTACTACGTCTCCTGCTTTTGGTATATCCGATTTTGAGTTTTATATTGCTAGAGAGTTTGCTTTTGGTAAGTCAGATGACACTTCTATCAATCTTGCCATAAAAGATACTACAGGAGACGTACAGAACACTTATAAGTCATCTACAGATGCAATAGTTGCTAGTACAGGCATACCAACACATAGAATAGGTCCTTTTGCTTCTACAGACCTAGATCCTGGCAACCAGAGGTATTTGAAGCGTATTCCTCTTACACCAAGTATTAAATCGCAGAAAACTGCTACACCAATTGGTCAGATCGGTATTGGAGCGAATGGAGTCCCATTATTCTCATATAAGTCTGAAACTACGAAAAAGTATGGTGGTATTAAATCTATTGAAAGAATTAGTGGTGGATCTGGATATGACATCACCAACCCTCCTACTGTAGAGTTTGAACCAGAATATGAATTAGATAAAGCATATGCGTCTCTTACTAGAGTAACATATCAAGGTAGAAGGTATAAAGCACTAAATCCTGCTAGATCTTCCGCAACAGTGTATCCAGTACACACCGCAGGGATACAGACTGTAGGACTTATTGATTGGGAGTATGAAGGAATTTCCGCATCTGCAGATGTTTCTATCTCAGGTTCCGTAACTGCTATCAACGTTACGAGTGGAGGTGCGGGATATAGAACCCAACCAAGCGTTTCTATCGTAGGTGGAGGAGCAACAAGCGGAAACCAAGCATATGCTACCGCACAAATCACGGACGGAATTGTAACTGGCATCAATATAGTAAATGGTGGTGCGGGATATACGAGTGTTCCTACTATAACCATCACAGGTGGCGGAGGAATAGGAGCAACTGCAGTAGCAGTTTGTAGAGGTCCTGTAGATAGTATCAACATAACAAACGCAGGATCCCAGTATACATACGAACCAACTATCAATTTGATTAGTGGTAGTGGTGCTGTTGCATATCCATCAATCATTAACGGAAAGATAGAAAGTATAATTGTTACATTTGGTGGTAGTGCGTATTTCGGTCCTCCTGATGTTGTAATTACTGGAGATGGTATTGGTGCAACCGCATTTGCTACTGTTGATCTAACTTCAAACATTGTTACTGGTATTACAGTGTCCAGTAAAGGTATTGGTTATACTGCGGGTGCTACACAGGTTAGTATCGTATATCCTGGTTCTGGTGCGTCATTCCAAACTAGACTTACAGAATTATCAATAAACGAAGCAGCAACTGGTAATGAATTAGGTAGTAGTACATTTGTATCACCTAAGACCACTGATGCATTTGGTGGTGCGGTATTCCAAGGTGAGAACTATTTGATCTATGGTGGAGAGTATGCGTACCTCTATAATCCAAAACAACTAAGATTCTTACTTAAGGATAGTATTGGTCTTGATAACACTGGTGCTCTACAAGAATTACCTCCTACACTACATTCCCCGATTATTGGTTGGGCATATGACGGACATCCAATATACGGACCTTATGGATATGAAGATCCTGAGAACAGTGCACCATTCAACGCATATAAACGTATTAGAACCAGTTACAGAGTCAAGACTAGCAGAGATGCTCTTCTAAGCGGTCTTACAGACCCTCTAGGGACTTATATTGAAGATTATGAGTATGTGGAAGGATTAGGCGATTTAGACCGCTATAATGGAAGATTCTGCGTTACTCCAGAATATCCAAGTGGAACATATTGTTATTTTACAACTATTACAGGTACAACTGGATTTCCTGCGTTTCCTTACTTTATTGGTTCAGAGTTTTATGGAGAAGCAGATGCGGTCAACTGGAATGGTAATGGACTGCAGAAAAACTTTACAGAAGACGCAATACGCTACAGAGCTCCATTTGTAGGTGTTGATAACATTACAGCAAAAAGAAAAGAGTTAGACAACAAAGTTGACTTCTTCTTAGCACTAGAAGACAGTACAACTCTTATTGTCATGGAAACTGGTGAAACACTTACTTACATCGAGGATGGTATTGGATATTATAGTTACTATCCGTTTATTAGAGGAGGTCAAGCGGATTCTCTAATTGTATCATCTACAAATAAGTTTTCTTCCGCAAACATTGATCAATACCTTGTAGAGGGTGGTGGTAAAGATTATAAGGTTAACGATAGACTGTTATTTGATAATACTGGAACTGGTGGAGATGGTGTAAGTGCAATTGTATCTCAAGTCCAAGGTGTAAGTACAAACAGAGTACAATTCTTTGGTTTGTTATACTTGGATAGGTACTTTGGAAGACTACACACTGATGCAGCACATTACTTACAAGTTGGAGATACAATTACTGTATCCGTAACTGACAATTCATATTCACGCACACTTACTACTAAAGTAATCAATGGTAACTATCATTTGAGTTACTTTACTCTACTTTCCGCAAAACTACTTGATCCATGGCAAGCAACCACTTCAATAACATCCTTCGATGCGGTTCATGTAGGAAATAGAGTTTATAGAAATAGAGCAGGAACTAACACCACTGGATCATCAGCTCCTACACATACAAGTGGAACTGCTACTGATGGTACAGTTATATGGACATATGAAGGAATACGTACAGATGGTAATTTATTCCAAGATGGATGGTCTTCCATTACAGGTGGGTCAGGCTATGCAAATGGCACATATGTAAATGTTCCACTAACAACCAATGGTGATGGTCTAGGTGCAAAGGCAACCATTGTTGTATCTGGTGGTGCAGTAGCAAGTGTGACTATTACAAACTTTGGATATGGGTATGATATTGGTGATACTATATCTGCAAACGATCTCAACTTGGGTAATAGCGGTGGATCATCATTTAGTATTACACTAACCCAAGTGGTACGACAAGTAGAGTTTCATACTAATACACCACATCAACTTAAAGTAGGAGCTCTTGTTAATGTCTCAGGTATCTCACCTTCGTCTTATGATAAGACAAATTATATTGTAACTGAGATCATTACAACCAATAGATTTATTGCTAAAAGAAATTTTGCCTCAACCACTGCAGCAAATGTCACAACAGGTAATAATAGTGGTCCTGCAGACGTTTATATTAATGAACCAAACTTATCTCTAATAAATGGACACTCTTATGTCTTTGATACATCAGATGCAAGTAATAGTGGTAAAGTATTGTCATTTACACTTGATCCTGCTAATACTGATGTATTCACTTACAAAAACATTACAAATGAAGTCAGAGATCCAATAACTAACCAACAAGACTCAATAACAATCAAAATGGTAGATTTGCCTGGCATTTTCTACTATCATGACGTAATACACGAAAATACATCACCAAACGCATACACAGTGACTGTTGCAGCAAAAACTACTGCACATCCTTTGTATAACTATGGATCTGGCAATGGATATTATATTACAGGTGACAAATA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Protein

Domains

Domains [InterPro]

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Taxonomy

Coding sequence (CDS)

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Genome Context

Genome Context

Tertiary structure