Protein

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Genbank accession
AMM44863.1 [GenBank]
Protein name
pectate lyase
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
Protein sequence
MGTIELNGVVHSNVGKVWYVSTQGNDSNPGTENEPLATVQSAVTKASSGDLIYAKEGTYRPNSISTWGAGLYDQNKQLIFAGDPGRTIFLMDGNEHSARDQHALSTRNPGTKIYHIIFDVIFRDNQNNSNETSLFNTSHIDSKWSEQTKGFVYNCVFKTNKRAAMNYDGSGGGKLYLENCLFDVPDNFIGSYNYPNNYELSNCVTNKSWYKEGLAKKACLENCNFDQDYRIISAPGSWIDTGIYEDKDGSPADLGVYGGRYAWDFDFDVNSIMWVGPAIDEIPGQADIAIPSDIHGSIRVTNHDDIEAKVAILHRDNIISSVQVWEKNLLPSLINIPPPYDNNNNNGWLKSSLGVRLTNELLGISVDRHGSPFQRQAIPASINVFTRGNESLVSSIGVRISNELNSRVLELRGVWDEDISGSIEISSLNYNDLFTRLGVRIPSVLYGQSYIPQNADESLPSSITVTHSDWDHITGKVIVRPEAILGGHVITNNGREDIPSKISIVRGHSILWSNMTVKYRTELNLVTDIIGVGDSDLKSIIDPRYRGNDDAQVSIRVNSPYVHDNEYGKVFKSSIRIIAAGNSDIQSSLSIPILNKMTGISDIIGVNESNIQGSIRINQYDSLPSSIRISPRNKMTSIIEIRPPERINGTVSVNKDSYVRQSLDKFNFGQDPTLTMGYSANKAEKFRTLVGFDISDITNLREGYSIDEVHLKLRFTIGRNPKSSLSLYEAIGDWTELGVTWSNQPRIGGLVSKKYVTDSTEGYITFDITDYIRNAKEQGITYLSFYLNATDELENNTTSFFSKESGNGPTIEYKYYDEVLRNSSKADLDSNVFIYSIGHKDQRSKINVKGIVWSEIPSSILVQRPGDFLSSITVTRSDMSGSMDVIARDDSDIKSSLTVQESLYFDIGGSIIPSKKSMPSEIYVAERYDVSSSLSVRVLDVSEIISWMTVSNPSRPGSIYVIPYVDLEGSISVRREAYDDLESGYFGVSVPQISLSFYVLPHEDLNSSISIRGEEKHELNSSISVNRPDNPSSIYVVPYYDRRGVIRVRRSTRADQISTLAISRPQFSGSLEVMSGDNLKGSIVVNRYDEEILNSQLVISHPDLRGSIHPKIAYDTSGTITVNKLDKDDLISTSYVLHRSDIKGSLEVWGASMIPSSIRVLSGYLRGTIGVPANDETEIEGSITVRQTDESWIKSQIDVWQFRLLPSKIVTRRSEESDIKSSIEVRQLESASIPSKVDIWKYDALKSKIDVRRDAKEFLDSSVYVLFSSDIKSFINVRGYSDVNSSLRVVYGSTSDIDSNLTPRLIGYDDIDTSVFVMYRVNRDLRSKLRVGASNKMTAILDITDAPREYTTIYAVKDSFVRSGMPTLNYGLDKSIPVGKSNNEILRSLIGFDISQIPSGDTIDKVELVINYSTLRDKDIRAYAIGNDWTELGVTWNNHPNSDQYVNSNNPKCTVDTLREVIKFDVTEYVRDGHYDVGDQFVNFLLKAFNESQDGYLNLMSRESGRIPRLEVVHYNPEVWSYNRAHLDAKIDVKYGGLSQIPSTVTVNTYDGYKDTYGKINVLSPSDFESNLSTRIAVSRPDIDGSVNIIGRGDSDIESSITVMISTVEELPSSLVVSQINLGSTIVVPDRSEIGGSITPRILDNSDLLTWITVNAKDRPSSIYVPYHEDLSSSIVVNGYKDYVIDSEIAISRPELEGSILVKIASDNDMDSSISVRNTKDEDLDSTLIVTYGDFKVLLSKINVKVTYHPGENTLPGTIWVGDAGSDLGSIIALSKPSLPSVIGVPYNEDADIESSIAVSRSTIPGSILISNRDDMSGQLEVFYTDSISSELTVTVPSLSGSISVPYSYDMKSKLDIVKVEKEYLNSTLIILERSDLDSSVDVYKHSSIDSIIRVISDGIEGTLIIPRRSDLPSTVDVYKYMDVDGIIRVISGNLGSKISVRRDADHDMDSRLYVVNVNGDSLPSSMFIVTEKDYIKSRIAVRFESPLYGEVDLIGVGESDLVSILRPVVFSDLPAQLSITITNKMTGEADFIPVGDSDVPGTIDLQPAANLPGSITVLMKDESDIEGTITVRAKDNRDLISKLDIRYRGTSDLDSHIRIPYTNKMTGLVDEISLLTTDEGFGDDVVIELKTYRTVIDESSVEEKSYIAGRIYYDDAEFLEDIQVGSSTEDSSSAISHSVIHIDRTDSGNASDSLVTKEFVSFDAETSVESISEITVPVCDSYKSTSSIVELGILGCDSSEGVDFVLFRGIVYYDSAAGEDCYEILINREDSVSHNECSNVVLELCDSSVPNELFLWDILLADQSTGEDCIDLQFEICDNAYSVHTIVDGIQLADHCDEGKGTDSVPVREFVSPDSGVTEHRVVGIYIELCQEVVVTENPVIYLSTCDDGEGSDWTPVREFISPDLGYGQDSLVELMLEVEYEILVNDHVADIDLLIHCDSGNGIDRVAVREFITQDSGYSEDQVSNVNIVVCDDYEVEYLTQIDLSYCDEAVAQELLTKEVMVKDEGSSDEQVVLIHLKDILDDDSSGNDCYQTVEVVVCEINSVTENVLDIELLVSDIGIGLEGHNVLFNIDEGSTAVEQVVDIDVVTCDQGSGIDLIIERGVLVSDSSESEENVVTIHLTNPSDEGSGVDCYLVEVLVSDLGQGNDIIGERGVLSSDPVFGIETSIVAIPTCDTTNGFESGTYIENPVCDGSSGLDVIVERGVVVRELLDSDELEFIEIPVSDTFSEDSRVIHIELPVVDEGNGEDISTEKEVLVSDSSEAQDTVNSVHVINLCDSGQSKDSLSNVNVVACDNAKGSDRLDEKMVVATDSAIAIETSIILIVTEGDASAGTDSAFMTPVLCDEGKGHDSTKEKMVISVDEGYGNSECWISLDLTDTAQYFDTKELMLPAEDEGNGYDNVTSREFVLEDNSDVVDIIVDILLNVEENYTSEDILTVGINGCDDGAGYDFITHRETVLIDNGDSDSHVVDIHLIDIEDNATVIEIPVIRPLVCDSGTIDIEIAKIDKYLFLSDSGTDCESVFIKGTENTEVRDLSYPGQRNHPSDVSLGPIIDGISPTKPNETKTTVWTSKPRVSYILSKYDKALGLWQGDVNINVRLQETSQGIGGYGRFKVFIDDELVVSASIPTGGSQDLNFYYDGLKSKSGGYRLEYEGTFCDERHCQWSRDVFFEFTYTGEFPRGIGDNGADFVLNPDYPANPFIDPYGTSILSNSINCDDDPSRIKLYVSTCGKNLDKYEWSMFDDPDYRDIEVLYHNLAIEARSNKLDRWYVIASDCAVSDNNIIMIELNQSDEGTSVEIPIMDKTLLVGDSADSCEAIFVYGHKNTEDRDLSYPGESTHPTDKVLNPEIINGESATIVGISDYNDWTAGTNQTVRPSRYIGLFKGTITFELRAGVSSDGSNFASSSGRATIYVDGVAYRMAEASASNRGGTPTRITIPFDGWNSPSGGFSAKVTAVPASGHRCTATLSVISLNGTFYPENSLIPDGSALNPKYPGDYFIDPYDRDIFPLGKYCGDNSQVYLYVNSCKQSLHDYNWSMLGHPDYERIKGLYQNTVNHKPYPKSINKNFVLAADCGYGEDESSLAFVLTDNGTLDDEKAILNKHIIVRDSADSIETLVIDQGFSDEVTSEDGMTFGLILCDNAVFVDRITDREFVIQEYIKVVECLKVHVSSDDTSSSEEHVASVHLYPSEDSGTAYDRQLSNGPATSDYGYGNDCYNNVEVVVCELSDSISKVVQLDLSLCEITEAIDFLSGKEFNTWDLDGKGTDCLQLEIPGCESPVIEEDLIYIDLGTHYDESEGQDSVVYKELPVDDEATALDELSFSIELCDSDKFLDGIALEMFYCDTALGFDRITDKELPVIDSSSVDESSLLELEFCEEVVSEFNVVLDLVSHCDTAEGRDILPNKEVPVNDNAESDECLVNNVLVSDEFGFEDGSLEDAAEVVIELCDTAEGIDIVPYKEILVSEELQSIETARLDLTLCDIGKVKDVVVQIDLNFTDESTGIDLVPYKEMPIEESAVLSDCITLESLFCDTGTVKDKDESVIIDLSQCDSGIGIDIVPYKELPVSDSIVSDDCLILELVLCEFGHTRDWVPMMEFCVCDWGTDPQDPGPPNFWCCGRYRPGHIPHPPYFPGDPGYPYDPDHPDYGKPVYPDDPNYPGPPYNPGDPGYPADCADGGTVYPGDVCYPGRPLYPGDPGYPSLPGDPDYGEPIYPGDPEYPPILNPGDPGYPYEPSDPGYGDPVYPGDPDYPKAPGDPTDEPESIIGHPPTPDVGVAIDCITIEQFLCDDGEGQDKLGFRRVPYHIDNDWIVDPFTWKCGPNFEWDIEEIEFEIKPIEIQVEVTEYKFNFRELEFKFRETPEKFEFADKLMFKACPLDIFEFQEAKPIVIEMIECPFTIQCTELEED
Physico‐chemical
properties
protein length:4401 AA
molecular weight: 486229,37970 Da
isoelectric point:4,29302
aromaticity:0,08180
hydropathy:-0,26353

Domains

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Domain architecture
AMM44863.1
1 4401 aa
STR 13–233 · CBM 650–809 · CBM 1350–1512 ·
ATT Attachment Domain STR Structural Domain RBD Receptor-Binding Domain CBM Carbohydrate-Binding Module LEC Lectin-like Domain ENZ Enzymatic Domain CHP Intramolecular Chaperone LNK Linker/Spacer Domain TAS Tail-Associated Structural TTP Tail Tubular Protein UNK Uncharacterized Domain Unmapped
Proteins with similar domain architecture

Tail Spike Domain Segmentation

Segmented into three structural domains: N-terminal, central, and C-terminal.

Domain layout
AMM44863.1
1 4401 aa
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 82 82 0,7471
Central domain 83 3786 3705 0,2126
C-terminal 3787 4401 614 0,0166
N-terminal Central domain C-terminal

Taxonomy

Phage
Bacillus phage SP-15 [NCBI] · taxon 1792032
Viruses Duplodnaviria Heunggongvirae Uroviricota Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Genbank protein accession
AMM44863.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KT624200 [NCBI]
CDS location
range 56443 -> 69648
strand +
CDS
TTGGGGACTATTGAGCTAAATGGAGTAGTTCATTCCAATGTTGGAAAAGTATGGTATGTCAGCACTCAGGGTAATGATTCAAATCCAGGTACAGAAAACGAACCCTTAGCAACAGTCCAGTCAGCTGTAACTAAAGCTTCTTCAGGTGATTTGATCTATGCTAAAGAAGGTACCTACCGACCTAACTCCATAAGTACTTGGGGAGCTGGATTGTATGATCAGAATAAACAATTAATATTCGCAGGAGATCCAGGTAGAACTATATTTTTAATGGATGGTAATGAGCACAGTGCAAGGGATCAACATGCTCTATCTACTCGTAATCCTGGGACTAAGATCTATCATATTATATTTGATGTTATTTTTAGGGATAACCAGAATAACAGCAATGAGACTTCTTTATTTAACACATCTCATATTGACTCTAAATGGTCTGAACAGACTAAAGGCTTTGTTTATAACTGTGTATTTAAGACTAACAAAAGAGCAGCAATGAACTATGATGGTAGTGGAGGCGGTAAACTTTATCTGGAAAACTGTCTATTCGATGTTCCTGATAATTTTATCGGATCCTACAATTATCCTAATAATTATGAGCTATCTAACTGTGTGACTAATAAGTCGTGGTACAAAGAAGGTTTGGCTAAGAAAGCATGCCTTGAAAATTGTAACTTTGATCAAGATTATCGGATTATTTCAGCTCCTGGTAGTTGGATAGATACTGGAATTTACGAGGATAAAGACGGTAGTCCTGCTGACTTGGGAGTTTATGGTGGTCGTTATGCTTGGGACTTTGACTTTGATGTCAACTCTATAATGTGGGTAGGTCCAGCTATCGATGAAATCCCTGGTCAGGCTGACATCGCTATACCTAGTGATATTCATGGTTCCATCCGTGTTACTAATCACGACGACATAGAAGCTAAAGTAGCTATTCTTCATCGGGATAATATCATATCTTCCGTACAAGTATGGGAAAAGAATTTACTCCCTTCTTTAATTAATATTCCTCCACCTTACGACAACAATAACAACAATGGGTGGTTAAAGTCTAGTTTAGGTGTTAGATTAACAAATGAATTATTAGGTATTTCTGTGGATCGTCATGGTTCGCCATTCCAAAGACAAGCGATACCTGCTAGCATCAATGTATTTACTAGAGGTAACGAGAGTCTAGTCTCGAGTATTGGGGTGCGTATATCTAATGAGCTTAATTCTCGTGTTCTTGAACTCCGAGGAGTTTGGGATGAAGATATATCAGGTTCTATAGAAATTAGTAGTCTAAATTATAACGACTTATTCACTAGATTAGGTGTTAGAATACCATCCGTACTTTATGGTCAGTCCTATATACCTCAGAATGCTGATGAGAGCCTACCGAGTTCAATCACAGTTACTCATAGTGATTGGGATCATATTACAGGTAAAGTGATAGTAAGACCTGAGGCTATACTTGGAGGTCACGTTATTACTAACAATGGACGGGAAGATATTCCTTCCAAAATTAGTATTGTAAGAGGTCATAGTATACTATGGTCTAACATGACTGTAAAGTATAGAACTGAACTCAATTTAGTAACGGATATCATAGGTGTAGGAGATAGTGATCTTAAATCGATCATTGATCCAAGGTACAGAGGTAACGACGATGCTCAAGTATCTATCAGAGTAAATAGTCCTTATGTACATGATAACGAGTACGGTAAAGTATTCAAATCGTCAATCCGAATTATAGCTGCTGGGAATAGTGATATTCAATCCAGCTTAAGTATACCTATTCTGAATAAAATGACAGGTATATCGGATATCATCGGAGTCAATGAATCTAATATTCAAGGTTCTATCAGAATTAATCAGTACGACAGCTTACCGTCATCTATCAGGATTTCTCCTCGTAATAAGATGACGTCAATAATTGAGATTCGACCACCTGAAAGAATTAATGGAACAGTCTCAGTTAATAAGGACTCTTACGTACGTCAGAGTCTAGATAAGTTTAACTTCGGTCAAGATCCTACTCTGACTATGGGTTATTCTGCTAATAAAGCAGAAAAGTTCAGAACTTTAGTTGGATTCGATATCTCTGATATCACTAACTTAAGAGAAGGGTACAGTATTGACGAGGTACACTTAAAGTTAAGATTCACTATAGGACGTAATCCTAAATCTAGTTTATCACTGTATGAAGCAATCGGTGACTGGACTGAATTAGGTGTTACTTGGAGTAACCAACCTCGAATCGGTGGCTTAGTTTCTAAGAAATACGTTACGGATAGTACAGAAGGTTATATCACTTTTGATATCACTGACTATATACGTAATGCTAAAGAACAAGGAATTACATATTTATCGTTCTACTTGAATGCTACTGATGAGTTGGAAAATAACACAACATCATTCTTCTCTAAAGAGAGTGGTAACGGACCTACGATAGAATACAAGTATTACGATGAAGTTCTTCGTAATTCAAGTAAAGCTGACTTAGATTCCAACGTGTTTATCTACTCTATAGGACATAAGGATCAACGCTCTAAGATCAACGTCAAAGGTATAGTATGGTCGGAAATACCTTCATCTATACTAGTCCAACGTCCAGGTGATTTCTTATCCAGCATTACTGTCACTAGATCTGACATGTCTGGTAGCATGGACGTTATCGCACGTGATGATTCAGATATCAAGTCCAGCTTGACTGTTCAAGAGTCATTGTACTTTGATATTGGTGGTAGCATTATTCCAAGTAAAAAGTCAATGCCATCGGAGATATACGTAGCTGAGAGGTATGACGTATCATCAAGCTTGTCTGTAAGAGTTCTAGATGTATCCGAAATAATATCTTGGATGACAGTAAGTAATCCGAGTAGACCTGGTAGTATTTACGTTATCCCTTACGTAGACCTAGAAGGTAGCATTTCAGTACGTCGTGAAGCTTATGATGACTTAGAGTCAGGTTATTTTGGAGTAAGTGTTCCACAAATTAGTTTGAGTTTCTATGTACTCCCTCACGAGGACTTGAATTCAAGTATCTCAATCAGAGGTGAAGAGAAACATGAACTAAACTCTAGTATCTCAGTAAATAGACCAGATAATCCAAGTTCTATATACGTAGTACCGTACTACGATAGACGAGGTGTTATCCGAGTTAGAAGAAGTACTAGAGCGGATCAAATATCGACCCTAGCTATTTCAAGACCTCAGTTCTCAGGAAGCTTAGAGGTAATGAGTGGGGATAACCTAAAAGGTTCGATCGTAGTTAATCGTTACGACGAAGAGATACTAAATTCTCAATTAGTGATCTCGCATCCTGATCTTAGAGGATCTATCCATCCTAAAATAGCTTACGATACTTCAGGTACGATTACTGTCAATAAACTTGATAAAGATGACTTAATCTCAACTTCTTACGTATTACATCGATCTGATATTAAAGGTTCATTAGAGGTTTGGGGAGCATCAATGATACCTTCGAGTATCCGAGTACTTTCAGGATATCTTAGAGGTACAATCGGAGTCCCTGCTAATGATGAAACTGAGATCGAAGGCTCGATTACAGTAAGACAAACGGATGAGTCTTGGATCAAGTCACAAATTGACGTTTGGCAATTTAGATTATTACCATCCAAAATCGTAACTAGACGTAGTGAAGAATCCGACATTAAGTCGTCAATTGAAGTAAGACAATTAGAATCGGCATCAATCCCATCTAAAGTAGATATATGGAAGTACGATGCATTAAAATCTAAGATTGATGTACGAAGAGATGCTAAGGAATTCTTAGACTCCTCAGTATATGTCTTATTCTCAAGTGATATTAAGTCATTCATTAACGTAAGAGGTTACTCAGATGTCAATTCCTCACTTAGAGTAGTTTATGGATCAACTTCAGATATTGATTCTAATTTAACTCCAAGGTTAATAGGATACGACGATATTGATACGAGCGTATTTGTAATGTATCGAGTCAATCGTGACTTGAGGTCTAAGTTACGAGTAGGTGCCTCAAACAAGATGACTGCGATTCTAGATATAACTGATGCTCCTAGAGAGTATACGACTATCTATGCAGTTAAGGATTCATTCGTCAGAAGTGGGATGCCAACACTTAACTACGGATTGGATAAATCAATACCTGTTGGTAAGTCCAACAACGAGATACTAAGATCATTGATCGGATTTGATATCAGTCAAATTCCATCTGGAGACACTATTGATAAGGTTGAATTAGTAATTAATTATTCAACTCTTAGAGACAAGGACATTAGAGCTTATGCAATCGGGAACGATTGGACTGAATTAGGGGTAACTTGGAATAACCATCCTAACTCCGATCAGTACGTAAATTCTAATAATCCTAAATGTACAGTAGATACTTTAAGAGAGGTAATCAAGTTTGATGTTACCGAGTACGTACGTGACGGTCATTATGACGTAGGCGACCAGTTCGTTAACTTCTTACTTAAAGCTTTCAATGAGAGTCAAGATGGTTACTTAAATCTAATGTCTCGTGAGAGTGGACGGATTCCTCGATTAGAAGTAGTCCATTACAATCCAGAAGTATGGAGCTACAATAGAGCTCATCTAGATGCTAAAATTGATGTAAAATACGGTGGACTTAGTCAAATACCTTCCACGGTAACTGTAAATACTTACGATGGATATAAGGATACCTACGGTAAAATCAACGTTTTATCTCCATCTGACTTCGAGTCTAACTTAAGTACTAGGATAGCTGTAAGTCGACCAGATATTGATGGTTCTGTTAATATCATAGGTCGTGGAGATAGTGATATTGAATCAAGTATCACAGTAATGATAAGTACAGTTGAAGAGCTCCCTTCATCACTCGTAGTAAGTCAAATCAACTTAGGATCAACTATTGTTGTACCTGATAGGTCTGAAATTGGAGGTTCAATAACTCCACGAATTCTCGATAATTCAGACTTGTTGACTTGGATTACAGTAAATGCTAAGGATAGACCTTCATCGATTTACGTTCCTTA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Genome Context

Tertiary structure

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