Protein

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Genbank accession
AMM44863.1 [GenBank]
Protein name
pectate lyase
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,58
Protein sequence
MGTIELNGVVHSNVGKVWYVSTQGNDSNPGTENEPLATVQSAVTKASSGDLIYAKEGTYRPNSISTWGAGLYDQNKQLIFAGDPGRTIFLMDGNEHSARDQHALSTRNPGTKIYHIIFDVIFRDNQNNSNETSLFNTSHIDSKWSEQTKGFVYNCVFKTNKRAAMNYDGSGGGKLYLENCLFDVPDNFIGSYNYPNNYELSNCVTNKSWYKEGLAKKACLENCNFDQDYRIISAPGSWIDTGIYEDKDGSPADLGVYGGRYAWDFDFDVNSIMWVGPAIDEIPGQADIAIPSDIHGSIRVTNHDDIEAKVAILHRDNIISSVQVWEKNLLPSLINIPPPYDNNNNNGWLKSSLGVRLTNELLGISVDRHGSPFQRQAIPASINVFTRGNESLVSSIGVRISNELNSRVLELRGVWDEDISGSIEISSLNYNDLFTRLGVRIPSVLYGQSYIPQNADESLPSSITVTHSDWDHITGKVIVRPEAILGGHVITNNGREDIPSKISIVRGHSILWSNMTVKYRTELNLVTDIIGVGDSDLKSIIDPRYRGNDDAQVSIRVNSPYVHDNEYGKVFKSSIRIIAAGNSDIQSSLSIPILNKMTGISDIIGVNESNIQGSIRINQYDSLPSSIRISPRNKMTSIIEIRPPERINGTVSVNKDSYVRQSLDKFNFGQDPTLTMGYSANKAEKFRTLVGFDISDITNLREGYSIDEVHLKLRFTIGRNPKSSLSLYEAIGDWTELGVTWSNQPRIGGLVSKKYVTDSTEGYITFDITDYIRNAKEQGITYLSFYLNATDELENNTTSFFSKESGNGPTIEYKYYDEVLRNSSKADLDSNVFIYSIGHKDQRSKINVKGIVWSEIPSSILVQRPGDFLSSITVTRSDMSGSMDVIARDDSDIKSSLTVQESLYFDIGGSIIPSKKSMPSEIYVAERYDVSSSLSVRVLDVSEIISWMTVSNPSRPGSIYVIPYVDLEGSISVRREAYDDLESGYFGVSVPQISLSFYVLPHEDLNSSISIRGEEKHELNSSISVNRPDNPSSIYVVPYYDRRGVIRVRRSTRADQISTLAISRPQFSGSLEVMSGDNLKGSIVVNRYDEEILNSQLVISHPDLRGSIHPKIAYDTSGTITVNKLDKDDLISTSYVLHRSDIKGSLEVWGASMIPSSIRVLSGYLRGTIGVPANDETEIEGSITVRQTDESWIKSQIDVWQFRLLPSKIVTRRSEESDIKSSIEVRQLESASIPSKVDIWKYDALKSKIDVRRDAKEFLDSSVYVLFSSDIKSFINVRGYSDVNSSLRVVYGSTSDIDSNLTPRLIGYDDIDTSVFVMYRVNRDLRSKLRVGASNKMTAILDITDAPREYTTIYAVKDSFVRSGMPTLNYGLDKSIPVGKSNNEILRSLIGFDISQIPSGDTIDKVELVINYSTLRDKDIRAYAIGNDWTELGVTWNNHPNSDQYVNSNNPKCTVDTLREVIKFDVTEYVRDGHYDVGDQFVNFLLKAFNESQDGYLNLMSRESGRIPRLEVVHYNPEVWSYNRAHLDAKIDVKYGGLSQIPSTVTVNTYDGYKDTYGKINVLSPSDFESNLSTRIAVSRPDIDGSVNIIGRGDSDIESSITVMISTVEELPSSLVVSQINLGSTIVVPDRSEIGGSITPRILDNSDLLTWITVNAKDRPSSIYVPYHEDLSSSIVVNGYKDYVIDSEIAISRPELEGSILVKIASDNDMDSSISVRNTKDEDLDSTLIVTYGDFKVLLSKINVKVTYHPGENTLPGTIWVGDAGSDLGSIIALSKPSLPSVIGVPYNEDADIESSIAVSRSTIPGSILISNRDDMSGQLEVFYTDSISSELTVTVPSLSGSISVPYSYDMKSKLDIVKVEKEYLNSTLIILERSDLDSSVDVYKHSSIDSIIRVISDGIEGTLIIPRRSDLPSTVDVYKYMDVDGIIRVISGNLGSKISVRRDADHDMDSRLYVVNVNGDSLPSSMFIVTEKDYIKSRIAVRFESPLYGEVDLIGVGESDLVSILRPVVFSDLPAQLSITITNKMTGEADFIPVGDSDVPGTIDLQPAANLPGSITVLMKDESDIEGTITVRAKDNRDLISKLDIRYRGTSDLDSHIRIPYTNKMTGLVDEISLLTTDEGFGDDVVIELKTYRTVIDESSVEEKSYIAGRIYYDDAEFLEDIQVGSSTEDSSSAISHSVIHIDRTDSGNASDSLVTKEFVSFDAETSVESISEITVPVCDSYKSTSSIVELGILGCDSSEGVDFVLFRGIVYYDSAAGEDCYEILINREDSVSHNECSNVVLELCDSSVPNELFLWDILLADQSTGEDCIDLQFEICDNAYSVHTIVDGIQLADHCDEGKGTDSVPVREFVSPDSGVTEHRVVGIYIELCQEVVVTENPVIYLSTCDDGEGSDWTPVREFISPDLGYGQDSLVELMLEVEYEILVNDHVADIDLLIHCDSGNGIDRVAVREFITQDSGYSEDQVSNVNIVVCDDYEVEYLTQIDLSYCDEAVAQELLTKEVMVKDEGSSDEQVVLIHLKDILDDDSSGNDCYQTVEVVVCEINSVTENVLDIELLVSDIGIGLEGHNVLFNIDEGSTAVEQVVDIDVVTCDQGSGIDLIIERGVLVSDSSESEENVVTIHLTNPSDEGSGVDCYLVEVLVSDLGQGNDIIGERGVLSSDPVFGIETSIVAIPTCDTTNGFESGTYIENPVCDGSSGLDVIVERGVVVRELLDSDELEFIEIPVSDTFSEDSRVIHIELPVVDEGNGEDISTEKEVLVSDSSEAQDTVNSVHVINLCDSGQSKDSLSNVNVVACDNAKGSDRLDEKMVVATDSAIAIETSIILIVTEGDASAGTDSAFMTPVLCDEGKGHDSTKEKMVISVDEGYGNSECWISLDLTDTAQYFDTKELMLPAEDEGNGYDNVTSREFVLEDNSDVVDIIVDILLNVEENYTSEDILTVGINGCDDGAGYDFITHRETVLIDNGDSDSHVVDIHLIDIEDNATVIEIPVIRPLVCDSGTIDIEIAKIDKYLFLSDSGTDCESVFIKGTENTEVRDLSYPGQRNHPSDVSLGPIIDGISPTKPNETKTTVWTSKPRVSYILSKYDKALGLWQGDVNINVRLQETSQGIGGYGRFKVFIDDELVVSASIPTGGSQDLNFYYDGLKSKSGGYRLEYEGTFCDERHCQWSRDVFFEFTYTGEFPRGIGDNGADFVLNPDYPANPFIDPYGTSILSNSINCDDDPSRIKLYVSTCGKNLDKYEWSMFDDPDYRDIEVLYHNLAIEARSNKLDRWYVIASDCAVSDNNIIMIELNQSDEGTSVEIPIMDKTLLVGDSADSCEAIFVYGHKNTEDRDLSYPGESTHPTDKVLNPEIINGESATIVGISDYNDWTAGTNQTVRPSRYIGLFKGTITFELRAGVSSDGSNFASSSGRATIYVDGVAYRMAEASASNRGGTPTRITIPFDGWNSPSGGFSAKVTAVPASGHRCTATLSVISLNGTFYPENSLIPDGSALNPKYPGDYFIDPYDRDIFPLGKYCGDNSQVYLYVNSCKQSLHDYNWSMLGHPDYERIKGLYQNTVNHKPYPKSINKNFVLAADCGYGEDESSLAFVLTDNGTLDDEKAILNKHIIVRDSADSIETLVIDQGFSDEVTSEDGMTFGLILCDNAVFVDRITDREFVIQEYIKVVECLKVHVSSDDTSSSEEHVASVHLYPSEDSGTAYDRQLSNGPATSDYGYGNDCYNNVEVVVCELSDSISKVVQLDLSLCEITEAIDFLSGKEFNTWDLDGKGTDCLQLEIPGCESPVIEEDLIYIDLGTHYDESEGQDSVVYKELPVDDEATALDELSFSIELCDSDKFLDGIALEMFYCDTALGFDRITDKELPVIDSSSVDESSLLELEFCEEVVSEFNVVLDLVSHCDTAEGRDILPNKEVPVNDNAESDECLVNNVLVSDEFGFEDGSLEDAAEVVIELCDTAEGIDIVPYKEILVSEELQSIETARLDLTLCDIGKVKDVVVQIDLNFTDESTGIDLVPYKEMPIEESAVLSDCITLESLFCDTGTVKDKDESVIIDLSQCDSGIGIDIVPYKELPVSDSIVSDDCLILELVLCEFGHTRDWVPMMEFCVCDWGTDPQDPGPPNFWCCGRYRPGHIPHPPYFPGDPGYPYDPDHPDYGKPVYPDDPNYPGPPYNPGDPGYPADCADGGTVYPGDVCYPGRPLYPGDPGYPSLPGDPDYGEPIYPGDPEYPPILNPGDPGYPYEPSDPGYGDPVYPGDPDYPKAPGDPTDEPESIIGHPPTPDVGVAIDCITIEQFLCDDGEGQDKLGFRRVPYHIDNDWIVDPFTWKCGPNFEWDIEEIEFEIKPIEIQVEVTEYKFNFRELEFKFRETPEKFEFADKLMFKACPLDIFEFQEAKPIVIEMIECPFTIQCTELEED
Physico‐chemical
properties
protein length:4401 AA
molecular weight: 486229,37970 Da
isoelectric point:4,29302
aromaticity:0,08180
hydropathy:-0,26353

Domains

Domains [InterPro]
IPR011050
13–210
IPR011050 IPR055372 IPR055372
IPR052052
14–86
IPR052052 NF033679 NF033679
IPR012334
17–233
IPR012334
AMM44863.1
1 4401
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Bacillus phage SP-15
[NCBI] 		1792032 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AMM44863.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KT624200 [NCBI]
CDS location
range 56443 -> 69648
strand +
CDS
TTGGGGACTATTGAGCTAAATGGAGTAGTTCATTCCAATGTTGGAAAAGTATGGTATGTCAGCACTCAGGGTAATGATTCAAATCCAGGTACAGAAAACGAACCCTTAGCAACAGTCCAGTCAGCTGTAACTAAAGCTTCTTCAGGTGATTTGATCTATGCTAAAGAAGGTACCTACCGACCTAACTCCATAAGTACTTGGGGAGCTGGATTGTATGATCAGAATAAACAATTAATATTCGCAGGAGATCCAGGTAGAACTATATTTTTAATGGATGGTAATGAGCACAGTGCAAGGGATCAACATGCTCTATCTACTCGTAATCCTGGGACTAAGATCTATCATATTATATTTGATGTTATTTTTAGGGATAACCAGAATAACAGCAATGAGACTTCTTTATTTAACACATCTCATATTGACTCTAAATGGTCTGAACAGACTAAAGGCTTTGTTTATAACTGTGTATTTAAGACTAACAAAAGAGCAGCAATGAACTATGATGGTAGTGGAGGCGGTAAACTTTATCTGGAAAACTGTCTATTCGATGTTCCTGATAATTTTATCGGATCCTACAATTATCCTAATAATTATGAGCTATCTAACTGTGTGACTAATAAGTCGTGGTACAAAGAAGGTTTGGCTAAGAAAGCATGCCTTGAAAATTGTAACTTTGATCAAGATTATCGGATTATTTCAGCTCCTGGTAGTTGGATAGATACTGGAATTTACGAGGATAAAGACGGTAGTCCTGCTGACTTGGGAGTTTATGGTGGTCGTTATGCTTGGGACTTTGACTTTGATGTCAACTCTATAATGTGGGTAGGTCCAGCTATCGATGAAATCCCTGGTCAGGCTGACATCGCTATACCTAGTGATATTCATGGTTCCATCCGTGTTACTAATCACGACGACATAGAAGCTAAAGTAGCTATTCTTCATCGGGATAATATCATATCTTCCGTACAAGTATGGGAAAAGAATTTACTCCCTTCTTTAATTAATATTCCTCCACCTTACGACAACAATAACAACAATGGGTGGTTAAAGTCTAGTTTAGGTGTTAGATTAACAAATGAATTATTAGGTATTTCTGTGGATCGTCATGGTTCGCCATTCCAAAGACAAGCGATACCTGCTAGCATCAATGTATTTACTAGAGGTAACGAGAGTCTAGTCTCGAGTATTGGGGTGCGTATATCTAATGAGCTTAATTCTCGTGTTCTTGAACTCCGAGGAGTTTGGGATGAAGATATATCAGGTTCTATAGAAATTAGTAGTCTAAATTATAACGACTTATTCACTAGATTAGGTGTTAGAATACCATCCGTACTTTATGGTCAGTCCTATATACCTCAGAATGCTGATGAGAGCCTACCGAGTTCAATCACAGTTACTCATAGTGATTGGGATCATATTACAGGTAAAGTGATAGTAAGACCTGAGGCTATACTTGGAGGTCACGTTATTACTAACAATGGACGGGAAGATATTCCTTCCAAAATTAGTATTGTAAGAGGTCATAGTATACTATGGTCTAACATGACTGTAAAGTATAGAACTGAACTCAATTTAGTAACGGATATCATAGGTGTAGGAGATAGTGATCTTAAATCGATCATTGATCCAAGGTACAGAGGTAACGACGATGCTCAAGTATCTATCAGAGTAAATAGTCCTTATGTACATGATAACGAGTACGGTAAAGTATTCAAATCGTCAATCCGAATTATAGCTGCTGGGAATAGTGATATTCAATCCAGCTTAAGTATACCTATTCTGAATAAAATGACAGGTATATCGGATATCATCGGAGTCAATGAATCTAATATTCAAGGTTCTATCAGAATTAATCAGTACGACAGCTTACCGTCATCTATCAGGATTTCTCCTCGTAATAAGATGACGTCAATAATTGAGATTCGACCACCTGAAAGAATTAATGGAACAGTCTCAGTTAATAAGGACTCTTACGTACGTCAGAGTCTAGATAAGTTTAACTTCGGTCAAGATCCTACTCTGACTATGGGTTATTCTGCTAATAAAGCAGAAAAGTTCAGAACTTTAGTTGGATTCGATATCTCTGATATCACTAACTTAAGAGAAGGGTACAGTATTGACGAGGTACACTTAAAGTTAAGATTCACTATAGGACGTAATCCTAAATCTAGTTTATCACTGTATGAAGCAATCGGTGACTGGACTGAATTAGGTGTTACTTGGAGTAACCAACCTCGAATCGGTGGCTTAGTTTCTAAGAAATACGTTACGGATAGTACAGAAGGTTATATCACTTTTGATATCACTGACTATATACGTAATGCTAAAGAACAAGGAATTACATATTTATCGTTCTACTTGAATGCTACTGATGAGTTGGAAAATAACACAACATCATTCTTCTCTAAAGAGAGTGGTAACGGACCTACGATAGAATACAAGTATTACGATGAAGTTCTTCGTAATTCAAGTAAAGCTGACTTAGATTCCAACGTGTTTATCTACTCTATAGGACATAAGGATCAACGCTCTAAGATCAACGTCAAAGGTATAGTATGGTCGGAAATACCTTCATCTATACTAGTCCAACGTCCAGGTGATTTCTTATCCAGCATTACTGTCACTAGATCTGACATGTCTGGTAGCATGGACGTTATCGCACGTGATGATTCAGATATCAAGTCCAGCTTGACTGTTCAAGAGTCATTGTACTTTGATATTGGTGGTAGCATTATTCCAAGTAAAAAGTCAATGCCATCGGAGATATACGTAGCTGAGAGGTATGACGTATCATCAAGCTTGTCTGTAAGAGTTCTAGATGTATCCGAAATAATATCTTGGATGACAGTAAGTAATCCGAGTAGACCTGGTAGTATTTACGTTATCCCTTACGTAGACCTAGAAGGTAGCATTTCAGTACGTCGTGAAGCTTATGATGACTTAGAGTCAGGTTATTTTGGAGTAAGTGTTCCACAAATTAGTTTGAGTTTCTATGTACTCCCTCACGAGGACTTGAATTCAAGTATCTCAATCAGAGGTGAAGAGAAACATGAACTAAACTCTAGTATCTCAGTAAATAGACCAGATAATCCAAGTTCTATATACGTAGTACCGTACTACGATAGACGAGGTGTTATCCGAGTTAGAAGAAGTACTAGAGCGGATCAAATATCGACCCTAGCTATTTCAAGACCTCAGTTCTCAGGAAGCTTAGAGGTAATGAGTGGGGATAACCTAAAAGGTTCGATCGTAGTTAATCGTTACGACGAAGAGATACTAAATTCTCAATTAGTGATCTCGCATCCTGATCTTAGAGGATCTATCCATCCTAAAATAGCTTACGATACTTCAGGTACGATTACTGTCAATAAACTTGATAAAGATGACTTAATCTCAACTTCTTACGTATTACATCGATCTGATATTAAAGGTTCATTAGAGGTTTGGGGAGCATCAATGATACCTTCGAGTATCCGAGTACTTTCAGGATATCTTAGAGGTACAATCGGAGTCCCTGCTAATGATGAAACTGAGATCGAAGGCTCGATTACAGTAAGACAAACGGATGAGTCTTGGATCAAGTCACAAATTGACGTTTGGCAATTTAGATTATTACCATCCAAAATCGTAACTAGACGTAGTGAAGAATCCGACATTAAGTCGTCAATTGAAGTAAGACAATTAGAATCGGCATCAATCCCATCTAAAGTAGATATATGGAAGTACGATGCATTAAAATCTAAGATTGATGTACGAAGAGATGCTAAGGAATTCTTAGACTCCTCAGTATATGTCTTATTCTCAAGTGATATTAAGTCATTCATTAACGTAAGAGGTTACTCAGATGTCAATTCCTCACTTAGAGTAGTTTATGGATCAACTTCAGATATTGATTCTAATTTAACTCCAAGGTTAATAGGATACGACGATATTGATACGAGCGTATTTGTAATGTATCGAGTCAATCGTGACTTGAGGTCTAAGTTACGAGTAGGTGCCTCAAACAAGATGACTGCGATTCTAGATATAACTGATGCTCCTAGAGAGTATACGACTATCTATGCAGTTAAGGATTCATTCGTCAGAAGTGGGATGCCAACACTTAACTACGGATTGGATAAATCAATACCTGTTGGTAAGTCCAACAACGAGATACTAAGATCATTGATCGGATTTGATATCAGTCAAATTCCATCTGGAGACACTATTGATAAGGTTGAATTAGTAATTAATTATTCAACTCTTAGAGACAAGGACATTAGAGCTTATGCAATCGGGAACGATTGGACTGAATTAGGGGTAACTTGGAATAACCATCCTAACTCCGATCAGTACGTAAATTCTAATAATCCTAAATGTACAGTAGATACTTTAAGAGAGGTAATCAAGTTTGATGTTACCGAGTACGTACGTGACGGTCATTATGACGTAGGCGACCAGTTCGTTAACTTCTTACTTAAAGCTTTCAATGAGAGTCAAGATGGTTACTTAAATCTAATGTCTCGTGAGAGTGGACGGATTCCTCGATTAGAAGTAGTCCATTACAATCCAGAAGTATGGAGCTACAATAGAGCTCATCTAGATGCTAAAATTGATGTAAAATACGGTGGACTTAGTCAAATACCTTCCACGGTAACTGTAAATACTTACGATGGATATAAGGATACCTACGGTAAAATCAACGTTTTATCTCCATCTGACTTCGAGTCTAACTTAAGTACTAGGATAGCTGTAAGTCGACCAGATATTGATGGTTCTGTTAATATCATAGGTCGTGGAGATAGTGATATTGAATCAAGTATCACAGTAATGATAAGTACAGTTGAAGAGCTCCCTTCATCACTCGTAGTAAGTCAAATCAACTTAGGATCAACTATTGTTGTACCTGATAGGTCTGAAATTGGAGGTTCAATAACTCCACGAATTCTCGATAATTCAGACTTGTTGACTTGGATTACAGTAAATGCTAAGGATAGACCTTCATCGATTTACGTTCCTTA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Tertiary structure

No tertiary structures available.