Protein

View in Explore
Genbank accession
YP_009845354.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,87
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,95
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MSRNLMPKSGAMAPYIVVNRDAAVAGVFSIDGEAGAVVLTSKYLQISKYNLDQQALATRLTGIDSSIQSNTEAIGNINTAIGSINSSLSAKAAKGANNDITELNALTKAITVSQGGTGATSPDGARLALELNHLTKSTDVSYMGSPDGSKLLYISNEGAWGVTAEGGGTNYALPITQGGTGALSAAEALVKLMDGKPLPLAADGQGPYDAVTVRQLSNISGGGNASMSGVMNNFIGAVEWFNGNRTKLPAGYIPADGQLESRTDPKTRDLWAAISGGLFVSVSDTEWITNSYGQDYQKTGNRGAYSTGDGSTNFRVPDLNGVRRNGDTMDGIPFAGYDTPYAAFLRGDGGGSINGVFASGALNMSAAPNITGNFSVRVPNMHGMYATGIFSGINHTGWPDAPDASYSGGSGTADFVDTQKYGYSLNAAAGSPVYGRDGTPEVRPTAVTGLWIIRANGSFNAAGSQYHVINGDSTRPTDGTTTYGGFAYSDYRIGETVNHSALIVSAKRFGNPYSVAVLQSYNNETGDLANLEVQSNGVVNLPTSINNKSWIKAFGANGLHLDAATTAQDLHTMPGGGCGVSQAERNAIELNNNPGAVGSGGYVNWLQGWWYDDRFQFGAIRSGSTVLDAVALSTYSNALGLKQWFFRANDGRIASTAGTIAIEGSDIKLKENIVRAPEGALDRITKITPREFDWKAGGRHDRGYIAQELRDVDPTYVYSSTVGEGEEVLNVSTSALISDLIAAVTTLKQELDSAKLEIKKLKAK
Physico‐chemical
properties
protein length:764 AA
molecular weight: 80093,82470 Da
isoelectric point:5,31595
aromaticity:0,08115
hydropathy:-0,24450

Domains

Domains [InterPro]
IPR030392
665–758
IPR030392
IPR030392
665–717
IPR030392 Coil
YP_009845354.1
1 764
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Salmonella phage Sepoy
[NCBI] 		2565517 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_009845354.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_048760.1 [NCBI]
CDS location
range 84207 -> 86501
strand -
CDS
ATGTCACGTAATTTAATGCCTAAATCTGGCGCAATGGCGCCCTACATTGTAGTTAATAGAGATGCTGCTGTTGCTGGAGTTTTCTCTATTGACGGAGAGGCTGGCGCTGTTGTACTTACTTCTAAGTACTTACAAATCTCTAAGTATAATTTAGATCAGCAAGCTCTAGCTACTCGTCTTACTGGAATAGATAGCTCTATTCAAAGTAATACTGAAGCTATTGGAAATATTAATACTGCAATTGGTAGTATTAATAGTAGTCTAAGTGCCAAGGCGGCTAAGGGTGCTAATAATGATATTACAGAATTAAATGCACTTACTAAGGCTATTACAGTATCTCAAGGTGGTACAGGTGCTACTTCTCCAGATGGAGCACGTTTAGCACTAGAATTAAATCATCTCACTAAGTCAACAGATGTCTCATATATGGGATCTCCTGATGGCTCAAAGTTACTTTATATTAGTAATGAGGGGGCTTGGGGAGTTACTGCTGAGGGTGGTGGCACTAACTATGCACTACCTATTACTCAGGGTGGTACAGGTGCTTTAAGTGCAGCAGAGGCACTAGTTAAGCTAATGGATGGTAAGCCCCTACCCCTAGCTGCTGATGGTCAAGGTCCCTACGATGCGGTGACTGTAAGGCAACTATCTAATATTTCCGGCGGTGGAAACGCTAGTATGAGTGGGGTTATGAATAACTTCATAGGTGCTGTTGAGTGGTTTAATGGTAACCGTACTAAGCTACCGGCTGGGTACATACCGGCAGACGGTCAATTAGAGAGTCGTACTGATCCTAAGACTAGAGATCTATGGGCGGCAATTTCAGGTGGATTATTCGTAAGTGTTAGCGATACAGAGTGGATAACTAATTCCTATGGCCAAGATTACCAAAAAACAGGTAATAGAGGTGCGTATTCTACAGGAGATGGCTCTACTAACTTCCGTGTACCTGATTTAAATGGTGTTAGAAGAAATGGGGATACTATGGATGGAATTCCTTTCGCAGGATATGATACCCCTTATGCAGCATTCCTTCGTGGTGATGGTGGTGGTAGTATTAATGGAGTATTTGCCTCCGGGGCATTAAATATGAGTGCTGCTCCTAATATAACTGGTAACTTTTCTGTAAGAGTACCAAATATGCATGGAATGTACGCTACTGGTATTTTCTCAGGTATAAATCATACAGGATGGCCGGATGCTCCAGATGCTAGTTATTCTGGAGGAAGTGGAACAGCGGATTTTGTAGATACTCAGAAGTATGGATATTCTCTAAATGCTGCAGCAGGTAGCCCAGTATATGGAAGAGATGGTACACCAGAGGTACGCCCTACTGCTGTTACTGGTCTTTGGATTATCCGTGCTAACGGTTCTTTTAACGCTGCTGGTTCACAGTATCATGTTATTAATGGGGACTCTACACGCCCTACTGATGGAACTACTACGTATGGTGGCTTTGCATATAGCGACTACAGAATAGGGGAAACAGTTAATCATTCAGCTTTAATAGTAAGTGCCAAAAGATTTGGTAATCCTTATAGTGTTGCTGTTCTTCAGTCCTATAATAATGAGACAGGGGATCTTGCCAACTTAGAGGTACAATCTAATGGTGTTGTTAACTTACCTACTTCGATTAATAATAAATCCTGGATAAAAGCTTTTGGTGCCAACGGCCTACATTTAGATGCTGCTACTACTGCTCAAGATCTGCATACTATGCCTGGTGGAGGTTGTGGTGTATCTCAAGCAGAGAGAAATGCTATTGAGTTGAATAATAACCCAGGTGCTGTAGGTTCTGGTGGTTATGTTAACTGGCTGCAAGGATGGTGGTATGATGATAGGTTCCAGTTCGGTGCCATTCGTAGTGGTTCTACTGTACTGGATGCCGTAGCCTTATCTACATATTCTAATGCATTGGGGTTAAAACAGTGGTTCTTTAGAGCTAATGATGGTAGGATTGCTTCCACTGCAGGTACTATTGCTATTGAAGGTTCCGATATCAAACTTAAGGAGAATATAGTTAGAGCACCAGAAGGGGCTTTAGATAGGATAACTAAAATCACCCCTAGAGAGTTTGACTGGAAAGCTGGGGGCAGACATGATAGAGGGTATATTGCACAGGAATTACGCGATGTAGATCCTACCTATGTATATTCATCAACTGTTGGGGAAGGAGAAGAGGTATTAAACGTTAGTACATCTGCTTTGATTTCTGACTTAATAGCTGCTGTTACAACTCTTAAACAAGAATTGGATTCTGCCAAATTAGAAATTAAAAAGCTAAAAGCTAAATAA

Tertiary structure

PDB ID
60a0d5985a4ccddaa92ba180f9cd3cf862900dc1dd1d6d0bf683eff506ad33be
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,6553
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50