Protein

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Genbank accession
XUQ14833.1 [GenBank]
Protein name
fibritin neck whisker
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,92
Protein sequence
MIELKSLPYVDGPPDVGQKRLNWIKNSEEITGADTLYGSEGVMNRPITEVQRNVETINDNVKTIAESLDTANADIVTIKSILDVSGDVDALAQIGHNTDDIEVLKHTVNSHGVDILNTEEKLDDTIANIGVVNPETDSVYRTVRNDLLWIKTELGQYTGQDINGVPTEGNESTGMKRRIITNSSVLVDQGVRLTELENKFADSDVGALTTEVENLRQEIGPRPSLTVPVYTRLSGIDSSISIQTRDIAALKDFVGYPNSTAIKTQVEANRLSISTINSDINSPGGIKPRLTTLETTIGSPDLPTTLQGKIKLNTDSISGINTVLGVDSSSGLRFNVAWLNQVVGVDSNGGQPEPADSLLYRTRILETGVTDLGNNIQNVQTELGTNSSGIKGQVTSLNKLISGTNPNGQTIEERGILPTVKNHDTTITDLTTRVTTLETDLAAAEAEIQALKEAGYIEDAPSDGKFYVRKDGAWVELPTA
Physico‐chemical
properties
protein length:480 AA
molecular weight: 51731,95340 Da
isoelectric point:4,54288
aromaticity:0,03542
hydropathy:-0,33604

Taxonomy

Phage
Escherichia phage LF82-35 [NCBI] · taxon 3433678
Viruses Duplodnaviria Heunggongvirae Uroviricota Caudoviricetes
Host
Escherichia coli LF82 [NCBI] · taxon 591946
Pseudomonadota Gammaproteobacteria Enterobacterales Enterobacteriaceae Escherichia Escherichia coli

Coding sequence (CDS)

Genbank protein accession
XUQ14833.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PV660461 [NCBI]
CDS location
range 165949 -> 167391
strand +
CDS
ATGATCGAATTAAAAAGTCTACCATACGTTGATGGCCCTCCTGATGTGGGTCAAAAACGCTTAAACTGGATTAAAAATTCAGAAGAAATAACTGGCGCTGATACGTTATACGGTTCTGAAGGAGTAATGAACCGTCCAATAACAGAAGTTCAACGAAATGTAGAAACAATTAACGATAACGTTAAGACTATCGCAGAATCTTTAGATACCGCTAATGCTGATATTGTCACAATTAAAAGTATCTTGGATGTTTCTGGTGATGTAGATGCTTTAGCACAAATTGGACATAACACTGATGATATTGAAGTATTAAAACACACTGTAAATTCACACGGTGTTGATATTTTAAACACTGAAGAAAAACTAGATGATACTATTGCTAATATCGGAGTAGTTAATCCAGAAACAGATTCGGTGTATCGTACGGTGCGTAACGACCTTCTTTGGATTAAAACCGAATTAGGGCAATATACTGGACAAGATATTAATGGTGTCCCAACCGAAGGTAATGAAAGCACCGGTATGAAACGACGTATTATTACTAACAGTTCAGTGTTGGTTGACCAAGGCGTTCGTTTAACCGAGTTAGAAAATAAATTTGCCGATTCTGATGTTGGGGCTCTGACAACCGAAGTTGAAAACCTCCGTCAAGAAATAGGTCCTAGACCATCGTTAACAGTACCGGTTTACACTCGTTTATCCGGTATTGATTCATCCATTTCTATCCAAACTAGAGATATTGCGGCATTAAAAGATTTTGTTGGATATCCTAATTCAACCGCTATTAAAACTCAAGTCGAGGCCAATCGTCTTTCTATATCAACAATAAATTCAGACATTAACTCGCCTGGCGGTATTAAACCACGTTTGACAACGTTAGAAACTACTATAGGCTCTCCAGATTTACCAACTACTCTTCAGGGTAAGATCAAATTAAATACCGATTCCATTTCAGGTATTAACACAGTTTTAGGTGTTGATTCTTCTAGTGGTTTACGTTTTAACGTAGCATGGCTTAATCAGGTGGTTGGCGTTGATTCAAACGGTGGACAACCTGAACCGGCCGATTCACTTTTATATAGGACTCGTATTCTTGAAACTGGTGTTACCGACCTAGGCAATAACATTCAAAACGTTCAAACTGAATTGGGAACTAATTCGTCTGGTATTAAAGGACAAGTAACTAGTTTAAATAAACTTATAAGCGGCACCAACCCAAACGGTCAAACCATAGAAGAACGTGGTATATTGCCAACAGTTAAAAACCACGACACGACAATTACGGATTTAACTACGCGTGTTACCACTTTAGAAACAGACCTTGCTGCAGCAGAAGCAGAAATTCAAGCCCTTAAAGAGGCTGGATATATCGAAGATGCTCCTTCAGACGGTAAATTCTATGTTCGTAAAGATGGTGCTTGGGTTGAACTTCCTACAGCTTAA

Genome Context

Tertiary structure

XUQ14833.1
ESMFold structure
Source ESMFold
pLDDT 61.2
Oligomeric state monomer
Download structure