Protein
View in Explore- Genbank accession
- UVD42807.1 [GenBank]
- Protein name
- glycerophosphoryl diester phosphodiesterase
- RBP type
-
TSPTF
- Protein sequence
-
MANKILRLDISKIPDLTPIIYGRVADGLVQTVDVYVTNNGEPFDLTGWVINFEGNTSGNRTYVKDLEGIVMVDRTKGHFTYTFPLIAFSTAGKYERAYFSFVKGDQRESTSDFNIQVFENADITVEEAHTVITEYEELVDELNRIFLEAQTELQQDFDEFKKNYDTRYNNYITDLTNKINAAQNKIDILNSNYEKTNAKLTDLEERMNDLVNDGLLKMEDVLSFLAGKNVKIKVPIDFAGKISGSTAENPNVMKFGTIPAANINSVGTVNDGTELISDDVAATMWKNYKNVSALDGKLAQAQQTLNGQVTFHLARIDAVSEISRRFPNLFINVGATTRSQQKEQLIKKATFVSATAYGFGSVGDVYKYTIGRSNWTTTGTTWQGWTGWGIDNNSHSSSKPDPVTAGVGSVDTIMDQNGVMAFIMGVPTPSDGTKMLRTNLDYFVCEITLNLNINDLIPKPDLSKYYTKDEMNEAFTEHSLYSNSLDFGNYDYSGNANLMTPLKASDFYKVTGGTIEDIGNALKVTFTKTDGATFLETMKSVPALLPNKQYTLSADVTVTEGYSGKLENLRLGYRKSPNGTIILPLTAKDAQVGKKTKIFITANSSSATDPSIFDRMYFTINTTSTEPFVGTVLIENIKVEEGSTATPYQPNLLDEPYYLSKAVWGENLIDPAVKFPITSSVETLYSGRTPEDFVEGETYTVTIGATKPSAQSFGVYLALKNHTIFKPVEGLHNTWTATLKIDILGEKKNAVYIYQSPASSVGACQIDWLKIEKGDTRTPNLNAPFKYKGIGFTKSSNPKDYNWNSAPENVDFIEKNAASNEAKIDEIDKNVVKTSGNQNITGLKNFTGTLQSSGVEVAKKGDSYTKTETYTKTEVDSKYIPKTQENTFVKTIGNQNVVGTKNFSDPRKNDALMYALTDEAMRPSDFNFAGDFTKVMTARSMRVMQRRLPWMKTFGWFGTGEGSANDIDEGFKQYIQTNSTTDADITNYQFIRKGRKVQFFARIKFTSATGTDVATFAQVPTGFRLSNAAKYTYWNVPLTCVQFNAPERINYKGFVERLGTNNIKIGTATYTGNTYWYGEWETSDPYPTSFTDEVTERMMAHRGATVSYPENTLEAFKAAIDLGYGGVELDPRLTSDGKLYLMHDDTVDRTTNGTGNFADLTEAQVKALNIKIDPVKYPNLVGQTLKVPSLSSVLLALRGTDLTINFDGSKIDLSVASTAKMIHDMIVSYGLEKRVFFVINNKTQRDAFHKLYPQYPVSWLWNSPGSRAAGTVNEIYAYGKHGGALLSIPMAVLNDDTSMRDIQASGVYYQVYGVQTEADYETCRLMRVPMIETDQLYPNLDFL
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1343 AA molecular weight: 149376,09590 Da isoelectric point: 5,30856 aromaticity: 0,10648 hydropathy: -0,38325
Domains
Domains [InterPro]
G3DSA:2.60.40.3350
1–122
1–122
IPR018913
4–143
4–143
PTHR46211
1097–1335
1097–1335
IPR017946
1099–1336
1099–1336
cd08566
1099–1299
1099–1299
IPR030395
1101–1335
1101–1335
1
1343
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Enterococcus phage TJE4 [NCBI] |
2951264 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
UVD42807.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
ON506926
[NCBI]
CDS location
range 70413 -> 74444
strand +
strand +
CDS
ATGGCAAATAAGATATTACGTCTTGACATTTCAAAAATTCCAGATTTGACTCCTATCATCTATGGGCGGGTCGCTGATGGACTCGTCCAAACTGTTGATGTATATGTCACGAATAATGGAGAGCCTTTTGACCTAACAGGTTGGGTCATTAACTTTGAAGGTAACACAAGTGGGAACCGAACATATGTAAAAGATCTTGAAGGAATCGTTATGGTTGATCGCACAAAAGGTCATTTTACTTACACATTTCCACTGATCGCTTTTTCAACAGCTGGAAAATATGAACGAGCATATTTTTCATTTGTGAAAGGAGATCAAAGAGAATCGACTTCAGACTTTAACATTCAAGTATTCGAAAATGCAGACATCACTGTTGAGGAAGCTCATACAGTCATTACAGAATATGAAGAATTGGTTGATGAATTAAATCGTATTTTCTTGGAAGCACAAACTGAATTACAACAAGACTTCGATGAGTTCAAGAAAAATTACGATACGAGGTACAATAACTACATTACTGATCTTACGAATAAGATTAATGCGGCTCAGAATAAAATCGATATTTTAAACAGTAATTACGAGAAAACTAACGCAAAACTCACTGATCTAGAAGAAAGAATGAACGATTTAGTGAATGATGGGTTACTAAAAATGGAAGATGTGCTTTCATTTTTAGCTGGTAAAAATGTTAAAATTAAGGTTCCTATCGATTTCGCTGGAAAAATTTCAGGTTCAACTGCAGAAAATCCTAACGTAATGAAGTTTGGCACAATACCCGCAGCGAATATAAACTCTGTAGGAACAGTGAACGATGGAACGGAATTAATTTCTGATGATGTAGCAGCAACAATGTGGAAGAACTATAAAAATGTTTCTGCATTAGATGGAAAACTTGCTCAAGCACAACAAACGCTAAATGGTCAAGTCACTTTTCATTTAGCAAGAATTGATGCAGTGTCAGAAATAAGTCGTCGTTTTCCAAACTTATTCATCAATGTAGGAGCGACTACTCGTTCACAACAAAAAGAACAATTAATAAAGAAAGCTACTTTTGTTAGTGCAACTGCTTATGGCTTCGGATCAGTAGGAGATGTATATAAATATACAATTGGCCGATCTAACTGGACGACAACTGGAACGACTTGGCAAGGTTGGACTGGTTGGGGCATTGATAATAATAGTCACAGTTCTTCCAAACCCGATCCTGTAACAGCAGGTGTTGGATCCGTTGACACAATAATGGATCAAAATGGTGTAATGGCTTTTATTATGGGCGTACCTACCCCATCAGATGGAACAAAAATGTTAAGAACTAATTTAGATTATTTCGTTTGTGAAATAACTTTAAATTTAAACATTAACGACCTAATTCCTAAGCCTGACTTAAGTAAGTATTACACTAAGGATGAAATGAATGAAGCATTCACTGAACATTCATTATATTCTAACTCATTGGATTTTGGCAATTATGATTATTCAGGAAATGCTAACTTAATGACTCCTCTAAAAGCTAGTGATTTTTATAAAGTTACTGGTGGTACTATAGAAGATATAGGAAATGCATTAAAAGTAACTTTCACAAAAACTGATGGTGCTACTTTTTTAGAAACTATGAAGAGTGTTCCAGCTTTACTTCCTAACAAACAATACACGTTAAGTGCAGATGTTACGGTTACGGAAGGTTATTCTGGGAAGTTAGAAAATTTAAGGTTAGGATATAGAAAAAGCCCTAACGGGACAATCATATTGCCATTGACGGCTAAAGATGCGCAAGTCGGAAAGAAGACGAAAATATTCATCACGGCAAATTCGAGTTCGGCAACCGATCCATCGATTTTCGATAGAATGTATTTCACGATCAATACAACATCAACAGAGCCTTTTGTCGGAACTGTTTTAATCGAAAATATCAAAGTCGAAGAAGGTTCGACAGCAACGCCTTATCAGCCTAATTTACTAGATGAGCCATATTATTTGAGTAAGGCGGTGTGGGGTGAGAATCTTATTGACCCTGCAGTGAAGTTTCCTATAACATCAAGTGTTGAAACGTTATACTCAGGTAGAACTCCTGAAGATTTCGTTGAAGGGGAGACGTACACTGTGACCATAGGTGCAACAAAACCTTCCGCTCAATCTTTTGGAGTATATTTAGCGTTAAAAAATCACACCATATTCAAACCGGTTGAGGGTCTGCATAATACATGGACGGCTACCCTAAAAATAGATATTTTAGGAGAAAAGAAAAATGCTGTGTACATTTACCAATCTCCAGCGTCAAGTGTTGGTGCATGCCAAATTGACTGGCTCAAAATCGAAAAAGGTGACACACGAACTCCTAATTTAAATGCCCCTTTTAAATATAAAGGAATTGGTTTTACTAAGTCATCTAATCCTAAAGATTATAATTGGAACAGTGCTCCCGAAAATGTAGATTTCATTGAAAAAAATGCAGCTTCAAATGAAGCAAAAATTGATGAAATTGATAAGAATGTAGTGAAAACTTCAGGTAATCAAAATATTACCGGCCTTAAAAACTTTACAGGTACGCTCCAAAGCAGCGGAGTAGAAGTTGCCAAAAAAGGTGATTCATATACGAAAACTGAAACGTATACGAAAACTGAAGTCGATTCAAAATACATTCCAAAAACACAAGAAAATACATTCGTAAAAACTATTGGAAATCAAAATGTTGTAGGAACAAAAAATTTCAGTGATCCAAGAAAAAATGATGCTTTAATGTATGCTCTTACTGATGAAGCAATGCGCCCATCAGATTTTAACTTCGCTGGTGATTTTACTAAAGTTATGACAGCGCGCTCAATGAGAGTTATGCAAAGACGTTTACCTTGGATGAAAACATTTGGTTGGTTTGGAACGGGTGAAGGATCAGCGAATGATATTGACGAAGGATTTAAGCAATACATTCAAACGAACTCAACAACAGATGCTGACATCACTAATTATCAATTCATTAGAAAAGGACGGAAAGTACAATTCTTTGCCAGAATTAAATTTACTAGTGCCACAGGAACAGATGTTGCTACTTTTGCGCAAGTTCCTACTGGTTTTCGCTTAAGCAATGCAGCAAAATATACTTATTGGAATGTTCCTTTAACATGTGTTCAATTTAATGCTCCAGAACGCATTAATTATAAAGGTTTCGTTGAACGACTGGGTACAAACAATATTAAAATTGGTACAGCAACTTACACAGGAAATACTTATTGGTATGGAGAATGGGAAACATCTGATCCTTACCCAACAAGTTTTACTGATGAAGTAACTGAGCGAATGATGGCTCATCGAGGAGCTACGGTGTCATATCCTGAAAATACTCTTGAGGCATTTAAAGCTGCGATTGACTTAGGTTATGGCGGAGTAGAATTGGATCCTCGTTTAACTAGCGATGGAAAATTATATTTAATGCATGATGACACTGTTGATCGAACAACTAATGGAACAGGCAATTTTGCCGATTTAACAGAAGCTCAAGTTAAAGCGTTAAATATTAAAATCGATCCAGTAAAATATCCTAACCTTGTTGGTCAAACACTTAAAGTTCCTTCATTATCATCTGTTCTTTTAGCATTGAGAGGAACAGATTTAACAATTAATTTCGATGGAAGTAAAATTGACTTAAGCGTTGCATCAACTGCAAAAATGATTCATGATATGATTGTAAGTTATGGTTTAGAAAAACGAGTATTCTTCGTTATCAATAATAAAACACAACGAGATGCTTTTCATAAGCTTTATCCTCAATATCCTGTTTCATGGCTTTGGAATAGCCCAGGATCTAGAGCTGCTGGAACAGTAAATGAAATTTATGCATATGGAAAACATGGAGGAGCACTCCTTTCAATTCCTATGGCTGTCTTAAATGATGATACATCTATGAGAGACATTCAAGCATCAGGTGTTTATTATCAGGTTTATGGTGTTCAGACTGAAGCTGATTATGAAACATGTAGATTAATGCGTGTTCCTATGATCGAAACTGATCAACTATATCCTAATTTAGATTTTTTATAA
Tertiary structure
PDB ID
9380d8f1bc8cc973efb051b0ec0e33eb4ff5914f1e6784a52115045fbf269bcc
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50