Protein
View in Explore- Genbank accession
- YP_009785006.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber protein
- RBP type
-
TSPTSPTSP
- Protein sequence
-
MTTQFYSLITKYGESVIAQAVANNTPVPLKTMAIGDGNGTPTTPSESQTTLINEVYRAEITDLLQDSETPNQVIAELLVPETVGGFTVREVGIYDDQNKLVAVANCPENYKPVLEQGSGKVQYYRIVLRVSSSDSVTLSLNNNIVYATRLEFNRFVNDLSKPDGFKLVGECESITQLRTIEPTEDQQRILVKSYHARKNLGGGVFYADFADTTTADNAGTVIVTAGGKRWKRVYSTLNIFDFGVSLDSVNNDAIKRLQAWQEPVLGLGNVIPASSRIVPASHISQVAYRFNGIDYLSEDYYKADLSQITRTGYYTAWTQDKAFVHNGVIYAPFMLAFRHGYDDLRIAWVKSFDNGNTWTTPEILMDYHPQNPTLGWHCFSMGIVGNRLFMLVEERDVASKKMVRSFLYSRVMTKNFFVTGGISQSGNVVTVELEEHGLFVGDSISFSNSGISGVSGKMTVTSVLDANRFTVMNSKEQTITNNDSWLCATYFEDNQWQIQELSTFANSAGVAATHLHSFCPVNRSQFAFGFHNGDASPREIGFVKCSINWATGRVTTDKIILPETLSRAAAEPCLRYYKNKLFLTTRSQNPNVGSLLIRCDLNGENISSFNISAEKIHYTNMPFHIENDVIYMFAAERAENEWETGQSDKSGNRYRANRPRMFLLKHRLSDWGKPEKTEVQVISQGIYSGEAANSACGVGSIVYKDGILHCLFGDEDYRNSHSLTENARKANNAHIDSGYQPEIYSLRIVIDKQMAGVTDKPLRGADNLHLPVFRGTDGVRTVQSPVRFSEKVEFDNAVALAVATVGRILASSKAGADYAMYGTDYLNDANRLYLSSTHQANSQNGSTITLHNDKSEEGSIIDYRATAHKFLGGVHINTGVINTPPESAGNTEIVNAKWVNSQIEKNNTEKVLFSGSTQEPVSVQVSSLRGQIHVLASIRGVKRWDSFSLWSSNNTYIGASEYGGENADRNYGSLIRVSINDRTLTLTPTSTYLPTIKKIIHLGA
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1004 AA molecular weight: 111273,42610 Da isoelectric point: 6,18536 aromaticity: 0,09562 hydropathy: -0,30538
Domains
Domains [InterPro]
IPR022225
1–149
1–149
IPR051934
1–151
1–151
IPR024428
304–750
304–750
G3DSA:2.120.10.10
304–749
304–749
IPR024427
417–483
417–483
IPR001724
482–505
482–505
1
1004
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Mannheimia phage vB_MhM_1127AP1 [NCBI] |
1572746 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_009785006.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_047750
[NCBI]
CDS location
range 15672 -> 18686
strand +
strand +
CDS
ATGACAACACAGTTTTATAGCTTAATCACAAAATATGGCGAGAGCGTTATTGCTCAAGCTGTTGCGAATAATACACCAGTGCCATTGAAAACAATGGCGATTGGTGATGGTAACGGTACACCAACTACGCCAAGTGAGAGTCAAACTACACTCATTAATGAGGTTTACCGAGCTGAAATCACGGATTTGTTGCAAGATAGCGAAACACCTAATCAGGTAATTGCAGAATTACTTGTGCCGGAAACAGTAGGCGGCTTTACCGTCCGAGAGGTCGGTATTTATGATGACCAAAACAAACTTGTTGCGGTTGCCAACTGCCCTGAAAATTATAAGCCGGTGTTAGAGCAAGGTAGTGGCAAAGTGCAATACTACCGTATTGTGCTAAGAGTTAGCAGTAGTGATTCGGTTACGTTGTCACTAAATAATAATATTGTTTACGCCACAAGGCTTGAGTTTAATCGATTTGTGAATGACCTTAGCAAGCCAGATGGTTTCAAGTTAGTTGGTGAATGTGAATCTATTACTCAACTACGCACCATCGAGCCAACAGAAGACCAGCAACGTATTTTGGTTAAATCCTACCACGCCCGAAAGAACCTTGGTGGTGGGGTGTTTTATGCTGATTTTGCGGATACCACAACCGCAGACAATGCTGGGACGGTGATTGTGACGGCCGGTGGCAAACGATGGAAACGAGTTTATTCAACACTCAATATCTTTGACTTTGGAGTCAGCTTAGACAGCGTGAATAACGATGCCATCAAGCGCTTGCAAGCGTGGCAAGAGCCGGTTTTAGGGTTGGGGAATGTGATTCCGGCAAGTTCAAGAATTGTGCCGGCTAGCCATATCTCACAAGTAGCTTATAGATTTAACGGTATTGATTACTTGTCTGAGGATTATTATAAGGCGGACTTATCACAAATTACCCGAACAGGTTATTACACAGCTTGGACTCAAGATAAAGCATTTGTTCATAATGGAGTGATTTATGCCCCCTTTATGTTGGCTTTCCGCCACGGCTATGATGACTTGCGTATTGCTTGGGTCAAATCCTTTGATAATGGCAATACTTGGACGACGCCAGAAATTTTAATGGACTATCATCCGCAAAATCCAACATTGGGTTGGCACTGTTTTTCTATGGGCATTGTTGGAAATCGGTTATTTATGCTTGTAGAAGAGCGTGATGTGGCGAGTAAGAAAATGGTTCGGTCATTCTTGTATAGCCGAGTAATGACTAAGAATTTTTTTGTAACAGGTGGCATTTCGCAATCCGGTAATGTAGTAACCGTAGAATTAGAAGAACACGGGTTATTTGTAGGCGATTCCATTTCGTTCTCCAATAGCGGAATCTCCGGTGTGAGTGGTAAAATGACAGTCACCTCCGTATTAGACGCAAACCGTTTTACGGTGATGAATAGCAAAGAACAGACTATTACCAACAACGATAGCTGGCTTTGTGCAACCTACTTTGAAGATAACCAATGGCAAATTCAAGAATTAAGCACGTTTGCCAATAGTGCTGGCGTTGCCGCTACGCACTTGCATAGTTTTTGCCCAGTGAATCGTTCACAGTTCGCCTTCGGGTTTCATAATGGTGATGCTTCACCTCGTGAAATCGGCTTTGTGAAATGTAGCATCAACTGGGCAACAGGTAGAGTGACAACGGATAAGATTATTCTCCCTGAAACGTTAAGTCGGGCTGCCGCTGAGCCTTGTTTACGATATTACAAAAACAAATTATTTTTAACGACCCGGTCACAAAATCCGAATGTAGGGTCACTTCTAATTCGTTGTGACTTAAACGGGGAAAATATCAGTTCATTCAATATTTCCGCGGAAAAGATTCACTACACCAATATGCCATTTCATATTGAGAATGATGTGATTTATATGTTCGCCGCCGAACGAGCGGAAAATGAATGGGAAACAGGGCAAAGCGATAAAAGTGGCAACCGCTATCGAGCAAATCGTCCACGAATGTTTTTGCTTAAGCATAGATTAAGCGATTGGGGCAAACCGGAAAAAACAGAAGTTCAGGTTATTTCGCAAGGCATTTATTCCGGCGAAGCAGCTAACAGTGCTTGTGGTGTTGGGTCAATCGTTTATAAAGATGGTATCTTGCATTGCCTCTTTGGTGATGAGGATTACCGTAATAGCCATTCTCTCACAGAGAATGCAAGAAAAGCCAATAACGCACATATTGATAGTGGTTATCAACCTGAAATTTACTCATTAAGGATTGTAATTGATAAGCAGATGGCAGGGGTGACAGACAAGCCTCTAAGAGGTGCGGATAATCTGCATCTACCTGTGTTTAGAGGCACTGACGGTGTTCGAACTGTTCAAAGTCCGGTTAGATTTAGCGAAAAAGTCGAATTTGACAACGCTGTTGCATTGGCGGTGGCGACTGTTGGAAGAATACTGGCCAGCAGCAAAGCCGGTGCAGATTATGCGATGTACGGCACGGATTATCTTAATGATGCGAATCGGCTTTATCTGTCAAGTACACACCAAGCTAACAGCCAGAACGGCTCAACAATCACGCTACACAATGATAAAAGCGAAGAGGGTAGCATTATTGACTATAGAGCAACTGCCCATAAATTTTTGGGAGGTGTGCATATTAACACAGGGGTGATTAATACTCCGCCCGAATCAGCGGGAAACACAGAAATTGTCAATGCTAAGTGGGTTAACTCGCAAATCGAAAAAAATAACACCGAAAAGGTGTTATTTAGTGGCTCTACACAAGAGCCTGTGTCGGTGCAGGTAAGTAGTTTGCGAGGCCAAATCCACGTGTTGGCAAGTATTAGAGGCGTAAAACGTTGGGATAGCTTTAGCCTCTGGAGCAGCAATAATACCTATATCGGAGCCTCAGAATATGGAGGCGAAAATGCAGATAGAAACTATGGCTCATTAATTAGAGTTAGTATTAACGATAGAACCTTAACGCTAACCCCAACCTCAACATATTTGCCAACAATTAAAAAAATTATACACCTAGGAGCATAA
Tertiary structure
PDB ID
e391493d830355dcd5f15e6dfe6a0307f7191ff408bad5dda5ad707bc31422ab
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50