Protein
View in Explore- Genbank accession
- QNL29349.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber protein
- RBP type
-
TSPTF
- Protein sequence
-
MPLYSQSIKNLKSGISQQPEILKYPEQGNQQINGWSSEIAGLQKRPPIIFNRMLGRKGLYGDAPFIHLINRDEHERYYAIFTGSEIKVIGLDGTPYVVKGNFSYVQTNNPRKDLRMITVADYTFVVNTSKVIKEDTSKNLPDFNEKQDALINVRGGQYGRTLIVGFNGAEQAKYLIPNGDKPEHVKNTDSQFIAEELAKQMRVKLPTWTFTVGQGYIHIQAPQGTSIDNLYTKDGYADQLLNPVTHYVQTFNKLPLVAPDGYMVKIVGDTSKTADSYYVKYSAAKKVWAETLGWDTPKGFLDNTMPHTLVRESDGTFSFKVHEWKQRRCGDKDTNPLPSFVDSSITDIFFYRNRLGFLSGENVILSRTSRYFDFFPASVANNSDDDPIDVAISHNRISNLKFAVPFSEELLLWSDEAQFTLRSSSILSARTIELNLVTEFDVSDQARPFGIGRGIYFANPRSTFTSISRYYAIQDVSSVRNAEDMTAHVPNYIPNGVFSIHGSNTENFCTVLTKGAPSKIFIYKYLFMDEQLLQQSWSHWDLGEECTILACTTIGSKMTILFENQHNVFIGTVKFTRDIKDFPQEPYRSHLDLKTLYTIPTDKYNITTNITRIRLADIYNSARFTRGKVTLMGVDGRNFEFQPKEDFWASDDTLDLQGDYSGQQFVVGFNIPFTYEFAKFLIKKADKDGSMTTEDIGRLQLRRAWVNYEESGVFSVKVVHGSTSFNYEMAGSRLGSRKLRIGELNISTDQFRFPVTGNALHTQVFLLSDSPTPLNIIGCGWEGSYIRRSRSL
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 792 AA molecular weight: 89913,40490 Da isoelectric point: 6,96081 aromaticity: 0,11995 hydropathy: -0,38598
Domains
Domains [InterPro]
IPR058003
1–791
1–791
1
792
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Pasteurella phage vB_PmuP_Pa7 [NCBI] |
2767198 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QNL29349.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
MT902335.1
[NCBI]
CDS location
range 20711 -> 23089
strand +
strand +
CDS
ATGCCACTATATAGCCAAAGTATTAAGAATTTAAAAAGTGGTATCAGCCAACAGCCAGAGATTTTAAAATATCCAGAACAAGGTAACCAACAAATTAATGGGTGGTCTAGTGAAATCGCAGGGTTACAAAAGAGACCTCCTATTATCTTCAATCGTATGCTTGGTCGTAAAGGTCTCTATGGGGACGCTCCGTTCATTCATTTAATTAATCGTGATGAACATGAGAGATACTACGCTATCTTCACGGGGTCTGAAATCAAGGTGATTGGTCTTGATGGGACACCTTATGTAGTCAAAGGAAATTTCTCTTATGTGCAAACAAATAACCCACGCAAAGACCTCCGAATGATTACAGTCGCTGATTATACTTTCGTAGTTAATACTTCTAAGGTAATCAAAGAGGACACCTCAAAAAATCTACCAGACTTCAATGAGAAGCAAGATGCTTTGATAAATGTTCGAGGTGGACAATATGGGAGAACTCTCATTGTAGGTTTTAACGGTGCAGAACAAGCAAAATATTTGATTCCAAACGGGGATAAACCAGAACACGTTAAGAACACTGACTCTCAATTTATTGCTGAGGAATTAGCCAAACAAATGAGAGTAAAGTTACCAACATGGACGTTTACTGTTGGTCAAGGCTACATTCACATTCAAGCACCACAAGGCACATCCATTGATAATCTTTATACGAAAGACGGGTATGCAGACCAATTGTTAAACCCTGTGACCCATTATGTCCAGACGTTTAATAAGTTACCGTTAGTGGCACCAGATGGTTACATGGTGAAGATTGTTGGGGACACATCAAAGACAGCTGATAGTTATTACGTTAAGTATAGCGCAGCCAAGAAGGTGTGGGCAGAGACTTTAGGTTGGGATACACCTAAAGGGTTCCTTGATAATACAATGCCACACACATTAGTTCGAGAGTCTGATGGCACATTCTCATTTAAAGTCCATGAATGGAAGCAAAGACGATGTGGTGATAAAGACACAAACCCACTGCCGTCTTTCGTAGATAGTTCTATTACAGATATCTTCTTCTACCGTAACCGACTAGGTTTTCTTAGTGGTGAGAACGTAATCCTAAGTAGGACATCACGTTACTTCGACTTCTTCCCAGCTAGTGTAGCAAATAATTCAGATGATGACCCTATTGATGTAGCAATTAGTCATAATAGGATTAGCAACCTTAAATTTGCGGTTCCATTTAGCGAGGAATTATTATTGTGGTCTGATGAAGCTCAGTTTACACTAAGGTCTTCAAGTATACTCTCAGCTCGAACCATTGAGTTAAACTTAGTGACCGAGTTTGATGTGAGCGACCAAGCAAGACCGTTTGGTATTGGTCGTGGTATTTACTTTGCGAACCCACGAAGCACCTTTACGTCTATCAGTCGGTATTATGCGATACAAGACGTATCGAGTGTGCGTAATGCTGAGGATATGACAGCCCATGTCCCTAACTATATCCCAAATGGGGTCTTTAGTATTCATGGGTCTAACACAGAGAACTTCTGTACGGTGCTTACTAAGGGTGCTCCAAGTAAGATTTTCATATACAAATACTTATTTATGGATGAGCAATTACTCCAACAGTCTTGGTCACATTGGGATTTAGGTGAGGAGTGTACTATCTTGGCTTGTACAACTATTGGTAGTAAGATGACGATTCTATTTGAGAATCAACATAATGTGTTCATAGGGACAGTAAAATTCACAAGAGACATCAAGGACTTCCCACAGGAGCCTTATAGGTCTCATTTAGACTTAAAGACCCTTTACACAATTCCAACCGATAAATATAATATCACAACGAACATCACACGGATTCGTCTAGCTGATATTTATAACAGTGCAAGATTCACAAGAGGTAAAGTTACCTTAATGGGTGTTGATGGTCGAAACTTTGAGTTCCAACCGAAAGAGGACTTCTGGGCATCTGACGACACTTTGGATTTACAAGGGGATTACTCTGGGCAACAATTCGTAGTTGGTTTCAACATTCCGTTTACTTATGAGTTCGCTAAGTTCTTAATTAAGAAAGCGGATAAAGATGGGTCGATGACAACCGAAGATATTGGCAGGTTACAACTACGGAGAGCATGGGTTAACTATGAGGAATCTGGGGTATTCAGTGTGAAAGTCGTTCATGGTTCAACAAGTTTTAACTATGAAATGGCAGGGTCTAGATTAGGGTCTAGGAAGCTTCGTATAGGTGAATTAAACATTAGTACTGACCAGTTCAGATTCCCTGTTACAGGTAATGCTTTACACACACAAGTCTTCTTACTTAGTGACTCACCAACACCACTAAACATTATCGGTTGTGGTTGGGAAGGTAGCTACATTCGTAGGAGTCGCTCGCTTTAA
Tertiary structure
PDB ID
f412a52a00ea465f248a5b7102234b98b5b18ad16fd5e60ee038259bafe0a2ee
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50