Protein

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Genbank accession
WBF80553.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber, proximal subunit
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,63
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,94
Protein sequence
MADIKRKFRAEDGLDAGGDKIVNVALADRTVGTDGVNVDFLVQENTVQVYDSTRGYNKGFVVLYDNRLYQAINDIVSPSGAFNLLQWRAVRTDAQWITVASGTYQLSSGESISVNTGAGNDMVFTLPNTPVDGDTVVLADIGGRTGTVKVQINASVQSILNFRGEQVRTVLMTRPRSQLLFVFSNRLWQMYITDYGKESITVTPASPYQAQANDFIVRRFTSAAPINITLPRNANNGDIIHLVDLDKLNPLYHTIVKTFDDTTSIGEVGTHIAEGRNDSDAFFVFDAASSLWRIWEGDQKSRLRIIRADSNIRPNEEVLIFGTNNATAGTINLTLPTGILSGDTVKISMNYMRKGQTVKIKAAEGDTIASSVALLQFPKRSEYPPDAQWVSVTELEFNGTTSYVPVLELAYIEDTDSDTHYWVVQQNVPTVERVDAGTDATRARLGVIALATQAQANADLENTPAKEVAITPETLANRTATEARRGIAKIATTAQVNQNSTAAFVDDTIVTPKKLNERTATETRRGLAEIATQAETDAGLDDTTIITPKKLQARQGSETLSGIVKYVSTTSATPAATRGAAGTNVYNKTVNNLTISPKALDQYKATYSQQGAVILAVDSEVIAGQSQAGYSHAVVTPETLHKKTSTDGRIGLIEIATQAETNAGTDYTRAVTPKTLNDRKATEGLSGIAELATQVEFDTGTDDTRISTPLKIKTHFDSSDRTSVNSDSGLIEEGTLWNHYTLDISKANETQRGTLRVATQTESNAGTLDDVLITPKKLLGTKSTETSEGVIKVATRAETVTGTSANTAVSPKNLKWIVQNEPTWAATTAIRGFVKTSSGSITFVGDDTQGSTQDLNLYEKNSYAISPYELNRVLANYLPLKAKAADANLLDGIDSSQFIRRDIAQTVNGSLTLTKQTNLSAPLVSSSTATFGGSVSANSTLTISNTGTATRLIFEKGPQTGTNPAQTMSIRVWGNEFGGGSDTTRSTVFEVGDETSNHFYSQRNKDGNIAFSINGTVMPININASGLMNVNGVATFGRSVTANGEFISKSANAFRAISGDYGFFIRNDAANTYFMLTASGDQTGGFNGLRPLAINNASGQVTIGEGLIIAKGATINSGGLTVNSRIRSQGNKTSDLYTLAPTSDTVGFWSIDINDSATYNQFPGYFKMVEKTNEVTGLPYLERGEEVKSPGTLTQFGNTLDSLYQDWITYPTTPEARTTRWTRTWQKTKNSWSSFVQVFDGGNPPQPSDIGALPSDNATIGNLTIRDFLRIGNVRIIPDPVNKSVKFEWIE
Physico‐chemical
properties
protein length:1291 AA
molecular weight: 139432,49770 Da
isoelectric point:5,33459
aromaticity:0,07359
hydropathy:-0,31084

Domains

Domains [InterPro]
DC_1986
ATT
15–140
DC_1986 DC_1209 IPR048391
IPR048390
ATT
981–1094
IPR048390
DC_1209
STR
1000–1276
DC_1209
WBF80553.1
1 1291
Architecture
ATT
STR
ATT
STR
ATT
STR
ATT 15-140 | STR 343-980 | ATT 981-1094 | STR 1095-1140 | ATT 1141-1239 | STR 1240-1276 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage vB_Eco_F31
[NCBI] 		3003734 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Escherichia coli
[NCBI] 		562 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WBF80553.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OP870147 [NCBI]
CDS location
range 151183 -> 155058
strand +
CDS
ATGGCCGACATCAAACGTAAGTTCAGAGCCGAAGACGGTCTGGACGCCGGTGGCGACAAGATTGTTAACGTAGCATTAGCCGACCGTACAGTAGGTACTGATGGCGTAAACGTTGACTTCCTGGTACAAGAAAACACCGTTCAAGTATATGATTCTACGCGTGGATATAACAAAGGATTTGTTGTTCTTTATGACAACCGTTTATATCAAGCAATAAATGATATCGTGTCTCCTTCCGGGGCATTTAACCTTTTACAATGGCGTGCAGTTCGTACTGATGCACAATGGATAACTGTCGCTTCTGGGACTTATCAACTTTCTTCAGGTGAATCTATTTCGGTTAACACTGGTGCCGGCAATGATATGGTTTTCACGTTGCCAAATACGCCGGTTGATGGTGATACTGTTGTTTTGGCTGATATTGGTGGAAGAACCGGGACAGTTAAAGTACAGATTAACGCGTCTGTGCAGAGTATTTTAAACTTTAGAGGTGAACAAGTTCGTACAGTTTTAATGACGCGCCCACGTTCACAACTATTGTTTGTGTTTAGTAATCGTTTGTGGCAGATGTATATTACCGATTATGGTAAAGAATCAATCACTGTTACACCTGCGTCACCATATCAAGCACAAGCAAATGATTTTATCGTTCGTCGTTTTACTAGTGCAGCACCAATCAACATTACACTTCCACGTAATGCTAACAACGGTGATATAATCCACCTAGTTGATTTAGATAAATTAAACCCACTGTATCATACAATTGTTAAAACATTTGATGATACAACGTCTATTGGTGAAGTCGGGACTCATATTGCCGAAGGCAGAAATGACTCTGACGCGTTTTTTGTTTTTGATGCTGCAAGTAGTTTATGGCGTATATGGGAAGGCGACCAGAAATCGCGTCTTCGTATTATCCGTGCGGATTCAAATATTCGTCCAAATGAAGAAGTTCTTATTTTTGGCACAAATAACGCTACAGCCGGAACTATTAATCTTACGCTGCCCACCGGAATTTTGAGTGGTGACACTGTTAAAATTTCAATGAACTACATGCGTAAAGGCCAAACAGTAAAAATTAAAGCTGCCGAAGGTGATACAATTGCTTCTTCTGTTGCATTGCTTCAGTTCCCTAAACGTTCTGAATATCCACCTGATGCTCAATGGGTCTCTGTTACTGAACTAGAATTCAATGGCACTACTTCATATGTTCCTGTATTAGAATTAGCGTATATCGAAGACACTGATTCTGACACTCACTATTGGGTTGTGCAACAGAATGTCCCTACAGTAGAACGTGTTGATGCCGGAACTGATGCTACACGAGCTCGTTTAGGTGTTATTGCTCTTGCTACTCAAGCGCAAGCAAATGCTGATTTAGAGAATACTCCAGCTAAAGAAGTGGCTATTACTCCTGAAACGTTGGCAAATCGTACAGCAACTGAAGCTCGACGTGGTATCGCTAAAATTGCTACAACAGCACAAGTTAACCAGAATTCCACTGCAGCATTTGTGGATGATACTATTGTTACGCCTAAAAAATTAAATGAGCGTACAGCAACTGAAACTCGTCGTGGTCTTGCTGAAATTGCTACTCAGGCTGAAACTGATGCCGGTCTTGATGACACAACGATTATTACACCTAAGAAATTGCAGGCACGTCAGGGTTCTGAAACACTATCTGGTATAGTTAAATATGTATCAACTACTTCTGCTACACCTGCCGCGACTCGTGGAGCTGCAGGTACTAACGTTTATAATAAAACCGTAAATAATTTAACTATTTCTCCTAAAGCCCTTGACCAATATAAAGCAACTTATTCTCAACAAGGTGCAGTAATTTTAGCTGTTGATAGTGAAGTAATTGCCGGCCAATCTCAAGCAGGTTATTCTCACGCTGTAGTAACTCCTGAAACACTACATAAGAAAACTTCCACAGATGGACGTATCGGTTTAATTGAAATTGCTACACAAGCAGAAACTAATGCTGGGACTGATTATACACGTGCAGTAACGCCTAAGACGTTAAATGATAGGAAAGCTACGGAAGGATTATCCGGCATAGCCGAACTTGCTACGCAAGTTGAATTTGATACTGGAACTGATGATACTCGTATCTCAACTCCACTGAAAATTAAAACTCATTTTGATTCTTCTGACCGTACCAGTGTTAATTCTGATTCCGGACTTATTGAAGAAGGAACCTTGTGGAACCATTATACTCTTGATATTTCTAAAGCAAATGAAACACAACGTGGTACACTTCGAGTAGCGACTCAGACAGAATCTAATGCAGGAACTTTAGATGATGTTCTTATTACTCCTAAAAAGCTTTTAGGGACTAAGTCAACTGAAACGTCTGAAGGCGTAATTAAGGTTGCTACTCGGGCCGAAACTGTAACAGGAACTTCTGCTAATACTGCTGTATCGCCTAAGAATTTAAAATGGATTGTCCAGAATGAACCAACATGGGCTGCTACTACGGCAATTCGTGGATTCGTTAAAACTTCATCTGGTTCAATTACATTCGTTGGTGACGATACTCAAGGTAGTACCCAGGATCTGAATCTTTACGAGAAAAATAGTTATGCTATTTCTCCATATGAATTAAACCGTGTACTTGCTAACTATTTGCCATTAAAAGCAAAAGCTGCTGACGCAAATTTATTAGATGGCATAGATTCATCTCAGTTCATTCGTAGGGATATTGCACAGACGGTTAATGGTTCACTAACCTTAACGAAACAAACTAATCTGAGTGCCCCTCTTGTATCATCTAGTACTGCTACATTTGGTGGTTCAGTTTCGGCAAATAGTACATTAACTATTTCTAATACTGGAACGGCAACTCGTCTGATTTTTGAGAAAGGACCTCAAACTGGAACTAACCCAGCGCAGACGATGTCTATCAGAGTTTGGGGAAATGAATTTGGTGGTGGTTCAGATACAACACGTTCTACTGTATTTGAAGTTGGTGATGAAACGTCTAATCATTTTTATTCTCAACGTAATAAAGATGGGAATATAGCGTTTAGCATTAATGGTACTGTGATGCCAATAAACATTAATGCTTCCGGTTTGATGAATGTTAATGGCGTTGCAACATTTGGTCGTTCAGTTACTGCTAATGGCGAATTCATTAGTAAGTCTGCAAATGCTTTCAGAGCAATTAGTGGTGATTACGGATTCTTTATTCGTAATGACGCTGCTAATACCTATTTTATGCTCACTGCATCAGGCGATCAGACCGGCGGATTTAACGGATTACGTCCTTTAGCTATTAATAATGCATCCGGCCAAGTAACGATTGGTGAAGGCTTAATCATTGCCAAAGGTGCTACTATAAATTCAGGTGGTTTGACTGTTAACTCGAGAATTCGTTCTCAGGGTAATAAAACATCTGATTTATATACCCTTGCGCCAACATCTGATACTGTAGGATTCTGGTCAATTGATATTAACGATTCAGCCACTTATAACCAGTTCCCAGGTTATTTTAAAATGGTTGAAAAAACTAATGAAGTGACTGGGCTTCCATACTTAGAACGTGGCGAAGAAGTTAAATCTCCTGGTACATTGACTCAGTTTGGTAATACACTTGATTCACTTTACCAAGATTGGATTACTTATCCAACAACTCCAGAAGCACGTACAACCCGTTGGACACGTACATGGCAGAAAACTAAAAATTCTTGGTCAAGTTTTGTTCAGGTATTTGATGGTGGAAACCCTCCTCAACCTTCTGATATTGGTGCTTTACCTTCTGATAATGCAACAATCGGAAACTTGACAATAAGGGATTTCTTAAGGATTGGTAATGTCCGCATTATTCCAGACCCTGTGAATAAATCTGTTAAATTCGAGTGGATTGAATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
1ca947308c8dd5afc66da6e0bbd7eae6a0a94bd6712bd37a64ad7e69021b180d
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5517
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50