Protein
View in Explore- Genbank accession
- WBF80553.1 [GenBank]
- Protein name
- long tail fiber, proximal subunit
- RBP type
-
TFTF
- Protein sequence
-
MADIKRKFRAEDGLDAGGDKIVNVALADRTVGTDGVNVDFLVQENTVQVYDSTRGYNKGFVVLYDNRLYQAINDIVSPSGAFNLLQWRAVRTDAQWITVASGTYQLSSGESISVNTGAGNDMVFTLPNTPVDGDTVVLADIGGRTGTVKVQINASVQSILNFRGEQVRTVLMTRPRSQLLFVFSNRLWQMYITDYGKESITVTPASPYQAQANDFIVRRFTSAAPINITLPRNANNGDIIHLVDLDKLNPLYHTIVKTFDDTTSIGEVGTHIAEGRNDSDAFFVFDAASSLWRIWEGDQKSRLRIIRADSNIRPNEEVLIFGTNNATAGTINLTLPTGILSGDTVKISMNYMRKGQTVKIKAAEGDTIASSVALLQFPKRSEYPPDAQWVSVTELEFNGTTSYVPVLELAYIEDTDSDTHYWVVQQNVPTVERVDAGTDATRARLGVIALATQAQANADLENTPAKEVAITPETLANRTATEARRGIAKIATTAQVNQNSTAAFVDDTIVTPKKLNERTATETRRGLAEIATQAETDAGLDDTTIITPKKLQARQGSETLSGIVKYVSTTSATPAATRGAAGTNVYNKTVNNLTISPKALDQYKATYSQQGAVILAVDSEVIAGQSQAGYSHAVVTPETLHKKTSTDGRIGLIEIATQAETNAGTDYTRAVTPKTLNDRKATEGLSGIAELATQVEFDTGTDDTRISTPLKIKTHFDSSDRTSVNSDSGLIEEGTLWNHYTLDISKANETQRGTLRVATQTESNAGTLDDVLITPKKLLGTKSTETSEGVIKVATRAETVTGTSANTAVSPKNLKWIVQNEPTWAATTAIRGFVKTSSGSITFVGDDTQGSTQDLNLYEKNSYAISPYELNRVLANYLPLKAKAADANLLDGIDSSQFIRRDIAQTVNGSLTLTKQTNLSAPLVSSSTATFGGSVSANSTLTISNTGTATRLIFEKGPQTGTNPAQTMSIRVWGNEFGGGSDTTRSTVFEVGDETSNHFYSQRNKDGNIAFSINGTVMPININASGLMNVNGVATFGRSVTANGEFISKSANAFRAISGDYGFFIRNDAANTYFMLTASGDQTGGFNGLRPLAINNASGQVTIGEGLIIAKGATINSGGLTVNSRIRSQGNKTSDLYTLAPTSDTVGFWSIDINDSATYNQFPGYFKMVEKTNEVTGLPYLERGEEVKSPGTLTQFGNTLDSLYQDWITYPTTPEARTTRWTRTWQKTKNSWSSFVQVFDGGNPPQPSDIGALPSDNATIGNLTIRDFLRIGNVRIIPDPVNKSVKFEWIE
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1291 AA molecular weight: 139432,49770 Da isoelectric point: 5,33459 aromaticity: 0,07359 hydropathy: -0,31084
Domains
Domains [InterPro]
IPR048390
981–1094
981–1094
1
1291
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Escherichia phage vB_Eco_F31 [NCBI] |
3003734 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WBF80553.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
OP870147
[NCBI]
CDS location
range 151183 -> 155058
strand +
strand +
CDS
ATGGCCGACATCAAACGTAAGTTCAGAGCCGAAGACGGTCTGGACGCCGGTGGCGACAAGATTGTTAACGTAGCATTAGCCGACCGTACAGTAGGTACTGATGGCGTAAACGTTGACTTCCTGGTACAAGAAAACACCGTTCAAGTATATGATTCTACGCGTGGATATAACAAAGGATTTGTTGTTCTTTATGACAACCGTTTATATCAAGCAATAAATGATATCGTGTCTCCTTCCGGGGCATTTAACCTTTTACAATGGCGTGCAGTTCGTACTGATGCACAATGGATAACTGTCGCTTCTGGGACTTATCAACTTTCTTCAGGTGAATCTATTTCGGTTAACACTGGTGCCGGCAATGATATGGTTTTCACGTTGCCAAATACGCCGGTTGATGGTGATACTGTTGTTTTGGCTGATATTGGTGGAAGAACCGGGACAGTTAAAGTACAGATTAACGCGTCTGTGCAGAGTATTTTAAACTTTAGAGGTGAACAAGTTCGTACAGTTTTAATGACGCGCCCACGTTCACAACTATTGTTTGTGTTTAGTAATCGTTTGTGGCAGATGTATATTACCGATTATGGTAAAGAATCAATCACTGTTACACCTGCGTCACCATATCAAGCACAAGCAAATGATTTTATCGTTCGTCGTTTTACTAGTGCAGCACCAATCAACATTACACTTCCACGTAATGCTAACAACGGTGATATAATCCACCTAGTTGATTTAGATAAATTAAACCCACTGTATCATACAATTGTTAAAACATTTGATGATACAACGTCTATTGGTGAAGTCGGGACTCATATTGCCGAAGGCAGAAATGACTCTGACGCGTTTTTTGTTTTTGATGCTGCAAGTAGTTTATGGCGTATATGGGAAGGCGACCAGAAATCGCGTCTTCGTATTATCCGTGCGGATTCAAATATTCGTCCAAATGAAGAAGTTCTTATTTTTGGCACAAATAACGCTACAGCCGGAACTATTAATCTTACGCTGCCCACCGGAATTTTGAGTGGTGACACTGTTAAAATTTCAATGAACTACATGCGTAAAGGCCAAACAGTAAAAATTAAAGCTGCCGAAGGTGATACAATTGCTTCTTCTGTTGCATTGCTTCAGTTCCCTAAACGTTCTGAATATCCACCTGATGCTCAATGGGTCTCTGTTACTGAACTAGAATTCAATGGCACTACTTCATATGTTCCTGTATTAGAATTAGCGTATATCGAAGACACTGATTCTGACACTCACTATTGGGTTGTGCAACAGAATGTCCCTACAGTAGAACGTGTTGATGCCGGAACTGATGCTACACGAGCTCGTTTAGGTGTTATTGCTCTTGCTACTCAAGCGCAAGCAAATGCTGATTTAGAGAATACTCCAGCTAAAGAAGTGGCTATTACTCCTGAAACGTTGGCAAATCGTACAGCAACTGAAGCTCGACGTGGTATCGCTAAAATTGCTACAACAGCACAAGTTAACCAGAATTCCACTGCAGCATTTGTGGATGATACTATTGTTACGCCTAAAAAATTAAATGAGCGTACAGCAACTGAAACTCGTCGTGGTCTTGCTGAAATTGCTACTCAGGCTGAAACTGATGCCGGTCTTGATGACACAACGATTATTACACCTAAGAAATTGCAGGCACGTCAGGGTTCTGAAACACTATCTGGTATAGTTAAATATGTATCAACTACTTCTGCTACACCTGCCGCGACTCGTGGAGCTGCAGGTACTAACGTTTATAATAAAACCGTAAATAATTTAACTATTTCTCCTAAAGCCCTTGACCAATATAAAGCAACTTATTCTCAACAAGGTGCAGTAATTTTAGCTGTTGATAGTGAAGTAATTGCCGGCCAATCTCAAGCAGGTTATTCTCACGCTGTAGTAACTCCTGAAACACTACATAAGAAAACTTCCACAGATGGACGTATCGGTTTAATTGAAATTGCTACACAAGCAGAAACTAATGCTGGGACTGATTATACACGTGCAGTAACGCCTAAGACGTTAAATGATAGGAAAGCTACGGAAGGATTATCCGGCATAGCCGAACTTGCTACGCAAGTTGAATTTGATACTGGAACTGATGATACTCGTATCTCAACTCCACTGAAAATTAAAACTCATTTTGATTCTTCTGACCGTACCAGTGTTAATTCTGATTCCGGACTTATTGAAGAAGGAACCTTGTGGAACCATTATACTCTTGATATTTCTAAAGCAAATGAAACACAACGTGGTACACTTCGAGTAGCGACTCAGACAGAATCTAATGCAGGAACTTTAGATGATGTTCTTATTACTCCTAAAAAGCTTTTAGGGACTAAGTCAACTGAAACGTCTGAAGGCGTAATTAAGGTTGCTACTCGGGCCGAAACTGTAACAGGAACTTCTGCTAATACTGCTGTATCGCCTAAGAATTTAAAATGGATTGTCCAGAATGAACCAACATGGGCTGCTACTACGGCAATTCGTGGATTCGTTAAAACTTCATCTGGTTCAATTACATTCGTTGGTGACGATACTCAAGGTAGTACCCAGGATCTGAATCTTTACGAGAAAAATAGTTATGCTATTTCTCCATATGAATTAAACCGTGTACTTGCTAACTATTTGCCATTAAAAGCAAAAGCTGCTGACGCAAATTTATTAGATGGCATAGATTCATCTCAGTTCATTCGTAGGGATATTGCACAGACGGTTAATGGTTCACTAACCTTAACGAAACAAACTAATCTGAGTGCCCCTCTTGTATCATCTAGTACTGCTACATTTGGTGGTTCAGTTTCGGCAAATAGTACATTAACTATTTCTAATACTGGAACGGCAACTCGTCTGATTTTTGAGAAAGGACCTCAAACTGGAACTAACCCAGCGCAGACGATGTCTATCAGAGTTTGGGGAAATGAATTTGGTGGTGGTTCAGATACAACACGTTCTACTGTATTTGAAGTTGGTGATGAAACGTCTAATCATTTTTATTCTCAACGTAATAAAGATGGGAATATAGCGTTTAGCATTAATGGTACTGTGATGCCAATAAACATTAATGCTTCCGGTTTGATGAATGTTAATGGCGTTGCAACATTTGGTCGTTCAGTTACTGCTAATGGCGAATTCATTAGTAAGTCTGCAAATGCTTTCAGAGCAATTAGTGGTGATTACGGATTCTTTATTCGTAATGACGCTGCTAATACCTATTTTATGCTCACTGCATCAGGCGATCAGACCGGCGGATTTAACGGATTACGTCCTTTAGCTATTAATAATGCATCCGGCCAAGTAACGATTGGTGAAGGCTTAATCATTGCCAAAGGTGCTACTATAAATTCAGGTGGTTTGACTGTTAACTCGAGAATTCGTTCTCAGGGTAATAAAACATCTGATTTATATACCCTTGCGCCAACATCTGATACTGTAGGATTCTGGTCAATTGATATTAACGATTCAGCCACTTATAACCAGTTCCCAGGTTATTTTAAAATGGTTGAAAAAACTAATGAAGTGACTGGGCTTCCATACTTAGAACGTGGCGAAGAAGTTAAATCTCCTGGTACATTGACTCAGTTTGGTAATACACTTGATTCACTTTACCAAGATTGGATTACTTATCCAACAACTCCAGAAGCACGTACAACCCGTTGGACACGTACATGGCAGAAAACTAAAAATTCTTGGTCAAGTTTTGTTCAGGTATTTGATGGTGGAAACCCTCCTCAACCTTCTGATATTGGTGCTTTACCTTCTGATAATGCAACAATCGGAAACTTGACAATAAGGGATTTCTTAAGGATTGGTAATGTCCGCATTATTCCAGACCCTGTGAATAAATCTGTTAAATTCGAGTGGATTGAATAA
Tertiary structure
PDB ID
1ca947308c8dd5afc66da6e0bbd7eae6a0a94bd6712bd37a64ad7e69021b180d
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50