Protein
View in Explore- Genbank accession
- CAO0863469.1 [GenBank]
- Protein name
- virion structural protein
- RBP type
-
TF
- Protein sequence
-
MYNPILQLPFDPLGTNPDCFIGSEPHTLVQYQGFDYRIIKLYHGGFYTKGLEVYDGKYNRLVKDIDYIVTYYHKDASAYVGQEICSAIVFLKTPSTPIVYTSAHMVGGDLAFSFTVIDDYINWWKTNGKPKPKDLDYTGNEPYWKDGELVGERWHLDTYQPYNNEMEWITQALMAGDTNGEDEYRSKVKEIYDEFLKKFNDRLEKHIQDKANPHKITPTNVELGLVNNFPLATPAIAQLGQSNAHYLTPQLAYGVLDEIAIKPLNAHIARRDNPHKVKNTHVQSYLKSDFDTRITGKYLKTDTVANTNMVYYKPKGQPTATLMGYSDLIWWMRKNFDTDVNFTAGDGQSNVININRIGSGTMGQWKAPLRGNGIFTHFDQLATEYSFPVKLKFYALGLQPSVQAALDFCRTNFTNLDTWPIGSTVFFTIKEQKIQAAGNGLIFVDYTPNYVCFRSQGGWVIP
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 462 AA molecular weight: 52685,96400 Da isoelectric point: 6,31574 aromaticity: 0,13636 hydropathy: -0,42641
Taxonomy
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
CAO0863469.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
OZ318595
[NCBI]
CDS location
range 158785 -> 160173
strand -
strand -
CDS
ATGTATAATCCTATTTTACAATTACCATTTGATCCATTAGGTACAAATCCAGATTGTTTCATTGGTAGTGAACCACATACTCTAGTTCAGTATCAAGGGTTCGACTATAGAATCATCAAATTATATCATGGTGGATTCTATACAAAAGGGTTAGAAGTTTATGATGGTAAATATAATCGTTTAGTTAAAGATATCGATTACATTGTTACTTATTATCATAAAGATGCTAGTGCATATGTTGGTCAAGAAATATGCTCAGCAATTGTTTTCTTAAAAACACCTAGTACACCAATAGTGTATACTTCAGCTCACATGGTTGGTGGTGACCTAGCTTTTAGTTTCACAGTTATTGATGATTATATTAACTGGTGGAAAACAAATGGTAAACCAAAGCCAAAAGACCTTGACTACACTGGTAATGAACCATACTGGAAAGATGGTGAGTTAGTTGGTGAACGATGGCATCTTGATACATATCAGCCTTACAATAATGAGATGGAGTGGATAACACAAGCACTCATGGCTGGCGATACAAATGGTGAAGATGAATATCGTAGTAAAGTTAAAGAGATCTATGATGAATTTTTAAAGAAATTTAATGATCGGCTAGAAAAACATATTCAAGATAAAGCCAATCCGCACAAGATTACTCCAACCAATGTAGAACTAGGTTTAGTTAATAACTTCCCATTAGCTACTCCAGCCATTGCTCAACTAGGTCAATCTAATGCACATTATCTAACACCACAATTAGCATATGGTGTATTAGATGAAATAGCTATAAAACCACTCAATGCTCACATAGCTCGTCGAGATAATCCACATAAAGTCAAAAATACACATGTACAGTCATATTTGAAAAGTGATTTCGATACACGGATCACTGGTAAGTATTTAAAGACTGATACGGTAGCTAATACCAATATGGTTTATTATAAACCTAAAGGGCAACCTACTGCTACTTTAATGGGTTATAGCGATCTTATTTGGTGGATGCGCAAGAACTTTGATACCGATGTGAACTTTACAGCTGGTGATGGTCAGAGTAATGTCATCAATATAAATCGGATTGGTTCTGGTACAATGGGGCAATGGAAAGCACCACTCCGTGGGAATGGTATATTTACACATTTTGATCAATTAGCCACAGAGTATTCATTTCCGGTTAAGTTAAAGTTTTATGCACTAGGATTACAACCATCCGTGCAGGCAGCATTAGATTTCTGTAGAACTAACTTTACTAATCTAGATACATGGCCTATTGGATCTACTGTATTCTTTACTATTAAAGAACAGAAAATCCAGGCAGCTGGTAACGGATTGATTTTCGTTGATTATACTCCTAACTACGTGTGTTTCCGTTCACAAGGTGGCTGGGTAATTCCATAA
Genome Context
Tertiary structure
CAO0863469.1
ESMFold structure
Source
ESMFold
pLDDT
57.9
Oligomeric state
monomer