Protein

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Genbank accession
AFF28264.1 [GenBank]
Protein name
gp266
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,88
Protein sequence
MENLQDTGIRLKQLSVSDWNTLIENLNYNFSILLSSPLFKGMPGREGLPGPSTNGERGSRWFWAIWDDFRVAYNLTNPNQVNLAFINGQLASDLAKLCDTLKTDSIISNDNIVLPDGSIITFDITLGKFKDAGMSFAQAQGVTEQRVNQMINDAIAGINEGSIIYEVFKAYAKNFPDATTSGNNNQVNPDSIIDIGSPLSKPGYLLDKHRFVALSTSNMNSMDDATTFIFGAAEMYHNLIQKTQNGAGKTTNEYGPGVNDSTALAVLQDNYKNGIIIGYKGANTLRDFARIYRDLNALRLTSNYSVYENEFSEIIIREDVIKLRTKDMSQTSEVQVESNFKVIGKARFMSDILHTAFEVLTAQNVTNIGIHQSLMPVGQTYKIDFKETPTFSTIPNMTFLSTDALGKVRGSGYTVTGVVNGSSTSTQIPTALAVMNALNGFNQNIANQIATINNSINVLNNNVGNLQRDALQFRNSVAIPSDASPNGIYRLAAGTSPNNQPGYVLNLVDTSTSTKAQFAVTTTDILFRASTSSINSVAWITLAKKTDLDNVNAALTARLNGHDVDISNLSSLVSGNYTTLDNKINTVNTNLTNKINSDIANTVTMLRTETVQAIQGISVSGGLIKSNVGNSINIAHPTFGTTVQQEANPSRIITSISTNNGHVTDVKWTPFTSTGELVYGMVIDLIAFYTPPGYWNWWNDSGSMNFHRAIVGQYFELNGRGKVNAQAMISGGTIKEFDLSKFVLCDGRNGTPNLTGLVLIGQGYSKALDSYGYRVDPGFYISGDALIPHTPNTGSHEYGLPIYGLSTKRLSIAEMPAHDHQVTFMEPYQEREGGGTKTRYVQASSKTKTTTSTGNGNRFSILPTSFSTFKLMYTG
Physico‐chemical
properties
protein length:875 AA
molecular weight: 95334,80600 Da
isoelectric point:6,10578
aromaticity:0,08686
hydropathy:-0,23360

Domains

Domains [InterPro]
Coil
442–469
Coil
AFF28264.1
1 875
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Sphingomonas phage PAU
[NCBI] 		1150991 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Sphingomonas paucimobilis
[NCBI] 		13689 Bacteria > Proteobacteria > Alphaproteobacteria > Sphingomonadales > Sphingomonadaceae > Sphingomonas

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AFF28264.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
JQ362498 [NCBI]
CDS location
range 194551 -> 197178
strand +
CDS
ATGGAAAATCTTCAAGATACTGGTATAAGGCTTAAACAACTATCCGTTAGTGATTGGAATACTTTAATTGAGAATTTGAACTATAACTTCTCGATACTTTTATCCAGTCCTTTGTTCAAGGGTATGCCTGGTAGGGAAGGTCTTCCAGGTCCTTCAACTAACGGTGAAAGGGGTTCAAGATGGTTTTGGGCTATTTGGGATGATTTCAGAGTAGCTTACAATCTAACGAATCCTAATCAAGTGAATTTAGCTTTCATAAATGGGCAATTGGCTTCAGATTTAGCTAAATTATGTGACACTTTAAAAACTGATTCGATTATATCAAATGATAATATAGTTTTACCTGACGGAAGTATCATAACATTCGATATTACTTTAGGTAAGTTCAAGGATGCTGGAATGTCATTTGCACAAGCACAAGGTGTTACCGAACAACGTGTTAATCAAATGATTAATGATGCTATCGCAGGTATTAACGAAGGTTCTATCATTTATGAAGTATTTAAAGCTTACGCAAAGAACTTCCCTGATGCTACAACTTCTGGAAATAATAATCAAGTAAACCCTGATTCTATTATCGATATCGGTTCTCCTTTATCGAAACCAGGATATCTTCTAGATAAACATAGATTCGTAGCATTATCAACTTCGAATATGAATTCTATGGATGATGCTACAACATTCATATTCGGTGCTGCTGAAATGTATCATAACTTGATTCAAAAGACTCAGAACGGTGCTGGTAAAACAACTAACGAATATGGTCCAGGTGTAAACGATTCTACAGCTTTAGCTGTATTACAGGATAACTATAAAAATGGTATCATAATCGGTTACAAAGGAGCTAATACACTTAGAGACTTTGCTAGAATTTATAGGGATCTAAACGCTTTACGATTAACTTCGAATTATTCAGTATACGAAAACGAATTCTCAGAAATCATAATTCGTGAAGACGTTATTAAGTTACGTACTAAGGATATGTCACAGACTAGTGAAGTTCAGGTTGAATCGAATTTCAAAGTTATTGGTAAGGCTAGATTTATGTCTGATATCTTACATACAGCATTTGAAGTATTAACTGCTCAAAATGTAACGAACATTGGTATACATCAATCTTTAATGCCTGTTGGACAGACTTACAAAATAGATTTCAAGGAAACTCCTACATTTAGTACGATTCCAAACATGACATTTTTAAGTACTGATGCTTTAGGTAAGGTTAGAGGTTCTGGATATACTGTTACTGGTGTGGTTAATGGTTCTTCAACTTCTACACAGATTCCAACAGCTTTAGCTGTAATGAACGCTTTAAATGGATTCAATCAGAATATAGCAAATCAAATAGCTACGATTAATAACAGTATAAACGTTTTAAATAATAACGTAGGTAATTTACAAAGGGATGCTTTACAATTTAGAAATTCTGTTGCTATTCCAAGTGATGCTTCACCTAATGGTATTTATCGATTAGCTGCTGGAACTTCTCCTAATAATCAACCAGGATATGTTTTGAATTTGGTAGATACTTCTACTTCCACTAAAGCTCAATTTGCTGTAACAACTACTGATATATTGTTCAGAGCTTCGACAAGTTCTATAAATTCTGTAGCTTGGATTACTTTAGCTAAAAAGACTGATTTGGATAATGTTAATGCTGCATTAACAGCCAGACTTAATGGTCATGATGTTGATATATCAAATTTAAGTTCGTTAGTTTCTGGTAACTATACAACACTAGATAATAAGATAAATACAGTAAATACGAATCTTACTAATAAGATAAACAGTGATATAGCTAATACTGTTACAATGCTAAGAACTGAAACTGTACAAGCTATTCAAGGTATATCAGTTTCTGGTGGGTTGATAAAATCTAACGTAGGTAACTCCATCAATATAGCTCACCCGACATTCGGAACTACTGTTCAACAGGAAGCTAATCCAAGTAGAATCATTACTTCGATTAGTACTAATAATGGTCATGTAACAGATGTAAAATGGACACCTTTTACATCAACTGGTGAGTTAGTTTATGGTATGGTTATAGACTTGATAGCATTCTACACACCTCCAGGATATTGGAATTGGTGGAATGATAGTGGTAGTATGAATTTTCATAGGGCTATAGTTGGTCAGTATTTCGAGCTTAATGGAAGAGGTAAAGTAAATGCACAAGCTATGATAAGTGGTGGTACAATTAAAGAATTTGATTTAAGTAAATTCGTTTTATGTGATGGTAGAAATGGTACACCAAACCTTACTGGTCTAGTACTTATAGGTCAAGGTTATTCTAAAGCTTTAGATAGTTATGGTTACAGAGTAGACCCAGGTTTTTACATATCTGGTGACGCATTGATTCCACATACACCGAATACAGGTTCACATGAATATGGTCTACCGATTTATGGTTTGTCCACAAAGAGATTAAGTATAGCTGAAATGCCAGCCCACGATCACCAAGTTACATTTATGGAACCTTATCAAGAAAGAGAAGGTGGTGGTACTAAAACAAGATATGTACAAGCTTCATCTAAAACTAAAACTACGACAAGTACTGGTAATGGTAACAGATTCTCAATATTACCAACATCTTTCTCGACATTCAAGTTAATGTATACAGGTTAG

Tertiary structure

PDB ID
c94c0de9daf95d889f1ec6f90d01d3ce60701a80e613864c730c5b3e50279344
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2483
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50