Protein

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Genbank accession
QBQ72452.1 [GenBank]
Protein name
putative tail fiber protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,85
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MAGYSRQSVADIIANAVIKAAPVNAEYNAIRDAFAFSGGHKHDGSSTEGAYVPLIADTDALNKVVVDTANNRIGIFTEVSSAAVEQIRIQDGAIVPVTDNDIDLGTSSLKYKNIYVNGIASIGSITLSGGTIDNTVIGGTTPAAADFTTMDASGNATVGGTLGVTGNTTIGGTLGVTGVTTLGTANITSVDIGSGAMDGTTIGATTAAAGTFTNLTATGTTTLTTVDINGGAIDGTAIGATSASTGAFTTLSATGTSTLSTVDINAGNIDGTIIGASSAAAGSFTTVSTSGQATLATADINGGTIDGAVIGATTPAAITGTTVTATSFVGPVTGNITGNVTGNVTGNVTGDVTGNVTASSGTSTFNNVTVNGTLNMDAGTTATITNLTSPTNTNDAATKGYVDTSVANLVDSAPGTLDTLNELAAALGDDPNFSTTITNSIATKLPLAGGTMTGAIAMGTNKITGLGDPTAAQDAATQNYVTTNFLGLTGGTMTGAIDMGSAKITTTYTPTNAADLTTKTYVDGILGSATAAAASATAAATSETNAATSETNAANSATAAASSATSAAASYDSFDDRYLGAKASAPALDNDGDALVLGALYFNTTTDIMYVYGSSGWQAAGSSVNGTAERNTYTATSGQTTFSATYDPGYVDVYLNGVKLLANTDFTATSGTSIVLTTGAATGDIVDIVAYGTFVVADTYTKSQSDARYVEVAGDTMTGTLNGTSAVFSGNLTVDTNTLHVDSTNNRVGVGTTSPSRQLHLSGSTPIIRLTDTDTNAYGEISSSSSDGNLMFYADQGNTQANTTIRFYVDTSERMRIDSSGNVGIGTSSFANLLNLHQSDASSNSYLHVTHVDSGTGASNGLSIGLESNGIDAAFRNRESGSVKLYTGNSERMRIDSSGNLLVGTTVTPVNLLTATSGGGMGFDPTDNYLVVAREGTNSSKPVIRLNQTGVDGSIAEFRKDGTTVGSIDTHGGVIQFGQGNVNLAFENGADVIYPANDNGTNNNGDIDLGTSSARFKGLYLSGGVVENTTTVTYASSIALTYNNGSIQTVTLTGNVTFTNSLADGEAIVYRMHPQTLIFM
Physico‐chemical
properties
protein length:1080 AA
molecular weight: 108354,92610 Da
isoelectric point:4,19258
aromaticity:0,05648
hydropathy:0,00731

Domains

Domains [InterPro]
IPR051934
373–500
IPR051934
QBQ72452.1
1 1080
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Roseobacter phage CRP-1
[NCBI] 		2559280 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QBQ72452.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MK613343 [NCBI]
CDS location
range 33886 -> 37128
strand -
CDS
ATGGCAGGTTATAGCAGACAATCAGTAGCAGATATTATCGCTAATGCGGTTATCAAAGCTGCACCAGTAAACGCAGAATACAACGCTATTCGTGATGCGTTTGCTTTCTCAGGCGGTCACAAACACGATGGTAGCTCTACTGAAGGTGCTTACGTACCTTTGATTGCTGACACTGATGCATTAAACAAAGTTGTAGTAGATACAGCTAACAACCGCATAGGTATCTTTACTGAGGTATCTAGTGCTGCAGTAGAACAGATACGTATTCAAGACGGTGCTATTGTTCCTGTAACAGACAACGACATTGACCTTGGTACTTCATCACTAAAATATAAAAACATTTATGTAAACGGTATTGCAAGCATTGGCTCCATCACACTGTCAGGTGGTACAATAGACAATACTGTTATTGGTGGTACTACTCCTGCCGCTGCTGACTTTACTACAATGGATGCATCAGGTAATGCTACTGTCGGTGGTACTCTTGGTGTCACAGGTAACACAACAATAGGTGGCACACTAGGTGTAACAGGTGTAACTACACTAGGCACTGCTAACATTACCTCTGTAGACATTGGCTCTGGTGCAATGGATGGAACTACTATTGGTGCCACAACTGCTGCAGCAGGTACATTTACTAACCTGACTGCTACAGGTACAACTACTCTTACAACAGTAGATATTAACGGTGGTGCTATTGATGGCACTGCTATCGGTGCAACTAGTGCATCTACTGGTGCTTTTACTACTCTGTCTGCCACAGGTACATCTACACTAAGCACAGTAGACATTAACGCAGGTAATATAGATGGTACTATTATTGGTGCTAGCAGTGCTGCTGCTGGTAGTTTTACAACTGTATCGACATCTGGACAAGCTACCTTGGCGACTGCTGACATTAATGGTGGCACTATTGACGGTGCTGTTATTGGTGCAACAACTCCAGCAGCTATCACAGGCACGACAGTTACAGCAACTTCTTTTGTTGGGCCAGTCACAGGTAACATCACAGGAAACGTTACAGGCAATGTAACTGGTAATGTCACAGGTGATGTAACAGGTAACGTTACTGCTTCAAGTGGTACATCTACATTTAACAACGTTACTGTTAATGGTACGTTGAACATGGATGCAGGTACAACTGCTACCATTACTAACCTAACAAGTCCAACTAACACAAATGATGCTGCCACTAAGGGGTATGTAGATACCTCTGTAGCTAACCTTGTAGACTCAGCCCCAGGTACACTAGACACACTAAACGAACTAGCTGCTGCTCTAGGTGATGACCCTAACTTCTCAACTACTATTACTAACAGCATAGCAACCAAGCTACCACTAGCAGGTGGTACGATGACTGGTGCTATTGCTATGGGTACAAACAAGATTACTGGCTTGGGTGATCCTACTGCAGCACAGGATGCAGCTACACAAAACTATGTAACAACTAACTTCTTAGGCTTAACAGGTGGCACTATGACAGGTGCTATCGACATGGGTAGTGCTAAGATTACAACTACCTATACACCTACTAACGCTGCTGATTTGACTACTAAAACATATGTAGACGGTATTCTAGGTAGTGCTACAGCCGCTGCTGCTAGTGCAACTGCTGCTGCTACATCGGAGACTAATGCAGCAACAAGTGAAACTAATGCGGCTAACTCAGCCACTGCTGCTGCAAGTTCAGCAACCAGTGCTGCAGCATCATATGATTCATTTGATGATCGTTACTTAGGTGCTAAAGCTTCTGCTCCTGCCCTAGATAATGACGGTGATGCTCTTGTACTTGGTGCATTGTACTTCAATACTACTACAGACATTATGTATGTCTATGGTAGCTCTGGGTGGCAAGCTGCAGGTTCATCTGTAAACGGTACAGCAGAACGTAATACTTACACAGCCACATCTGGTCAGACAACATTCAGTGCTACTTATGATCCAGGCTATGTAGATGTATATTTGAATGGTGTTAAGTTACTAGCTAATACAGACTTCACTGCTACATCAGGTACATCTATTGTACTAACTACAGGCGCAGCTACAGGTGACATCGTTGATATTGTAGCTTATGGTACATTCGTTGTAGCTGATACTTATACTAAGTCACAGTCTGATGCTCGTTATGTTGAAGTAGCTGGCGATACTATGACTGGTACACTTAACGGTACATCAGCAGTATTCAGTGGCAATCTGACAGTAGATACAAACACACTACACGTTGATAGCACAAATAATCGTGTTGGGGTTGGGACAACTTCGCCTAGCAGACAGCTTCATCTTTCTGGTTCTACACCAATCATTAGGCTGACCGACACAGATACAAACGCATATGGGGAAATTAGTAGTTCATCTTCGGATGGGAACTTAATGTTCTATGCTGACCAAGGCAACACACAAGCAAATACAACAATACGGTTTTATGTTGATACTTCAGAACGCATGCGCATCGACAGTTCTGGTAATGTTGGGATCGGGACGAGTTCGTTCGCCAACCTTTTAAATCTCCACCAGTCGGATGCATCCTCAAACTCTTATCTTCATGTAACTCATGTTGATAGTGGAACTGGTGCATCAAATGGTTTGTCTATTGGGCTAGAAAGTAACGGTATAGACGCAGCATTTAGAAACCGTGAAAGCGGCAGTGTTAAACTGTATACTGGTAACTCAGAACGCATGCGCATCGACAGCAGCGGTAACTTGCTGGTGGGGACTACTGTTACACCTGTTAACTTGCTAACTGCAACAAGCGGCGGTGGCATGGGGTTTGATCCAACTGATAATTACTTGGTCGTTGCGAGAGAGGGAACTAACAGCTCAAAACCTGTTATTCGATTAAATCAAACAGGCGTTGATGGGTCTATTGCAGAGTTCCGCAAAGACGGCACCACTGTGGGGAGTATTGATACCCACGGCGGTGTTATTCAGTTTGGTCAGGGTAATGTAAACCTAGCATTCGAAAATGGTGCAGATGTAATCTATCCCGCAAACGATAATGGCACCAACAATAATGGAGATATAGATTTAGGTACGTCAAGTGCTCGCTTCAAAGGCCTCTACCTCTCTGGGGGCGTAGTAGAAAACACAACCACAGTTACATACGCATCATCTATTGCTCTTACCTACAACAATGGTTCTATCCAAACAGTCACACTTACAGGCAACGTCACATTTACTAACAGCTTGGCAGACGGTGAAGCCATTGTGTATCGGATGCATCCTCAAACTCTTATCTTCATGTAA

Tertiary structure

PDB ID
4f1e798988fbd9cd2d0671323d8a55636f9eca547a048d5a85e255162910ebe6
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2554
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Diverse, abundant and novel viruses infecting the marine abundant Roseobacter RCA lineage Zhang,Z.F., Chen,F., Chu,X., Zhang,H., Luo,H.W., Zhai,Z.Q., Yang,M.Y. and Zhao,Y.L. 2019 — GenBank