Protein
View in Explore- Genbank accession
- VAY28108.1 [GenBank]
- Protein name
- side tail fiber protein
- RBP type
-
TSPTSPTFTF
- Protein sequence
-
MATRLYGTLRDGLGKPIINATVALLAKGNSLTVLSSSEAIFKTSATGTYDITVQTGYYKVIIGPQGSEPYKAGEIAIYADSKEGTLNNYLTTWAPEELTPEVIAQVRDLVSQAETAKNASSTSATKSEQERVKAEAAAKKAEDTANGMKASIGLTSSARHVADITVNPSSFLGFLRILRSSTVGYPGIANSDNVLGGFISPMDGSPGFIGLFIGDVTGTVYSYKWTAQTGTVWWKGVLYSQVDRLAQASTETALYSPNRNAKIIVENNISWGAFDVSGSRYLPLPVNRGGTGALTIADAKTNLQIPEGGLSNIITINAPEGSEDEKYYPIIIYTGNMNGYGNMLCPVDIVTKSAPANDPMNNSSFFGYIRCGGWSDLKDAAFGYLATYDPKEVGILCVKGSKKDYSNHIAFYIHKKAFPIRIQVGYKANVIVPIEDYVLGTNGVRFKFGVSAPTEGDTENNVTNILNFEGGGSGFYSNSPFRQGSSQNFALTNNLSTGDSFIASIPSFTLLGKIQATQGFIGYSDSTEGRSFISRRTNAEKNITLDQTELRAGDSNGQIVVRDMSSAARHQFFNFNLDGTFSSPNGLLSATGSDWNGQINTVNKFYGIAGGVNGPEHSTNVVYGGVHVGFSGNYAFQIAGRRNNAFIRTIEASTNGEWLKLLTSSFGANTPLDGRDCFISDGSTNPSWVPTYGAGFQSCYATSRIGQAWIGADGKMYYRFLLSDNPQASKTDSPWHQLAALDIENIWTQPNTFNNRLLTNNLSVVNGGRITRILTGGNSAKNIELYTWGNSDRPTVIECKVKNPDTDASDTWIFYGQQNPDNSLQLQVNGAVNCVTVNQSSDRDLKDNIQVISSATEAIRKMNGYTYTLKENGLPYAGVIAQEVMEALPEAVSSFTKHEYMDGQDVEGNDITLDFGKRYLSVDYSAVTGLLVQVCREADDRITKLETEVEELKKLVATLVNKESLP
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 966 AA molecular weight: 104496,35490 Da isoelectric point: 5,34402 aromaticity: 0,09627 hydropathy: -0,27329
Domains
Domains [InterPro]
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Escherichia phage vB_Eco_SLUR26 [NCBI] |
2029173 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
VAY28108.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
LR025198.1
[NCBI]
CDS location
range 29958 -> 32858
strand -
strand -
CDS
ATGGCAACTCGTTTATATGGTACTTTGCGTGATGGACTGGGCAAACCAATTATCAACGCTACAGTTGCGCTTTTAGCTAAAGGAAACAGTCTTACCGTATTATCCAGCAGCGAAGCTATCTTTAAAACAAGTGCAACCGGAACTTATGACATCACCGTCCAGACAGGCTATTACAAGGTTATTATTGGGCCTCAAGGTAGCGAGCCTTATAAAGCTGGTGAAATTGCTATTTACGCGGACAGTAAAGAAGGTACGCTGAATAACTATTTAACCACATGGGCCCCGGAAGAATTAACTCCGGAAGTTATTGCACAGGTTAGAGATTTAGTTTCACAAGCCGAAACAGCTAAGAACGCTTCATCTACTTCTGCTACTAAATCCGAGCAGGAGAGAGTTAAAGCAGAAGCTGCTGCTAAAAAGGCAGAAGACACCGCTAATGGCATGAAGGCATCTATCGGCTTAACTAGCAGCGCAAGACATGTCGCAGATATTACTGTTAATCCTTCTAGCTTCCTGGGTTTTTTAAGAATACTTAGAAGTTCAACCGTCGGGTATCCGGGCATTGCTAATAGTGATAACGTTCTAGGTGGCTTTATTTCCCCTATGGACGGAAGCCCGGGCTTTATTGGCTTGTTTATAGGTGATGTGACAGGAACTGTTTATAGCTACAAATGGACCGCTCAAACTGGAACTGTATGGTGGAAAGGTGTTCTTTATAGTCAAGTAGACAGATTAGCGCAAGCAAGCACAGAGACAGCTTTATACTCTCCAAATCGTAATGCAAAAATTATAGTTGAAAATAATATAAGTTGGGGCGCATTTGACGTCTCTGGTAGTAGATATCTTCCTTTACCTGTCAATAGAGGTGGGACTGGAGCTTTAACAATAGCAGACGCTAAGACCAATCTCCAAATCCCGGAAGGTGGTTTGTCAAACATCATAACCATCAACGCCCCGGAAGGGTCAGAGGATGAAAAATATTATCCTATTATAATCTATACAGGTAATATGAACGGGTATGGGAACATGCTATGCCCTGTTGATATTGTCACTAAAAGTGCACCAGCAAACGATCCGATGAATAATAGTTCGTTCTTTGGATACATTCGTTGTGGCGGTTGGTCAGATTTGAAAGATGCTGCTTTTGGTTATCTAGCAACTTATGATCCAAAAGAAGTTGGAATACTTTGCGTCAAAGGTTCTAAAAAGGATTATAGCAATCATATAGCTTTTTATATCCACAAAAAAGCTTTTCCAATTAGGATTCAAGTTGGTTACAAGGCAAATGTCATAGTACCAATTGAAGACTATGTTTTAGGTACTAATGGTGTTCGTTTTAAGTTTGGAGTGTCCGCTCCAACTGAAGGTGACACGGAGAATAACGTTACAAACATCCTTAACTTTGAAGGTGGTGGTAGTGGATTCTATAGCAATTCTCCATTTAGACAAGGAAGTTCACAAAACTTTGCACTAACAAATAATCTGTCTACAGGTGATTCTTTTATTGCGTCAATTCCTAGTTTCACATTACTTGGAAAAATACAAGCAACACAGGGATTTATAGGGTATAGCGATTCTACTGAAGGTAGATCTTTTATAAGCAGAAGAACAAATGCTGAAAAAAATATAACATTGGATCAGACAGAACTTCGCGCAGGAGATAGCAATGGACAGATTGTTGTGCGTGATATGTCATCTGCTGCCAGACATCAATTTTTTAACTTTAATCTGGATGGAACATTTAGTTCCCCAAATGGATTGTTATCAGCAACTGGATCCGATTGGAACGGTCAAATCAATACCGTGAATAAATTCTACGGGATTGCTGGAGGCGTTAACGGTCCTGAACATTCTACAAATGTTGTTTATGGTGGTGTACATGTAGGTTTTAGCGGAAACTACGCATTTCAAATAGCAGGTCGTAGGAACAATGCTTTTATTAGAACAATCGAAGCTAGTACAAATGGCGAATGGTTGAAGCTACTTACTTCATCTTTTGGAGCCAATACACCTCTGGACGGTCGCGATTGCTTTATTAGCGATGGATCAACAAATCCTTCATGGGTTCCTACATATGGGGCAGGGTTCCAATCATGCTATGCTACATCAAGGATTGGTCAAGCGTGGATTGGTGCGGATGGTAAAATGTACTACCGTTTCCTACTCTCCGATAATCCACAAGCATCGAAAACTGATTCACCCTGGCATCAGTTAGCAGCTTTGGATATTGAAAATATATGGACACAGCCAAATACATTTAACAATAGATTATTAACAAATAATTTATCTGTGGTTAATGGTGGTAGAATTACGCGCATATTAACTGGCGGAAATTCTGCTAAGAATATTGAACTGTATACTTGGGGTAACTCCGATAGACCGACAGTTATTGAATGTAAAGTAAAAAACCCCGACACGGATGCATCGGATACTTGGATTTTTTATGGTCAACAGAATCCGGATAACAGCCTACAACTTCAAGTAAATGGTGCTGTTAACTGTGTTACAGTTAATCAGTCATCCGATAGAGACTTAAAAGATAACATACAGGTAATAAGTTCAGCTACTGAAGCAATTCGGAAAATGAATGGTTATACATATACACTTAAGGAGAACGGTCTACCTTATGCTGGTGTAATTGCTCAGGAAGTTATGGAAGCACTACCTGAAGCTGTTAGCAGTTTCACAAAGCATGAATATATGGATGGTCAGGACGTAGAAGGTAATGATATAACCTTGGATTTTGGTAAACGTTACCTTAGCGTCGACTACTCCGCGGTAACCGGTCTTCTGGTTCAGGTTTGTCGTGAAGCAGATGACCGCATTACAAAACTTGAAACTGAAGTTGAGGAACTCAAAAAGTTAGTTGCGACGCTTGTTAATAAAGAATCACTACCATAA
Tertiary structure
PDB ID
2fd1c991ceaee95219a5098b51d09572b19161d60dfc4b772a7cb75baefd844d
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50