Protein

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Genbank accession
AKE45305.1 [GenBank]
Protein name
tail collar domain protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,67
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,95
Protein sequence
MATLKQIQFKRSKVAGVNPTAAQLAEGELAINLKDRTLFTKDDLGNIISLGFAKGGDINGNVTQNGDYLQNGTYNLNGNQFVYAGKYIEFLPKTAGNGAWANQHTNKAPIFTDLSSTTSTSEYHPLIKQRYKDGTFSVGTLVSEGSFRVHYIDSTAPDNSKHWVFNRNGNFIVDSGSIEVRAGNISASGNINSANGIVSAPQVNTKTIVLDTKAFGQYDSQSLVQYVYPGTGEENGINYLRKVRAKSGGTIYHEIASAQTGKNDEISWWTGNTLTTKLMGLRNDGAMVLRRSLAIGTITTDENTNNYGSPTPMGERYIALGDAATGLKYIKQGVYDLVGNWNSVASITPDSFRSTRKGIFGRSEDQGTTWIMPGTNAALLSVQTQADNNNAGDGQTHIGYNAGGKMNHYFRGTGQMNINTQQGMEINPGILKLVTGSNNVMFYADGGITSVKQLSIYNGIYLAANNSTAGLTFAPTTTIDGTKQILWEGGTRAGQNKSYVTVKAWGNSFNASGDRNRETVFEVADGQGYYFYSQRVAPTGSETVGPVVTQINGQLNARGSIITDGSLRVNGLSTLSGQVTMDNGLVLSGGGSITGQVKIGNTADAFRIYNAEYGAIFRRSEASLHIIPTLKDAGENGGISNLRPLSVSLNNGMVQMRHSVTLGDDGAGGNMVTVDNDNKLVVITSHSRISPNYRMQLGQSAYIDAECTDTARPAGAGSFASQNNENVRAPFYMNIDRTDTSTYVPIVKQRYVQNNSCYSIGTLINGGNFRVHYHEGGDGVSTGAIIKDLGWEFNKNGDFYSPGKLGAGNVRIGTDGNITGGSGNFANLNTTINNLKTDIVSSYPIGAPIPWPTDTPPEGYAIMEGQTFDTGLYPKLAAVYPSGTLPDMRGQTIKGKPSGRDVLSTEADGIKSHNHSASASNTDLGTKTTSSFDYGTKTSSSFDYGTKTSNTTGNHNHTVSGTTSAAGNHQHARSGPQIQAGIPNNIFYDGYNSVGANANAKFTGTVNGATAGSNIAKTSSEGNHTHSWSGTTSTTGNHAHTVGIGAHTHSVGIGAHSHTVAIGSHGHTITVNATGNTENTVKNVAFNYIVRLA
Physico‐chemical
properties
protein length:1093 AA
molecular weight: 115994,52590 Da
isoelectric point:8,32089
aromaticity:0,08051
hydropathy:-0,42351

Domains

Domains [InterPro]
IPR051934
735–1093
IPR051934
SSF88874
834–962
SSF88874 SSF88874
IPR037053
841–894
IPR037053
IPR011083
846–893
IPR011083
AKE45305.1
1 1093
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia coli O157 typing phage 3
[NCBI] 		1508678 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AKE45305.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KP869101 [NCBI]
CDS location
range 160442 -> 163723
strand -
CDS
ATGGCTACATTAAAACAGATACAATTTAAAAGAAGCAAAGTAGCAGGAGTTAATCCTACTGCAGCACAATTAGCCGAAGGCGAATTAGCGATAAACTTAAAAGATCGAACTCTTTTTACTAAAGATGACCTCGGTAATATTATTAGCCTAGGCTTTGCTAAGGGCGGGGATATTAACGGTAATGTAACTCAAAATGGTGATTATTTACAAAACGGCACGTATAATCTTAATGGAAACCAGTTTGTTTATGCAGGAAAGTATATTGAATTCTTGCCAAAAACTGCTGGAAATGGCGCTTGGGCTAACCAACACACAAATAAAGCCCCTATCTTTACAGATTTGAGTTCAACTACTTCAACTTCTGAATACCACCCTTTGATTAAGCAACGTTATAAAGACGGTACTTTTTCAGTAGGTACATTAGTAAGCGAAGGCTCATTTAGAGTTCATTATATTGATTCTACAGCTCCAGACAATTCTAAACACTGGGTCTTTAACCGTAATGGTAATTTTATTGTAGATTCTGGTAGTATTGAGGTCCGCGCAGGTAATATTTCTGCGTCAGGCAATATTAACTCCGCTAATGGTATAGTTTCTGCTCCACAAGTTAATACGAAAACCATTGTTTTAGACACAAAAGCATTCGGACAATATGATTCACAGTCATTAGTTCAATATGTTTATCCTGGAACAGGTGAAGAAAATGGTATAAACTATCTTCGTAAAGTTCGAGCTAAATCAGGTGGAACTATTTACCATGAAATCGCTTCAGCTCAAACTGGTAAGAATGATGAAATTTCTTGGTGGACCGGAAATACACTTACTACTAAATTAATGGGTCTTCGTAATGATGGCGCAATGGTATTACGTCGTTCACTTGCTATTGGCACAATTACCACTGATGAAAATACCAATAACTACGGCTCTCCTACTCCAATGGGAGAAAGATATATTGCTTTGGGTGATGCTGCCACTGGTTTAAAATACATTAAGCAGGGTGTTTATGATTTAGTAGGTAATTGGAATTCTGTTGCTTCTATTACTCCTGACAGTTTCCGTAGTACTCGTAAAGGTATATTTGGTCGTTCCGAGGACCAAGGCACCACATGGATTATGCCTGGTACAAATGCTGCTCTCTTGTCTGTTCAAACACAAGCTGATAATAACAATGCTGGAGACGGACAAACCCATATCGGGTACAATGCTGGTGGTAAAATGAACCACTATTTCCGTGGTACAGGTCAGATGAATATCAATACCCAACAAGGTATGGAAATTAACCCGGGTATTCTTAAACTAGTAACTGGCTCTAATAATGTAATGTTTTATGCTGATGGCGGTATTACATCTGTTAAGCAGCTTTCAATATATAACGGCATATATTTAGCAGCTAATAATTCTACTGCTGGGCTAACATTCGCTCCAACTACTACAATTGATGGCACTAAGCAAATTTTGTGGGAAGGCGGTACTCGTGCTGGTCAGAATAAAAGCTATGTAACTGTTAAAGCATGGGGTAATTCATTTAACGCATCTGGCGATCGTAATCGTGAAACAGTTTTTGAAGTAGCTGACGGCCAGGGATATTATTTTTATTCTCAGCGCGTAGCTCCAACCGGTTCAGAAACTGTGGGACCTGTTGTAACACAAATTAATGGACAACTGAATGCAAGAGGGAGCATTATCACCGATGGAAGTCTTAGAGTTAATGGATTAAGTACATTATCCGGACAAGTTACTATGGATAACGGGCTTGTTTTATCCGGCGGTGGTTCTATTACCGGTCAAGTTAAAATCGGCAATACCGCAGATGCTTTCCGTATTTACAATGCTGAATATGGAGCTATTTTCCGTCGTTCTGAAGCGTCTTTGCATATTATACCTACACTTAAAGATGCAGGTGAAAATGGTGGTATTTCTAACCTTCGCCCATTGAGTGTTTCTCTTAACAACGGTATGGTTCAAATGCGCCATTCTGTTACGTTAGGTGATGATGGTGCTGGCGGTAATATGGTGACCGTTGATAATGATAATAAACTTGTTGTTATAACTAGTCATAGTCGCATTTCTCCTAATTACCGTATGCAATTAGGACAATCGGCATATATCGACGCTGAATGTACTGATACTGCACGACCTGCTGGAGCCGGTTCTTTTGCTTCTCAGAATAATGAAAACGTTCGTGCTCCGTTCTATATGAATATTGATAGAACAGATACAAGCACTTATGTTCCTATTGTGAAACAAAGATACGTTCAAAATAATAGTTGCTATTCTATTGGTACTTTAATTAATGGTGGTAACTTTAGAGTTCACTATCACGAAGGTGGTGACGGCGTTTCTACTGGCGCAATTATAAAGGATTTAGGTTGGGAATTTAATAAAAACGGTGATTTTTACTCTCCTGGTAAATTAGGCGCTGGTAATGTTCGTATTGGTACTGATGGTAATATCACCGGCGGTTCTGGTAATTTTGCTAACTTGAATACCACAATAAATAACCTTAAGACAGATATTGTCTCAAGTTATCCTATTGGTGCTCCGATTCCTTGGCCTACTGATACACCTCCTGAAGGTTATGCCATAATGGAAGGTCAAACATTTGATACTGGCTTGTATCCTAAGTTAGCTGCGGTGTATCCTTCCGGCACTCTGCCCGATATGCGTGGTCAGACGATTAAAGGTAAACCATCTGGGCGTGATGTATTAAGTACAGAAGCTGATGGTATTAAGTCTCATAACCATAGTGCTTCAGCATCTAATACTGATTTAGGTACTAAAACCACATCAAGCTTTGATTATGGTACTAAAACATCTTCAAGCTTTGATTATGGTACTAAAACCAGTAATACCACAGGTAACCATAACCATACGGTGAGTGGAACTACAAGTGCTGCAGGTAACCACCAACATGCGCGCTCAGGTCCTCAGATACAAGCTGGCATACCCAATAACATATTCTATGACGGATATAATAGTGTAGGTGCAAACGCCAACGCTAAATTCACTGGAACCGTGAACGGTGCTACTGCAGGGTCGAATATAGCCAAAACTTCTTCAGAAGGTAACCATACACACTCTTGGTCAGGAACCACAAGTACCACAGGTAACCATGCTCATACTGTGGGTATTGGTGCTCATACCCATTCGGTAGGTATTGGTGCTCATTCTCATACTGTTGCAATTGGTTCCCATGGACATACAATAACTGTAAATGCCACAGGAAATACAGAAAACACAGTTAAAAACGTTGCTTTTAACTATATCGTTCGTTTAGCATAA

Tertiary structure

PDB ID
531a71771e853646631dd2d52c1c3325f8e07846d87033e9bed2c0847f8d1407
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,4833
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50