Protein

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Genbank accession
YAO55681.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,91
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MADYKLSELNSIDTIRSDDLLHVRVKKRPEMLGDEDRRMTYQDFLASFKLERFVQIAGSTMTGDLGIVKLLYGGKAVFDPTGSSEITIGDVLKTFKLNASGLKLTIADASRSATVYHTLNKPSPNELGMRTNEENDARYARLAVNNTFRGTQTILSDNEALIVKNNTQGMPLGIRGRDADGANRWYFGNDNRDSNTLVLSNVKTGVSIGILENLVSVNRTLQIAGQVQPSSFANLDARYFTQTAANQRFAQLAADNTFRGANTFTRLSVFKKDGEAIRLQNNNATQPLYIMAMDSEGAKRWYVGNTDSSGNVVLENYKTGGKITVGTSVNINKTLTVTGQVQPSDWANIDSRYIPAATLSNLAKLSDMNTFRSAQIITQNGSLLRLKNTVQDNELYLSGHNADNVRRWYIGTADRTHPSRFIIHNDKTVTTIFMEDDFLLNKTVRITGQVQPSDWANIDARYYGKSETDSKYFWSASRGLVEETEGGVAWNQPSGIYLETTETGWSNRLVLHLFANTTASTPSAQLRFDYRNGGMWYRTARDANGFEIEWSRVYTSADKPTPAEIGAYTKAETDQKIAQAISDSTDLNKIYPVGIVTWFNSNVDPNTALPGLTWTYLNNGVGRTIRIAAANGSDVATTGGSDSVTLAVGNLPSHTHSFSATTSSFDYGTKGTNTTGGHTHSGSGSTSTNGEHTHYIEAWNGTGRGGDKMSSYAVSYRTGGSYTNAAGNHSHTFSFGTSGAGDHSHSVGIGAHSHTVSGNTGGTGSGSAFSVTNQFYKLMAWVRTA
Physico‐chemical
properties
protein length:785 AA
molecular weight: 85505,47180 Da
isoelectric point:7,82590
aromaticity:0,09045
hydropathy:-0,46713

Domains

Domains [InterPro]
DC_1566
STR
60–785
DC_1566
G3DSA:6.20.80.10
STR
158–219
G3DSA:6.20.80.10 G3DSA:6.20.80.10 G3DSA:6.20.80.10 IPR022246 IPR053827 IPR005003 IPR005003
IPR048388
ATT
159–248
IPR048388 IPR048388 IPR048388 IPR051934
YAO55681.1
1 785
Architecture
STR
ATT
STR
ATT
STR
ATT
STR
ATT
STR
STR 60-158 | ATT 159-248 | STR 249-274 | ATT 275-362 | STR 363-381 | ATT 382-466 | STR 467-587 | ATT 588-717 | STR 718-785
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage vB_CECAV_015
[NCBI] 		3464055 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Escherichia coli
[NCBI] 		562 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YAO55681.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PX246730.1 [NCBI]
CDS location
range 50796 -> 53153
strand +
CDS
ATGGCAGATTACAAGTTGAGTGAATTAAACTCAATTGATACAATTCGTTCAGATGACCTTCTTCATGTCAGGGTTAAAAAGAGACCTGAGATGTTGGGTGATGAAGACCGTCGAATGACCTATCAAGACTTCTTAGCATCTTTTAAACTTGAAAGATTTGTTCAGATTGCTGGTAGTACTATGACGGGTGACTTAGGGATTGTTAAGTTACTTTATGGTGGTAAGGCAGTATTTGACCCTACAGGTTCTTCTGAAATTACTATTGGGGATGTTTTAAAGACTTTTAAACTTAACGCAAGTGGTCTTAAACTAACTATTGCAGATGCTTCAAGGTCAGCAACTGTTTATCATACTCTGAATAAGCCAAGTCCTAATGAGCTTGGTATGAGAACTAATGAAGAGAATGACGCAAGATATGCAAGACTTGCTGTAAATAATACCTTCAGGGGCACTCAAACTATTTTATCTGATAATGAAGCACTTATTGTTAAGAATAACACACAGGGTATGCCACTAGGTATTCGTGGTCGAGATGCAGATGGAGCTAATAGATGGTATTTTGGCAATGATAATAGAGACTCAAATACTCTTGTATTATCGAATGTAAAGACTGGTGTTTCAATTGGTATTCTTGAAAATTTGGTGTCAGTCAACAGAACTCTTCAAATTGCTGGTCAAGTTCAGCCTTCAAGTTTTGCTAACTTAGATGCTAGATACTTTACTCAGACGGCAGCTAATCAGAGATTTGCACAGTTAGCTGCTGATAATACTTTCAGAGGCGCGAACACATTTACCCGACTAAGTGTTTTCAAAAAAGATGGTGAGGCGATTAGGCTACAGAATAACAATGCTACACAGCCATTGTACATTATGGCGATGGATAGCGAAGGTGCCAAAAGATGGTACGTTGGTAATACTGATAGTAGTGGTAACGTAGTTCTAGAAAACTACAAAACTGGTGGAAAAATTACTGTAGGGACAAGTGTTAATATCAATAAAACACTAACTGTAACTGGTCAGGTTCAGCCTTCTGACTGGGCTAACATTGACTCTAGATACATTCCAGCAGCTACTTTGAGTAATCTTGCTAAACTCAGTGACATGAATACCTTTAGGTCTGCACAAATTATTACACAAAATGGTTCATTGTTGCGACTAAAAAACACTGTTCAGGATAATGAACTGTACTTGTCTGGTCATAATGCTGATAATGTGAGAAGGTGGTACATCGGGACTGCTGATAGAACACACCCATCTAGATTCATTATCCACAATGATAAAACTGTGACCACTATTTTTATGGAAGATGACTTTTTGCTAAATAAAACTGTAAGGATTACTGGTCAAGTTCAGCCTTCAGATTGGGCTAACATTGATGCAAGATACTACGGTAAATCAGAAACTGATTCGAAGTATTTCTGGTCAGCATCCAGAGGTCTGGTAGAAGAGACTGAAGGTGGTGTAGCTTGGAATCAACCTTCAGGAATCTATCTTGAGACAACTGAGACTGGTTGGTCAAACCGCTTAGTCTTGCACCTGTTTGCTAATACGACAGCATCGACACCATCTGCACAATTAAGGTTTGATTACAGAAATGGTGGAATGTGGTATAGAACAGCCAGAGATGCAAATGGTTTTGAGATTGAATGGTCTAGGGTTTACACTAGCGCCGACAAACCAACCCCTGCTGAGATTGGTGCATACACTAAAGCAGAAACTGACCAGAAGATTGCACAGGCAATTAGTGACTCCACAGACCTTAATAAAATCTATCCAGTAGGTATTGTAACATGGTTTAATAGTAATGTTGACCCTAATACAGCACTACCTGGGTTAACTTGGACGTACCTTAACAATGGTGTTGGTAGGACTATCAGGATTGCAGCAGCAAATGGTTCAGATGTTGCTACAACTGGTGGTTCAGATTCTGTGACGTTAGCTGTTGGTAACTTACCATCACACACCCATAGTTTCTCTGCAACTACTTCATCTTTTGATTATGGTACGAAGGGAACTAACACTACGGGTGGACACACTCACTCTGGTAGTGGTTCTACTAGCACAAATGGTGAGCACACCCACTACATTGAGGCGTGGAACGGTACTGGTAGAGGTGGTGATAAGATGTCATCATATGCCGTATCATACAGGACGGGTGGGAGTTATACTAATGCAGCAGGGAACCACAGTCATACTTTCTCTTTTGGTACTAGTGGTGCTGGTGACCATTCCCACTCTGTAGGCATTGGTGCTCACAGCCACACAGTTAGTGGTAACACTGGTGGTACAGGTTCTGGTTCAGCATTTAGTGTTACTAACCAGTTCTACAAGTTAATGGCTTGGGTAAGAACTGCTTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
678eb281e05d77045fd640ada76537263ffc39281d2eb4353ee2aa5d20de290b
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,7355
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50