Protein
View in Explore- Genbank accession
- YAO55681.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber protein
- RBP type
-
TFTFTF
- Protein sequence
-
MADYKLSELNSIDTIRSDDLLHVRVKKRPEMLGDEDRRMTYQDFLASFKLERFVQIAGSTMTGDLGIVKLLYGGKAVFDPTGSSEITIGDVLKTFKLNASGLKLTIADASRSATVYHTLNKPSPNELGMRTNEENDARYARLAVNNTFRGTQTILSDNEALIVKNNTQGMPLGIRGRDADGANRWYFGNDNRDSNTLVLSNVKTGVSIGILENLVSVNRTLQIAGQVQPSSFANLDARYFTQTAANQRFAQLAADNTFRGANTFTRLSVFKKDGEAIRLQNNNATQPLYIMAMDSEGAKRWYVGNTDSSGNVVLENYKTGGKITVGTSVNINKTLTVTGQVQPSDWANIDSRYIPAATLSNLAKLSDMNTFRSAQIITQNGSLLRLKNTVQDNELYLSGHNADNVRRWYIGTADRTHPSRFIIHNDKTVTTIFMEDDFLLNKTVRITGQVQPSDWANIDARYYGKSETDSKYFWSASRGLVEETEGGVAWNQPSGIYLETTETGWSNRLVLHLFANTTASTPSAQLRFDYRNGGMWYRTARDANGFEIEWSRVYTSADKPTPAEIGAYTKAETDQKIAQAISDSTDLNKIYPVGIVTWFNSNVDPNTALPGLTWTYLNNGVGRTIRIAAANGSDVATTGGSDSVTLAVGNLPSHTHSFSATTSSFDYGTKGTNTTGGHTHSGSGSTSTNGEHTHYIEAWNGTGRGGDKMSSYAVSYRTGGSYTNAAGNHSHTFSFGTSGAGDHSHSVGIGAHSHTVSGNTGGTGSGSAFSVTNQFYKLMAWVRTA
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 785 AA molecular weight: 85505,47180 Da isoelectric point: 7,82590 aromaticity: 0,09045 hydropathy: -0,46713
Domains
Domains [InterPro]
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Escherichia phage vB_CECAV_015 [NCBI] |
3464055 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YAO55681.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
PX246730.1
[NCBI]
CDS location
range 50796 -> 53153
strand +
strand +
CDS
ATGGCAGATTACAAGTTGAGTGAATTAAACTCAATTGATACAATTCGTTCAGATGACCTTCTTCATGTCAGGGTTAAAAAGAGACCTGAGATGTTGGGTGATGAAGACCGTCGAATGACCTATCAAGACTTCTTAGCATCTTTTAAACTTGAAAGATTTGTTCAGATTGCTGGTAGTACTATGACGGGTGACTTAGGGATTGTTAAGTTACTTTATGGTGGTAAGGCAGTATTTGACCCTACAGGTTCTTCTGAAATTACTATTGGGGATGTTTTAAAGACTTTTAAACTTAACGCAAGTGGTCTTAAACTAACTATTGCAGATGCTTCAAGGTCAGCAACTGTTTATCATACTCTGAATAAGCCAAGTCCTAATGAGCTTGGTATGAGAACTAATGAAGAGAATGACGCAAGATATGCAAGACTTGCTGTAAATAATACCTTCAGGGGCACTCAAACTATTTTATCTGATAATGAAGCACTTATTGTTAAGAATAACACACAGGGTATGCCACTAGGTATTCGTGGTCGAGATGCAGATGGAGCTAATAGATGGTATTTTGGCAATGATAATAGAGACTCAAATACTCTTGTATTATCGAATGTAAAGACTGGTGTTTCAATTGGTATTCTTGAAAATTTGGTGTCAGTCAACAGAACTCTTCAAATTGCTGGTCAAGTTCAGCCTTCAAGTTTTGCTAACTTAGATGCTAGATACTTTACTCAGACGGCAGCTAATCAGAGATTTGCACAGTTAGCTGCTGATAATACTTTCAGAGGCGCGAACACATTTACCCGACTAAGTGTTTTCAAAAAAGATGGTGAGGCGATTAGGCTACAGAATAACAATGCTACACAGCCATTGTACATTATGGCGATGGATAGCGAAGGTGCCAAAAGATGGTACGTTGGTAATACTGATAGTAGTGGTAACGTAGTTCTAGAAAACTACAAAACTGGTGGAAAAATTACTGTAGGGACAAGTGTTAATATCAATAAAACACTAACTGTAACTGGTCAGGTTCAGCCTTCTGACTGGGCTAACATTGACTCTAGATACATTCCAGCAGCTACTTTGAGTAATCTTGCTAAACTCAGTGACATGAATACCTTTAGGTCTGCACAAATTATTACACAAAATGGTTCATTGTTGCGACTAAAAAACACTGTTCAGGATAATGAACTGTACTTGTCTGGTCATAATGCTGATAATGTGAGAAGGTGGTACATCGGGACTGCTGATAGAACACACCCATCTAGATTCATTATCCACAATGATAAAACTGTGACCACTATTTTTATGGAAGATGACTTTTTGCTAAATAAAACTGTAAGGATTACTGGTCAAGTTCAGCCTTCAGATTGGGCTAACATTGATGCAAGATACTACGGTAAATCAGAAACTGATTCGAAGTATTTCTGGTCAGCATCCAGAGGTCTGGTAGAAGAGACTGAAGGTGGTGTAGCTTGGAATCAACCTTCAGGAATCTATCTTGAGACAACTGAGACTGGTTGGTCAAACCGCTTAGTCTTGCACCTGTTTGCTAATACGACAGCATCGACACCATCTGCACAATTAAGGTTTGATTACAGAAATGGTGGAATGTGGTATAGAACAGCCAGAGATGCAAATGGTTTTGAGATTGAATGGTCTAGGGTTTACACTAGCGCCGACAAACCAACCCCTGCTGAGATTGGTGCATACACTAAAGCAGAAACTGACCAGAAGATTGCACAGGCAATTAGTGACTCCACAGACCTTAATAAAATCTATCCAGTAGGTATTGTAACATGGTTTAATAGTAATGTTGACCCTAATACAGCACTACCTGGGTTAACTTGGACGTACCTTAACAATGGTGTTGGTAGGACTATCAGGATTGCAGCAGCAAATGGTTCAGATGTTGCTACAACTGGTGGTTCAGATTCTGTGACGTTAGCTGTTGGTAACTTACCATCACACACCCATAGTTTCTCTGCAACTACTTCATCTTTTGATTATGGTACGAAGGGAACTAACACTACGGGTGGACACACTCACTCTGGTAGTGGTTCTACTAGCACAAATGGTGAGCACACCCACTACATTGAGGCGTGGAACGGTACTGGTAGAGGTGGTGATAAGATGTCATCATATGCCGTATCATACAGGACGGGTGGGAGTTATACTAATGCAGCAGGGAACCACAGTCATACTTTCTCTTTTGGTACTAGTGGTGCTGGTGACCATTCCCACTCTGTAGGCATTGGTGCTCACAGCCACACAGTTAGTGGTAACACTGGTGGTACAGGTTCTGGTTCAGCATTTAGTGTTACTAACCAGTTCTACAAGTTAATGGCTTGGGTAAGAACTGCTTAA
Tertiary structure
PDB ID
678eb281e05d77045fd640ada76537263ffc39281d2eb4353ee2aa5d20de290b
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50