Protein

View in Explore
Genbank accession
QGT54649.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect2
Probability 0,93
Protein sequence
MAIERNFIIKNGLEIADNLLVANNDKIGIGKTQPNYVLDIIGDVASTGKLLFPPENQPNPTTGTFSSSTPFLVTGINTSLFRVHDLLDDTGNILTPGSKVVNIGISSISIFPGHNLTVGSAQTTISIIRNVTAGETEQFLVSRGPSLPPVWKTASGFGTVAGLSTVATTGSYNDLINRPSLGTASTVSRTAFATSSQGALAESVSSIVSGLSTVATTGSYGDLGNKPIGVTTSVDGLQQTDQNSLIYVNQYYINYEAEADLLLLRDVQKDGGGLFVWDSSISKAEHDGGLFISPTVPYDGTRANLENFLYGVGETDPSGSGVWVRQFTGNVFASYYGQVGNNIADDQPSIQQALDRLRELNNINYVGAGNVGRSRTVQITGTCKVKKGIVVPGGMKLFGEGQTLAYANQVSSFANDTNYLSGPIIYADAECELFTGRVGKRDSCVVFLAPDASAIEGIVVDGYDLPFGSWYVPISARNTVTGQSAANSASAYLKVIDPDDTRQTVAGNLRIITTQVPAFYLGDTWHSGYQLICDAGNMTGVGSSVGVYTSITPANPYQWDVISGTLPTGISVSKSGWVTCNSPPSAQKNFIRIRVADASGATAEKDLVFEVTGKYINPVRNGALPRATINYSYLFQMDLVNNDGQPHYWWLLNAPKGLGIGRTTGIISGTPEANTFGKYTIKIGITTAGNINDFDRNILIDSIEYDLPVENTQFPNFTGPPLDTAILGVAYTGVLYPYGGVAPMTWAIVGSLPAGIAFTSDGVRGYLTGTATTTGSYSFRSIFTDSTGKASSGNQTLNVNNAVPPQIKLTNYPILPVAVKGQPYFYQLETTQPDCVFRIRGKSLPTGLALSETTGIIAGIPTGGIYANGISCEWSTKINNVHSRNFKQGAGIQYDGPSNVHIVEKFFISACDIGIQSDNCYDSRFDRFYIYNCRVGFNMGGGTAANTYINGRIEFIHEDGVNALFSNDHIFTNILWDTCGTTAINMDRCKYWVISNNVFFRSARRVLPRGKHYIPDTPTKQSAHINLLESDGITITGNTFIRGSESPSSLFLRRYDESLRRDWIRPYTCLTVEDCQELVITGNNMAGCTRQSIIPEVIVFDLVNNDAIIEGNVVHYKNAFDTIDATTKKSDNLFENANKYNYVSSGGEELIDTFYRNTSLILNGDTLTDTSYLRHTINNINVGTSNTTAAIGNTSLAFNGTTSLLTVVIPNSGVTTSGFYFGNDPWTFELQVNPIRNNVPQTLIDFGTTNEPTTFGIGLNDQGKLVILRSRSSSGQSTVFTSNETIPINSWTRIAGCKTGTTDNTVRIYINDSVVGTFTTEFDSRFFVSGTNRPIIGRGGFTGAADFFKGYMQGIRVTKGISRYGALSIIPTQTLPWTSIDYGVIRADTRIYLPKSGVSQQSYWGDGTYSVLLGPTSQISKAVKVERRSKSIITEELRAGNGSYVAGDKNPSDYYFNITKEAEAGTTPNNFVFQECELRLWLARLGNTLEFNKYRGKYLNIVWYARSNNKNPISFFTRFYAGTADNGFNVDGGFYTEITLTPYWRRYYFELQVPEYDIVRESSENCNMFLRFLMDDKSESYDWDFGGFMIYPADGTFGFKQFTESSVGIQTSNIVNVSSTSPTGLEGFRNLLINGDFQVKQQYGTTVTPGFTTSLYVTDRWVAQAFGSGLTAQTVVTDQRASLQINGAAGNSGCNVLQRIESANVQHMRNRDVTLSVDLANTLLTSVTWAAYYPNTVDTFTSLNLLAFGTFIVTPTLNRYSATFNMGDFAWRGVEIRFSVGAQTGGTFTLRDAMLASGTAVTPMERRFYGTELQLCQRYFRWVSCNSTLRAVISAQTQETGINWPEMRVTPTAGTPVPDPNIPGFSETTNVAFFFLGRMTPYGGSLILTSNTSGVSYTLGYRASLSAEL
Physico‐chemical
properties
protein length:1909 AA
molecular weight: 207715,05920 Da
isoelectric point:5,46418
aromaticity:0,10843
hydropathy:-0,14605

Domains

Domains [InterPro]
IPR013783
618–698
IPR013783 IPR013783 IPR012334 IPR013320
PF05345
654–690
PF05345 PF05345 G3DSA:2.60.120.200
PF13385
1212–1357
PF13385
QGT54649.1
1 1909
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage B23
[NCBI] 		2674977 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QGT54649.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MN695335 [NCBI]
CDS location
range 24097 -> 29826
strand +
CDS
ATGGCAATAGAAAGAAATTTTATAATAAAAAATGGACTTGAGATTGCAGATAATTTATTAGTCGCAAATAATGATAAGATTGGTATTGGTAAAACTCAACCAAATTATGTTTTAGATATAATAGGTGATGTTGCTTCAACGGGAAAATTATTATTTCCGCCCGAAAATCAACCAAATCCAACAACCGGAACATTCAGTTCTTCGACTCCTTTTTTAGTTACAGGAATTAATACTTCCCTTTTCCGTGTACATGATTTATTAGATGACACTGGTAATATATTAACGCCCGGCAGTAAAGTCGTAAATATTGGAATATCTAGTATTAGTATTTTTCCTGGTCATAATTTAACTGTAGGTTCGGCCCAAACAACTATTTCCATTATTAGAAATGTAACTGCCGGAGAAACAGAACAATTTTTAGTATCTAGGGGTCCAAGTCTACCTCCCGTTTGGAAAACCGCTAGTGGCTTTGGTACAGTTGCCGGTCTTTCCACTGTTGCTACAACTGGTTCATACAATGACCTTATCAATAGACCTTCATTAGGAACAGCATCCACTGTTAGCAGAACTGCCTTTGCAACTTCGTCTCAAGGCGCTTTAGCTGAATCAGTATCTAGTATAGTTTCAGGTCTTTCGACTGTTGCTACAACTGGTTCTTATGGTGACTTAGGGAATAAGCCAATTGGAGTAACTACTAGTGTTGATGGACTTCAACAAACAGACCAAAATAGTCTAATCTATGTCAATCAGTATTATATTAATTATGAGGCCGAAGCCGATTTACTTCTACTTCGTGATGTGCAAAAAGATGGCGGTGGACTTTTTGTGTGGGATTCAAGTATATCAAAGGCTGAACATGATGGTGGCCTATTCATCTCACCAACTGTTCCTTACGATGGAACCAGGGCCAATTTAGAGAACTTTTTATATGGTGTGGGCGAAACGGATCCTTCTGGATCTGGTGTTTGGGTAAGGCAATTTACTGGAAATGTATTTGCATCTTATTATGGTCAAGTAGGAAATAATATCGCAGATGACCAACCTTCCATACAACAGGCTTTAGATAGATTAAGAGAACTTAATAATATTAATTATGTTGGTGCCGGTAACGTAGGGAGATCCAGAACAGTTCAGATAACTGGTACCTGTAAAGTTAAAAAAGGTATCGTAGTTCCAGGTGGCATGAAGCTTTTTGGTGAAGGCCAGACATTAGCATATGCAAACCAAGTTTCTAGTTTTGCAAATGATACTAACTACTTGTCTGGTCCCATAATTTATGCTGATGCTGAATGTGAGTTGTTTACTGGTAGGGTAGGTAAGAGAGATAGTTGTGTTGTATTTCTGGCCCCAGATGCCTCTGCAATTGAAGGTATTGTGGTGGATGGATATGATCTGCCATTTGGATCATGGTACGTACCTATCTCAGCTAGAAATACAGTAACTGGACAAAGTGCCGCAAATAGTGCATCTGCATATTTAAAAGTAATTGATCCAGATGACACAAGACAAACCGTTGCAGGCAACCTAAGAATTATTACTACTCAAGTCCCGGCGTTCTATCTGGGTGATACTTGGCATTCTGGATATCAATTAATTTGTGACGCCGGTAACATGACCGGGGTTGGTTCTAGTGTAGGTGTATATACTAGCATTACTCCGGCAAACCCCTACCAATGGGATGTAATATCCGGTACACTTCCTACAGGTATAAGCGTATCAAAATCTGGTTGGGTTACATGTAACTCACCACCCTCCGCACAGAAGAATTTTATCAGAATCAGAGTAGCTGATGCGAGTGGCGCAACAGCAGAAAAAGATTTGGTTTTTGAGGTAACAGGAAAATATATTAATCCTGTCCGAAATGGAGCACTACCTAGAGCAACAATTAATTATAGTTACCTGTTCCAAATGGATTTGGTGAATAATGATGGACAACCACATTATTGGTGGCTTCTAAATGCACCGAAAGGTCTTGGAATTGGAAGAACAACTGGAATCATTTCTGGCACTCCAGAGGCTAATACATTCGGTAAATATACAATTAAAATAGGAATTACAACTGCTGGTAATATTAATGATTTTGATCGAAATATTCTTATCGACTCTATCGAATATGATTTACCCGTAGAGAATACACAGTTTCCTAATTTCACTGGCCCCCCATTAGATACCGCAATTTTGGGTGTAGCTTATACCGGCGTTCTATATCCATATGGCGGTGTTGCTCCTATGACATGGGCGATTGTGGGTTCTCTTCCGGCTGGTATAGCCTTTACTTCTGATGGAGTCCGAGGATATTTAACTGGAACTGCAACAACAACCGGAAGTTACTCATTCAGATCCATATTTACCGATTCAACAGGAAAAGCGTCTAGTGGTAATCAGACATTGAATGTGAATAATGCTGTTCCACCTCAGATTAAATTAACAAACTACCCAATACTTCCTGTTGCAGTTAAGGGTCAGCCTTATTTTTATCAACTTGAGACAACTCAGCCAGATTGTGTTTTTAGGATCAGAGGTAAATCATTACCAACTGGTCTGGCTCTTTCTGAGACAACCGGTATTATAGCCGGTATTCCTACGGGTGGTATTTATGCTAATGGTATTTCTTGTGAATGGAGTACCAAAATCAATAATGTTCACTCTAGGAACTTTAAGCAAGGCGCCGGAATACAATATGATGGTCCATCAAATGTCCATATAGTTGAAAAGTTTTTTATTAGTGCATGTGATATTGGTATTCAATCCGATAACTGTTATGATTCTAGATTTGATAGATTCTATATCTACAATTGTAGAGTTGGATTTAATATGGGCGGTGGTACTGCGGCAAATACTTATATAAATGGTCGAATTGAGTTTATACATGAGGATGGTGTAAATGCTCTATTCAGTAATGATCATATCTTTACTAATATACTATGGGATACTTGTGGCACGACTGCCATTAATATGGATAGATGCAAGTATTGGGTAATCAGCAATAACGTCTTCTTCAGAAGTGCACGTAGAGTATTACCAAGAGGTAAGCACTATATTCCAGACACACCCACTAAACAATCCGCTCACATCAATCTATTAGAGTCCGATGGTATCACGATTACCGGTAATACATTTATACGTGGTTCAGAAAGCCCAAGTTCTCTTTTCCTTAGGCGATATGACGAGTCTCTTAGGAGAGATTGGATTAGACCATATACCTGCCTCACCGTGGAGGATTGTCAAGAACTTGTCATTACTGGTAATAATATGGCCGGTTGTACTAGACAATCTATTATACCTGAAGTAATTGTATTTGATTTAGTTAACAACGATGCCATTATCGAGGGCAATGTAGTTCATTATAAAAATGCTTTTGATACAATAGATGCAACCACTAAAAAATCAGATAATTTATTTGAGAATGCAAATAAGTATAATTATGTGAGTAGTGGTGGAGAAGAACTTATCGATACATTTTACCGAAATACATCACTTATACTAAATGGTGATACATTAACTGATACTAGCTATCTAAGGCACACTATAAATAATATAAACGTTGGAACTAGTAATACAACTGCTGCTATTGGTAATACTAGCTTAGCTTTTAATGGAACGACTTCCCTTCTTACTGTAGTCATTCCCAATTCTGGTGTAACCACATCAGGCTTTTACTTTGGCAACGATCCATGGACATTTGAGCTTCAAGTGAATCCAATAAGAAACAATGTCCCACAGACATTAATAGACTTTGGAACCACAAATGAACCAACAACATTTGGTATCGGTTTGAATGATCAAGGAAAACTGGTGATTCTTAGGAGCCGGTCTTCTAGTGGACAGTCAACTGTATTCACAAGTAACGAAACAATTCCAATTAATTCCTGGACAAGAATTGCAGGATGTAAGACTGGAACTACGGACAACACTGTGAGGATTTATATCAATGATTCAGTTGTTGGCACATTCACAACAGAATTTGATTCTAGGTTTTTTGTTAGTGGCACTAATAGGCCAATCATAGGGCGAGGTGGATTTACTGGTGCAGCGGATTTCTTTAAAGGTTATATGCAGGGAATCCGAGTCACTAAGGGTATTTCAAGATATGGCGCTCTTAGTATAATACCAACACAGACACTCCCGTGGACTAGTATCGATTATGGTGTAATCAGAGCCGATACTCGTATTTATTTACCCAAGTCCGGTGTTTCACAACAATCGTATTGGGGAGATGGGACATATTCAGTCCTTCTTGGCCCTACTTCACAAATAAGTAAAGCGGTAAAAGTCGAGCGCAGATCTAAGTCAATTATTACAGAAGAATTAAGAGCCGGAAATGGATCTTATGTGGCGGGTGATAAAAACCCTTCAGATTATTATTTTAATATAACTAAAGAGGCCGAAGCGGGCACGACTCCAAATAATTTTGTGTTCCAAGAATGTGAATTGAGACTTTGGTTGGCAAGACTTGGTAATACTTTAGAATTTAATAAGTATAGAGGTAAATATTTAAATATTGTATGGTATGCGAGATCAAATAATAAAAATCCCATTTCATTTTTTACAAGATTCTATGCAGGAACTGCTGATAATGGATTTAACGTAGATGGTGGTTTTTATACAGAAATTACTTTGACTCCATATTGGAGAAGATATTATTTTGAGCTACAAGTACCAGAATATGATATAGTCCGCGAAAGCTCAGAGAATTGCAATATGTTCTTGAGATTCTTGATGGACGACAAGTCAGAATCTTATGATTGGGATTTTGGTGGTTTTATGATTTATCCGGCAGATGGTACGTTTGGTTTCAAACAATTTACCGAGAGTTCTGTTGGGATTCAGACATCGAATATAGTGAATGTCTCTTCGACTAGTCCCACTGGTCTTGAGGGATTCAGAAATCTTCTAATTAATGGAGATTTTCAGGTCAAGCAACAATATGGTACAACAGTAACGCCTGGATTCACCACAAGTCTATATGTAACTGACCGGTGGGTAGCACAAGCGTTCGGTTCTGGACTAACCGCACAAACTGTTGTCACGGACCAGCGAGCCAGTCTACAAATCAATGGGGCCGCAGGCAACTCTGGCTGCAACGTACTTCAGCGCATTGAGTCAGCCAATGTGCAACACATGCGCAACCGCGACGTGACTCTTTCTGTCGATCTGGCAAATACTCTGCTGACATCAGTTACCTGGGCTGCATATTATCCCAACACAGTCGATACTTTTACGTCTCTGAACCTGCTTGCGTTTGGCACTTTTATTGTGACACCAACACTGAATCGTTACAGTGCTACGTTCAACATGGGCGACTTCGCTTGGAGAGGTGTCGAAATTCGCTTTTCTGTCGGCGCTCAGACCGGAGGTACTTTTACTTTGCGTGACGCCATGTTGGCATCTGGCACTGCGGTAACTCCCATGGAAAGACGATTTTACGGTACAGAGTTACAGCTTTGCCAGCGTTATTTCCGCTGGGTTTCATGTAACTCTACTCTCCGTGCTGTCATCAGCGCCCAAACCCAGGAGACTGGAATAAACTGGCCCGAGATGAGGGTAACTCCAACAGCGGGAACTCCGGTCCCAGATCCAAACATACCTGGATTCTCTGAAACCACTAACGTCGCTTTCTTCTTTCTTGGGCGTATGACACCATATGGCGGCTCTCTTATACTGACCAGCAATACCTCTGGTGTCTCATATACTCTCGGTTACCGAGCCTCTCTCTCTGCTGAACTATGA

Tertiary structure

PDB ID
bc71ed739050c3f36869cfa014f6b3c71b05a0d4d37d9c9ac63932319f48de06
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,5002
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Complete genome sequences for two Myoviridae strains infecting cyanobacteria in a subarctic lake Levesque,A.V., Thaler,M., Labrie,S.J., Marois,C., Vincent,A.T., Lapointe,A.-M. and Culley,A. — — GenBank