Protein
View in Explore- Genbank accession
- AAQ15494.1 [GenBank]
- Protein name
- large distal tail fiber subunit
- RBP type
-
TSP
- Protein sequence
-
MADLSRIQFKRTSTKGRRPDAGTMNPGELAINLADQYLLTKNDFGAIINLSCPPVYDRDVTMAGKVKGNNYILSKTANYLEDQTARDLNYFGAFRTNGLDGLLELTLNVPHSSGVQHGRGFTFQYGHTGSRVETYGYNREGQKAFSYKMYHEGDKPTPSELNVYSKQEIDRMFVKNVKMVVPSGGATRGYFKIASAMIPQSGRMVFLRIYDGNGYNVNSYDQVDFLEIVIRSGNNNPKGVSIAAYRRNALNVHQVFAVNTSGDNYDIYVNYGRYTDNVIVEYGKTNDVTLTVHDVPELTLVKPSVGVTDARVITMFNTENKAGTLMFDNNPQGTYDIISLSNAADNNRNYLRKFRSKASEMVWHETVQGAVYRLATGATDSTEVIRIDSNSAIPGNYKGYVITGKMELHGSGNAMTLHRQTGQAAYMAWWDRRDGKNQRSGYIGHADGTSDGFVWRNDVGANSFDLEGSGQVNLTTGKTKIVYTNGQYYSANADAYRMIFGNYGAFWRNDGTKVYLLSTAENDKYGGWNAYRPFIYDLTSGNVQLGGDGNEEALTLERASRAARFSNDVYIKKGHLTFDAGRLNSRDYFRFNHWGDSNNARDNILQLDDSKGAHFTTERTLATGAIKTKFFGDLESAGQIKWGKGTATSTFTLRVWGNDSRKQIFECGDESGWHWYTQRAGGPGTNEIIFNVNGKFQSRDFETSGNIKITGPDIEFRRTGNKHIWFRDPNGLELGLMYCDDAGAIRFRGQKQAQTWKLADKMIHLEAGTVGGSDKGLIRGSVAGGSWASWRDRSAGILVDCPQSTDSAHNIWKATHWGKYHIAAMGVHVPGGTIGNAIARLNVNDANFEFSASGDMSAGRNGSFNDVYIRSDARLKINKEEYKENATDKVNRLTVYTYDKVKSLTDRTVIAHEVGIIAQDLEKELPEAVTTSKVGDPDKPEEILTISNSAVNALLIKAFQEMSEELKAVKAELEELKKN
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 979 AA molecular weight: 108796,94060 Da isoelectric point: 8,20665 aromaticity: 0,10419 hydropathy: -0,55741
Domains
Domains [InterPro]
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Escherichia phage RB49 [NCBI] |
50948 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host |
Escherichia coli [NCBI] |
562 | Bacteria > Proteobacteria > Gammaproteobacteria > Enterobacteriales > Enterobacteriaceae > Escherichia |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AAQ15494.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
AY343333
[NCBI]
CDS location
range 151717 -> 154656
strand +
strand +
CDS
ATGGCAGATTTAAGCAGAATCCAATTTAAACGCACTAGCACTAAAGGTCGTCGACCTGATGCTGGTACGATGAATCCGGGGGAATTGGCAATCAACCTTGCGGATCAATATCTTCTTACTAAAAATGATTTCGGTGCTATTATCAATTTAAGTTGTCCTCCGGTTTATGACCGCGATGTTACAATGGCAGGTAAGGTTAAAGGTAATAATTATATCTTAAGTAAAACCGCTAACTATCTGGAAGATCAGACAGCGCGAGATCTTAATTACTTTGGTGCTTTCCGTACCAATGGTCTTGATGGTCTTCTCGAACTCACGCTAAACGTTCCTCATTCTTCTGGTGTTCAGCATGGTCGAGGATTTACTTTCCAGTATGGACATACTGGATCACGAGTAGAAACCTATGGCTATAATAGAGAAGGTCAAAAAGCATTTAGTTATAAAATGTATCACGAAGGCGATAAACCTACACCATCGGAATTGAACGTTTACAGCAAACAAGAAATTGACCGTATGTTTGTTAAGAACGTTAAAATGGTTGTTCCTTCTGGTGGTGCAACCCGTGGTTATTTTAAAATTGCATCCGCAATGATCCCGCAGAGTGGTCGGATGGTGTTTCTGCGAATCTATGATGGTAATGGATATAATGTAAACTCATATGATCAAGTTGATTTTCTTGAAATTGTTATTCGTAGTGGTAATAATAACCCTAAAGGTGTTAGTATTGCTGCTTATCGTCGAAATGCTCTGAACGTTCATCAAGTATTTGCGGTTAATACTTCCGGTGATAACTACGATATCTACGTTAACTACGGTCGTTACACCGATAACGTTATTGTCGAATACGGTAAAACTAATGATGTTACTCTGACAGTACATGATGTTCCTGAATTAACTCTCGTTAAACCTTCTGTTGGTGTTACCGATGCTCGTGTTATTACAATGTTCAACACCGAAAACAAAGCCGGAACGTTGATGTTTGATAATAACCCGCAAGGGACTTACGATATTATCAGTTTGAGTAATGCTGCTGATAATAATAGAAATTATCTGCGTAAATTCCGAAGCAAAGCTAGTGAAATGGTTTGGCATGAAACCGTTCAGGGTGCTGTATATCGTCTTGCTACTGGTGCTACAGATTCTACAGAAGTTATTAGAATTGATTCTAATAGTGCAATACCGGGTAATTATAAAGGATATGTAATTACTGGTAAAATGGAATTGCACGGTAGTGGTAATGCGATGACTTTACATCGACAGACTGGTCAAGCTGCATATATGGCGTGGTGGGATCGTCGTGATGGTAAAAACCAACGTAGTGGTTATATCGGTCATGCGGATGGTACTAGTGATGGTTTTGTGTGGCGTAATGATGTTGGTGCTAACTCATTTGATTTGGAAGGTAGTGGACAAGTAAATTTGACTACAGGAAAAACAAAAATTGTATATACCAATGGTCAATATTATTCCGCTAACGCCGATGCATACCGTATGATCTTTGGTAATTACGGTGCATTCTGGCGTAATGACGGCACTAAAGTTTATCTTCTGTCTACTGCTGAAAATGATAAGTATGGTGGATGGAATGCCTATCGTCCATTCATTTATGATTTAACTTCCGGTAACGTTCAATTAGGCGGTGATGGTAACGAAGAAGCATTAACGTTAGAACGTGCTTCTCGTGCCGCTCGCTTTAGTAATGACGTTTACATTAAGAAAGGGCATTTGACTTTCGACGCTGGGCGATTAAATTCCCGCGATTACTTCCGGTTTAACCATTGGGGTGATAGTAATAATGCTCGTGATAACATCTTACAGCTTGACGATAGCAAGGGTGCTCATTTTACCACTGAACGTACTTTAGCAACTGGTGCAATTAAAACTAAATTCTTCGGTGATTTGGAATCTGCTGGTCAAATTAAATGGGGTAAAGGGACCGCCACATCTACGTTTACTCTACGTGTATGGGGTAACGATAGTCGTAAACAAATATTTGAATGCGGCGATGAAAGCGGGTGGCATTGGTATACCCAACGAGCGGGGGGTCCTGGTACAAATGAGATTATATTCAATGTTAACGGGAAATTTCAATCTCGGGATTTTGAGACTTCCGGTAATATTAAGATAACTGGTCCAGACATTGAGTTTCGTCGCACTGGTAATAAGCACATCTGGTTTAGAGATCCGAACGGTTTAGAATTAGGTTTGATGTACTGCGATGATGCTGGTGCTATTCGCTTCCGTGGTCAGAAACAAGCCCAGACGTGGAAACTTGCGGATAAGATGATTCATCTTGAGGCGGGGACTGTCGGCGGATCTGATAAAGGTTTGATTCGTGGTAGTGTTGCTGGTGGTAGCTGGGCTAGCTGGCGTGATCGTTCTGCCGGAATCCTCGTAGACTGTCCTCAATCAACCGATTCCGCTCATAACATCTGGAAAGCGACTCATTGGGGAAAATATCATATTGCGGCAATGGGTGTACACGTTCCTGGCGGCACTATAGGTAATGCTATAGCACGCCTAAACGTTAATGACGCAAACTTTGAATTTAGCGCCTCCGGTGACATGTCGGCAGGACGTAACGGTAGCTTTAACGATGTGTATATTCGTTCTGATGCTCGACTTAAAATCAATAAGGAAGAGTATAAAGAGAATGCCACCGATAAAGTTAATCGCTTGACTGTATACACCTATGATAAGGTTAAATCTTTAACCGACCGTACTGTCATTGCCCACGAAGTTGGTATTATTGCACAGGATCTTGAGAAAGAATTGCCGGAAGCAGTAACAACTTCTAAGGTTGGCGATCCTGATAAGCCAGAAGAAATCTTAACAATTTCTAACTCTGCTGTCAACGCTCTTTTAATTAAGGCGTTCCAGGAAATGAGCGAAGAACTTAAAGCCGTTAAAGCTGAACTAGAGGAACTTAAAAAGAATTAA
Tertiary structure
PDB ID
f3be67860386f25f0ed9121c2a3c2cbb7f29281ff9d0d34ba4395187a854bf14
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50