Protein
View in Explore- Genbank accession
- AZU99069.1 [GenBank]
- Protein name
- receptor binding protein
- RBP type
-
TSPTF
- Protein sequence
-
MVKQVIASAQITLTDLGDAIISGTKPTNPKLDQLWIERLTGKPDKLWRWNGTSWIEQTLDLGSLDPDADGKIENHETTIGNMVDDAKLDITERQEVKNKLTPIIGQAVTDNLASLPTAAQLWTNGVGEVFAVRKAAQNVGIQTTEAVYIAVETAYNSLQTFLNGMTPVKPWDASAANKDKVIAVVPTDWRTKWLDYYKAVQALTVAVQTKLQGNIDSIDISGRNLLNGTSTPTTAIGENRTNQTWTPYFFAAGNSKEIIDAATFCMSFDWVIEGTAAGTLNVQGNNPYPALASVITFSANNNKGHYSGTRSIPNATGTFTGVNFRLDNFPVGSKLTISNVKIETGNKPTGWTPSPEDVAKAIDDADKKAQQVTDSVNDMSLDSKLTPVEKIQLKTDYDSITAEFTTTLNSADAFNLTSSSERAAYNTAYNALKTFVDPLLVKMNETSGVDRTAFRQRFKDYYDTKAKLLKKISDTSKGLIDEAASQMPNILMNSGFINDSKYWTLAPNVTVDSVLFEGVKTVKSNQTGLSTAQWRGMVSEFYDCSAGQSIVYSVYTMTSNLASIDTGVTCEINYYDKDKNRILSQGGSFDIKPANNNEWKRFSGTYKATDPNVKYVRFNCYVRQNGLLYMAKPMIQFGTVLGSWCPSPSDFIISNIDKTAEESKSAIADMSSDNKLTPLEKVQLKKEWGTIAAEKPQFEALGKSYYNASSELNAYINAYNTLNNTLNGTTGYLKNMASTDTINGATFRAQFDTYYAKQAELIKKVNNLIQGNIDGIQGVKNLILASKRVINSNDYLLNDFTITEDFVAGQDYTFVVKGTVPAGQKFGIWQNGGSTNVGYAEVEFIKGVYYVSFKAVATTAGNARSLRLYNFPSNTTNATVEWVALYKGTKPFDWTAAPEDADVGKTNLIIDSEFKYLASWLQSNPNLCKTETGIMPNGVKNVTLSINSTDGTNKYVDFAQYIEVEPNTEYTFSCKAGGTFQTFLWEKKADKTPTNVYKDNAKSHGGASWDMSSPRDTFTRTIKTQPDTKYIHFIFRVQSNTTTYVSGRLALPQLEKGTTASEWKPNPFDTSNGEIFIQGSATDITDGNRKLTVNGNVVYDSNAGRGLRLVTLKKDTLAVVDDITYDVYGSDVPKNDLATKINSLGNDVFITLTSYDAVNFNTNLLTALVSIGASGTILQGRLPYAFIGMKGLGRYNGLEQWTGLGNMFPPATISCKVVNGMIQGINNNNGQSDANVRKDLRLNAPLPTSILMDSNGITASGTDASKYARLDYRGLYIAGGAIQIDGGLSEGQLAQGVTRKMSYLDSNGLYTGQVNIGGSGQNGILSIKNASNSEIVRGDTNGLTVNNGAITIKRPDGANLIINGMAAYNFAVTTHNPPFRGDNIDTRSWYYHTTKGIPFSRDLQVCDYVATQHTGRYMKMDVDFYTSPGNSGALVVIQAGKYNSGGQEVIVSQVEITNTTPQPSYTISIDCGVPNYQRIGFYFCLASWSAGDVYARLVRAWMEG
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1504 AA molecular weight: 164449,43720 Da isoelectric point: 5,88360 aromaticity: 0,09707 hydropathy: -0,33484
Domains
Domains [InterPro]
DC_0015
STR
3–360
STR
3–360
DC_0015
STR
357–664
STR
357–664
DC_0904
STR
1184–1504
STR
1184–1504
1
1504
Architecture
STR 3-1045 | STR 1066-1504
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Tail Spike Domain Segmentation
Tail Spike Domain Segmentation
This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.
Domain Layout
1
1504
| Domain | Start | End | Length (AA) | Confidence |
|---|---|---|---|---|
| N-terminal | 1 | 236 | 236 | 0,9928 |
| Central domain | 237 | 542 | 307 | 0,3791 |
| C-terminal | 543 | 1504 | 961 | 0,1364 |
Legend:
N-terminal
Central domain
C-terminal
3D Structure with Domain Coloring
The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).
Domain Coloring
N-terminal
1-236
1-236
Central
237-542
237-542
C-terminal
543-1504
543-1504
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Bacillus phage pW4 [NCBI] |
2500560 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host |
Bacillus cereus [NCBI] |
1396 | cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Bacillota > Bacilli > Bacillales |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AZU99069.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
MK288022
[NCBI]
CDS location
range 35186 -> 39700
strand +
strand +
CDS
ATGGTAAAACAGGTTATCGCTTCAGCACAAATAACATTAACAGACTTAGGCGATGCAATAATTTCAGGTACAAAGCCTACTAATCCTAAACTGGATCAGTTATGGATTGAACGTTTAACTGGTAAACCTGATAAGTTATGGCGATGGAATGGTACAAGTTGGATTGAACAAACATTAGATTTAGGATCACTAGACCCTGATGCTGATGGCAAAATAGAAAACCATGAAACTACTATTGGGAATATGGTTGATGATGCAAAACTTGATATAACAGAACGTCAAGAAGTTAAGAATAAATTAACTCCAATCATCGGACAAGCTGTTACTGATAATTTAGCTTCACTACCTACAGCTGCTCAATTATGGACTAACGGTGTCGGTGAAGTATTTGCAGTTCGTAAGGCCGCTCAAAACGTAGGGATTCAAACTACTGAAGCTGTTTATATAGCTGTAGAAACTGCATATAATTCATTGCAAACTTTTTTAAACGGAATGACACCTGTTAAACCGTGGGATGCTTCAGCTGCTAATAAAGATAAAGTTATTGCTGTAGTACCTACTGATTGGAGAACTAAATGGTTAGATTATTACAAAGCTGTACAAGCATTAACTGTAGCTGTTCAAACTAAATTACAAGGTAATATAGATTCTATAGATATTAGTGGTCGTAACTTATTGAATGGAACATCTACACCAACAACTGCAATAGGTGAAAATAGAACTAACCAAACGTGGACTCCTTATTTTTTCGCTGCTGGTAATTCTAAAGAAATAATTGATGCTGCAACATTTTGTATGTCGTTTGATTGGGTTATAGAAGGTACGGCTGCTGGAACATTAAACGTTCAAGGTAACAATCCTTATCCAGCTTTAGCTAGTGTAATAACTTTTTCGGCAAATAATAACAAAGGACACTATTCAGGTACAAGAAGTATACCAAACGCTACAGGAACATTTACAGGAGTTAACTTCCGTCTAGATAATTTCCCTGTAGGCTCTAAATTAACTATTTCAAATGTTAAAATCGAAACTGGAAACAAACCTACTGGCTGGACTCCATCACCTGAAGATGTAGCTAAAGCTATTGATGATGCTGACAAAAAAGCTCAACAAGTAACTGATTCAGTAAATGATATGTCTTTAGATAGTAAATTAACACCAGTTGAGAAAATCCAATTAAAAACTGATTATGATTCAATTACTGCTGAGTTCACTACTACTCTAAATAGTGCTGATGCATTTAATTTGACTTCATCATCGGAAAGGGCTGCATACAATACAGCTTATAATGCGTTAAAAACTTTCGTTGATCCATTGTTAGTAAAAATGAACGAAACTTCAGGCGTAGATAGAACTGCATTTAGACAAAGATTCAAAGATTACTATGATACTAAAGCTAAATTATTAAAAAAGATTTCTGACACATCAAAAGGATTAATAGATGAAGCCGCTAGTCAAATGCCGAACATTCTTATGAATAGTGGTTTTATTAATGATTCTAAATATTGGACTTTAGCTCCTAACGTTACTGTAGATTCAGTTTTATTTGAAGGTGTTAAAACAGTAAAAAGTAATCAGACAGGTTTATCTACAGCTCAATGGCGCGGTATGGTTTCTGAGTTTTATGATTGTTCTGCTGGTCAATCAATTGTTTATAGTGTCTATACAATGACATCCAATTTAGCATCAATCGATACAGGAGTTACTTGTGAAATTAATTATTACGATAAAGACAAGAACAGAATATTATCTCAAGGTGGTTCTTTTGATATAAAACCTGCAAACAATAATGAATGGAAGAGGTTTTCGGGAACGTATAAAGCTACTGATCCAAATGTTAAATACGTAAGATTTAACTGTTATGTAAGACAAAACGGACTTCTTTACATGGCGAAACCTATGATTCAATTTGGTACAGTATTAGGTTCTTGGTGTCCTAGTCCTTCTGATTTCATTATTAGCAATATTGATAAAACGGCCGAAGAAAGCAAAAGTGCTATTGCAGATATGTCTAGCGATAACAAATTAACTCCTTTAGAAAAGGTTCAGTTAAAGAAGGAATGGGGTACAATCGCTGCTGAGAAACCTCAATTTGAAGCTTTAGGTAAAAGTTATTACAATGCTTCTTCTGAGCTTAACGCGTACATTAATGCTTACAACACATTGAACAATACGTTGAATGGAACTACTGGTTATCTAAAGAATATGGCTTCTACAGATACAATCAATGGCGCTACATTCCGCGCTCAATTCGACACGTATTATGCGAAACAAGCTGAGTTAATAAAGAAAGTTAACAACTTGATCCAAGGTAATATTGATGGGATTCAAGGCGTTAAGAATTTAATATTAGCTTCCAAAAGAGTTATTAATTCTAACGACTATCTTCTTAATGACTTTACCATTACTGAAGATTTCGTTGCTGGACAGGATTATACTTTTGTTGTTAAAGGTACTGTTCCTGCTGGTCAAAAGTTTGGAATATGGCAAAACGGCGGTTCTACTAATGTAGGTTATGCTGAAGTTGAATTTATTAAAGGTGTTTATTACGTTTCATTCAAAGCTGTTGCAACTACAGCAGGAAACGCACGTTCTTTACGATTATATAATTTCCCTAGCAACACAACTAATGCTACAGTTGAATGGGTTGCATTGTACAAAGGAACTAAACCTTTTGATTGGACGGCTGCTCCTGAAGATGCTGATGTAGGTAAAACTAACTTGATTATCGATTCTGAATTTAAGTATTTAGCAAGTTGGTTACAATCAAATCCTAACTTATGCAAAACAGAAACCGGAATAATGCCTAACGGTGTGAAAAACGTAACACTTTCGATTAACAGCACTGACGGAACTAATAAGTATGTTGATTTCGCTCAATATATAGAAGTAGAACCGAATACAGAATATACTTTCTCGTGTAAAGCTGGTGGTACTTTCCAAACATTCTTATGGGAAAAGAAAGCTGATAAAACACCAACTAACGTTTATAAAGACAATGCTAAATCTCATGGTGGTGCTTCATGGGACATGTCATCACCACGCGATACATTCACAAGAACAATCAAAACTCAACCTGACACTAAGTATATTCATTTTATCTTCAGGGTTCAAAGTAACACAACAACTTATGTTAGTGGTCGTTTGGCGCTTCCGCAATTAGAAAAAGGAACTACAGCTAGTGAATGGAAACCTAATCCGTTTGACACTTCTAATGGTGAAATTTTTATTCAAGGTTCTGCTACTGATATAACTGATGGAAACAGAAAGTTAACAGTTAATGGAAATGTTGTTTATGATAGTAATGCAGGTCGTGGTTTAAGGCTTGTCACGTTAAAGAAAGATACGTTAGCTGTTGTGGATGATATCACATATGATGTATATGGTTCTGATGTTCCGAAAAATGATTTAGCAACAAAGATTAACTCATTAGGGAATGATGTATTCATAACTTTAACTTCTTACGATGCAGTTAATTTTAATACAAACTTATTAACAGCTCTTGTTTCGATTGGAGCTTCAGGGACTATCCTACAAGGACGTTTACCTTATGCATTTATCGGTATGAAAGGTTTAGGTCGTTACAACGGATTAGAACAATGGACAGGCCTTGGTAACATGTTCCCTCCTGCTACTATAAGTTGTAAAGTTGTTAACGGGATGATCCAAGGAATCAATAATAACAATGGGCAATCTGATGCTAACGTTCGTAAAGATTTACGTCTTAATGCTCCCTTACCGACAAGTATCCTCATGGATTCGAACGGTATAACAGCAAGTGGTACTGATGCAAGTAAGTACGCACGTTTAGATTATCGTGGTCTTTATATCGCTGGTGGAGCTATTCAAATTGATGGTGGTCTTTCTGAAGGACAACTTGCTCAAGGTGTTACGAGAAAAATGTCGTATCTAGATAGTAATGGTTTATACACTGGACAGGTAAACATTGGTGGTTCTGGTCAAAATGGTATATTATCCATTAAAAATGCTTCCAATAGTGAGATTGTCCGTGGTGATACAAATGGATTAACCGTCAATAACGGCGCTATAACAATTAAACGTCCTGATGGAGCTAACTTGATTATAAATGGTATGGCTGCTTATAACTTCGCTGTAACAACTCATAATCCACCTTTCCGTGGTGACAACATCGATACAAGATCATGGTATTACCACACAACGAAAGGGATTCCGTTCAGTCGTGACTTACAAGTTTGTGATTATGTAGCAACTCAACATACAGGAAGATATATGAAAATGGATGTTGATTTTTATACTTCACCTGGCAATTCAGGAGCTTTAGTAGTCATACAGGCTGGTAAATACAATTCAGGCGGTCAGGAAGTTATTGTTTCTCAAGTAGAGATAACTAATACAACTCCACAACCATCTTATACAATTAGTATAGATTGTGGAGTTCCGAATTATCAAAGAATTGGTTTCTATTTCTGTTTAGCTTCTTGGAGTGCTGGTGATGTATACGCACGTTTAGTTAGAGCTTGGATGGAAGGTTAA
Genome Context
Genome Context
Tertiary structure
PDB ID
8660ce3caed00f11d8052b343fb7a058c5cc11d2b7534683452a0189bc7fdaa6
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50
Literature
| Title | Authors | Date | PMID | Source |
|---|---|---|---|---|
| Characterization of novel siphovirus infecting Emetic Bacillus cereus | Hu,X., Wan,X., Geng,P. and Yuan,Z. | 2017-09-08 | — | GenBank |