Genbank accession
AZU99069.1 [GenBank]
Protein name
receptor binding protein
RBP type
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,50
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,91
Protein sequence
MVKQVIASAQITLTDLGDAIISGTKPTNPKLDQLWIERLTGKPDKLWRWNGTSWIEQTLDLGSLDPDADGKIENHETTIGNMVDDAKLDITERQEVKNKLTPIIGQAVTDNLASLPTAAQLWTNGVGEVFAVRKAAQNVGIQTTEAVYIAVETAYNSLQTFLNGMTPVKPWDASAANKDKVIAVVPTDWRTKWLDYYKAVQALTVAVQTKLQGNIDSIDISGRNLLNGTSTPTTAIGENRTNQTWTPYFFAAGNSKEIIDAATFCMSFDWVIEGTAAGTLNVQGNNPYPALASVITFSANNNKGHYSGTRSIPNATGTFTGVNFRLDNFPVGSKLTISNVKIETGNKPTGWTPSPEDVAKAIDDADKKAQQVTDSVNDMSLDSKLTPVEKIQLKTDYDSITAEFTTTLNSADAFNLTSSSERAAYNTAYNALKTFVDPLLVKMNETSGVDRTAFRQRFKDYYDTKAKLLKKISDTSKGLIDEAASQMPNILMNSGFINDSKYWTLAPNVTVDSVLFEGVKTVKSNQTGLSTAQWRGMVSEFYDCSAGQSIVYSVYTMTSNLASIDTGVTCEINYYDKDKNRILSQGGSFDIKPANNNEWKRFSGTYKATDPNVKYVRFNCYVRQNGLLYMAKPMIQFGTVLGSWCPSPSDFIISNIDKTAEESKSAIADMSSDNKLTPLEKVQLKKEWGTIAAEKPQFEALGKSYYNASSELNAYINAYNTLNNTLNGTTGYLKNMASTDTINGATFRAQFDTYYAKQAELIKKVNNLIQGNIDGIQGVKNLILASKRVINSNDYLLNDFTITEDFVAGQDYTFVVKGTVPAGQKFGIWQNGGSTNVGYAEVEFIKGVYYVSFKAVATTAGNARSLRLYNFPSNTTNATVEWVALYKGTKPFDWTAAPEDADVGKTNLIIDSEFKYLASWLQSNPNLCKTETGIMPNGVKNVTLSINSTDGTNKYVDFAQYIEVEPNTEYTFSCKAGGTFQTFLWEKKADKTPTNVYKDNAKSHGGASWDMSSPRDTFTRTIKTQPDTKYIHFIFRVQSNTTTYVSGRLALPQLEKGTTASEWKPNPFDTSNGEIFIQGSATDITDGNRKLTVNGNVVYDSNAGRGLRLVTLKKDTLAVVDDITYDVYGSDVPKNDLATKINSLGNDVFITLTSYDAVNFNTNLLTALVSIGASGTILQGRLPYAFIGMKGLGRYNGLEQWTGLGNMFPPATISCKVVNGMIQGINNNNGQSDANVRKDLRLNAPLPTSILMDSNGITASGTDASKYARLDYRGLYIAGGAIQIDGGLSEGQLAQGVTRKMSYLDSNGLYTGQVNIGGSGQNGILSIKNASNSEIVRGDTNGLTVNNGAITIKRPDGANLIINGMAAYNFAVTTHNPPFRGDNIDTRSWYYHTTKGIPFSRDLQVCDYVATQHTGRYMKMDVDFYTSPGNSGALVVIQAGKYNSGGQEVIVSQVEITNTTPQPSYTISIDCGVPNYQRIGFYFCLASWSAGDVYARLVRAWMEG
Physico‐chemical
properties
protein length:1504 AA
molecular weight: 164449,43720 Da
isoelectric point:5,88360
aromaticity:0,09707
hydropathy:-0,33484

Domains

Domains [InterPro]
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Bacillus phage pW4
[NCBI]
2500560 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AZU99069.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MK288022 [NCBI]
CDS location
range 35186 -> 39700
strand +
CDS
ATGGTAAAACAGGTTATCGCTTCAGCACAAATAACATTAACAGACTTAGGCGATGCAATAATTTCAGGTACAAAGCCTACTAATCCTAAACTGGATCAGTTATGGATTGAACGTTTAACTGGTAAACCTGATAAGTTATGGCGATGGAATGGTACAAGTTGGATTGAACAAACATTAGATTTAGGATCACTAGACCCTGATGCTGATGGCAAAATAGAAAACCATGAAACTACTATTGGGAATATGGTTGATGATGCAAAACTTGATATAACAGAACGTCAAGAAGTTAAGAATAAATTAACTCCAATCATCGGACAAGCTGTTACTGATAATTTAGCTTCACTACCTACAGCTGCTCAATTATGGACTAACGGTGTCGGTGAAGTATTTGCAGTTCGTAAGGCCGCTCAAAACGTAGGGATTCAAACTACTGAAGCTGTTTATATAGCTGTAGAAACTGCATATAATTCATTGCAAACTTTTTTAAACGGAATGACACCTGTTAAACCGTGGGATGCTTCAGCTGCTAATAAAGATAAAGTTATTGCTGTAGTACCTACTGATTGGAGAACTAAATGGTTAGATTATTACAAAGCTGTACAAGCATTAACTGTAGCTGTTCAAACTAAATTACAAGGTAATATAGATTCTATAGATATTAGTGGTCGTAACTTATTGAATGGAACATCTACACCAACAACTGCAATAGGTGAAAATAGAACTAACCAAACGTGGACTCCTTATTTTTTCGCTGCTGGTAATTCTAAAGAAATAATTGATGCTGCAACATTTTGTATGTCGTTTGATTGGGTTATAGAAGGTACGGCTGCTGGAACATTAAACGTTCAAGGTAACAATCCTTATCCAGCTTTAGCTAGTGTAATAACTTTTTCGGCAAATAATAACAAAGGACACTATTCAGGTACAAGAAGTATACCAAACGCTACAGGAACATTTACAGGAGTTAACTTCCGTCTAGATAATTTCCCTGTAGGCTCTAAATTAACTATTTCAAATGTTAAAATCGAAACTGGAAACAAACCTACTGGCTGGACTCCATCACCTGAAGATGTAGCTAAAGCTATTGATGATGCTGACAAAAAAGCTCAACAAGTAACTGATTCAGTAAATGATATGTCTTTAGATAGTAAATTAACACCAGTTGAGAAAATCCAATTAAAAACTGATTATGATTCAATTACTGCTGAGTTCACTACTACTCTAAATAGTGCTGATGCATTTAATTTGACTTCATCATCGGAAAGGGCTGCATACAATACAGCTTATAATGCGTTAAAAACTTTCGTTGATCCATTGTTAGTAAAAATGAACGAAACTTCAGGCGTAGATAGAACTGCATTTAGACAAAGATTCAAAGATTACTATGATACTAAAGCTAAATTATTAAAAAAGATTTCTGACACATCAAAAGGATTAATAGATGAAGCCGCTAGTCAAATGCCGAACATTCTTATGAATAGTGGTTTTATTAATGATTCTAAATATTGGACTTTAGCTCCTAACGTTACTGTAGATTCAGTTTTATTTGAAGGTGTTAAAACAGTAAAAAGTAATCAGACAGGTTTATCTACAGCTCAATGGCGCGGTATGGTTTCTGAGTTTTATGATTGTTCTGCTGGTCAATCAATTGTTTATAGTGTCTATACAATGACATCCAATTTAGCATCAATCGATACAGGAGTTACTTGTGAAATTAATTATTACGATAAAGACAAGAACAGAATATTATCTCAAGGTGGTTCTTTTGATATAAAACCTGCAAACAATAATGAATGGAAGAGGTTTTCGGGAACGTATAAAGCTACTGATCCAAATGTTAAATACGTAAGATTTAACTGTTATGTAAGACAAAACGGACTTCTTTACATGGCGAAACCTATGATTCAATTTGGTACAGTATTAGGTTCTTGGTGTCCTAGTCCTTCTGATTTCATTATTAGCAATATTGATAAAACGGCCGAAGAAAGCAAAAGTGCTATTGCAGATATGTCTAGCGATAACAAATTAACTCCTTTAGAAAAGGTTCAGTTAAAGAAGGAATGGGGTACAATCGCTGCTGAGAAACCTCAATTTGAAGCTTTAGGTAAAAGTTATTACAATGCTTCTTCTGAGCTTAACGCGTACATTAATGCTTACAACACATTGAACAATACGTTGAATGGAACTACTGGTTATCTAAAGAATATGGCTTCTACAGATACAATCAATGGCGCTACATTCCGCGCTCAATTCGACACGTATTATGCGAAACAAGCTGAGTTAATAAAGAAAGTTAACAACTTGATCCAAGGTAATATTGATGGGATTCAAGGCGTTAAGAATTTAATATTAGCTTCCAAAAGAGTTATTAATTCTAACGACTATCTTCTTAATGACTTTACCATTACTGAAGATTTCGTTGCTGGACAGGATTATACTTTTGTTGTTAAAGGTACTGTTCCTGCTGGTCAAAAGTTTGGAATATGGCAAAACGGCGGTTCTACTAATGTAGGTTATGCTGAAGTTGAATTTATTAAAGGTGTTTATTACGTTTCATTCAAAGCTGTTGCAACTACAGCAGGAAACGCACGTTCTTTACGATTATATAATTTCCCTAGCAACACAACTAATGCTACAGTTGAATGGGTTGCATTGTACAAAGGAACTAAACCTTTTGATTGGACGGCTGCTCCTGAAGATGCTGATGTAGGTAAAACTAACTTGATTATCGATTCTGAATTTAAGTATTTAGCAAGTTGGTTACAATCAAATCCTAACTTATGCAAAACAGAAACCGGAATAATGCCTAACGGTGTGAAAAACGTAACACTTTCGATTAACAGCACTGACGGAACTAATAAGTATGTTGATTTCGCTCAATATATAGAAGTAGAACCGAATACAGAATATACTTTCTCGTGTAAAGCTGGTGGTACTTTCCAAACATTCTTATGGGAAAAGAAAGCTGATAAAACACCAACTAACGTTTATAAAGACAATGCTAAATCTCATGGTGGTGCTTCATGGGACATGTCATCACCACGCGATACATTCACAAGAACAATCAAAACTCAACCTGACACTAAGTATATTCATTTTATCTTCAGGGTTCAAAGTAACACAACAACTTATGTTAGTGGTCGTTTGGCGCTTCCGCAATTAGAAAAAGGAACTACAGCTAGTGAATGGAAACCTAATCCGTTTGACACTTCTAATGGTGAAATTTTTATTCAAGGTTCTGCTACTGATATAACTGATGGAAACAGAAAGTTAACAGTTAATGGAAATGTTGTTTATGATAGTAATGCAGGTCGTGGTTTAAGGCTTGTCACGTTAAAGAAAGATACGTTAGCTGTTGTGGATGATATCACATATGATGTATATGGTTCTGATGTTCCGAAAAATGATTTAGCAACAAAGATTAACTCATTAGGGAATGATGTATTCATAACTTTAACTTCTTACGATGCAGTTAATTTTAATACAAACTTATTAACAGCTCTTGTTTCGATTGGAGCTTCAGGGACTATCCTACAAGGACGTTTACCTTATGCATTTATCGGTATGAAAGGTTTAGGTCGTTACAACGGATTAGAACAATGGACAGGCCTTGGTAACATGTTCCCTCCTGCTACTATAAGTTGTAAAGTTGTTAACGGGATGATCCAAGGAATCAATAATAACAATGGGCAATCTGATGCTAACGTTCGTAAAGATTTACGTCTTAATGCTCCCTTACCGACAAGTATCCTCATGGATTCGAACGGTATAACAGCAAGTGGTACTGATGCAAGTAAGTACGCACGTTTAGATTATCGTGGTCTTTATATCGCTGGTGGAGCTATTCAAATTGATGGTGGTCTTTCTGAAGGACAACTTGCTCAAGGTGTTACGAGAAAAATGTCGTATCTAGATAGTAATGGTTTATACACTGGACAGGTAAACATTGGTGGTTCTGGTCAAAATGGTATATTATCCATTAAAAATGCTTCCAATAGTGAGATTGTCCGTGGTGATACAAATGGATTAACCGTCAATAACGGCGCTATAACAATTAAACGTCCTGATGGAGCTAACTTGATTATAAATGGTATGGCTGCTTATAACTTCGCTGTAACAACTCATAATCCACCTTTCCGTGGTGACAACATCGATACAAGATCATGGTATTACCACACAACGAAAGGGATTCCGTTCAGTCGTGACTTACAAGTTTGTGATTATGTAGCAACTCAACATACAGGAAGATATATGAAAATGGATGTTGATTTTTATACTTCACCTGGCAATTCAGGAGCTTTAGTAGTCATACAGGCTGGTAAATACAATTCAGGCGGTCAGGAAGTTATTGTTTCTCAAGTAGAGATAACTAATACAACTCCACAACCATCTTATACAATTAGTATAGATTGTGGAGTTCCGAATTATCAAAGAATTGGTTTCTATTTCTGTTTAGCTTCTTGGAGTGCTGGTGATGTATACGCACGTTTAGTTAGAGCTTGGATGGAAGGTTAA

Tertiary structure

PDB ID
8660ce3caed00f11d8052b343fb7a058c5cc11d2b7534683452a0189bc7fdaa6
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,8277
Oligomeric State monomer
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Characterization of novel siphovirus infecting Emetic Bacillus cereus Hu,X., Wan,X., Geng,P. and Yuan,Z. 2017-09-08 GenBank