Protein
View in Explore- Genbank accession
- AZU99069.1 [GenBank]
- Protein name
- receptor binding protein
- RBP type
-
TSPTF
- Protein sequence
-
MVKQVIASAQITLTDLGDAIISGTKPTNPKLDQLWIERLTGKPDKLWRWNGTSWIEQTLDLGSLDPDADGKIENHETTIGNMVDDAKLDITERQEVKNKLTPIIGQAVTDNLASLPTAAQLWTNGVGEVFAVRKAAQNVGIQTTEAVYIAVETAYNSLQTFLNGMTPVKPWDASAANKDKVIAVVPTDWRTKWLDYYKAVQALTVAVQTKLQGNIDSIDISGRNLLNGTSTPTTAIGENRTNQTWTPYFFAAGNSKEIIDAATFCMSFDWVIEGTAAGTLNVQGNNPYPALASVITFSANNNKGHYSGTRSIPNATGTFTGVNFRLDNFPVGSKLTISNVKIETGNKPTGWTPSPEDVAKAIDDADKKAQQVTDSVNDMSLDSKLTPVEKIQLKTDYDSITAEFTTTLNSADAFNLTSSSERAAYNTAYNALKTFVDPLLVKMNETSGVDRTAFRQRFKDYYDTKAKLLKKISDTSKGLIDEAASQMPNILMNSGFINDSKYWTLAPNVTVDSVLFEGVKTVKSNQTGLSTAQWRGMVSEFYDCSAGQSIVYSVYTMTSNLASIDTGVTCEINYYDKDKNRILSQGGSFDIKPANNNEWKRFSGTYKATDPNVKYVRFNCYVRQNGLLYMAKPMIQFGTVLGSWCPSPSDFIISNIDKTAEESKSAIADMSSDNKLTPLEKVQLKKEWGTIAAEKPQFEALGKSYYNASSELNAYINAYNTLNNTLNGTTGYLKNMASTDTINGATFRAQFDTYYAKQAELIKKVNNLIQGNIDGIQGVKNLILASKRVINSNDYLLNDFTITEDFVAGQDYTFVVKGTVPAGQKFGIWQNGGSTNVGYAEVEFIKGVYYVSFKAVATTAGNARSLRLYNFPSNTTNATVEWVALYKGTKPFDWTAAPEDADVGKTNLIIDSEFKYLASWLQSNPNLCKTETGIMPNGVKNVTLSINSTDGTNKYVDFAQYIEVEPNTEYTFSCKAGGTFQTFLWEKKADKTPTNVYKDNAKSHGGASWDMSSPRDTFTRTIKTQPDTKYIHFIFRVQSNTTTYVSGRLALPQLEKGTTASEWKPNPFDTSNGEIFIQGSATDITDGNRKLTVNGNVVYDSNAGRGLRLVTLKKDTLAVVDDITYDVYGSDVPKNDLATKINSLGNDVFITLTSYDAVNFNTNLLTALVSIGASGTILQGRLPYAFIGMKGLGRYNGLEQWTGLGNMFPPATISCKVVNGMIQGINNNNGQSDANVRKDLRLNAPLPTSILMDSNGITASGTDASKYARLDYRGLYIAGGAIQIDGGLSEGQLAQGVTRKMSYLDSNGLYTGQVNIGGSGQNGILSIKNASNSEIVRGDTNGLTVNNGAITIKRPDGANLIINGMAAYNFAVTTHNPPFRGDNIDTRSWYYHTTKGIPFSRDLQVCDYVATQHTGRYMKMDVDFYTSPGNSGALVVIQAGKYNSGGQEVIVSQVEITNTTPQPSYTISIDCGVPNYQRIGFYFCLASWSAGDVYARLVRAWMEG
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1504 AA molecular weight: 164449,43720 Da isoelectric point: 5,88360 aromaticity: 0,09707 hydropathy: -0,33484
Domains
Domains [InterPro]
G3DSA:2.60.120.260
484–630
484–630
1
1504
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Bacillus phage pW4 [NCBI] |
2500560 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AZU99069.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
MK288022
[NCBI]
CDS location
range 35186 -> 39700
strand +
strand +
CDS
ATGGTAAAACAGGTTATCGCTTCAGCACAAATAACATTAACAGACTTAGGCGATGCAATAATTTCAGGTACAAAGCCTACTAATCCTAAACTGGATCAGTTATGGATTGAACGTTTAACTGGTAAACCTGATAAGTTATGGCGATGGAATGGTACAAGTTGGATTGAACAAACATTAGATTTAGGATCACTAGACCCTGATGCTGATGGCAAAATAGAAAACCATGAAACTACTATTGGGAATATGGTTGATGATGCAAAACTTGATATAACAGAACGTCAAGAAGTTAAGAATAAATTAACTCCAATCATCGGACAAGCTGTTACTGATAATTTAGCTTCACTACCTACAGCTGCTCAATTATGGACTAACGGTGTCGGTGAAGTATTTGCAGTTCGTAAGGCCGCTCAAAACGTAGGGATTCAAACTACTGAAGCTGTTTATATAGCTGTAGAAACTGCATATAATTCATTGCAAACTTTTTTAAACGGAATGACACCTGTTAAACCGTGGGATGCTTCAGCTGCTAATAAAGATAAAGTTATTGCTGTAGTACCTACTGATTGGAGAACTAAATGGTTAGATTATTACAAAGCTGTACAAGCATTAACTGTAGCTGTTCAAACTAAATTACAAGGTAATATAGATTCTATAGATATTAGTGGTCGTAACTTATTGAATGGAACATCTACACCAACAACTGCAATAGGTGAAAATAGAACTAACCAAACGTGGACTCCTTATTTTTTCGCTGCTGGTAATTCTAAAGAAATAATTGATGCTGCAACATTTTGTATGTCGTTTGATTGGGTTATAGAAGGTACGGCTGCTGGAACATTAAACGTTCAAGGTAACAATCCTTATCCAGCTTTAGCTAGTGTAATAACTTTTTCGGCAAATAATAACAAAGGACACTATTCAGGTACAAGAAGTATACCAAACGCTACAGGAACATTTACAGGAGTTAACTTCCGTCTAGATAATTTCCCTGTAGGCTCTAAATTAACTATTTCAAATGTTAAAATCGAAACTGGAAACAAACCTACTGGCTGGACTCCATCACCTGAAGATGTAGCTAAAGCTATTGATGATGCTGACAAAAAAGCTCAACAAGTAACTGATTCAGTAAATGATATGTCTTTAGATAGTAAATTAACACCAGTTGAGAAAATCCAATTAAAAACTGATTATGATTCAATTACTGCTGAGTTCACTACTACTCTAAATAGTGCTGATGCATTTAATTTGACTTCATCATCGGAAAGGGCTGCATACAATACAGCTTATAATGCGTTAAAAACTTTCGTTGATCCATTGTTAGTAAAAATGAACGAAACTTCAGGCGTAGATAGAACTGCATTTAGACAAAGATTCAAAGATTACTATGATACTAAAGCTAAATTATTAAAAAAGATTTCTGACACATCAAAAGGATTAATAGATGAAGCCGCTAGTCAAATGCCGAACATTCTTATGAATAGTGGTTTTATTAATGATTCTAAATATTGGACTTTAGCTCCTAACGTTACTGTAGATTCAGTTTTATTTGAAGGTGTTAAAACAGTAAAAAGTAATCAGACAGGTTTATCTACAGCTCAATGGCGCGGTATGGTTTCTGAGTTTTATGATTGTTCTGCTGGTCAATCAATTGTTTATAGTGTCTATACAATGACATCCAATTTAGCATCAATCGATACAGGAGTTACTTGTGAAATTAATTATTACGATAAAGACAAGAACAGAATATTATCTCAAGGTGGTTCTTTTGATATAAAACCTGCAAACAATAATGAATGGAAGAGGTTTTCGGGAACGTATAAAGCTACTGATCCAAATGTTAAATACGTAAGATTTAACTGTTATGTAAGACAAAACGGACTTCTTTACATGGCGAAACCTATGATTCAATTTGGTACAGTATTAGGTTCTTGGTGTCCTAGTCCTTCTGATTTCATTATTAGCAATATTGATAAAACGGCCGAAGAAAGCAAAAGTGCTATTGCAGATATGTCTAGCGATAACAAATTAACTCCTTTAGAAAAGGTTCAGTTAAAGAAGGAATGGGGTACAATCGCTGCTGAGAAACCTCAATTTGAAGCTTTAGGTAAAAGTTATTACAATGCTTCTTCTGAGCTTAACGCGTACATTAATGCTTACAACACATTGAACAATACGTTGAATGGAACTACTGGTTATCTAAAGAATATGGCTTCTACAGATACAATCAATGGCGCTACATTCCGCGCTCAATTCGACACGTATTATGCGAAACAAGCTGAGTTAATAAAGAAAGTTAACAACTTGATCCAAGGTAATATTGATGGGATTCAAGGCGTTAAGAATTTAATATTAGCTTCCAAAAGAGTTATTAATTCTAACGACTATCTTCTTAATGACTTTACCATTACTGAAGATTTCGTTGCTGGACAGGATTATACTTTTGTTGTTAAAGGTACTGTTCCTGCTGGTCAAAAGTTTGGAATATGGCAAAACGGCGGTTCTACTAATGTAGGTTATGCTGAAGTTGAATTTATTAAAGGTGTTTATTACGTTTCATTCAAAGCTGTTGCAACTACAGCAGGAAACGCACGTTCTTTACGATTATATAATTTCCCTAGCAACACAACTAATGCTACAGTTGAATGGGTTGCATTGTACAAAGGAACTAAACCTTTTGATTGGACGGCTGCTCCTGAAGATGCTGATGTAGGTAAAACTAACTTGATTATCGATTCTGAATTTAAGTATTTAGCAAGTTGGTTACAATCAAATCCTAACTTATGCAAAACAGAAACCGGAATAATGCCTAACGGTGTGAAAAACGTAACACTTTCGATTAACAGCACTGACGGAACTAATAAGTATGTTGATTTCGCTCAATATATAGAAGTAGAACCGAATACAGAATATACTTTCTCGTGTAAAGCTGGTGGTACTTTCCAAACATTCTTATGGGAAAAGAAAGCTGATAAAACACCAACTAACGTTTATAAAGACAATGCTAAATCTCATGGTGGTGCTTCATGGGACATGTCATCACCACGCGATACATTCACAAGAACAATCAAAACTCAACCTGACACTAAGTATATTCATTTTATCTTCAGGGTTCAAAGTAACACAACAACTTATGTTAGTGGTCGTTTGGCGCTTCCGCAATTAGAAAAAGGAACTACAGCTAGTGAATGGAAACCTAATCCGTTTGACACTTCTAATGGTGAAATTTTTATTCAAGGTTCTGCTACTGATATAACTGATGGAAACAGAAAGTTAACAGTTAATGGAAATGTTGTTTATGATAGTAATGCAGGTCGTGGTTTAAGGCTTGTCACGTTAAAGAAAGATACGTTAGCTGTTGTGGATGATATCACATATGATGTATATGGTTCTGATGTTCCGAAAAATGATTTAGCAACAAAGATTAACTCATTAGGGAATGATGTATTCATAACTTTAACTTCTTACGATGCAGTTAATTTTAATACAAACTTATTAACAGCTCTTGTTTCGATTGGAGCTTCAGGGACTATCCTACAAGGACGTTTACCTTATGCATTTATCGGTATGAAAGGTTTAGGTCGTTACAACGGATTAGAACAATGGACAGGCCTTGGTAACATGTTCCCTCCTGCTACTATAAGTTGTAAAGTTGTTAACGGGATGATCCAAGGAATCAATAATAACAATGGGCAATCTGATGCTAACGTTCGTAAAGATTTACGTCTTAATGCTCCCTTACCGACAAGTATCCTCATGGATTCGAACGGTATAACAGCAAGTGGTACTGATGCAAGTAAGTACGCACGTTTAGATTATCGTGGTCTTTATATCGCTGGTGGAGCTATTCAAATTGATGGTGGTCTTTCTGAAGGACAACTTGCTCAAGGTGTTACGAGAAAAATGTCGTATCTAGATAGTAATGGTTTATACACTGGACAGGTAAACATTGGTGGTTCTGGTCAAAATGGTATATTATCCATTAAAAATGCTTCCAATAGTGAGATTGTCCGTGGTGATACAAATGGATTAACCGTCAATAACGGCGCTATAACAATTAAACGTCCTGATGGAGCTAACTTGATTATAAATGGTATGGCTGCTTATAACTTCGCTGTAACAACTCATAATCCACCTTTCCGTGGTGACAACATCGATACAAGATCATGGTATTACCACACAACGAAAGGGATTCCGTTCAGTCGTGACTTACAAGTTTGTGATTATGTAGCAACTCAACATACAGGAAGATATATGAAAATGGATGTTGATTTTTATACTTCACCTGGCAATTCAGGAGCTTTAGTAGTCATACAGGCTGGTAAATACAATTCAGGCGGTCAGGAAGTTATTGTTTCTCAAGTAGAGATAACTAATACAACTCCACAACCATCTTATACAATTAGTATAGATTGTGGAGTTCCGAATTATCAAAGAATTGGTTTCTATTTCTGTTTAGCTTCTTGGAGTGCTGGTGATGTATACGCACGTTTAGTTAGAGCTTGGATGGAAGGTTAA
Tertiary structure
PDB ID
8660ce3caed00f11d8052b343fb7a058c5cc11d2b7534683452a0189bc7fdaa6
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50
Literature
| Title | Authors | Date | PMID | Source |
|---|---|---|---|---|
| Characterization of novel siphovirus infecting Emetic Bacillus cereus | Hu,X., Wan,X., Geng,P. and Yuan,Z. | 2017-09-08 | — | GenBank |