Protein

View in Explore
Genbank accession
XLY82435.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MAKKVTLPKGQTGATGTTLGQAGNILDLSDVDDIFGDTPKAKKGSPVTEFFNGIKQGLFDSVKPQQALKAFMRSAAPDGFSRMFGVYEDTMSTIRDVKDSVERTSASDLLFLTREAQDLAVKLKDKVPASVFDRLNNRLESQIENYKYAEDSNRNYKEIRRRMEAERDEDELKSAIDQVTLVQRDLAIKAEQGEVKRFAIGQAERGIRDKVSADRFDWMAKAMGQTVDNLSKLASYNEQVNYSIQKKGLEIQFRSMLHLRKIAQQTEATMELLNNGFAALVRNTGIPDHKKSSMKDLVGFNAAQRVSSSFVDNAIQTLPNFLGNFGSAVTNNATRFANENIRNFADAVRAGNMFGADAWENRYNIAGQFAGSYLGDWTRNSVIPVLGRMARPGIERFSNNYLGGRHNQASYLLDNFPAWTQEYMNNYQNTYGARGILRDIMAPFIPQFTLQDRLKTGSYQTIGQDSGFNQLTQRTIVEAIPGYLSRLLQETRMIRTGRDDITREVFDLSTGSFMSVEDSAANTERRLVSRSTVRGVSGALTDVLEAFDPNKELSIDARKALTERLIRDANMNKRFDPEAYARAGGYDRSKVSGETIKELTEYIKRQYNIGADGRMASTNENFARRQEISTLFLDVRNFSRDPIKEIERLTNAGKTDQLREMGIIITEQGIDRINYPRIWELMSSEVKYEGWGNDNPFDRYSDTPPSDNGGPEQLSPLGDQNNPHFIGPMYQSQTERKMRQAQEQVIRASKLAQEQANKGYDYAQQKVSLATDYVRDNVPNQFSELRRNVNIPASMNFGDLRDQLYGQAGDMYSRAVNYSNQLNGYSDIINQSIADLYTKANTFTPVIKGMDFLNGNLIDINTGKIVEKISDITGEIKNQAGITVVTAQEVATGLYNQRGDLLTKATDIASQLRDKAAQIAGDARERLTQGLDNVSDMAKDWYIPGREEAVILGRDLLAGEYIDTATNQIITNLKDAKGTIINRAGDVVVTAQELAKGLIRSDGFNLRRNIADTSNWIQRNVLGGGSTTQKIFNAMGTVANKAKDFTIGLGKDILSNRDAYLPGMLKPVLQKVKLKAGEYYTTAGNLLKSFDEINGPVLDRDGNIVVDEEQISELINSDGSKHTAAKSKGLFRTGLGNLARGYANMSMRYWKWLGKKSVDTAKGMAGLGYKLLGSPFKKRFSAFTGKVETQIDKKALDTTTDQLLAGIWEELRNQKPDANKPRRGSWQDLTSRVSDTLNGKNNGDEETTESKGLFGKLGDTLKNIFGKKKGDEEDEGLLEDLGLGGKKGGKWAAARQILGRGALAIGGGALSTAAAYASFGGTGASTNDKLAGAAIVTSNPIMWALKDFLIKPVLGWRGSQKFKDDLISYRMMQYGATTTDQMNKVTELEQLVSSVATRGGDASFDVRALNARDIIKIFGYSTDDGPAIMRLANWIDFRFKPIFEAWLKGLSKINRSDVDISEVDSKVPNELKGQLIRSVSFPYEGNTPYLVLNNPFGEEDLSIDVASIQMKEKELLDKYSSTEKTPAAPKATSSSFKESATDVINDTITTIKSKSTDITNWFRDSTIGKAIKAVSPVESIRKMVTTVVDTIIPKANASDSLTSLQALRVHAYGMQGLDLAAVNGLLSIESLVNDKMRVANGKATYTGDIEELIKWTGQAFGMVTTSDGPDRVKVVDWLYRRFLPAFKAFIVTARSVSTSITLSQIETLTATQRLQIANAIMGATDDEGVSIWKAPSIFNIVGDMDSVEDLAKISLDEIKKEAETEVAEAPGKSKSAQIAGKNDAASGRSFASRIIDNVKSTFNSATTKVTNWMENTSARVSQVIGRAQEGITDTYYTAKYKLGAGGELTPTGQTYGQLATGNGGVWENIPMPQSNKSRDAAQATFKAVSEMTGVPVELLNIFCGIESSFNYNAKAPTSSAAGWFQFIKSTWKGMLAKYGAKFGIPADDENGSLRFDPRINALMGAMFLRDNYEYLENALGRAPTDVDLYLAHFMGPAGARKFLTRDQNSIGAEIFPDQARANRSIFFKTDGSARTLGEIYQVMENKVAKFRTGGGKNANSQSLGKPKSTEELMNDAAAAKQKDMATDKELIGGAADTSITDSSNNKIGLGKIMSGMASPLRTNAPSMMLPGAPSSAADVSSGQQPVVDTGVATQATVRASQIEEQRKVVTSQDKAMLDIASEQLSVLKQFHADMLNYIKNKAANPSAQTGQEQANTIAPSQRPGRVVDNRPLPIRLR
Physico‐chemical
properties
protein length:2237 AA
molecular weight: 245722,98460 Da
isoelectric point:8,63324
aromaticity:0,07555
hydropathy:-0,46133

Domains

Domains [InterPro]
Coil
149–173
Coil Coil G3DSA:1.10.530.10
IPR023346
1883–2015
IPR023346
IPR008258
1885–1978
IPR008258
XLY82435.1
1 2237
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Pseudomonas phage vB_PaerM_AttikonH10
[NCBI] 		3455448 Viruses >
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XLY82435.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PQ741806.1 [NCBI]
CDS location
range 100107 -> 106820
strand -
CDS
ATGGCCAAGAAGGTAACATTGCCCAAAGGTCAAACTGGTGCAACCGGTACAACATTAGGGCAGGCTGGTAATATTCTTGACTTAAGTGATGTCGATGATATTTTTGGCGATACGCCAAAAGCTAAAAAGGGATCACCTGTCACTGAATTTTTTAATGGTATTAAACAAGGACTCTTTGACTCTGTTAAACCACAACAAGCTTTAAAAGCATTCATGCGGTCTGCGGCACCAGATGGCTTTTCACGTATGTTCGGTGTATATGAAGATACGATGTCAACTATCCGGGATGTCAAAGATTCTGTAGAACGTACGAGTGCTAGTGATTTACTCTTTTTAACAAGAGAAGCACAAGATTTAGCAGTTAAGTTAAAAGATAAAGTTCCAGCTTCTGTTTTTGACAGACTTAATAATCGATTAGAAAGTCAAATCGAAAACTATAAGTACGCTGAAGATTCAAATAGAAATTATAAAGAAATCCGTCGTCGCATGGAAGCTGAACGTGACGAGGATGAACTTAAATCTGCTATAGATCAAGTAACTCTTGTTCAACGGGATTTAGCTATAAAAGCTGAACAAGGCGAAGTTAAACGATTCGCTATTGGACAAGCTGAACGTGGAATACGTGATAAAGTATCGGCTGATAGATTTGACTGGATGGCTAAGGCTATGGGTCAAACAGTTGATAATTTATCTAAATTAGCTAGTTATAATGAACAAGTTAATTACAGTATTCAAAAGAAAGGATTAGAAATCCAATTTCGTTCTATGTTACATCTTCGGAAAATTGCACAGCAAACCGAAGCTACCATGGAATTATTAAATAATGGTTTTGCAGCACTTGTTAGAAACACAGGGATCCCCGATCATAAAAAGTCATCAATGAAGGATCTTGTTGGCTTTAATGCGGCTCAACGGGTATCGAGTAGTTTTGTTGACAACGCCATTCAAACATTACCAAATTTCTTAGGTAATTTTGGATCAGCCGTAACTAATAATGCTACTCGCTTTGCAAATGAAAATATCCGTAACTTTGCCGATGCTGTTCGCGCTGGAAACATGTTTGGTGCAGATGCATGGGAGAATAGATACAATATAGCCGGTCAATTCGCTGGCTCTTATCTTGGTGATTGGACAAGGAATTCAGTTATACCTGTATTAGGTAGGATGGCACGGCCAGGCATAGAACGATTCTCTAATAATTATCTAGGGGGTCGACATAATCAAGCATCTTATTTACTTGATAACTTCCCTGCCTGGACACAAGAATACATGAATAATTACCAAAACACTTATGGTGCTCGTGGTATTCTTCGTGACATTATGGCTCCATTTATTCCCCAGTTCACATTACAAGATCGATTAAAGACTGGCTCCTATCAAACAATTGGTCAGGACAGTGGCTTTAATCAACTAACACAACGTACTATAGTCGAAGCTATTCCTGGATATCTATCTAGGTTACTACAAGAAACAAGAATGATCCGGACTGGTCGTGATGATATTACACGTGAAGTGTTTGATCTCTCAACTGGTTCATTCATGTCTGTAGAGGATTCAGCTGCAAACACAGAACGTCGTCTAGTTAGTCGTTCTACTGTACGTGGTGTAAGTGGTGCTCTTACCGATGTTCTTGAAGCATTTGACCCAAATAAAGAACTATCAATAGATGCTAGGAAAGCACTAACTGAACGTTTAATTCGTGATGCCAATATGAATAAACGTTTTGATCCCGAAGCATATGCTCGTGCTGGTGGGTATGATCGTTCTAAAGTGTCCGGTGAGACGATTAAAGAATTAACGGAATATATTAAACGGCAATACAATATTGGTGCTGATGGTAGGATGGCAAGCACTAATGAAAACTTTGCTAGGCGTCAAGAAATATCTACATTATTCTTAGACGTTAGAAACTTCTCACGTGACCCTATTAAAGAAATTGAGCGTTTAACCAATGCTGGTAAAACTGATCAATTACGTGAAATGGGTATTATCATAACTGAGCAAGGTATTGATCGTATTAATTACCCACGTATTTGGGAACTGATGAGTTCAGAAGTAAAATACGAAGGATGGGGTAATGATAATCCATTTGATCGTTATAGTGATACACCACCTTCTGATAATGGTGGTCCAGAGCAACTCTCCCCACTAGGTGATCAGAATAACCCGCACTTTATTGGCCCAATGTATCAGTCACAAACTGAACGAAAAATGCGTCAAGCTCAAGAGCAAGTTATTCGTGCCTCTAAACTGGCTCAAGAGCAAGCTAATAAAGGTTATGATTACGCGCAACAAAAAGTATCGCTAGCTACGGATTATGTAAGGGATAATGTACCTAATCAATTTAGCGAATTACGCAGGAATGTAAACATACCGGCGTCAATGAACTTTGGTGATTTAAGAGATCAACTATACGGCCAAGCCGGCGATATGTATAGTCGTGCTGTTAACTATAGTAATCAGCTCAATGGATATTCTGATATAATCAATCAATCAATAGCTGATCTATATACCAAAGCTAATACTTTTACTCCAGTTATCAAAGGAATGGATTTTTTAAATGGAAATTTAATTGATATTAATACTGGTAAGATAGTAGAGAAAATATCTGATATTACTGGTGAAATTAAAAACCAAGCTGGCATAACTGTAGTAACCGCTCAAGAAGTAGCTACTGGTCTCTATAATCAACGTGGTGACTTATTAACCAAGGCAACTGATATTGCTAGTCAATTACGTGATAAAGCAGCGCAGATTGCTGGCGATGCTAGAGAACGGTTAACTCAAGGTTTAGATAATGTTTCTGATATGGCTAAAGATTGGTATATACCTGGCCGTGAAGAAGCTGTTATTCTTGGACGTGATCTACTAGCCGGTGAGTATATCGATACAGCAACTAATCAAATTATAACTAATTTGAAAGATGCCAAAGGCACTATTATTAATAGGGCTGGTGATGTTGTCGTAACTGCTCAAGAACTGGCTAAAGGTTTAATACGGTCAGATGGTTTCAATCTACGAAGGAATATAGCAGATACATCTAACTGGATACAACGAAATGTACTAGGTGGTGGATCAACTACTCAGAAAATCTTTAATGCAATGGGTACAGTCGCTAATAAAGCAAAAGACTTTACTATTGGATTAGGTAAGGATATTCTAAGTAATCGAGATGCATATTTACCTGGTATGCTAAAACCAGTATTACAGAAAGTTAAACTAAAAGCAGGCGAGTATTATACAACAGCTGGTAACCTATTAAAATCATTCGATGAAATTAATGGACCAGTTTTAGATAGGGATGGTAACATTGTTGTTGATGAAGAACAAATCTCTGAGCTTATCAACTCTGATGGATCTAAACACACTGCTGCTAAGAGTAAGGGTTTATTCCGAACTGGCTTAGGTAATCTAGCCCGTGGTTATGCCAATATGTCAATGCGTTATTGGAAGTGGTTAGGTAAGAAATCTGTAGACACTGCTAAAGGAATGGCGGGTTTAGGATATAAATTGCTTGGATCACCTTTCAAGAAACGTTTTAGTGCATTCACTGGTAAAGTAGAAACACAGATAGATAAGAAAGCTCTAGATACAACCACTGATCAATTATTAGCAGGTATATGGGAAGAACTACGTAATCAGAAACCAGATGCTAATAAACCTCGTCGTGGTTCCTGGCAAGATCTAACATCACGTGTTAGCGATACTTTAAATGGTAAAAATAACGGTGATGAAGAAACCACTGAATCAAAAGGTCTTTTTGGTAAACTTGGTGATACCCTAAAGAATATCTTTGGTAAGAAGAAAGGCGATGAGGAAGATGAAGGATTATTGGAAGACCTAGGTCTTGGTGGTAAGAAAGGTGGGAAATGGGCTGCTGCCCGCCAAATACTTGGTAGAGGTGCTTTAGCTATTGGCGGTGGAGCATTATCGACAGCTGCTGCATATGCTAGTTTTGGTGGTACTGGTGCATCAACAAATGATAAATTAGCTGGTGCAGCTATTGTAACTAGTAATCCGATTATGTGGGCACTTAAAGATTTCTTAATAAAACCTGTATTAGGTTGGAGAGGAAGTCAGAAATTCAAAGATGACTTAATCAGTTATCGAATGATGCAGTATGGTGCCACAACAACTGATCAGATGAACAAGGTTACTGAATTAGAACAACTTGTATCTAGTGTAGCTACACGTGGTGGAGATGCGTCCTTTGATGTAAGGGCTCTTAATGCACGTGACATTATTAAGATATTTGGATATAGTACTGATGATGGCCCAGCTATCATGCGTTTAGCCAATTGGATCGACTTCAGGTTTAAACCGATCTTTGAGGCGTGGCTTAAAGGACTATCCAAAATTAATCGTAGTGATGTAGACATCAGTGAGGTTGATAGTAAAGTACCTAATGAACTAAAAGGACAGCTCATTAGATCAGTATCATTCCCATACGAAGGTAATACACCTTATCTAGTCCTTAATAACCCATTTGGTGAAGAGGACTTATCAATTGATGTTGCTTCTATACAGATGAAAGAAAAGGAATTATTGGATAAGTATAGTTCCACAGAGAAAACACCTGCCGCACCTAAAGCAACTTCCAGTAGTTTTAAGGAAAGTGCTACCGATGTAATAAATGATACCATTACTACGATTAAGTCTAAGTCAACTGATATTACTAATTGGTTTAGGGATTCAACTATTGGAAAAGCAATTAAAGCGGTTAGTCCAGTTGAATCTATACGTAAAATGGTAACTACAGTAGTAGACACAATTATTCCTAAAGCAAATGCAAGTGATTCATTAACTTCATTGCAAGCACTACGTGTACATGCTTATGGGATGCAAGGTTTAGACTTAGCTGCTGTAAATGGATTACTATCGATTGAAAGTCTTGTTAATGATAAAATGCGAGTAGCTAATGGTAAAGCTACTTATACAGGTGATATAGAGGAATTAATTAAGTGGACTGGCCAAGCATTTGGTATGGTTACGACTAGCGATGGTCCTGACCGTGTTAAAGTGGTTGATTGGTTATATCGTCGATTCCTACCTGCATTTAAAGCATTTATTGTTACTGCTCGATCAGTATCTACATCGATAACGCTTAGCCAAATAGAAACATTAACAGCAACTCAGCGCCTCCAGATTGCTAATGCGATAATGGGTGCTACTGATGATGAAGGTGTTTCAATATGGAAAGCACCATCAATATTTAATATTGTTGGCGATATGGATTCGGTAGAAGATCTAGCTAAAATAAGTCTTGATGAGATAAAGAAAGAAGCTGAAACTGAGGTAGCTGAAGCTCCAGGTAAATCTAAATCTGCACAGATAGCAGGTAAGAATGATGCAGCTTCAGGACGTAGTTTTGCTAGTCGGATTATTGATAATGTTAAATCAACATTCAATAGTGCCACGACCAAAGTAACTAACTGGATGGAAAATACATCAGCACGAGTTAGTCAAGTTATTGGTAGAGCCCAAGAAGGGATAACTGATACTTACTATACGGCTAAGTATAAGTTAGGGGCAGGTGGTGAATTAACACCAACTGGTCAGACTTATGGTCAATTAGCAACTGGGAATGGTGGTGTATGGGAGAATATCCCAATGCCGCAATCTAATAAGTCTAGAGATGCAGCTCAAGCTACATTTAAAGCTGTATCAGAAATGACTGGCGTACCAGTGGAACTATTAAATATTTTCTGTGGCATTGAATCATCATTCAACTATAATGCCAAGGCACCAACCTCATCAGCAGCAGGCTGGTTCCAATTTATTAAGAGTACCTGGAAAGGGATGCTTGCTAAATATGGAGCTAAGTTTGGTATACCTGCTGATGATGAAAATGGTTCACTACGGTTTGACCCACGTATAAATGCTCTCATGGGCGCGATGTTCCTTCGTGACAATTATGAGTATTTAGAAAATGCATTAGGTAGGGCACCCACTGATGTGGATCTTTATCTAGCGCACTTCATGGGTCCAGCTGGTGCACGTAAGTTCCTTACACGTGATCAGAACTCCATTGGTGCTGAGATATTCCCTGACCAAGCTAGGGCTAATAGATCTATCTTCTTTAAAACGGACGGTAGCGCTAGAACCTTAGGTGAAATCTATCAGGTCATGGAGAATAAGGTTGCTAAGTTTAGAACTGGTGGCGGTAAGAATGCCAATAGTCAATCACTTGGTAAACCAAAATCAACAGAAGAGTTGATGAATGATGCAGCAGCTGCTAAACAAAAAGATATGGCTACTGATAAGGAGCTTATCGGCGGTGCTGCGGATACATCAATAACAGATAGTTCTAATAATAAAATTGGACTTGGGAAGATAATGTCTGGTATGGCGTCACCATTAAGGACGAATGCTCCGTCAATGATGTTACCTGGCGCACCTTCATCTGCGGCCGATGTGTCTTCTGGCCAACAACCAGTTGTAGATACAGGTGTGGCAACACAGGCTACAGTACGCGCCTCTCAAATAGAGGAACAGCGTAAAGTAGTTACCAGTCAAGATAAAGCCATGTTAGATATAGCAAGCGAACAATTAAGTGTACTGAAGCAATTCCATGCCGATATGCTTAATTACATCAAAAACAAAGCGGCTAATCCATCTGCACAAACTGGACAAGAGCAAGCTAATACTATAGCTCCCTCTCAACGTCCTGGTCGGGTAGTGGATAACCGTCCATTGCCAATTAGACTACGTTAA

Tertiary structure

PDB ID
297cc93b2ba4229d17565314f8bba218c3eb761b7a446b9bd222da00bb3dc937
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,4990
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Isolation and complete characterization of a jumbo bacteriophage against Pseudomonas aeruginosa clinical isolates Paranos,P., Skliros,D., Zrelovs,N., Paranos,P., Kazaks,A., Flemetakis,E., Pournaras,S. and Meletiadis,J. 2025-08-11 — GenBank