Protein
View in Explore- Genbank accession
- AXH71385.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber
- RBP type
-
TFTFTF
- Protein sequence
-
MANSFLEYTGNGNTTAFSITFDYLDASHIACTVNGVSTSFTLSNGGATANISPAPANAAAIRFTRTTSQSTRLTDYVAGSVLKEEDLDTDSKQAFFMAQEGIETISSKMGQSTTNFQFDALNKRIINVADPVDNTDAVNKQFISTNLPNITTVAGISSDVTTVAGISSDVTAVANNEADIDLVALNMPSVTTVATNINDVITVANDLNEAISEIETAANDLNEATSEIDTVSNNIANVNIVGTNIGNVNTIATANTDIQTLADLEDGTVTTNGLSTLAGLNTEIQGVYNIRNNVTNVDTNATNVNLVAGQISPTNNVSAVSAVATEIGTLGALGTEITNLNNIRTDITGVNTISADVTGVNNIAPAVTAVNNNSANINAVNANSVNINAVKNNEANINAVNANSANINTVAGLNTEITALGASGTVASINTVANNLASVNSFANTYLGASATAPTQDPDGSALDLGDLYFDTASDTMKVYSSGGWINAGSAVNGTANRFKYTATASQTTFSGADDSGNTLAYDSGYADIYLNGVKLVNGSDFTATSGTSIVLASGASANDILEVIAYGTFTLSNFSITNANDVPALGSAGQVLQVNSGATALEFGTVDLANLNADNLTSGTVPSARVSGAYTGITQTGTLTKSGATVTTFNRTTSDGNILELQKDTSLSGSVGSVGGNGAFYISGANNVGLQFNNVNDEIRPCNSDGSARDNAIDLGNATRRFKDLYLGGGLYVGGTGTANKLDDYEEGTWTPNVNSTSGFTNTNV
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 766 AA molecular weight: 78387,26030 Da isoelectric point: 4,05003 aromaticity: 0,05483 hydropathy: -0,05770
Domains
Domains [InterPro]
DC_1263
ATT
1–287
ATT
1–287
IPR005604
ATT
3–110
ATT
3–110
1
766
Architecture
ATT 1-287 | STR 335-766
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Pelagibacter phage HTVC119P [NCBI] |
2283020 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host |
Candidatus Pelagibacter sp. HTCC7211 [NCBI] |
439493 | Pseudomonadota > Alphaproteobacteria > Candidatus Pelagibacterales > Candidatus Pelagibacteraceae > Candidatus Pelagibacter > |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AXH71385.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
MH598806.1
[NCBI]
CDS location
range 27982 -> 30282
strand +
strand +
CDS
ATGGCTAATTCATTTTTAGAGTATACAGGTAATGGCAACACAACTGCCTTTTCGATCACATTTGATTACTTAGACGCATCACATATTGCGTGTACAGTTAATGGTGTGTCTACATCATTTACTCTTAGTAATGGTGGAGCTACAGCTAATATAAGTCCAGCACCTGCAAATGCAGCAGCAATTAGATTTACAAGAACTACATCACAATCAACAAGATTAACAGATTATGTAGCAGGTTCAGTATTAAAAGAAGAAGACTTAGATACAGACAGTAAACAAGCTTTCTTTATGGCTCAAGAAGGTATTGAAACTATTAGTTCTAAAATGGGTCAAAGTACAACTAACTTTCAATTTGATGCTTTAAATAAAAGAATTATAAATGTTGCAGACCCAGTAGATAATACTGATGCTGTTAACAAACAGTTTATTTCTACAAATTTACCAAACATAACTACAGTTGCAGGTATTAGTTCAGATGTCACAACAGTAGCAGGAATAAGTTCTGATGTTACAGCAGTAGCAAACAACGAAGCTGACATTGACTTAGTAGCTCTTAATATGCCTTCAGTTACTACTGTAGCAACCAATATTAATGATGTAATAACAGTAGCTAACGATTTAAACGAAGCTATCTCAGAAATAGAAACTGCGGCTAACGATTTAAACGAAGCTACTTCAGAAATAGATACTGTTTCAAACAACATAGCCAATGTTAATATTGTTGGTACAAACATAGGTAATGTTAATACAATCGCAACAGCAAATACAGATATTCAAACTTTAGCTGACCTAGAAGACGGTACAGTTACTACAAACGGTCTTAGCACTTTAGCAGGTCTAAATACAGAAATTCAAGGTGTCTATAATATTAGAAACAATGTTACTAATGTTGATACCAATGCTACCAATGTAAATTTAGTTGCAGGACAAATTTCACCTACTAATAATGTTTCAGCAGTAAGTGCTGTTGCAACAGAAATTGGAACATTAGGTGCATTAGGAACAGAAATTACAAACCTAAATAATATTAGAACAGATATTACTGGAGTAAATACAATTTCAGCAGATGTAACTGGTGTAAATAATATTGCACCTGCTGTTACTGCTGTAAATAACAATTCAGCTAACATTAATGCAGTTAATGCTAATAGTGTAAATATTAATGCTGTTAAAAATAATGAAGCAAACATAAATGCAGTTAATGCAAATTCAGCTAACATCAATACTGTTGCAGGATTAAATACAGAGATTACAGCTTTAGGTGCGTCAGGCACAGTAGCTTCTATTAATACAGTTGCTAACAATTTAGCTTCAGTAAACAGTTTCGCAAATACATATTTAGGTGCTAGTGCAACTGCACCAACACAAGACCCAGATGGTTCGGCTTTAGATTTAGGGGATTTATATTTCGATACAGCGTCAGATACCATGAAGGTCTACTCAAGTGGTGGTTGGATAAACGCAGGTTCAGCAGTTAATGGAACTGCAAACAGATTTAAGTACACAGCAACAGCATCACAAACTACATTTTCTGGTGCAGACGATAGTGGAAATACTTTAGCCTACGATAGTGGGTATGCAGATATTTATTTGAATGGAGTTAAACTTGTAAATGGTTCTGACTTTACAGCTACTTCTGGTACTTCAATAGTATTAGCTAGTGGTGCTTCAGCTAACGATATTTTAGAGGTGATTGCCTATGGTACATTCACTTTATCTAACTTCAGTATTACTAATGCTAATGATGTTCCTGCATTGGGTTCAGCAGGACAAGTATTACAAGTTAATTCTGGTGCAACAGCTTTAGAGTTTGGAACAGTAGATTTAGCTAATCTTAATGCAGATAATTTGACAAGTGGTACAGTACCATCAGCTAGAGTATCTGGTGCGTACACAGGAATTACACAGACAGGAACTTTAACAAAATCTGGTGCTACTGTTACCACATTTAATAGAACTACAAGTGATGGTAATATTTTAGAATTACAAAAAGATACTTCACTTTCTGGTAGTGTTGGTAGTGTTGGTGGTAATGGTGCATTTTATATTTCAGGTGCAAATAATGTTGGATTACAATTTAATAACGTTAATGACGAAATAAGACCTTGCAATTCAGATGGTTCAGCAAGAGATAATGCTATTGATTTAGGAAATGCTACTAGGCGTTTTAAAGATTTATACTTAGGTGGTGGTCTATATGTTGGTGGCACAGGCACAGCAAACAAATTAGACGATTACGAAGAAGGAACTTGGACACCAAATGTTAATTCAACAAGTGGATTTACTAATACAAATGTATAA
Genome Context
Genome Context
Tertiary structure
PDB ID
1e9e5812b618795b178891936fe6b12233f2e4bb9fe812e596315d0fd10a6bf3
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50