Protein
View in Explore- Genbank accession
- XTJ58298.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber protein
- RBP type
-
TSPTSPTFTF
- Protein sequence
-
MADQNLKQIQFKRTSTENKAPGADIVARGEIALNTHGRTLAIYTKDEADNVVQLAGKGVPFLDTAGNLNVDGTTTLKDNVTISPNKAINFEASDLSGALVRHITGKCANNDGWYIGAGGASDQGFLEIGTYDNGNEPIYFVQRTGGSAQAEVRRLALLDGFGDTSIPGDLRLTNKTVKISNGSTLTLEMGVGANDAYIKNLRGTGVLQLTNDSNLTFRNSQVYYAMNGRGPGKSGTLLTNVENNRQAWQYTISAATAGTPRWVKVATIKHPGDASSQLDLMITGGIDSGHGRHYVDFITLSGRNLTSWSTNNLDNWVEWRRVGSPDKGKIPEYYVVKNDAATDSEASFDFYAKVPRYGNGLYVTVLNTAGYNGQDSGKVIIYETNQDTGGYGPAGSILVSMKQIFDSYAKPDFGDTTGTLPVNRGGTGATSAGAARNNLGLGTAAVRDVGESNGNVMEVGAYGLGGNGGKSIENITSNADMLTRLKAYGGTFWRGVTKSGVSVQNGLYSHGSGIFMNAGDTMSAINIDYASAKVRVYAANDRSLAEGNVRYNELYGTANKPSKADVGLGNLTNDTQVKKAGDTMTGDLAAPNLHASGTGTASVYVNAGSGNAHVWFRTNANERGVIWATPNTADLGQINIRAKTTGGVSAGDFSFRSDGRFDVPVAVKVGGAAMLTKDGNITSGSMFGGNLNNYLTSIKNDITAGDNKQVSKTGDTMTGNLTINANLKVENPNGTMADFGSENSDKYSRITLARKVGSGAAVAMLKVTPEGHVQFGYQTAVSTPAPSKYILVKSSGLEVEGDLVFNQTYSGAEEAVDISDKTIDLNSLIIRRSDLGTRQLYKCVSSGGGSKITNKPTSDGNFVLEVLSLRKVSDTDWSCKQTFTTKNGGVEGTYIRYGQNGSWSAWKEVVSGVQPINLGGTGATSAASARNNLGVGEGQTVKFGNLVTTDLTANGNARLVGRLNLGSTSATGVLRANESGAVVLGSSSGQNIHIRAGSPDTSSGETRFEPNGNVLVGGVLTSSGSLQVNGEAAMSRSLIVSQNIKNTNDNSFILMGKDSDLGFVKKSNSGAKLVFASGKSFVVAKSSATAIANPASETYTDVFKVDADGNQTVYGNSAVSRALTVSSTATINGVINANGGIIVPTTKYVQIADAPTQNNQAANKKYVDDKVASAISNAGDTYLPLAGGTVTGNLDVTGTRLKTWQLEVDGKSTLRGGLDVSSSLKVSSGNLVAADTTNAGGLFAKNGNVYCDAGSAGTNSNYWFRDSAGNVRGVIWSNGQNGDMIIRNQSGRELVFRNDGYLQLAHLAPGNTDNANTVNGIRLQRGDTIFDSFNAWQSGEYVRAGWHFYNAAGVDQWLALTDTGVKIWGSAANLRVEGVGNFWDVEIRSDRRVKSNIAKIDNALDKVSKLSGNVYDLQLPNGDTKPSAGLIAQEVQEVLPEAVTTDNDKDALLRLNYNAVIALLVESVKELKAEIEELKSK
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1481 AA molecular weight: 155977,14510 Da isoelectric point: 6,90335 aromaticity: 0,07022 hydropathy: -0,31884
Domains
Domains [InterPro]
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Klebsiella phage 15882-6-3 [NCBI] |
3373945 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XTJ58298.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
PQ537379.1
[NCBI]
CDS location
range 57472 -> 61917
strand +
strand +
CDS
ATGGCCGATCAAAACTTAAAACAAATACAATTTAAAAGAACTAGCACAGAGAATAAAGCACCAGGTGCAGATATCGTAGCCCGTGGCGAAATCGCGTTGAATACCCATGGGCGTACTCTCGCTATCTACACCAAAGATGAAGCCGATAACGTTGTTCAGCTTGCAGGTAAAGGTGTTCCTTTCTTAGATACTGCAGGTAATCTTAATGTTGATGGAACTACTACGTTAAAAGACAATGTAACCATTTCTCCGAATAAAGCGATCAATTTTGAAGCTTCTGATTTAAGTGGAGCATTAGTACGTCATATCACCGGTAAGTGTGCTAATAACGATGGCTGGTACATTGGAGCTGGTGGCGCATCTGACCAGGGATTTCTTGAAATCGGTACGTATGATAACGGAAATGAACCTATCTATTTTGTTCAAAGAACTGGTGGATCGGCGCAAGCTGAAGTTCGTCGTTTAGCATTATTAGATGGGTTTGGCGATACCTCTATACCTGGGGACCTTCGTTTAACTAATAAAACGGTAAAAATTTCAAACGGAAGCACTCTTACTTTGGAAATGGGTGTAGGCGCTAATGACGCGTACATTAAAAACCTGAGAGGAACCGGTGTTCTTCAATTAACTAATGACAGCAATTTAACGTTCAGAAATTCCCAGGTTTATTATGCCATGAACGGAAGAGGTCCTGGTAAATCCGGTACTCTTCTGACGAATGTAGAAAACAATCGTCAAGCCTGGCAATATACTATTTCTGCTGCAACTGCTGGAACTCCACGTTGGGTTAAAGTAGCTACAATTAAACACCCAGGAGATGCGTCTTCACAGTTAGATTTAATGATTACTGGTGGCATTGATTCTGGGCACGGAAGACATTATGTTGATTTTATCACGTTATCAGGACGAAATTTAACATCTTGGAGCACTAACAATTTAGATAACTGGGTTGAATGGCGTCGAGTTGGTTCTCCTGATAAAGGAAAGATTCCAGAGTATTACGTTGTTAAAAATGATGCTGCTACAGATTCAGAGGCTTCATTTGATTTTTACGCTAAAGTTCCTCGATACGGCAATGGGCTTTATGTTACAGTGCTAAACACTGCTGGATACAACGGCCAAGATAGCGGTAAAGTAATTATCTATGAAACCAACCAAGACACTGGTGGATATGGACCAGCTGGAAGTATTCTTGTTTCAATGAAACAGATTTTTGACAGTTACGCAAAACCAGATTTCGGCGATACTACGGGTACTCTTCCAGTTAACCGTGGTGGTACAGGTGCTACTAGCGCAGGAGCAGCTCGTAATAACTTAGGTCTTGGTACTGCTGCTGTTCGCGACGTTGGTGAATCTAACGGAAACGTGATGGAAGTTGGTGCTTATGGCTTAGGCGGTAATGGCGGTAAATCAATCGAAAACATTACCTCTAATGCTGATATGTTGACCCGTTTAAAAGCATATGGTGGTACTTTCTGGCGTGGTGTTACTAAATCTGGTGTTAGTGTTCAAAATGGTCTTTATAGCCATGGCTCCGGTATTTTTATGAATGCTGGCGATACCATGTCAGCTATTAATATCGACTACGCCAGCGCTAAAGTTCGCGTATACGCAGCTAACGACAGAAGTCTTGCTGAGGGAAATGTTAGATACAACGAACTTTATGGTACAGCAAATAAGCCATCTAAGGCTGATGTCGGACTTGGTAATCTGACAAACGATACCCAAGTTAAGAAAGCTGGCGACACCATGACCGGTGATTTAGCTGCACCTAATTTACATGCTTCCGGCACCGGTACTGCATCAGTGTATGTTAATGCAGGAAGCGGAAATGCTCATGTATGGTTTAGAACAAACGCCAATGAACGCGGTGTAATTTGGGCAACTCCAAATACAGCGGATTTAGGACAAATTAATATTCGCGCAAAAACTACTGGAGGTGTTTCTGCTGGTGATTTTAGCTTCCGTTCTGACGGTCGATTTGATGTTCCTGTAGCAGTTAAAGTCGGTGGAGCAGCAATGCTGACTAAAGACGGGAATATTACCTCTGGTTCGATGTTTGGTGGTAACCTTAACAACTATTTGACTTCCATTAAAAACGACATCACTGCTGGCGATAATAAGCAAGTAAGTAAAACTGGCGACACAATGACCGGTAACTTGACTATTAACGCTAACTTAAAAGTCGAAAACCCTAATGGAACAATGGCTGATTTTGGTTCAGAGAATTCGGATAAGTATAGCAGAATAACTCTTGCTCGCAAAGTTGGTAGCGGTGCTGCCGTAGCAATGCTTAAAGTTACTCCTGAAGGACACGTGCAATTTGGTTATCAAACTGCAGTTTCTACTCCAGCTCCTAGTAAATATATTCTAGTTAAATCCAGCGGTCTTGAGGTAGAAGGGGATTTAGTTTTTAATCAGACATATAGCGGCGCTGAAGAGGCAGTTGATATTTCCGATAAGACTATCGACCTTAATAGTCTGATTATTAGACGATCAGATTTAGGTACTCGTCAGTTATATAAATGCGTATCTTCTGGCGGTGGTTCTAAGATAACAAACAAACCTACATCTGATGGTAACTTTGTTCTTGAAGTTCTGTCTTTACGCAAGGTTTCTGATACCGATTGGTCATGTAAGCAGACCTTTACTACAAAGAACGGCGGTGTTGAAGGCACATATATCCGCTACGGACAAAATGGTTCATGGTCTGCATGGAAAGAAGTTGTTTCTGGTGTTCAGCCAATTAATTTAGGTGGTACTGGAGCAACTTCTGCAGCTTCTGCTCGTAACAACCTCGGTGTTGGTGAAGGACAAACTGTAAAATTCGGTAATTTAGTTACAACCGATTTAACCGCAAACGGAAACGCTAGATTAGTCGGAAGACTGAACCTTGGTTCTACTTCCGCAACCGGTGTATTACGGGCTAATGAATCTGGCGCAGTTGTTTTAGGTTCTTCTAGTGGTCAAAACATCCACATCAGAGCAGGAAGCCCAGATACTTCTTCTGGTGAAACCCGCTTTGAGCCAAATGGAAACGTTTTAGTTGGCGGAGTTCTGACGTCTTCAGGAAGCTTACAAGTAAATGGCGAAGCTGCGATGAGCAGAAGCTTGATCGTTTCTCAAAACATAAAGAATACTAACGATAACAGTTTTATTCTGATGGGGAAAGATTCTGATTTAGGTTTCGTTAAAAAATCTAACTCAGGCGCTAAGCTGGTATTTGCTTCAGGAAAATCATTTGTTGTTGCTAAATCATCAGCAACTGCCATAGCTAATCCAGCTTCGGAAACTTACACTGATGTGTTTAAAGTTGACGCAGATGGAAACCAAACAGTTTATGGAAACTCAGCAGTTTCTAGAGCTTTGACTGTATCAAGTACAGCAACTATTAATGGGGTTATTAATGCCAACGGCGGTATTATTGTTCCTACTACCAAGTATGTGCAAATTGCCGATGCTCCTACACAGAATAACCAAGCTGCCAACAAGAAATATGTTGATGATAAGGTTGCTTCTGCTATTAGTAACGCTGGCGATACTTATCTTCCATTAGCCGGTGGTACTGTAACTGGTAACCTTGACGTAACTGGCACCAGATTAAAAACATGGCAGTTAGAAGTTGATGGCAAAAGTACTCTAAGAGGCGGGTTAGATGTTAGTAGCAGTCTTAAAGTTTCTAGCGGAAACTTAGTCGCCGCTGACACAACCAATGCTGGTGGTCTTTTTGCTAAAAACGGTAATGTTTACTGTGATGCAGGTTCAGCTGGTACAAACTCTAACTACTGGTTCCGTGATTCTGCTGGAAATGTCAGAGGTGTTATTTGGTCAAATGGTCAAAACGGTGACATGATTATCCGTAACCAAAGTGGCCGAGAGCTTGTATTCAGAAATGATGGATATCTGCAATTAGCCCACTTAGCACCAGGAAACACAGATAATGCAAACACCGTAAATGGAATACGTTTACAGCGCGGTGATACGATTTTCGATAGCTTTAACGCATGGCAGTCGGGTGAATATGTTCGCGCTGGATGGCATTTCTATAACGCCGCTGGAGTTGACCAGTGGTTAGCACTTACAGATACTGGTGTAAAAATCTGGGGTAGTGCTGCTAATCTACGCGTTGAAGGTGTTGGTAATTTCTGGGACGTTGAAATTCGTTCTGACCGTCGTGTGAAATCAAATATTGCTAAGATTGATAACGCTCTTGATAAAGTGTCGAAGCTATCTGGTAATGTTTATGATTTACAGCTTCCAAATGGTGATACTAAACCATCGGCTGGCCTTATCGCACAAGAAGTGCAGGAAGTTCTTCCTGAAGCAGTTACAACTGATAACGATAAAGATGCATTACTTCGTTTAAACTATAATGCAGTAATTGCGTTATTAGTCGAATCTGTTAAAGAGCTTAAAGCAGAAATTGAAGAACTTAAATCTAAATAA
Tertiary structure
PDB ID
5e7ece1d5ab5bc7c39b3086477f097905271aaf7b238a238e36f649096d6539d
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50
Literature
| Title | Authors | Date | PMID | Source |
|---|---|---|---|---|
| Phage training: Klebsiella pneumoniae | Burke,K.A., Filippov,A.A., Nikolich,M.P. and Peters,T.L. | 1997-09 | — | GenBank |