Protein

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Genbank accession
QRD99295.1 [GenBank]
Protein name
preneck appendage protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect2
Probability 0,94
Protein sequence
MSTKPELKRFEQFGEIMVQLYERYLPTAFDESLTLLEKMNKIIHYLNEIGKVTNELIEEWNKVMEWILNDGLEDLVKETLERWYEEGKFADLVIQVIDELKQFGVSVKTYGAKGDGVTDDIKAFEKAIESGFPVYVPYGTFMVSRGIKLPSNTVLTGAGKRNAVIKFMDSVGRGESLMYNENVTTGNENIFLSSFTLDGNNKRLGQGISGIGGSRESNLSIRACHNVYIRDIEAVDCTLHGIDITCGGLDYPYLGDGTTAPNPSENIWIENCEATGFGDDGITTHHSQYINILNCYSHDPRLTANCNGFEIDDGSRHVVLSNNRSKGCYGGIEIKAHGDAPAAYNISVNGHMSVEDVRSYNFRHIGHHAATDPQSLSAKNIVASNLVSIRPNNKRGFQDNATPRVLAVSAYYGVVINGLTGYTDDPNLLTETVVSVQFRARNCSLNGVVLTGFSNSENGIYVIGGSRGGDAVNISNVTLNNSGRYGVSIGSGIENVSITNISGIGDGINSPVALVSTINSNPEISGLSSIGYPTVARVAGTDYNDGLTLFNGAFRASTTSSGKIHSEGFIMGSTSGCEASVSKSGILTSSSSKTSSERSLIAGSSTSEANATYNTILGSLGAVADEQFAALISASQSRASGNHNLILSSYGINTTGSYKVNGGFEKINWELDSLNGRIKARDTVTGGNTWSDFAEYFESLDGQVIETGYLVTLEKGKIRKAEKGEKIIGVISETAGFVLGESSFEWQGAVLKNEFGGIVYEEVTTEDGVKFKRPLPNPDFDPNKNYIPRSQRREWHVVGLLGQIAVRIDDTVKQGQGIDAVGGVATDGDNFIVKEITTPYNKEKGYGVAIVLIK
Physico‐chemical
properties
protein length:854 AA
molecular weight: 92171,75470 Da
isoelectric point:5,17533
aromaticity:0,08197
hydropathy:-0,24555

Domains

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Bacillus phage Whiting18
[NCBI] 		2803381 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QRD99295.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MW477480 [NCBI]
CDS location
range 11463 -> 14027
strand +
CDS
ATGTCAACTAAACCCGAATTAAAACGGTTTGAGCAGTTTGGTGAAATCATGGTGCAACTGTATGAACGATATCTACCGACTGCCTTTGATGAAAGTTTAACACTATTAGAGAAAATGAACAAGATTATCCATTACTTAAACGAGATTGGTAAAGTAACAAATGAGCTAATCGAAGAATGGAACAAGGTAATGGAATGGATTCTGAACGACGGGTTAGAAGACTTGGTGAAAGAGACGCTCGAACGATGGTATGAAGAAGGTAAATTCGCTGACCTCGTTATCCAAGTTATTGACGAGTTGAAGCAGTTTGGTGTTAGCGTTAAAACATATGGAGCAAAGGGAGACGGTGTAACCGATGATATTAAGGCGTTTGAGAAGGCTATCGAGTCTGGTTTCCCTGTATATGTACCATATGGAACATTCATGGTTTCACGTGGAATTAAGTTACCCAGCAACACCGTATTAACGGGAGCAGGTAAACGCAATGCTGTTATTAAATTCATGGATAGTGTGGGACGTGGAGAAAGTCTCATGTATAACGAAAATGTGACAACTGGAAATGAAAATATTTTCCTATCTTCCTTCACACTTGACGGCAATAATAAGCGTTTAGGACAAGGCATCTCCGGTATCGGTGGTTCACGTGAAAGTAACTTGTCAATCCGTGCATGTCATAACGTGTATATCCGTGATATCGAGGCTGTTGACTGTACCTTACATGGAATCGACATTACATGTGGCGGACTTGATTACCCGTATCTAGGCGACGGGACAACCGCTCCTAACCCATCGGAAAACATATGGATTGAAAACTGTGAGGCGACTGGTTTCGGTGATGACGGAATCACAACTCACCATAGTCAGTACATCAATATCTTGAATTGTTATTCGCATGACCCACGTTTAACTGCTAACTGTAACGGATTCGAAATTGATGATGGTTCACGTCACGTGGTGTTAAGTAATAACCGCTCAAAGGGTTGTTATGGTGGTATTGAGATTAAAGCACATGGAGACGCTCCGGCGGCTTATAACATTTCTGTTAACGGTCATATGTCTGTTGAAGATGTTCGCTCATACAACTTCCGTCACATCGGACACCATGCGGCTACTGACCCACAATCCTTATCGGCTAAAAACATTGTTGCAAGTAACCTTGTCTCTATTCGACCTAACAATAAGCGTGGTTTCCAAGACAATGCTACCCCGAGGGTACTAGCAGTATCAGCTTACTACGGGGTTGTGATCAATGGTTTAACAGGGTACACAGACGATCCGAACCTATTGACTGAGACTGTTGTATCTGTTCAATTCCGTGCAAGAAACTGTTCTCTAAATGGTGTTGTTCTTACTGGATTCTCTAACTCTGAAAATGGTATCTATGTTATCGGCGGTAGCCGTGGCGGTGATGCTGTTAATATCAGTAACGTTACACTTAATAACTCAGGTCGATATGGAGTGTCAATCGGTTCAGGAATTGAAAACGTATCTATTACCAATATTAGTGGTATCGGTGATGGTATCAATTCTCCTGTAGCACTCGTATCAACAATTAACAGCAACCCTGAGATTAGCGGATTAAGTAGCATTGGTTATCCAACGGTTGCTAGGGTCGCTGGAACAGACTATAACGATGGCTTAACACTATTTAATGGTGCGTTCCGTGCTTCCACAACATCTAGCGGTAAGATTCATAGTGAAGGCTTCATTATGGGGTCAACTTCTGGATGTGAAGCATCTGTATCAAAATCAGGTATTTTAACATCGTCAAGCTCAAAGACTAGCTCTGAACGTTCTTTGATTGCAGGTAGCTCAACTTCTGAAGCCAACGCAACATACAATACTATTCTGGGTTCTCTCGGTGCGGTTGCAGATGAGCAGTTTGCGGCATTGATTTCTGCTTCCCAGTCCAGAGCATCAGGAAATCACAATTTAATTCTATCGAGTTATGGAATTAATACAACAGGTTCATATAAGGTTAACGGCGGGTTCGAAAAAATCAACTGGGAGCTAGATTCCTTAAACGGTAGAATTAAAGCACGTGACACCGTAACAGGTGGTAACACATGGAGTGACTTTGCTGAGTATTTTGAGAGCTTAGATGGTCAAGTCATTGAAACTGGTTACCTCGTTACCCTTGAAAAAGGTAAAATCCGTAAAGCTGAAAAAGGTGAAAAAATCATCGGTGTTATCAGTGAAACGGCGGGCTTTGTCCTTGGTGAGTCATCATTCGAATGGCAGGGCGCTGTCCTTAAAAATGAGTTTGGCGGTATCGTGTACGAGGAAGTAACAACCGAAGACGGTGTGAAGTTTAAAAGACCGCTTCCTAACCCTGACTTTGACCCTAACAAAAACTACATCCCACGTAGTCAACGAAGAGAATGGCATGTTGTTGGTTTACTCGGTCAGATCGCTGTTAGAATCGATGATACAGTAAAACAAGGACAAGGGATAGATGCTGTTGGTGGTGTTGCTACAGATGGTGACAATTTCATTGTTAAGGAAATCACAACACCATATAACAAAGAAAAAGGCTACGGTGTAGCGATTGTATTAATTAAGTGA

Tertiary structure

PDB ID
e03b05a5f370baae332f55cbb1a7a6fad1c97ca681dc64fdd0827d7d612e4165
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2652
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50