Protein

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Genbank accession
WNM52166.1 [GenBank]
Protein name
pre-neck appendage protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect2
Probability 0,94
Protein sequence
MILRLFLDFPVELGQEFRYKTVENFKRIVNAHGRLVDDLEYHRKEEKHAHDAKQIDYTTSYSRSVSDALDKQNNRINNLVVGANGDAMAEVKDSRVALDGTISELLSQRLDYDFGKLNKKIDDNFKYLNDKIERIVNVNDYGADPTGQKDSTLAFQKAFGEGHRHVHMTEGTYIISGIKMPNYTILSGEGKGITYLRIADDAPAETIGITNLNMDGTAEYIGVDNFTIDGNRTRQGNTLSPAGGSRSSNIRFAGVKHGFACSVESFSSLLHGIDVTYASDDYFYQGDGIRVNEALESKYIHIQECETYDFGDDGITTHHSRYLILQNNYSHDPVKDSGNHNGIEVDDGSQHVFVMGNKTEKCFGGLEIKAHEPTSAASDVVVSDHIDIKSIRSYNIRHIGHHRAGDVQSKTAYNIMLNNCTSLYPQYNGSYENTTPRAMVICAYRNVVVNNFTAIGDGNFMANMPVIAVQFRAENVMLNNINVSGFKNSLADVKVFGGANRPKKVSLSNINIVNSSNNRGIAGGGKIYDLRIINANLQGNGTGNGVELYNNTAEIVGVSAENYKRPAMIAGKEYFYMPTSLKGGFSGGSTGSAAIAERSAVIASTDGSFAHSNRSFVIGSGAGSIANGSRSGVISSLSSVIEPGGHTRMIINSKNMKNSENYHIKAGYGADGPPSESNTKLDISTFTGTIKTAGQVQSGQNFGDYAEYFESQSGMAIPTGNIVTLDGRFIRKAQVNDIPIGVISETAGVILGDQMFHHKDKYLKNEFGGVITESVKKEWQDDAGNWYSDTVEMPVKNPDFDERDEEEYLSRAERPEWNVVGLIGQVYIRIDGTVKENDYIKPVNGVGTKDNINGYYRVEQITTPYDNDKGYGVAIAFIHPITPSIINKGSVK
Physico‐chemical
properties
protein length:892 AA
molecular weight: 97813,65390 Da
isoelectric point:5,78572
aromaticity:0,08744
hydropathy:-0,44933

Domains

Domains [InterPro]
IPR012334
119–579
IPR012334 G3DSA:2.160.10.20 G3DSA:2.40.300.10
IPR011050
133–486
IPR011050 IPR021865
IPR024535
135–366
IPR024535 G3DSA:4.10.80.40
WNM52166.1
1 892
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Staphylococcus phage S-CoN_Ph5
[NCBI] 		3076598 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WNM52166.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OR354828 [NCBI]
CDS location
range 57675 -> 60353
strand -
CDS
ATGATTTTGAGATTATTTTTAGATTTCCCTGTTGAATTAGGGCAAGAGTTTAGATATAAAACAGTAGAAAATTTCAAAAGAATCGTTAATGCTCATGGGCGTTTAGTTGATGATTTAGAATACCATAGAAAAGAAGAAAAGCACGCACATGATGCTAAACAAATTGATTACACAACAAGTTATTCAAGAAGTGTTAGTGACGCATTAGATAAACAGAACAATAGAATCAATAATCTAGTAGTCGGTGCAAATGGAGATGCTATGGCAGAAGTTAAAGATAGCCGAGTTGCATTAGACGGAACAATAAGTGAATTGCTTTCACAAAGATTAGATTATGATTTTGGTAAATTGAATAAAAAAATAGATGATAACTTTAAGTACCTTAACGATAAGATTGAACGTATTGTTAATGTTAATGATTATGGCGCTGACCCTACAGGTCAAAAAGATTCAACATTAGCATTTCAAAAAGCATTTGGAGAAGGTCATAGACACGTTCATATGACAGAAGGTACTTATATTATATCTGGTATTAAAATGCCTAACTACACTATTTTAAGTGGAGAAGGTAAAGGGATAACATATTTAAGAATTGCTGATGATGCTCCAGCTGAAACAATTGGTATAACTAACTTAAATATGGATGGAACAGCTGAATATATCGGTGTTGATAATTTCACAATTGATGGAAATAGAACAAGACAAGGAAACACGTTATCTCCAGCTGGTGGTTCACGTTCAAGTAATATTAGATTTGCTGGTGTTAAGCATGGTTTTGCATGTTCTGTAGAATCATTTAGTAGTTTATTACATGGTATTGATGTAACGTACGCTAGTGATGATTATTTCTATCAAGGAGACGGAATCAGAGTAAATGAAGCATTAGAAAGTAAATACATTCATATACAAGAATGTGAAACTTATGATTTCGGAGATGATGGTATCACTACTCATCATAGTAGATACTTAATTCTACAAAATAATTATTCACATGACCCAGTAAAAGATAGTGGGAACCATAACGGTATTGAAGTAGACGATGGTTCACAACATGTATTTGTTATGGGTAACAAAACAGAAAAATGTTTTGGTGGTTTAGAAATCAAAGCACACGAACCTACAAGCGCAGCAAGCGATGTTGTTGTAAGTGACCATATTGATATTAAAAGTATTCGTTCTTATAATATTCGTCATATCGGACATCATAGAGCTGGGGATGTACAATCTAAAACAGCTTATAATATTATGTTGAATAACTGTACTTCATTATATCCACAATATAATGGTTCATATGAGAACACAACACCAAGAGCAATGGTTATTTGTGCTTACAGAAATGTAGTCGTTAATAACTTTACAGCTATTGGCGATGGCAACTTTATGGCAAATATGCCAGTTATTGCTGTTCAATTCAGAGCTGAAAATGTTATGCTTAATAATATTAATGTAAGTGGTTTCAAAAATTCATTAGCTGATGTTAAAGTATTTGGTGGAGCAAATAGACCTAAAAAAGTATCATTATCTAATATCAACATTGTTAATTCATCTAACAATAGAGGTATTGCAGGCGGTGGAAAAATTTATGATTTAAGAATTATAAATGCTAACTTGCAAGGTAATGGTACAGGAAATGGTGTTGAATTATATAACAACACGGCTGAAATTGTTGGAGTAAGTGCTGAGAATTATAAAAGACCAGCTATGATTGCTGGAAAAGAGTATTTTTATATGCCCACAAGTCTTAAAGGAGGATTTAGTGGAGGGAGTACAGGTAGTGCAGCTATTGCTGAAAGAAGTGCTGTTATTGCCTCTACTGATGGTTCCTTTGCTCATAGTAACCGTTCTTTTGTTATAGGCTCTGGTGCTGGTAGTATTGCTAATGGTTCACGTTCTGGTGTTATTAGTTCATTGTCATCTGTTATTGAGCCAGGCGGACATACTAGAATGATTATTAATAGTAAAAACATGAAAAACAGTGAAAACTATCACATTAAAGCTGGTTATGGAGCTGACGGTCCACCAAGTGAATCAAATACTAAACTTGATATTAGTACATTTACTGGTACAATCAAGACAGCAGGACAAGTTCAATCTGGACAAAACTTTGGGGACTATGCCGAGTATTTTGAATCACAAAGTGGTATGGCAATTCCTACTGGTAATATAGTTACACTTGATGGCAGATTTATAAGAAAAGCACAAGTCAATGATATTCCAATCGGTGTTATATCTGAGACAGCAGGAGTTATTTTAGGGGACCAAATGTTCCATCACAAAGATAAATATCTTAAAAATGAGTTTGGCGGAGTCATTACTGAAAGCGTCAAAAAAGAATGGCAAGATGATGCTGGTAATTGGTATTCAGATACAGTAGAAATGCCAGTTAAAAATCCAGATTTTGACGAACGAGACGAAGAAGAATATCTATCTCGTGCTGAACGACCAGAATGGAACGTTGTAGGTCTTATAGGTCAAGTATATATTAGAATAGATGGTACTGTCAAAGAAAATGATTATATTAAGCCAGTAAACGGTGTCGGAACTAAAGATAATATTAATGGTTATTATAGAGTTGAACAAATTACTACCCCATATGATAACGATAAAGGTTATGGTGTGGCAATTGCATTTATCCACCCTATTACACCAAGCATAATTAATAAAGGAAGTGTTAAATAA

Tertiary structure

PDB ID
ce3bdfeca0589b9e60ed9786b8ae611ba3dc98e422b617c93761f841ca25ed04
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2529
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50