Protein

View in Explore
Genbank accession
CAI9865750.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein proximal subunit
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,56
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,88
Protein sequence
MADILKPAFRATSGLDAAGEKVINVAKADYNVLDDGVNVEFFIDENTIQAYDETRGYKKGFAVIHDQRIWVAQRDIVAPAGTFVPGYWAATRTDPKWITVASPTRQLASGEYIAVDSAASFTTFTLPPNPTDGDTIVIKDIGGRVGYNEIKVQSSSAPGGGNQKIVRFGNQFSETLITKPFSYNMLIFANRLWHFWEASNEERGIRVEPNTAQFQSQAGDNVLRRYTSGAVIKFTLPKYANQGDMVKTVDIDGLGSKFHLVVETFDASSSLGKPGQHSMEFRTSGDGFFVYNSVEKMWYVWDGDRQTRLRVIRDDVELLANESIIVFGPNNTTPQTINITLPTSVAQGDTIKIALNYLRKAQTVNIKAALGDKIASSVQLLQFPKRSEYPPDTEWVLNDVLTFNGNLSYTPVIELSYIEDTTTGGKYWVVAQNVPTVERVDSKDDLTRARLGVIALASQTQANVDHENNPEKELAITPQTLANRVATESRRGIARIATTAQVNQNTTFAFQDDLIISPKKLNERTATETRRGVAEIATQQETDAGVDDTTIITPKKLQTRQGTESLSGIVKYTSTVDTTPATARDTVGTNVYNKNTTTLVISPKALDQYKADQNNQGAVYLATQAEVNAGATNPGFSNSVVTPETLGARRSTDTNHGLIEIATQAETDAGTDYTRAVTPKTLNDRKATETLTGIARIGTQVEFDAGVLDNVISTPLKIKTRFDNTARTSVSAASGLVESGTLWNHYTLDIREASNTQRGTARLATQTEVNTGTDDKTIITPLKLQAKKATENAEGIIQLATQTEVISGTVSNKAFSPKHYKYIVQQEKSWEATSARRGYVKLTTGTATWEGDDTNGSVANLAKFEDDGFAISPLQMNTALTHYLPIKGKAFDSDKLDNLDSSQFVRRDIDQIVEGTLTLRKNIRVDGQLATGGTGEFGGSLAANRTFTIRNTGLPTSIIFEKGPASGSNPVQSMSIRVWGNQYGGGSDTSRSTVFEVGDETSNHFYSQRNKDGNIAFSINGTVMPINVNASGLMNVNGVATFGRSVTAQGEIISYSPNAFRAINGNYGFIIRNAGNDTFFVLSHAGEQTGGFNALRPLTINNQSGQVTIGEGLIIAKGATINSGGLTVNSRIRSQGTKPADLYSRKPDADNTGFWSVDVNDSATYNQFPGYFKMVEKINEVTGLPYLVRGEEVKSPGTLTQFGNTLNSLYQDWITYPNTADGSTTRWTRTWQQNKNAWSGFVQVFDGGNPPQPSDIGALPSDNASMSNLTIRDWLRIGNVRIIPDPVTRSVKFEWIDTP
Physico‐chemical
properties
protein length:1299 AA
molecular weight: 141647,95780 Da
isoelectric point:5,70370
aromaticity:0,08237
hydropathy:-0,40223

Domains

Domains [InterPro]
IPR048390
987–1100
IPR048390 IPR048391
CAI9865750.1
1 1299
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage UP19
[NCBI] 		3044049 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
CAI9865750.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OX638288 [NCBI]
CDS location
range 18131 -> 22030
strand -
CDS
ATGGCTGATATTTTAAAACCTGCATTCCGTGCTACATCCGGACTCGATGCTGCGGGCGAGAAAGTTATCAATGTTGCCAAAGCCGATTACAATGTACTAGATGATGGCGTCAACGTTGAATTCTTTATAGATGAGAACACCATCCAGGCGTACGACGAGACGCGCGGATATAAGAAAGGGTTTGCAGTAATCCATGACCAACGTATTTGGGTTGCCCAACGTGATATCGTTGCACCGGCTGGAACTTTTGTACCTGGTTATTGGGCCGCTACCCGTACTGACCCTAAATGGATTACAGTAGCATCTCCTACGCGCCAGCTGGCTTCTGGTGAATATATCGCAGTGGATTCTGCTGCTAGCTTTACTACATTTACTCTGCCTCCTAACCCTACTGATGGTGATACCATTGTAATCAAGGACATCGGTGGCCGTGTAGGTTATAATGAAATCAAGGTTCAATCTAGTTCCGCTCCAGGTGGTGGTAATCAGAAAATTGTTCGATTTGGTAACCAGTTCTCTGAAACTCTGATAACCAAACCTTTTTCTTATAACATGCTTATCTTTGCTAACCGTCTTTGGCATTTTTGGGAAGCCAGTAATGAAGAACGCGGTATTCGTGTAGAGCCTAACACTGCACAGTTCCAATCACAAGCAGGTGATAACGTTTTACGTCGTTATACTTCAGGCGCAGTAATTAAATTTACTCTTCCTAAGTATGCAAACCAAGGTGATATGGTTAAAACCGTTGATATCGATGGTCTTGGAAGTAAGTTCCATTTAGTAGTTGAAACGTTTGATGCGTCGTCTTCATTAGGTAAGCCTGGCCAGCACAGCATGGAATTCCGTACCTCTGGTGATGGGTTCTTTGTTTATAACTCTGTTGAAAAAATGTGGTATGTTTGGGACGGAGACCGCCAAACTCGACTGCGTGTTATTCGTGATGACGTAGAACTTTTGGCTAACGAAAGTATTATTGTTTTTGGTCCTAATAACACAACTCCACAAACTATTAACATCACTTTACCTACTAGCGTAGCACAAGGCGATACTATTAAAATCGCATTGAACTATCTTCGTAAAGCACAGACAGTAAATATTAAGGCCGCTTTAGGTGATAAAATTGCTTCTTCGGTTCAATTGCTCCAGTTCCCTAAACGTTCGGAATATCCACCGGATACTGAATGGGTTCTGAATGACGTATTGACCTTCAACGGCAACTTAAGTTATACTCCGGTTATTGAACTTAGCTATATCGAAGACACTACTACAGGCGGTAAATATTGGGTTGTTGCTCAGAACGTTCCTACTGTAGAACGTGTGGATTCTAAGGATGATTTAACTCGTGCTCGTCTTGGTGTTATTGCCCTTGCGTCTCAGACCCAGGCAAACGTCGACCATGAAAATAATCCTGAAAAAGAACTTGCAATTACTCCGCAGACTTTAGCCAATCGTGTAGCTACTGAATCACGTCGTGGTATTGCTCGTATTGCTACAACTGCTCAGGTAAACCAGAATACAACTTTCGCTTTCCAGGACGATTTGATTATTTCTCCTAAGAAATTAAACGAACGTACTGCTACCGAAACTCGTCGTGGTGTAGCTGAAATTGCTACGCAACAGGAAACTGATGCAGGTGTTGATGATACAACCATTATCACTCCTAAGAAGCTACAGACGCGCCAGGGCACTGAAAGTCTTTCAGGTATTGTAAAATATACCTCTACGGTGGACACCACTCCTGCGACTGCTAGGGACACTGTAGGTACCAACGTTTATAATAAGAACACTACTACTTTAGTTATTTCTCCTAAAGCTTTGGACCAGTATAAAGCTGACCAAAATAACCAAGGTGCTGTATATCTTGCTACGCAAGCCGAAGTTAATGCTGGTGCTACTAACCCTGGTTTTAGTAACTCGGTTGTCACACCTGAAACATTAGGTGCTCGTCGTTCTACTGATACTAATCATGGTTTAATTGAAATTGCTACGCAAGCAGAGACTGATGCTGGAACTGATTATACTCGTGCGGTAACGCCTAAGACGTTAAATGATAGGAAGGCTACAGAGACTTTAACTGGTATTGCTCGTATTGGTACTCAAGTAGAATTTGATGCAGGTGTATTAGATAATGTTATTTCAACTCCGTTGAAAATTAAAACAAGATTTGATAATACTGCTAGAACTTCTGTCTCAGCAGCCAGTGGTTTGGTTGAATCAGGAACCTTATGGAACCATTATACACTAGATATCCGTGAAGCAAGTAATACCCAACGTGGTACGGCTCGTTTAGCTACCCAAACCGAAGTTAATACCGGAACCGATGATAAAACAATCATTACTCCGCTTAAGCTTCAAGCTAAAAAGGCCACCGAAAATGCTGAAGGTATTATCCAGCTTGCTACTCAGACCGAAGTTATTAGTGGTACGGTAAGTAATAAAGCGTTTAGTCCTAAGCATTACAAATATATCGTCCAGCAGGAAAAATCCTGGGAAGCTACTTCTGCCCGTAGAGGATATGTTAAATTAACTACAGGTACAGCCACTTGGGAAGGTGACGATACTAATGGTTCTGTTGCTAACCTGGCTAAATTTGAAGACGATGGCTTTGCTATTTCCCCTCTTCAAATGAATACGGCGTTAACTCACTATCTTCCGATTAAAGGTAAGGCTTTTGACTCTGATAAATTGGACAACCTGGATAGCTCACAGTTCGTCAGGAGAGATATCGACCAAATAGTTGAAGGAACATTAACCCTTCGTAAAAACATTAGAGTGGATGGCCAGTTGGCTACAGGCGGTACCGGTGAATTTGGTGGTTCTTTAGCTGCTAATAGAACATTTACCATCCGTAATACAGGATTACCGACCAGTATCATTTTCGAAAAAGGTCCTGCATCCGGTTCAAACCCGGTTCAGTCAATGAGCATCCGTGTATGGGGTAACCAGTATGGTGGCGGTTCGGATACGAGTCGTTCTACCGTGTTTGAAGTTGGTGATGAAACGTCTAACCATTTTTATTCTCAACGCAATAAAGATGGTAATATAGCGTTTAGCATTAATGGCACTGTAATGCCGATAAATGTGAATGCTTCCGGGTTAATGAATGTGAATGGTGTTGCAACATTCGGTCGTTCGGTGACCGCACAGGGTGAAATCATATCTTATAGTCCAAACGCCTTCCGAGCTATTAACGGTAATTACGGTTTCATTATTCGTAATGCTGGTAATGACACCTTTTTTGTGCTGTCTCATGCAGGTGAGCAAACAGGTGGATTTAATGCATTACGTCCATTAACAATTAATAATCAATCCGGTCAGGTTACAATTGGTGAAGGGTTAATTATTGCTAAAGGAGCTACTATTAACTCCGGTGGTTTAACTGTTAACTCAAGAATTCGTTCTCAAGGTACTAAACCTGCAGACCTTTATTCTAGAAAACCTGATGCAGATAACACTGGCTTTTGGTCTGTTGACGTTAATGATTCAGCTACATATAACCAATTCCCAGGTTATTTTAAAATGGTTGAAAAAATTAACGAAGTAACAGGGTTGCCGTATTTGGTTCGTGGTGAAGAAGTTAAATCGCCTGGTACGTTAACTCAGTTCGGTAACACTCTGAATTCACTTTACCAGGATTGGATTACCTATCCAAATACTGCAGACGGAAGCACCACTCGCTGGACCCGTACTTGGCAACAAAATAAAAATGCTTGGTCTGGATTTGTTCAGGTATTTGATGGCGGTAACCCACCTCAACCGTCTGATATAGGTGCACTACCTTCTGACAACGCTTCAATGAGTAACTTGACCATTCGTGATTGGTTACGTATTGGTAACGTTCGCATAATTCCGGACCCAGTAACTCGTTCTGTTAAATTCGAATGGATTGATACACCATAA

Tertiary structure

PDB ID
3fac7ec7c81fb8191f32a7868c22169eeca2918102354e5d85e4a4d09c09d5e8
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5599
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50