Protein

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Genbank accession
CAM0027129.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MPRKQSTNRNVGNVQKFVGTSYDEMKALYDNLDALLALETGVQYTLRYLGPSAGDAPSTREDGSPIQDGDYFFDTDADALVYYDAVDDIWFAVDPSEVIQARDEAIAASIVAGQAKDNAELAANNARLSENTAKVYETNAEASKDAAGLSEMSAGLSATDAATYAAQSAIDASNTAADVMTTNADVVTTTDNAATTSTHAINAKNSETAAALSAQQAEQAFDSFDDRYLGTFSTPPTTDNDGDPLVKGATYYNSVELAVYYWNGAVWEAPDKSASDSADAAAASAATATTKAGEASNAATTALNAQTAAKSSENAAQSSQNAAEAAEVGAELAESNAATSEANAAESETVARASENNAANSAASAKENADRSEQHAAGGKGLTLAIRDALRAQRKREYAGSGFAEWGKHLENTSNLTPINEGLWQSIDSRFPNALFMGDTDGIGTSRTDYAISVVDGVEHTITQTAGVDGRAYSQFKFPTAPDGTKTLNESTGEVRKYHDLAGVGTPYEAHTVDFDGSTYIDLVASPYVMPVGSKVEFKFKLNDVSGYQYLFDTQNLTRVYIYKTTGTNNLLWGGFGSTIKVNGVDISTNTFAVEAGVEYHIEATTNATSNIDRIGAKSAGGVLSDFARGQIWDITLASSEDGVEPITYNTVTTQPKDDAAPVVSEIDAGDNPDMPTGYMPFYQDAGYVTIPEFPLADSMNISMVMRPDNDTELMVFGQNPEGQTMRLYWYNDTSSGLFRIAAGSGTSLTFDPLVAGRVYVTEVQIRKNVGASDYTVTAQVNGVIKTQSNVTFGHNTFDSFTLGSEEGVKNNNRWDGAIFGFGIEYPDAPDLNRTYGSVEVDDPAGRLTVEDDLGFGTEDWTPEFDGFNNVIVPPVMNFTGIARELEMTVVPDNVGSSWRIGQTFSKDGEVNRFYLRYDASGTITAGIGNATIQSVLNMTVGETYNFKFICDNSLNIELFVNGVSTITGTTSFRADFVLDNFYLGAAGTADSGPSEHLNGKLTNVRITDPNSVANSRHYPLVINSATKPDTLIAEDAGYDKDTSPFYSPDYYGSSRGTYIEIPDWSMSVGNSVGMKVLYDGSLTTGFSFLFDHDVNDAINPYLYCTLYDDGWTVNSPSQLDVSIDGNPYGNTRLEYGREYDVEVNANAEFRINLLGNSWYKNQSHAFKGKMWDIELTDNTDPTNSRYYPSLDYRVDGDTSGTVLDETHGLLSDSFSDGRWVESAAGTINGESLTITSSFGSGRVGTFPSPAINGVDVTVSFDVVSYSGTTNGGRVIVYRNGSQDGNLGTFDSSDVGTRVTLTANPTGNYGSDGNDVVFYVDASGISFEVANVEVSANNNGTLVNFPSGSEWTLAQVDGASDGTLENFTAGLEWNNDLPITDGTMVGFAQPWHHETGRYIGSIIGETTQAVWDVQDSQKAFHDVKYNADFHVITSRKDLVFLETWLEKVEGFVRPYGNVQFGGSSHDGVTLVPVTNFKAQGYSAFGEWDENTVGKVADWDAMTPTQKSVWASNPKNNLVFNPEDNEYYQDSYRIRTVEGLGDEWACVRPTIASTGTPTWLGYAQSGTNSRYIVQRGQREDTRDWYKDNTVSGTIFGGTNRSGFNDDEPTIFQNTEGTNTSSANGKCFAMPIALVQRLNQGAYHPTYNPQGCDAFIRNDGAAKVGWYVSNKFREPNNTGDCFPVRKGYPAWDGFRYGHGYIGQSGGRADQYKYYDAIYAGQVEDLRLNANKQDKQELLTDAVRRGVRGETRGKGKVPFTTVQTADQAATGSPTSAFDGIDTSHITVGDMCWAEDAAGDYQRRTITYAGSNGTISFNETIQGRKSDSKLIHERELSAEYDSLPWVDIIGDPERIAATFPDGVVGQWIPQIPDGTSIAFSANEKMNENFTKLYTSDDGATWTTGSPTYGIDTITNTYTDDIAVNQVALMYYESLSDFTESDDNRAVVGDLGDVYNAKFYTIERGNRIAPSLLGVILKDNRDPTHHQLRVNSYSIHPANGDLDGGSGYLPIHEPIRLPAPANDSDAVKALPHLVEKDGLLYVQWHGTQLFYDAAGTVGNEWGDTFAGTTFTNAYGKISIVDGEDTKPDENGNTVKVVTHTETIPIGIANHNQDI
Physico‐chemical
properties
protein length:2109 AA
molecular weight: 228063,77860 Da
isoelectric point:4,40277
aromaticity:0,10194
hydropathy:-0,44476

Domains

Domains [InterPro]
IPR013320
872–1009
IPR013320
CAM0027129.1
1 2109
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Vibrio phage D520
[NCBI] 		3105283 No lineage information
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
CAM0027129.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OZ196215.1 [NCBI]
CDS location
range 2364 -> 8693
strand +
CDS
ATGCCACGTAAACAGTCAACCAACAGAAATGTTGGTAATGTACAAAAATTCGTAGGGACATCCTACGATGAAATGAAAGCCCTTTACGATAATCTTGATGCGTTGTTGGCATTGGAAACAGGTGTCCAGTACACATTACGTTACTTAGGCCCATCTGCCGGAGATGCTCCGTCAACTCGTGAAGATGGTTCACCAATCCAAGATGGTGATTATTTCTTTGATACAGATGCGGATGCCTTGGTGTACTACGATGCAGTTGATGACATTTGGTTTGCAGTTGACCCAAGTGAAGTTATTCAAGCTCGTGATGAAGCTATTGCTGCATCTATCGTTGCAGGCCAAGCAAAAGACAATGCAGAATTAGCGGCAAACAATGCACGCTTATCTGAAAATACTGCAAAAGTGTACGAGACCAATGCTGAAGCATCAAAGGATGCAGCAGGGTTGTCTGAAATGTCTGCAGGCTTGAGCGCAACAGATGCCGCTACATATGCAGCACAATCAGCAATTGACGCGTCAAATACTGCCGCAGATGTCATGACAACAAATGCAGATGTGGTGACTACAACAGATAACGCTGCGACAACTTCTACCCATGCAATCAATGCAAAAAATTCTGAGACGGCTGCAGCTCTTTCAGCTCAACAAGCAGAACAGGCATTTGATAGTTTCGATGACCGTTACCTGGGTACGTTTTCTACCCCGCCTACAACAGACAATGATGGTGACCCTCTAGTAAAAGGCGCTACTTACTACAACTCTGTGGAATTAGCGGTGTACTACTGGAATGGTGCTGTATGGGAGGCACCTGATAAGTCTGCATCTGATTCGGCTGATGCGGCAGCAGCGAGTGCAGCCACAGCTACAACTAAAGCCGGTGAAGCGTCAAACGCAGCAACTACAGCTTTAAATGCACAGACAGCGGCAAAGTCTTCTGAAAATGCAGCGCAGTCTTCACAGAATGCAGCGGAAGCGGCAGAAGTGGGCGCAGAACTTGCTGAGAGTAACGCAGCAACAAGTGAAGCCAATGCTGCTGAATCAGAAACTGTTGCTCGTGCAAGCGAAAACAACGCGGCTAATTCGGCTGCTTCTGCCAAGGAAAATGCTGACCGTTCTGAACAACATGCTGCGGGTGGTAAAGGTTTGACTTTAGCCATACGTGACGCACTTCGTGCCCAACGTAAGCGTGAATACGCAGGTTCAGGTTTCGCTGAATGGGGTAAGCATTTAGAAAACACATCAAACTTAACGCCTATAAACGAAGGTTTATGGCAAAGTATCGACAGCCGTTTCCCTAATGCACTGTTTATGGGGGATACTGATGGTATAGGTACATCTAGAACAGATTATGCAATTAGTGTTGTTGATGGGGTTGAGCATACTATTACCCAAACAGCAGGTGTTGATGGACGTGCCTACTCACAGTTTAAATTCCCAACAGCACCAGATGGTACAAAGACACTAAACGAAAGCACAGGTGAAGTTCGTAAATACCATGACCTAGCAGGTGTGGGTACTCCATACGAAGCTCATACGGTTGACTTCGACGGCTCTACTTACATTGACCTAGTAGCCTCGCCTTACGTGATGCCTGTAGGTTCTAAGGTTGAGTTTAAGTTTAAGTTAAATGATGTGAGTGGCTATCAATATCTATTTGATACGCAAAATTTAACGCGAGTTTACATCTACAAAACAACAGGAACTAATAATCTTTTATGGGGTGGTTTTGGTTCTACCATAAAGGTTAACGGCGTAGATATTTCAACTAATACATTTGCTGTAGAGGCTGGTGTTGAATACCATATTGAAGCAACTACAAACGCTACATCAAACATAGACCGTATTGGCGCTAAATCAGCAGGTGGCGTATTAAGTGATTTTGCGCGTGGTCAAATCTGGGATATCACTCTAGCTTCTAGCGAAGATGGTGTTGAACCGATTACGTACAACACAGTAACTACTCAACCTAAAGATGATGCAGCTCCTGTAGTGTCTGAGATTGATGCAGGTGACAATCCTGACATGCCGACTGGTTACATGCCTTTCTATCAGGACGCTGGTTACGTAACTATTCCAGAGTTCCCACTGGCTGATAGCATGAATATTAGTATGGTTATGCGACCTGATAACGACACTGAACTGATGGTATTCGGTCAGAACCCTGAAGGACAAACAATGCGTTTGTATTGGTACAACGATACATCATCAGGGTTATTCAGAATTGCAGCAGGTTCAGGGACAAGTTTAACTTTTGACCCTCTGGTGGCAGGTCGTGTTTACGTTACAGAGGTACAGATTCGTAAGAATGTAGGTGCAAGTGACTACACGGTTACAGCACAAGTAAATGGGGTTATTAAAACTCAGTCCAATGTTACGTTTGGTCATAACACATTTGATTCGTTTACCCTAGGTTCAGAAGAAGGTGTCAAGAACAATAACCGTTGGGACGGTGCTATCTTCGGATTTGGTATTGAATACCCTGATGCTCCAGACCTTAACCGTACCTACGGTTCAGTTGAAGTTGATGACCCTGCGGGACGATTGACTGTAGAAGATGACTTAGGTTTTGGTACGGAAGATTGGACACCTGAATTTGATGGTTTTAATAACGTAATTGTACCACCAGTAATGAACTTTACTGGTATAGCACGGGAACTTGAAATGACAGTAGTTCCCGATAATGTCGGTTCATCATGGCGTATAGGTCAAACGTTTTCTAAGGATGGTGAAGTTAACCGTTTTTATCTCCGTTATGACGCATCTGGAACGATTACAGCGGGTATTGGTAACGCAACAATACAGTCAGTTCTTAATATGACTGTTGGTGAAACATATAACTTTAAGTTCATATGCGATAATTCACTTAATATTGAACTGTTTGTTAATGGAGTTAGTACCATAACAGGTACTACATCATTCCGTGCAGACTTTGTTCTTGATAATTTCTATCTGGGTGCTGCGGGTACAGCAGATAGTGGTCCGTCAGAACACTTAAATGGTAAACTTACGAATGTACGTATTACTGACCCCAATTCAGTTGCTAACAGTCGTCACTATCCTTTAGTAATCAACAGTGCTACTAAGCCAGATACATTGATTGCAGAGGATGCAGGTTACGATAAGGACACCAGTCCTTTCTATAGTCCTGATTATTATGGTTCATCAAGAGGAACATACATAGAAATACCAGACTGGTCTATGAGTGTTGGTAATTCAGTTGGTATGAAGGTACTGTATGATGGTTCACTAACTACTGGTTTTTCATTCTTATTCGACCATGATGTAAATGATGCTATCAATCCATACCTATATTGTACTTTGTATGATGATGGTTGGACTGTTAATTCACCATCGCAGTTAGACGTATCTATAGACGGTAATCCATATGGCAATACACGTTTAGAGTATGGTAGAGAGTATGATGTGGAAGTAAATGCTAATGCTGAGTTTAGAATAAACCTACTTGGAAATTCTTGGTACAAAAACCAAAGTCATGCATTCAAAGGTAAGATGTGGGACATCGAGTTAACAGATAACACAGACCCTACCAATTCACGTTATTACCCATCATTGGATTACCGTGTAGACGGTGATACTTCTGGTACTGTTTTGGATGAGACTCACGGTTTACTGTCTGATTCATTCTCAGACGGTCGTTGGGTAGAAAGTGCAGCAGGAACTATTAACGGTGAATCATTAACAATTACATCTTCTTTTGGTTCAGGTAGAGTGGGCACATTCCCATCCCCTGCGATAAATGGTGTTGATGTTACAGTCTCATTTGACGTAGTTAGTTACTCAGGCACTACGAACGGTGGACGTGTCATCGTGTACCGTAATGGTTCTCAAGATGGCAACCTAGGCACATTTGATAGTTCGGATGTAGGTACTCGCGTCACACTTACAGCGAACCCTACTGGTAACTATGGCTCTGATGGTAATGATGTTGTTTTCTATGTAGATGCTTCTGGTATTTCTTTTGAAGTAGCTAATGTAGAGGTATCAGCAAATAACAACGGTACTCTAGTTAACTTCCCAAGCGGTTCAGAATGGACACTTGCTCAAGTAGACGGTGCTTCAGATGGTACGTTAGAGAACTTCACAGCAGGTTTAGAGTGGAACAATGACCTACCTATTACTGACGGTACAATGGTTGGCTTTGCACAACCTTGGCATCACGAAACAGGTCGTTACATTGGCTCCATAATTGGTGAAACTACTCAAGCAGTATGGGACGTTCAAGACTCTCAGAAAGCTTTCCACGATGTGAAATACAATGCCGACTTCCACGTGATTACATCACGTAAGGACTTGGTGTTCTTGGAAACTTGGTTAGAGAAAGTAGAAGGGTTTGTTCGACCTTACGGTAACGTACAGTTCGGTGGCTCTAGTCATGATGGTGTTACCCTGGTTCCGGTTACTAACTTCAAAGCTCAAGGCTACTCAGCGTTTGGTGAGTGGGACGAGAACACAGTTGGTAAGGTTGCTGATTGGGATGCAATGACCCCAACACAGAAATCTGTATGGGCAAGCAACCCTAAGAACAACTTAGTGTTCAACCCAGAAGACAACGAGTACTATCAAGACTCATATCGTATTCGTACAGTAGAAGGTTTAGGTGATGAATGGGCTTGTGTTAGACCAACAATTGCATCAACAGGTACACCTACATGGCTTGGTTACGCCCAATCAGGTACAAATAGTCGATACATAGTTCAACGTGGACAACGTGAAGATACTCGTGATTGGTATAAGGACAATACAGTATCGGGTACTATTTTTGGGGGTACTAACCGTTCTGGATTTAATGATGATGAACCAACCATTTTCCAGAATACAGAGGGTACAAACACTTCTTCTGCTAACGGTAAGTGTTTTGCTATGCCCATCGCACTAGTGCAGCGTTTGAACCAAGGTGCTTACCATCCAACGTATAACCCACAAGGTTGTGATGCTTTCATACGTAATGACGGTGCTGCTAAGGTTGGTTGGTATGTATC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Tertiary structure

PDB ID
b09329b07e8926929faf792087215c462b5fa651b77a6b25ef90860ce5f1d02a
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,5197
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50