Protein

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Genbank accession
ATI16839.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber subunit, distal
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,83
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,92
Protein sequence
MATLKQIQFKRSKTAGARPAASVLAEGELAINLKDRTIFTKDDSGNIIDLGIAKGGQIDGNVTIDGTLRVNGPINNFGNFSTSGTITASNIVSATVFRSTSGSFYTRAINDTANAHLWFENTNGSERGVLYSKPQSENEGVITMRVRQGTAAGAQNSEFHFISTDGGIFQARKLTALTSISTPTISVNLINHDSKAFGQYDSQSLVQYVYPGTGETNGVNYLRKVRAKSGGTIYHEICTAQTGLADEVSWWTGNIPLFKLYGIRNDGRMIIRNSLAIGTVTEGFPSSDYGNTGVMGDRYLALGDNASGLKWVRTGVIDLMANGISAASIINNGINSTKKLMVGYSRDSGSTWDFPNNNQAMFTARTDVDGNNNGDGQTHIGYSSNSKMYHYFRGTGRMSVSMGDGLLVEPGILDIKTGSNSLNLRADGTVASTQEVKLNNGLFFNSSSSNAGLKFGASSSINGTKTIQWNAGTRPGQNKSYVTMKAWGNAFEDNTNKNRETVFELGDGQGWHFYSQRVAPAAGSTAGSVEFAMAGSLLTSGSITTRSSLNADNGLSVNGQAKFGGTADVLRIWNAEYGAIFRRSESNLYIIPTPKDAGESGGISNLRPLIIELNTGTVKMSHDVHLGDSGSGTGLLQVSNSLKTIKMICPVTINERNAALTLDSPSSSSANYLQGSKAGTRSWYVGLGGAGNDLSLYSQSYGHGLVISDNFTSITKPLKVGNAQLGTDGNITNGSGNFVNLNTTLNRKVNSGFITYGATSGWYKFATVTMPQSTSTVFFKIVGGSGFNSGLFTQCNIAEIVLRTSNERPSDLNAVLYTRTTGMYSAAFRNIAVNNVSGNTYDIYVYAGTYCNQLVCEWSCTENATVSVIGINSSTQSPVDALPDTAVDGQVANVLNNLVDRGKVKRYEADSEIAINSQTGIRIRSNADKTGSVATMLRNDGGSFYILFTDKNATDGAATVNGDWNSKRPFAINLTTGEVMMNNGIAVRSAALFYNSINVKDNGSINFDKSGANPRNMRIFHAGDGTRGNRIEIADETNYIAYFQKLPGGQNQVSFNSATLSGLTQCNQFGVNTTNALGGNSITFGDTDTGIKQNGDGLLDIYANNVQVFRFQNGDLYSYKNINAPNVYIRSDIRLKSNFKPIENALDKVEKLNGVIYDKAEYIGGEAIETEAGIVAQTLQDVLPEAVRETEDSKGNKILTVSSQAQIALLVEAVKTLSSRVKELESKLM
Physico‐chemical
properties
protein length:1229 AA
molecular weight: 131546,85480 Da
isoelectric point:8,14141
aromaticity:0,08218
hydropathy:-0,28910

Domains

Domains [InterPro]
G3DSA:6.20.80.10
657–716
G3DSA:6.20.80.10 IPR030392
IPR048388
660–732
IPR048388 IPR030392 Coil
ATI16839.1
1 1229
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Shigella phage Sf22
[NCBI] 		2024320 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
ATI16839.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MF158045 [NCBI]
CDS location
range 98688 -> 102377
strand +
CDS
ATGGCTACTTTAAAACAAATACAATTTAAAAGAAGCAAAACCGCAGGAGCACGTCCTGCTGCTTCAGTATTAGCCGAAGGTGAATTGGCTATAAACTTAAAAGATAGAACAATTTTTACTAAAGATGATTCAGGAAATATCATTGATCTAGGTATTGCTAAAGGCGGTCAAATTGATGGAAATGTAACTATTGATGGAACTTTACGCGTCAATGGACCAATAAACAACTTTGGAAATTTTTCTACAAGTGGTACTATTACGGCAAGTAATATTGTTTCTGCTACAGTATTCAGATCAACATCCGGTTCATTTTATACAAGAGCAATAAATGATACTGCAAATGCCCATCTTTGGTTTGAAAATACGAATGGATCGGAGAGAGGGGTTTTATATTCAAAACCACAGTCTGAAAATGAAGGCGTAATTACAATGCGCGTTCGCCAAGGAACCGCAGCAGGGGCTCAAAATTCAGAATTTCATTTCATTTCTACTGATGGCGGTATCTTCCAGGCACGCAAATTAACTGCTTTAACTTCTATTAGTACACCAACTATTAGTGTTAATTTAATTAATCATGATTCTAAAGCCTTTGGACAATACGATTCACAATCATTAGTTCAGTATGTTTATCCTGGAACCGGTGAAACAAATGGTGTAAACTATCTTCGTAAAGTTCGAGCTAAATCAGGTGGAACTATTTACCATGAAATTTGTACAGCTCAGACTGGGCTAGCTGATGAAGTTTCTTGGTGGACTGGTAATATACCGTTATTTAAACTATACGGTATTCGTAACGACGGTAGAATGATTATTCGCAATAGCTTGGCCATTGGTACTGTGACGGAAGGGTTTCCGTCAAGCGATTATGGAAATACTGGGGTAATGGGAGATAGGTATTTAGCTCTTGGCGATAATGCTTCTGGACTTAAATGGGTTCGTACTGGCGTTATTGACTTAATGGCTAACGGTATTTCTGCGGCGTCTATTATTAATAATGGTATTAACAGTACTAAAAAATTAATGGTTGGTTATAGTCGAGATTCTGGTTCTACTTGGGATTTCCCAAATAACAACCAAGCAATGTTTACTGCGCGTACCGATGTTGATGGTAATAATAACGGTGATGGTCAAACTCATATCGGTTATAGCAGTAATTCTAAAATGTATCACTATTTCCGTGGTACAGGTCGTATGTCCGTTAGTATGGGCGATGGACTTCTTGTTGAGCCTGGCATTTTAGATATTAAAACTGGTTCAAATTCATTAAATTTGCGTGCTGATGGTACTGTTGCATCTACTCAAGAAGTTAAGCTTAATAATGGGTTATTCTTTAATAGTAGTTCTTCTAACGCCGGTCTTAAATTTGGCGCTTCTTCTTCTATAAATGGAACTAAGACAATACAATGGAACGCAGGCACCCGCCCGGGTCAGAACAAAAGCTATGTGACCATGAAAGCATGGGGCAATGCATTTGAGGATAATACTAATAAAAACAGAGAAACTGTATTTGAATTAGGCGATGGACAGGGTTGGCATTTTTATTCACAGCGCGTTGCTCCTGCAGCAGGTTCTACTGCCGGTTCTGTTGAATTTGCGATGGCCGGTAGTTTATTAACTTCTGGTTCTATTACAACAAGATCTTCCCTGAATGCTGATAATGGATTGTCTGTAAATGGACAAGCTAAATTTGGTGGAACGGCTGATGTATTAAGAATTTGGAATGCTGAATACGGTGCTATTTTCCGTCGCTCAGAAAGTAATCTTTATATTATACCGACTCCTAAAGATGCTGGAGAATCGGGCGGTATAAGTAATCTTAGACCATTGATAATAGAACTGAACACTGGCACAGTTAAAATGTCGCATGATGTTCATTTAGGAGATTCTGGATCTGGTACAGGACTTTTACAAGTAAGTAATAGTCTTAAAACTATTAAAATGATATGTCCAGTAACTATTAATGAACGCAATGCAGCGCTTACCCTGGATTCTCCTTCATCTTCTTCTGCTAATTATTTACAGGGTTCTAAAGCTGGAACTAGATCATGGTACGTTGGTCTTGGCGGCGCTGGAAATGATTTATCTCTTTATAGCCAATCTTATGGACATGGTCTTGTTATAAGTGATAATTTCACGTCAATCACTAAGCCTCTTAAAGTCGGCAATGCCCAATTAGGAACTGACGGTAATATTACCAATGGTTCAGGAAACTTTGTCAACTTAAATACCACGTTAAATCGTAAAGTTAATTCTGGATTTATTACTTATGGAGCAACCTCTGGATGGTATAAGTTTGCAACAGTAACAATGCCACAATCCACTTCGACGGTCTTCTTTAAAATAGTTGGAGGTTCTGGATTTAATAGCGGATTATTCACACAATGTAATATTGCTGAAATTGTTTTACGTACTAGTAATGAAAGACCTTCTGACTTAAATGCTGTATTATACACAAGAACAACTGGAATGTATAGCGCAGCATTTAGAAATATTGCAGTTAACAATGTCTCTGGAAATACATATGACATTTATGTTTATGCTGGAACATATTGTAATCAACTAGTTTGTGAATGGTCATGTACCGAAAATGCTACTGTTAGCGTTATTGGTATTAACTCATCTACCCAATCACCTGTGGATGCTCTTCCAGATACAGCAGTTGATGGGCAAGTTGCTAATGTTCTTAATAACTTGGTTGATCGTGGTAAAGTTAAGCGTTATGAAGCCGATTCTGAAATAGCTATTAATAGCCAAACCGGTATTCGTATCAGAAGCAATGCCGATAAAACTGGTTCTGTGGCTACAATGTTACGAAATGACGGTGGCAGTTTTTATATTCTGTTTACAGATAAAAATGCCACTGATGGCGCAGCAACTGTTAATGGTGATTGGAATAGTAAACGTCCTTTCGCAATTAACTTAACAACCGGCGAAGTGATGATGAATAACGGCATAGCTGTTCGCAGCGCTGCTTTATTCTATAATAGCATAAACGTCAAAGATAATGGTTCTATTAACTTTGATAAGTCCGGCGCTAACCCGAGAAACATGCGTATATTCCATGCAGGTGATGGCACTCGTGGTAATCGCATTGAAATTGCTGATGAAACAAACTATATTGCTTACTTCCAAAAATTACCTGGTGGTCAAAATCAGGTTTCATTCAATAGTGCTACACTTTCTGGATTAACACAGTGTAATCAATTTGGTGTTAACACAACAAACGCACTTGGTGGAAACAGTATAACATTTGGTGATACTGATACTGGTATTAAGCAAAATGGCGATGGATTATTAGACATATATGCGAACAACGTGCAAGTGTTCCGTTTCCAAAATGGTGATTTGTACTCATATAAAAATATAAATGCTCCAAACGTTTATATTCGTTCTGATATTCGTTTAAAATCTAACTTCAAACCTATCGAAAATGCACTTGATAAAGTTGAAAAACTCAATGGTGTCATTTATGATAAAGCTGAATACATCGGTGGAGAGGCAATTGAAACTGAAGCGGGTATTGTAGCTCAAACGTTACAAGACGTTTTACCAGAAGCCGTCCGTGAAACAGAAGACAGCAAGGGTAATAAAATACTCACTGTTTCTTCTCAAGCCCAGATTGCTCTTCTGGTTGAAGCTGTGAAAACGCTTTCTTCTCGTGTAAAAGAACTTGAATCTAAACTTATGTAA

Tertiary structure

PDB ID
85edce6fe6d4b118e82afef0413b46c4d6693eef118c644ca87470e62e708d0b
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5249
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
The isolation and characterization of 16 novel Shigella-infecting phages from the environment Doore,S.M., Schrad,J.R., Dover,J.A. and Parent,K.N. 2020-09-29 — GenBank