Protein
View in Explore- Genbank accession
- CAB4144760.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber protein
- RBP type
-
TF
- Protein sequence
-
MPDLPISGLPAVTEPAAGDLYAIVSGGVTSKVSRANNSKIITDSTAKTANYTLTANDEAVKFDTSSGSLTVFLPTAVGIKGKWYSVIKVSASNTLTVEPDGSETINGSLNYAITANNSVITFQSDGANWFITSIGVQGAGNGDVVGPSSSTDNALVRFDSTTGKLIQNSVATLTDTGTLDTANLTTDYIQIDTAATPPTVVEGTLAWNTTEGSLELGLRNGNVSNVLGEDLHVRVSNAEATTLNKGEVVYLFGATGNRASVKRASNTSDLTSAKTLGIVAESIGASQTGFVITQGVIDGLSLGAPYADGDILWLGSTAGTFTRTKPVQPNHLVFIGVIERANAGNGQIYVKPQNGYELNEIHDVLISSPANGQLLIRDETAGVWENAHLTAGSNITITNAAGAITIAASGGGVTDGDKGDITVSGSGATWTIDNTAVTYSKIQDVTNNRLLGRANAVNGTIQEISLGSNLSFSGTTLNATTFQKIITSGTAAPSGGIDGDIYLQYT
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 506 AA molecular weight: 52025,90710 Da isoelectric point: 4,55902 aromaticity: 0,05731 hydropathy: -0,01561
Domains
Domains [InterPro]
IPR045571
419–481
419–481
1
506
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
uncultured Caudovirales phage [NCBI] |
2100421 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
CAB4144760.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
LR796427.1
[NCBI]
CDS location
range 32390 -> 33910
strand -
strand -
CDS
TTGCCAGATTTACCAATAAGCGGATTACCAGCAGTTACCGAGCCAGCAGCAGGTGATTTATACGCTATTGTAAGTGGTGGTGTTACATCTAAGGTATCGAGAGCTAACAACTCTAAGATTATTACTGATAGCACTGCTAAGACAGCGAATTATACATTAACGGCTAATGATGAGGCTGTAAAGTTTGATACCAGTAGTGGTAGTCTAACGGTTTTCTTACCAACTGCAGTAGGCATTAAAGGTAAGTGGTATTCAGTTATTAAGGTTAGTGCTAGTAATACTTTAACAGTTGAGCCTGATGGTAGTGAGACTATCAATGGTTCTTTAAACTATGCCATTACAGCTAATAACAGCGTTATAACTTTTCAGAGTGATGGTGCTAATTGGTTTATAACTAGCATTGGTGTTCAAGGTGCTGGAAATGGTGATGTAGTAGGCCCTAGCAGCTCTACAGACAACGCTTTAGTCCGTTTTGACAGTACGACAGGCAAGTTAATTCAAAACAGCGTAGCAACGCTCACAGACACTGGTACGTTAGATACTGCAAATCTCACAACTGATTATATTCAAATTGATACAGCAGCAACTCCACCGACTGTTGTTGAGGGTACATTAGCTTGGAACACAACAGAAGGTTCTCTAGAATTAGGTTTAAGAAATGGCAATGTATCAAATGTACTTGGTGAAGATTTACATGTAAGAGTTTCAAATGCAGAAGCTACAACTTTAAACAAGGGTGAAGTAGTTTATTTGTTTGGCGCAACTGGGAATCGTGCTTCAGTCAAGAGAGCTTCTAATACAAGTGATTTAACGAGTGCAAAAACTTTAGGTATTGTAGCGGAGTCAATAGGAGCTAGTCAAACAGGCTTTGTTATAACTCAAGGTGTAATTGACGGCTTGAGTCTTGGGGCTCCTTATGCAGATGGAGATATTCTTTGGCTAGGTTCAACGGCTGGAACATTTACCAGAACAAAGCCAGTACAACCAAATCATTTAGTTTTCATTGGCGTAATAGAACGTGCTAATGCTGGCAATGGACAGATTTATGTCAAACCTCAAAACGGCTATGAGCTTAATGAAATTCATGATGTTTTGATTTCAAGTCCTGCTAACGGACAGTTATTGATTAGAGATGAGACTGCTGGAGTTTGGGAAAACGCACATTTGACGGCTGGTAGTAATATCACTATTACAAATGCAGCAGGAGCGATTACGATTGCTGCTAGTGGTGGTGGTGTTACAGATGGCGACAAAGGGGATATTACAGTCAGTGGCTCTGGTGCTACTTGGACGATTGATAATACTGCTGTTACTTATAGCAAAATTCAAGACGTAACAAACAACAGATTGCTAGGACGTGCAAACGCAGTTAATGGTACTATTCAAGAGATTTCACTTGGTAGCAATTTGAGTTTTAGCGGTACAACTTTAAACGCAACTACGTTTCAAAAGATTATAACTAGCGGGACAGCGGCTCCAAGCGGTGGAATTGACGGAGATATTTATTTACAATATACATAA
Tertiary structure
PDB ID
964ef82519f7cf1074278a43edf42226b1c29a6bd4a36f4d83f0f1e0d94b09c4
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50