Protein

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Genbank accession
YAL63835.1 [GenBank]
Protein name
L-shaped tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,76
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,54
Protein sequence
MADLAKIQFLRSTVAGKTPTTSQLADGELAINMADYAIYTKNGSSIVQLAGKGIPETNTKKLTVNGPSALNDTVTVAEGKTITFTNADLSGGMVRHITGKNALNDGWYIGSGGESNKGFLEIGTIDDGDEEIRFVSRGSGDTVRRTLKLIDSGGNTRVPGNIYIDEAMGGGGSAFISKNKAYFGAGGADIYMRNTAGGATNQLTITDGGELLFQAKPVYWDGRKPTLTELGIGRVENARQMQQDNWPITTGNETRWVKVALLKDPASGQSRLQLMVTNGGNYGSTRGSFDFIDCSARSMPSTLTAANIRSYLQIRRLGDPAMDDTNQMRYSLVRTSEGLELWFTQRSFIGSTKIALLSTAGVTEYYIPSGYTSQTTAPDGLIESKPIRIYDEMNKPSLDDGTDGILSVAKGGTGASTAAAARTNLGLGTAATRDVGTGSGQVMLVGAYGLGGKGTSYSIANARDFLKQLRTDGSQFMRNTLGTDINYGMGASFYSSVSDVHAVISVDWNTGRVKVGATNDTNLNSDTGRINFQELYGTAFKPTPDDVGAVARAGDTMSGDLTISKVSPGFHLNAESGNSVIWFKYKGVESGAVWALPNTASSGEVRIRARTSGGTTGGEFSFKSDGTFTSPGNINITSGAFNGKSVNTQYANFNNTSSTTTEQTVSISGSQHTPLLLNRPTNSNLSIGFKLSGMNMKRLGIDVNGDIRYGEAENQTQNAWLLTSDTINRWSVNFGRDINVAGVVNSTGGFTGPVTAYDLTGVTQDLDALTLNNAEPGHIKVYSCRSMGGGDNITNKPSGVGGNFIVIVECLRKVGDTDYTNRQVLRASDNKRSWERWFTVSGTAKAWTPWRMNVVSGNDDDVSFKSVTTTTGNLNSGNDLIVANNARVGGNLGLGGASSTTYTDKGVVIGNGSALLESTDGRMIIGSSGAGRAVELRPGGPTQTNNGIKVTATSGSGGDTAIEYAQGVKIRANNGGALIISAKAGQTIYLRPQGDTSSTNETRIDSSGNMIVNGNISANGNMSATGTLTVSGATTLNNTLTVNNVGAIEKRGIRTYTDGSVTVNETDGIRMRGNGTINGTMRLVERVNNTTFIGLQTSLDDTTNGWFEFHHTGKFKTNTIETNGNIVAVNGTIGAQGALTITAPSVDNGTDHIWFRNSDGSERGVIYMPGNNNLAGFRVRGVEWQFDSGSSQFIGPGARWRIHPDGNIQGDVYGGSGYITEYINNRFNQCAQWVRTGAQQDFGQIGRPAPGKTVPAGWVLVGLNANSNEANQNMQLIGGRLQVWKSGQEWVDSAT
Physico‐chemical
properties
protein length:1295 AA
molecular weight: 137050,25570 Da
isoelectric point:7,13309
aromaticity:0,07259
hydropathy:-0,36239

Tail Spike Domain Segmentation

Segmented into three structural domains: N-terminal, central, and C-terminal.

Domain layout
YAL63835.1
1 1295 aa
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 321 321 0,0505
Central domain 322 531 211 0,2801
C-terminal 532 1295 763 0,6253
N-terminal Central domain C-terminal

View these domains on the 3D structure via the Color by → Tail spike option in the Tertiary structure section below.

Taxonomy

Phage
Acinetobacter phage AbDIP2 [NCBI] · taxon 3411816
Viruses
Host
Acinetobacter sp. [NCBI] · taxon 472
cellular organisms Bacteria Pseudomonadati Pseudomonadota Gammaproteobacteria Moraxellales

Coding sequence (CDS)

Genbank protein accession
YAL63835.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PV126533.1 [NCBI]
CDS location
range 130729 -> 134616
strand -
CDS
ATGGCTGATTTAGCAAAAATTCAATTCCTACGTAGCACAGTTGCGGGGAAAACACCTACTACAAGTCAGCTTGCAGATGGTGAACTGGCGATCAACATGGCTGATTATGCCATTTACACGAAAAATGGTTCTTCGATCGTTCAGTTAGCGGGTAAAGGTATCCCAGAAACAAATACCAAAAAATTAACAGTAAATGGGCCTAGTGCTCTTAATGATACCGTTACCGTAGCGGAAGGTAAAACTATTACTTTCACCAACGCGGATTTGAGCGGGGGTATGGTTCGTCATATCACTGGTAAAAACGCGCTTAATGATGGTTGGTACATCGGTTCTGGTGGTGAGAGCAATAAAGGCTTTTTAGAAATCGGTACAATTGATGACGGTGATGAAGAGATCCGTTTCGTTTCCCGTGGTTCTGGTGATACTGTTCGCCGTACTCTGAAACTTATTGATTCCGGTGGTAACACTCGCGTACCAGGTAACATCTATATCGATGAAGCTATGGGCGGTGGTGGTTCTGCTTTTATTTCAAAAAATAAAGCATATTTTGGTGCTGGCGGCGCTGATATCTATATGCGTAACACGGCTGGCGGTGCGACAAATCAGTTAACGATTACTGATGGCGGTGAATTGCTGTTTCAAGCAAAACCTGTATACTGGGACGGTCGTAAACCGACTTTAACCGAATTGGGGATCGGGCGGGTTGAAAACGCGCGTCAAATGCAGCAAGACAATTGGCCTATAACTACAGGTAATGAAACCCGATGGGTTAAAGTTGCTCTTTTAAAAGATCCGGCATCCGGTCAGAGTCGCTTGCAACTGATGGTGACTAACGGCGGTAACTATGGTTCTACACGCGGATCGTTCGATTTTATCGATTGTTCTGCTCGTAGTATGCCTTCAACATTAACGGCTGCAAATATTCGTTCTTATCTGCAAATTCGTCGATTGGGCGATCCGGCAATGGATGACACTAACCAGATGCGTTATAGTTTGGTTCGCACATCCGAAGGTTTGGAATTGTGGTTTACTCAAAGATCGTTCATCGGTAGTACAAAAATTGCTCTGTTATCTACGGCTGGCGTGACTGAATATTATATTCCTAGTGGATATACATCACAAACAACCGCTCCGGATGGTTTGATCGAGAGTAAGCCTATTCGTATCTATGACGAAATGAACAAACCTAGCCTTGACGATGGTACTGATGGTATTCTGTCTGTTGCTAAAGGTGGTACAGGCGCAAGTACAGCGGCTGCTGCTCGCACAAACTTAGGTTTGGGTACTGCTGCAACCCGTGATGTTGGTACAGGTTCCGGACAAGTAATGCTTGTTGGTGCTTACGGTTTAGGCGGTAAGGGTACATCATATAGCATCGCAAATGCTCGCGACTTCCTGAAACAACTGCGTACTGATGGTTCTCAGTTCATGCGAAATACGCTTGGTACTGACATTAACTATGGTATGGGCGCAAGTTTTTATAGTTCCGTATCAGATGTTCATGCAGTGATCTCGGTTGATTGGAATACTGGTCGCGTTAAAGTTGGTGCAACTAATGATACTAACCTTAACTCAGATACAGGAAGAATCAACTTCCAGGAACTGTACGGTACTGCATTTAAACCGACTCCGGATGACGTAGGGGCTGTTGCACGTGCTGGTGATACGATGTCTGGTGATCTGACGATCTCTAAAGTGTCGCCTGGTTTCCATTTGAATGCTGAGAGCGGAAACTCCGTAATTTGGTTTAAGTATAAAGGGGTTGAAAGTGGTGCTGTGTGGGCGTTGCCTAATACTGCCTCTTCTGGTGAAGTTCGCATTCGTGCCAGAACGTCGGGCGGAACGACTGGGGGCGAATTCTCATTTAAATCAGACGGTACATTTACATCACCTGGTAATATCAATATTACTAGCGGCGCTTTCAACGGTAAAAGTGTCAATACTCAGTATGCGAACTTTAATAACACAAGTTCAACAACAACCGAACAAACCGTTTCTATTAGTGGTTCGCAGCACACTCCTCTGTTACTGAATAGACCGACTAACTCGAACTTGTCTATCGGGTTTAAACTTTCCGGAATGAACATGAAACGTTTGGGTATCGATGTAAACGGTGATATTCGTTACGGTGAAGCCGAAAACCAGACACAAAACGCATGGCTGTTGACTTCGGATACCATAAACAGATGGAGTGTTAACTTCGGGCGTGATATTAACGTTGCAGGTGTAGTTAATTCAACTGGTGGATTTACTGGCCCTGTTACTGCATATGATTTGACCGGGGTAACTCAGGATCTTGATGCTTTAACATTGAACAATGCCGAACCAGGACATATTAAAGTTTATTCGTGCCGTAGTATGGGTGGCGGTGATAACATCACCAATAAACCTTCCGGCGTAGGTGGTAACTTTATTGTTATCGTTGAATGTCTCCGTAAAGTCGGCGATACTGATTACACTAACCGTCAAGTATTACGCGCATCGGACAATAAACGCAGTTGGGAACGTTGGTTTACTGTTAGCGGTACTGCTAAAGCCTGGACACCGTGGAGAATGAACGTTGTTAGCGGAAACGATGACGATGTATCATTTAAATCTGTTACCACAACTACAGGAAACCTGAACAGTGGAAACGATCTGATTGTTGCGAACAACGCTCGCGTAGGTGGCAACTTAGGGTTAGGTGGTGCTTCTTCCACGACATACACTGATAAAGGTGTTGTGATTGGTAACGGTAGTGCGCTGTTAGAATCCACTGATGGTCGCATGATTATTGGTAGTTCTGGTGCTGGTCGTGCTGTTGAATTGCGTCCTGGTGGCCCAACTCAAACCAACAACGGGATCAAAGTGACTGCTACCTCTGGAAGTGGTGGTGATACTGCGATCGAGTATGCGCAAGGGGTGAAAATCCGGGCAAATAACGGTGGTGCGTTGATTATTTCTGCTAAAGCTGGACAAACGATTTATCTACGTCCTCAAGGAGATACATCCAGCACAAACGAAACAAGGATTGATTCTAGTGGTAACATGATAGTTAATGGTAATATCAGTGCAAACGGAAATATGTCTGCTACTGGTACGTTAACTGTTTCTGGTGCTACTACATTAAACAACACATTAACGGTTAATAACGTAGGGGCAATCGAGAAACGGGGAATCAGGACGTATACAGACGGTTCTGTTACTGTCAACGAAACTGACGGTATTCGAATGCGTGGTAATGGAACTATTAATGGCACGATGCGATTAGTTGAGAGAGTGAATAACACTACTTTCATCGGTTTGCAAACTTCCCTTGATGATACTACAAACGGTTGGTTTGAATTCCATCATACAGGAAAATTCAAAACAAACACTATTGAAACTAATGGTAATATCGTTGCTGTTAATGGTACGATAGGTGCTCAGGGTGCATTGACTATTACGGCTCCTTCTGTTGATAACGGTACTGACCATATTTGGTTCCGTAACTCTGACGGTTCTGAACGCGGTGTTATCTATATGCCGGGTAATAACAACTTAGCAGGTTTCCGTGTTCGTGGCGTGGAATGGCAATTTGATAGTGGTTCTAGTCAATTCATCGGCCCTGGTGCTCGCTGGCGTATTCATCCAGATGGTAATATTCAGGGTGATGTGTACGGTGGCAGTGGATATATCACAGAATATATCAACAACCGATTTAACCAGTGTGCTCAATGGGTTCGTACTGGCGCACAACAGGACTTTGGACAAATTGGCCGACCTGCTCCTGGTAAAACTGTTCCTGCTGGTTGGGTTCTGGTTGGTCTTAACGCCAACAGCAACGAAGCTAACCAGAACATGCAATTAATCGGTGGTCGTTTGCAGGTATGGAAATCTGGTCAAGAATGGGTTGATTCCGCAACTTGA

Genome Context

Tertiary structure

YAL63835.1
ColabFold structure
Source ColabFold
pLDDT 73.9
Oligomeric state monomer
Download structure