Protein

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Genbank accession
YP_006201094.1 [GenBank]
Protein name
neck passage structure protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,34
Protein sequence
MSLDNFRNRAIVWDTVNKDFPQPIQIMQGDVNARTLSVKIIDNGGEIDLTGHSLKLTYQYTNSSNSGFVMIPPENLTKGEFILVIPTEMTKAGVIEANLILLNEDKEQVIVSKNLTFISDNSTVTDLAQEVNNKIDDFTKLLLENMPQVMRSELNDLHAQTESNKSNIELKANQADLDNLRATVDKQGVAISTKAEQTDLNNLRATVDKQGVAISTKADKSEIYEKIKILDEKIPINKFKDGQKDFSLYTSPSENSLYVINKPLSSGSIIAHVSSNKDQAGSILIVKKNGLTFTILSKKNINLTAGHNTVDMDYTVSGDGTEYLATVGVINFKPNSRPGFYQIAYGSNVGNVGDTFETVDHTDMAIDLGVYAEYKGQLEIIHDDLLNRIEKCNSLLSLTSLTNFLLPRYTQITEPVGFVGRWFDSTISGTNVKSTINQGSELYFKVKNTTSINVNFIVNTAYETPYFAYSIDGADMTRQLVTSPTLPTVSLDEHIIRVVVDGVTESEDKWIGEKGFAFKDITVDSTGTVTGVLPKNKKIMFFGDSITEGIRVLNMNANSDGNSATGAFPYIASTNLNAISYRVGFGGAGVTKSGNGGVPSLINFIDNMTKNKLAPYYEPDVIVVNMGTNDIDAATDVFKSQYTAVINRLLIKYSGTPLFIMVPFNGARKSEITDITNNKKGVYMVDTNGWDISTTDGLHPDVAGSIKAGTKLSDYIISTLGRNYFI
Physico‐chemical
properties
protein length:726 AA
molecular weight: 79629,97550 Da
isoelectric point:5,10871
aromaticity:0,07989
hydropathy:-0,20895

Taxonomy

Phage
Lactococcus phage ASCC191 [NCBI] · taxon 2892347
Viruses Duplodnaviria Heunggongvirae Uroviricota Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Genbank protein accession
YP_006201094.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_017688 [NCBI]
CDS location
range 7090 -> 9270
strand +
CDS
ATGAGTTTAGATAATTTTAGAAATAGAGCGATTGTATGGGATACGGTCAATAAAGACTTCCCACAACCAATTCAAATAATGCAAGGCGACGTCAACGCTAGAACATTGTCAGTTAAAATAATTGATAATGGAGGCGAAATTGATTTGACGGGTCATTCATTAAAACTTACATATCAATATACTAATAGCAGTAATTCAGGCTTTGTTATGATTCCTCCTGAAAACTTAACTAAAGGAGAGTTTATTTTGGTAATTCCTACTGAAATGACAAAAGCCGGAGTTATTGAAGCGAACTTAATACTTCTCAATGAAGATAAAGAGCAGGTTATCGTCAGTAAGAACCTTACATTTATATCAGATAATTCTACAGTTACAGACTTAGCTCAAGAAGTAAATAATAAGATTGATGATTTCACTAAATTATTATTGGAAAATATGCCACAAGTAATGCGTAGTGAGTTGAATGACTTACATGCTCAAACTGAATCAAACAAGAGCAATATTGAGCTTAAAGCCAATCAAGCGGATTTAGACAACTTACGAGCTACTGTTGATAAACAAGGTGTTGCGATTTCAACAAAAGCTGAACAAACAGACTTGAACAACTTACGAGCTACTGTTGATAAACAAGGTGTTGCGATTTCAACAAAAGCAGATAAATCAGAAATTTATGAAAAAATAAAGATATTAGATGAAAAAATTCCTATTAATAAGTTCAAAGATGGTCAAAAAGATTTTTCTTTGTATACATCACCTAGTGAAAACTCATTATATGTTATTAATAAGCCTTTATCATCTGGTAGTATCATTGCTCATGTTAGTTCAAATAAAGATCAAGCAGGTTCAATTTTAATCGTCAAAAAAAACGGTTTAACTTTTACAATATTATCCAAAAAAAATATCAATTTAACAGCAGGACATAACACCGTTGATATGGATTATACTGTATCAGGAGACGGGACTGAATATCTTGCTACGGTTGGTGTTATCAACTTTAAGCCGAACAGCAGGCCAGGATTTTATCAAATTGCTTATGGCTCTAACGTTGGTAATGTTGGAGACACTTTTGAAACAGTTGATCACACGGACATGGCCATTGATTTGGGTGTCTATGCTGAATATAAAGGTCAATTAGAAATAATTCATGATGACTTATTAAACCGTATTGAAAAATGTAATTCATTATTATCTTTAACATCTTTAACAAATTTCTTGCTTCCTAGATACACACAAATAACTGAACCAGTTGGTTTTGTTGGCCGGTGGTTCGATTCAACAATTAGTGGCACGAATGTTAAATCAACAATCAATCAAGGTTCGGAGTTATATTTTAAAGTAAAAAATACAACTTCTATTAACGTCAACTTTATTGTTAATACCGCTTATGAAACGCCTTACTTTGCTTATTCAATTGATGGTGCTGACATGACACGACAATTAGTTACGTCACCAACACTTCCCACAGTGTCATTAGACGAACACATTATCAGAGTTGTTGTTGATGGTGTAACCGAATCAGAAGATAAATGGATTGGTGAGAAGGGGTTCGCGTTTAAAGATATTACAGTTGACAGTACAGGCACTGTTACTGGAGTATTACCGAAAAATAAAAAAATTATGTTCTTCGGTGATAGTATAACAGAAGGCATTCGGGTCCTAAACATGAACGCTAATTCTGATGGTAATAGCGCGACAGGCGCATTCCCATATATTGCAAGCACTAATTTAAATGCTATCTCTTATCGTGTTGGCTTTGGCGGCGCTGGTGTTACTAAGAGCGGCAACGGCGGTGTTCCTTCATTGATTAACTTTATTGATAATATGACTAAAAATAAATTAGCGCCTTATTATGAACCTGATGTTATTGTCGTTAATATGGGAACAAATGATATCGACGCGGCTACTGACGTATTTAAATCACAATATACAGCCGTTATTAATAGATTATTGATTAAATATAGCGGTACACCATTATTTATTATGGTGCCATTTAACGGTGCTAGAAAAAGTGAAATAACAGATATAACTAATAATAAAAAAGGTGTCTACATGGTTGACACTAATGGGTGGGATATTTCAACAACAGATGGTCTTCACCCTGACGTTGCAGGTAGCATAAAAGCTGGTACTAAATTATCAGATTATATTATTAGCACTTTAGGTAGAAATTATTTTATTTAG

Genome Context

Tertiary structure

YP_006201094.1
ESMFold structure
Source ESMFold
pLDDT 78.8
Oligomeric state monomer
Download structure