Protein

View in Explore
Genbank accession
YP_009874603.1 [GenBank]
Protein name
neck passage structure
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,72
Protein sequence
MEGDVNARTLLIKIVDNGTEIDLTGHSLRLTYQYTNDSNSGFIVIPPKNLATGEFILVIPTEMTKPGVIEANLILINENEEQVVVSKNLTFISDNSTVSDLVQEVNNKIDDFAKLLFKKMPQVLRSELNDLHAQTESNKSNIDLKANLADMTSLQNAMTELKNEVEAFGISPKNLVTIKSLLDAIASSASESEVVELINSVKVLTSNISLMSNGDYSPKANQTDLESLQHTVNNQSAIVSTKANQTDLDNLQAKVDKTETDVKTAITKATEAQTNSLPLNGNAVSASKLETARKLRVNLQTSAFQNFDGTADATNIGVVGALPIANGGTGNSSAYAYGLNSNGNTTDFSAGMKIYTRAVNTNQANMFILQSVWAKNAPAPGVYVVICSVTKYNANGNVSMTALANGTIYTAVVPYVYTEPTTTTPAIYTTTATPNWVKILDTNGKGVDYAQAQPVGSVVSNVSDSTSGYSAGKWENIGSAVIDSTTVYYWKRTA
Physico‐chemical
properties
protein length:494 AA
molecular weight: 52944,65980 Da
isoelectric point:4,89545
aromaticity:0,06073
hydropathy:-0,18300

Taxonomy

Phage
Lactococcus phage 936 group phage PhiB1127 [NCBI] · taxon 1636573
Viruses Duplodnaviria Heunggongvirae Uroviricota Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Genbank protein accession
YP_009874603.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_049355 [NCBI]
CDS location
range 6950 -> 8434
strand +
CDS
ATGGAGGGTGATGTCAATGCTAGAACGTTATTAATTAAAATAGTTGATAACGGAACTGAAATTGATTTAACTGGTCATTCTTTAAGGCTTACATATCAATATACTAACGATAGCAATTCAGGTTTTATTGTCATTCCTCCTAAGAACTTGGCTACTGGAGAGTTTATTTTGGTAATTCCTACTGAAATGACAAAACCTGGAGTTATTGAAGCTAACTTGATTCTTATTAATGAAAATGAAGAGCAAGTTGTTGTCAGCAAAAATTTAACATTCATATCAGATAATTCTACGGTTAGTGATTTAGTTCAAGAAGTAAATAATAAGATTGATGATTTTGCAAAATTATTATTCAAAAAGATGCCACAAGTTTTGCGTAGTGAGTTGAATGATTTACATGCTCAAACTGAATCAAATAAGAGTAATATTGATCTTAAAGCAAATTTAGCTGATATGACTAGCTTACAAAATGCAATGACAGAGCTAAAAAATGAAGTAGAAGCATTTGGTATCAGTCCTAAAAATTTAGTTACTATAAAATCACTATTAGACGCAATTGCAAGTAGTGCCAGTGAATCTGAAGTAGTTGAACTAATAAATTCAGTAAAGGTTTTAACAAGTAATATTTCTTTAATGAGTAACGGAGATTACTCTCCTAAAGCTAATCAAACGGACTTAGAAAGTTTACAGCATACTGTTAATAATCAATCAGCAATTGTTTCAACAAAAGCCAATCAAACGGACTTGGATAACTTACAAGCAAAGGTAGATAAAACCGAAACTGATGTAAAAACTGCAATAACAAAGGCAACTGAAGCACAAACGAACAGTTTACCACTTAATGGCAATGCGGTCAGTGCAAGCAAACTGGAAACAGCTAGAAAACTTAGGGTAAATCTTCAAACTTCGGCATTTCAAAACTTTGATGGGACTGCTGACGCAACTAATATTGGTGTTGTAGGGGCGCTTCCTATTGCAAATGGAGGTACTGGTAACTCAAGCGCTTATGCTTATGGTTTAAATTCCAATGGTAATACAACTGATTTTAGTGCTGGAATGAAGATTTATACTAGAGCTGTCAACACAAATCAAGCTAATATGTTTATATTGCAATCTGTATGGGCTAAAAATGCACCGGCACCTGGAGTGTATGTAGTAATTTGTAGCGTCACAAAGTATAATGCTAATGGAAATGTGAGCATGACTGCTCTAGCAAATGGAACAATTTATACTGCGGTGGTTCCTTATGTTTATACTGAGCCAACTACAACTACTCCAGCCATTTATACTACTACGGCTACACCAAATTGGGTTAAAATTTTGGATACAAATGGAAAAGGCGTTGACTATGCTCAAGCTCAACCAGTTGGTTCCGTGGTATCAAACGTTTCAGACTCAACATCAGGGTATTCCGCAGGAAAGTGGGAAAATATCGGTTCAGCAGTAATCGATTCAACAACAGTTTATTATTGGAAACGTACTGCGTAA

Genome Context

Tertiary structure

YP_009874603.1
ESMFold structure
Source ESMFold
pLDDT 62.2
Oligomeric state monomer
Download structure