Protein

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Genbank accession
AIK67888.1 [GenBank]
Protein name
putative tail fiber protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,90
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MADYKLSQLNSIDTIRSEDLLHIRVKKRPEMLGDEDRRMTYQDFLASFKLERFVQIAGSTMTGDLGIVKLLYGGKAVFDPTGSSEITIGDILKTFKINSNGLKLTIADATRSATVYHTLNKPSPNELGMRTNEENDARYARLAVTNNFSIRQAIITDGEQLTLKKATNAGASYIQGRDANNQQTWYVGQGNANSTNVYLYNHATGAMLTLDATAAFNKSLRITGQVQPSDFSNLDARYFTQTVANQRFAQLAANNNFTGTNTFSRNLLIISDSAALRLKNATASSLFIQGVDSQNTNRWYVGNGDNTASVLLHNYVHGSNIRLDNGYISVNQNFRITGQVQPSDWANIDSRYIPAATLNNLAKINAKNTFSQGQIIKVDGEVIRLQGVNDTGGLFLQGYTSDGTKKWFMGTNASGNFTIREMVLGTELSLRENYIQFNKNVTINGQVQPQDWANIDGRYYNKSSADSRYLRVRSTNFNTSNVEKWAKIATVTMRQATSTAVIELFGGSGFNYGAYNQACKTEIVIRAGNNSPKGLNVVAWKNSPNGVVMEIGHVNTSGDNYDIYLKAGPYQNATTARVQSSSNATVQLFETPETSDSAPSGYVAGTIAYYYTSLLKPTPSDIGAYTKAETDQKIADAISDSTDLNKIYPVGIVTWFNSNVNPNTALPGLTWTYLNNGVGRTIRIAAANGSDVATTGGSDSVTLSVGNLPSHTHSFSATTSSFDYGTKTSSTTGNHNHNRGTMEITGSFGYFRSDASSFYTASGAFYLGSQAGSKGYTGNNFTNGIPVNFNASRNWSGVTNTTGNHSHTVGIGAHSHTVSGNTGGTGSGSAFSVTNQFYKLMAWVRTA
Physico‐chemical
properties
protein length:847 AA
molecular weight: 91852,48060 Da
isoelectric point:9,12745
aromaticity:0,09681
hydropathy:-0,40165

Domains

Domains [InterPro]
G3DSA:6.20.80.10
157–218
G3DSA:6.20.80.10 G3DSA:6.20.80.10 IPR048388
IPR048388
158–247
IPR048388 IPR048388
AIK67888.1
1 847
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage HY02
[NCBI] 		1527531 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Escherichia coli O157:H7
[NCBI] 		83334 Bacteria > Proteobacteria > Gammaproteobacteria > Enterobacteriales > Enterobacteriaceae > Escherichia

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AIK67888.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KM092515 [NCBI]
CDS location
range 51111 -> 53654
strand +
CDS
ATGGCAGATTACAAATTGAGTCAATTAAACTCAATCGACACAATTCGTTCAGAAGACCTATTGCACATCAGAGTTAAGAAAAGACCTGAAATGCTGGGTGATGAAGACCGTAGAATGACCTATCAAGACTTCTTAGCTTCCTTCAAACTAGAAAGGTTTGTTCAGATTGCTGGGAGTACTATGACGGGAGACTTAGGTATTGTCAAGTTACTTTACGGTGGCAAGGCTGTATTTGACCCTACAGGCTCTTCTGAGATTACTATTGGGGATATTTTAAAGACTTTTAAAATTAACTCAAATGGTCTTAAACTCACTATTGCAGATGCCACAAGGTCGGCAACTGTTTATCATACTTTGAATAAACCAAGTCCTAATGAACTTGGCATGAGAACTAATGAAGAGAATGATGCAAGATATGCAAGGCTTGCTGTTACAAATAACTTCAGTATTAGGCAAGCAATTATAACTGATGGTGAGCAGTTAACTCTTAAGAAGGCAACCAATGCAGGTGCTTCATATATTCAAGGTAGAGATGCTAATAACCAGCAAACTTGGTATGTTGGACAGGGAAATGCAAACAGTACTAATGTTTATTTGTACAATCATGCTACTGGTGCAATGTTGACCCTTGATGCAACAGCAGCATTTAACAAGTCACTTAGAATCACTGGTCAAGTTCAACCTTCGGATTTCTCTAACTTAGATGCTAGGTACTTCACTCAGACAGTCGCTAATCAGAGATTTGCACAGTTAGCTGCTAATAATAATTTTACTGGAACAAACACGTTTAGTAGAAACCTACTTATCATCAGTGACAGTGCTGCTTTAAGGTTGAAAAATGCAACAGCTAGCTCACTATTCATTCAGGGTGTTGACTCCCAGAATACTAACAGGTGGTATGTAGGAAACGGGGATAACACAGCCTCTGTGCTGCTACACAACTATGTACACGGCTCAAATATCAGGCTTGATAATGGTTATATCTCAGTCAACCAGAACTTCAGAATCACTGGTCAAGTTCAACCTTCAGATTGGGCTAACATTGACTCTAGATATATTCCAGCAGCTACTTTGAATAATCTTGCTAAGATTAATGCTAAGAATACTTTTTCTCAAGGTCAGATTATTAAGGTTGACGGAGAGGTTATTAGACTTCAGGGGGTAAATGATACTGGTGGTTTGTTCTTGCAAGGTTATACTTCTGATGGTACTAAGAAGTGGTTTATGGGTACTAATGCTTCAGGCAACTTTACTATCAGGGAGATGGTGTTAGGTACTGAACTGTCTCTTAGAGAGAACTATATCCAGTTCAATAAGAATGTAACAATTAATGGGCAGGTTCAACCACAAGATTGGGCTAACATTGATGGGAGATACTACAACAAATCATCTGCTGATAGTAGATATCTGAGGGTAAGAAGCACTAACTTTAACACTAGTAATGTGGAGAAATGGGCTAAGATTGCAACTGTTACTATGCGGCAGGCAACATCGACAGCGGTAATTGAGTTGTTTGGTGGGTCTGGGTTCAACTATGGTGCATATAACCAAGCATGTAAAACAGAGATTGTTATTAGAGCAGGGAATAATAGTCCAAAAGGCTTAAATGTTGTTGCATGGAAAAACTCACCGAATGGTGTTGTGATGGAAATTGGGCATGTTAATACATCTGGTGATAATTATGACATCTACTTAAAAGCTGGTCCCTACCAAAATGCTACGACAGCTAGGGTTCAGTCATCATCTAATGCAACAGTGCAGTTGTTTGAGACTCCAGAGACATCTGACAGTGCTCCATCTGGCTATGTTGCTGGGACAATTGCTTATTATTATACTAGTCTCTTGAAACCAACCCCTTCAGATATTGGTGCATACACTAAAGCAGAGACTGACCAGAAGATTGCAGATGCAATTAGTGACTCTACAGACCTGAATAAAATCTATCCAGTAGGTATTGTGACGTGGTTTAACAGTAATGTCAACCCAAACACAGCACTTCCTGGGTTAACTTGGACGTACCTGAATAATGGTGTTGGTAGAACTATTAGAATTGCAGCAGCAAACGGTTCAGATGTTGCTACAACTGGTGGTTCAGACTCTGTAACGTTGTCTGTTGGTAACTTACCTTCACACACGCACAGCTTCTCTGCTACTACTTCATCATTTGACTATGGTACTAAGACTTCTAGCACAACTGGTAACCACAACCACAACAGAGGTACTATGGAGATTACTGGTTCATTTGGTTACTTCAGAAGTGACGCTAGTAGCTTCTACACAGCAAGTGGTGCATTCTACCTCGGTAGTCAGGCAGGTTCTAAAGGGTATACTGGTAACAACTTTACTAATGGTATCCCTGTCAACTTCAACGCATCAAGAAACTGGTCTGGTGTAACGAATACAACAGGTAACCACAGCCACACTGTTGGTATTGGTGCTCACAGCCACACAGTTAGCGGTAACACAGGTGGTACTGGTTCTGGTTCAGCATTTAGTGTTACTAACCAGTTCTATAAGTTAATGGCTTGGGTAAGAACTGCTTAA

Tertiary structure

PDB ID
656cab81a55e3ae1daacf76dea907afd89ed2899a6959891ff5aad048dd5c5d6
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,6623
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Complete Genome Sequence of E. coli O157:H7 Bacteriophage HY02 Lee,J.-H., Lee,D.H., Lee,H., Park,E.A. and Ryu,S. 2016-12-29 — GenBank