Protein
View in Explore- Genbank accession
- BAW85693.1 [GenBank]
- Protein name
- S1-3
- RBP type
-
TSPTSPTSPTFTSP
- Protein sequence
-
MSTELTQAKGSTSRYTSRKSCAIEFNTKIDEVQYISVGLDTSTIKVFIDNNTQIPYVGNFINGNVISWVSDPVKCILTTSSGTYTLFSYGLTKNIPNLLDYDSDSATDDSTRFKKAILAGTESLYIPPREIYKDVMIGELDITSTLRLWGDSGSNINTGGSTIKKIASASYGIHFNGTGQTTRPMGGGLFNLQVRGESSTDTGPLIKVTSWSYMRINNCAIQNISDWGIIARDMMESSCEYTLFRRIGSDTTGILLMDDYIGTPNSNVNNFHFSNNTLGYSSGNWIKSSTNSNPDLIWIERNKFEWDGTPTSANITPKAVIDFGQMSRCRITNNGFTHFTTDHNNYEGILRMRSGCAYLTKLIDNDALSCSGYFGSVEGGKLQASGNFYNRGVVASGNMQFNVTSTRPQSIEPVICFTSNGNITSVGDYIDPNFISAHNMFGTSNNMFQTDTMASLYTTMNVPSLVEIRRFQLGKQYLDSNTVLTIQARVKCVDTAGTNGELKLNIDGTTDIGSSTITASTGWQLITFQLKPSQIGAGSLRFINSGTVSILFDGIYIQRSKYIDWNFAFNPGAIAAGASITSALQSYTDTIGVTGLIQSFSQPKFDGNINGLLCSVVSNNINGSFYVTLYNPTASPITPTITRCYIRLFLI
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 651 AA molecular weight: 71222,15660 Da isoelectric point: 6,03382 aromaticity: 0,10138 hydropathy: -0,16467
Domains
Domains [InterPro]
G3DSA:3.30.2020.50
1–94
1–94
1
651
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Klebsiella phage K64-1 [NCBI] |
1439894 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host |
Klebsiella pneumoniae [NCBI] |
573 | Bacteria > Proteobacteria > Gammaproteobacteria > Enterobacteriales > Enterobacteriaceae > Klebsiella |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
BAW85693.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
LC121099.1
[NCBI]
CDS location
range 1 -> 1956
strand +
strand +
CDS
ATGTCTACTGAATTAACACAAGCAAAAGGTTCAACATCAAGATACACATCTAGAAAATCATGTGCAATTGAATTTAATACTAAAATAGATGAAGTACAATATATTAGTGTTGGACTTGATACATCCACCATAAAAGTTTTTATTGATAATAATACACAAATACCATATGTCGGAAATTTTATTAATGGTAATGTGATTTCATGGGTTTCAGATCCAGTAAAATGTATATTAACAACATCAAGTGGGACATATACTCTATTTTCATATGGTTTAACTAAAAATATACCAAATTTATTAGATTATGATTCAGATTCAGCTACGGATGATAGCACTAGATTTAAAAAAGCTATTTTAGCTGGGACAGAATCTTTATATATTCCTCCTCGTGAAATTTATAAAGATGTTATGATAGGTGAATTAGATATTACATCTACATTACGTTTGTGGGGAGATTCTGGTTCTAATATTAATACGGGCGGCAGTACTATTAAAAAAATAGCATCAGCAAGTTATGGTATACATTTTAATGGTACTGGTCAAACTACAAGGCCAATGGGTGGTGGTTTATTTAATTTACAAGTTCGAGGTGAATCAAGTACTGATACTGGACCTTTAATTAAAGTTACTTCGTGGTCGTATATGAGAATCAATAATTGTGCTATTCAAAATATATCTGACTGGGGAATTATTGCTCGTGATATGATGGAATCATCATGTGAATATACATTATTCAGAAGAATAGGTAGTGATACTACTGGTATTTTATTAATGGATGATTATATTGGAACTCCAAATAGTAATGTAAATAATTTTCATTTTTCTAATAATACATTAGGTTATAGTAGTGGGAATTGGATTAAATCATCAACTAATTCAAATCCAGATTTAATATGGATTGAACGTAATAAGTTCGAATGGGATGGTACACCAACAAGTGCTAATATTACCCCTAAAGCGGTTATTGACTTTGGGCAAATGTCAAGATGTAGAATAACAAATAATGGTTTTACACATTTCACAACTGATCATAATAATTATGAAGGCATATTACGTATGCGTTCGGGATGTGCTTATCTTACTAAATTAATTGATAATGACGCATTATCTTGTTCTGGATATTTTGGTTCAGTTGAAGGTGGAAAATTACAAGCATCTGGAAATTTTTATAATAGAGGTGTGGTCGCCAGCGGTAATATGCAATTTAATGTTACAAGTACTAGACCGCAAAGTATAGAGCCTGTTATTTGTTTTACTAGTAATGGAAACATAACATCTGTTGGTGATTATATTGATCCAAATTTTATTTCAGCACATAACATGTTTGGTACTAGTAATAATATGTTTCAAACTGACACCATGGCATCATTGTACACGACAATGAATGTACCATCATTGGTTGAAATTAGAAGATTTCAATTGGGTAAACAATATTTAGATTCTAACACAGTATTGACAATTCAAGCTCGTGTAAAATGTGTAGATACTGCTGGAACTAATGGTGAATTAAAATTAAATATTGATGGTACGACTGATATTGGTTCTAGTACTATAACAGCATCTACTGGTTGGCAACTTATAACATTTCAGTTAAAACCATCACAAATTGGAGCAGGAAGTTTACGTTTCATAAATTCAGGTACCGTTTCTATATTATTTGATGGCATATATATACAACGTTCAAAATATATTGATTGGAACTTTGCATTTAATCCAGGGGCTATTGCCGCTGGTGCATCCATCACATCTGCATTACAAAGTTACACTGATACGATTGGTGTCACTGGTTTAATACAATCATTTTCACAACCTAAATTTGATGGAAATATTAATGGTTTACTATGTTCAGTTGTTTCTAATAATATTAATGGCTCTTTTTATGTAACATTATATAATCCAACAGCATCACCAATAACACCAACAATAACAAGATGTTATATTAGACTATTTTTAATATAA
DepoCatalog
K-type Target
Number of Rings
11
Structural Classification
Domain Ranges
N-terminal Domain
1-104
Central Domain
105-420
C-terminal Domain
421-651
Experimentally Tested K-types
Phage Morphotype
Tertiary structure
1 / 2
PDB ID
Literature
| Title | Authors | Date | PMID | Source |
|---|---|---|---|---|
| Klebsiella Phage ΦK64-1 Encodes Multiple Depolymerases for Multiple Host Capsular Types | Pan, Yi-Jiun; Lin, Tzu-Lung; Chen, Ching-Ching; Tsai, Yun-Ting; Cheng, Yi-Hsiang; Chen, Yi-Yin; Hsieh, Pei-Fang; Lin, Yi-Tsung; Wang, Jin-Town | 2017-01-01 | — | 10.1128/jvi.02457-16 |