Genbank accession
ASV43935.1 [GenBank]
Protein name
central tail fiber J
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,80
Protein sequence
MTVVKTSTGVFVSGAGGGGGGSNDANTLFSTDAFEMVIGLSEGPIHGLEGETVKEQLANLFVNDVPVMSQAGTMNFQDSDFVIRYESGLPLTDQEDPERGQSPIRYMLGGQATPNNVSAELLPSVEIIRTIPNAITGQYDRVEVRLLINQLYKATKKGTKVDTLPMRLRWRYAGETSWKSIFQGYISGKTTVGGYVKAYSFAVDDKTRQVEISVTNTHSPNVDDEEHVHSVSWLNYETEKVITDENPEYHPNTAMLHVVGLIGNEITQLPIISGVWKGMVCSVPSNYDPITREYSENSPWDGEFATQKVWTDNPFWIAYELITNPNFGLYRYNPRIRVNRYSFYALAKDADELVEGSTGEFTPRYTFNALLADKQDGLDLINYILGSAQSRLIDGQNGELVLVSDRNTPAVATITPEQCLADENEVVFNYTHTDIKDRINEVVTSYIDENLSWERQTIGPFSDIESQNKYGVNTEEYDSIGCIYPDEVKRKAYLRLIGYQTETMSVTFRVPANSAVLQLFDIINIVDPDQNWGISGRVRSYDTHSLTLRDPLYFEEINNYRVVIPLKTGGEFEAYINIPSVGFHSELNLASYTLPEGGSTPSSFPEGLATHTPFSIQRSGSEPGLAKPFRILSVRASDENNSTFTITAIEVNRNKWAAADNLELVGSPQYSFKMPPIPEKPKNVTLLKQEFETVDEKTKINLWLGWDEPIETFLGHYYEVSLKRNAVDLGVVVKSSTNIVEIPELDFGDYEITVAMVFNGQKEYSDVFRWEVKYLSFLEGEYAPERLETSLEASYNGTDLYLTFGAWYSYNQGSTLSLSDIITNKEIKHAQIDIRTNVEGEPRRLLKTIETTQRDAVFTGKEHLEANPDGYVAELRLELTLIDLQGNPSPVFVKELMADNIPDVTGIVVDATYKAVSAAPLFDEMDTNQVDVEWYILEVPESGLGDVDFSSAILVETAPKLLDYIHVDNQKQYCIWAKSISEFWQSSLYPAANAPVADLVVFEVPIFPLEELAGEITDIGLAQLSEDAQTLIEDINNQVDRLRPDTEDNIPDVLARTVNELNLERQARTDIEQGVFDLSAEYTNWRQNYEQRQLGNERLIDAAVYIDPESGTIVNRAFAYTDEAFSEANVLIDGVNASIELQANRITGTNERLTQAESTLTVQAGQINQRATFTEMRTEIAGAIEALTPAYSWHFNHNTEGFSGDVAHNPQGFLVITGVANAAAITYEAEENPMLRLRVRKHADLPWLGNLYFGADEFLVNVLEPESENWETTQIDLTGIEGYTGTITALKIDLGHVDIDFIEIGKRGANDLALNDITTRATILENDIDAATGIMAQYATTTWVNELGYQTQSNVNAVIDSFNTTYQISATLQEFNDNGTLEKANNAQQFINGAEAYITSQITAFNAAENGVDAKFANVDQTLDAINGTISQSIVQVQGLELDLQDANLNDVIAEANQLLLGHDLAQQDVKVALAQSKLTAHTTEIESLASFTLDLQAWFNDSQAAFSELVTTVANDQQALVTVEQNLQAKITNDTNAALASAQEYTRTAVGYCVDAEGNITSEKDAIQCVTDGGSWVDGPLAEYISNLQISDGESTASIKELKQVFKKVNGELVARGGWVLDNNGRAVSVAGYNDGETGNLDLVADVIRQGVMVGNTFVPTSYIDNTDPANPVHTFKGRMVLGDGTAIENAADIQAQGGGRGGVYYVGTSTGAWSDSTANSAVPDNTPIKGDVVNIYKTSNPNVNTTKKYTGSAWESYALEVNGAIFATGSIDGNAFRAGTRIESPRIDLIGGAFMKVEYAAGFGPNNLWYWYGPKILNNGMPDLNLLTKSNATEWKDTTGNSYFGGSIVAGTYSTALTTTDLSADAFVEIGPFGSNGGVINIVCSIQLSSSAAGSSVNPAGRPSDPEYTIQLSELINDSWVVRQTQTYNGEGVIIRNDYDRETDKYYWLLTQSASGSFTYTDNKQTTADRTYKLAITSRSGVNIYGSWQNPSQRLSIISQED
Physico‐chemical
properties
protein length:2004 AA
molecular weight: 220757,10750 Da
isoelectric point:4,41727
aromaticity:0,09232
hydropathy:-0,29925

Domains

View on InterPro
ASV43935.1
1 2004 aa
ATT 113–236 · ATT 379–532 ·

ATT Attachment Domain STR Structural Domain RBD Receptor-Binding Domain CBM Carbohydrate-Binding Module LEC Lectin-like Domain ENZ Enzymatic Domain CHP Intramolecular Chaperone LNK Linker/Spacer Domain TAS Tail-Associated Structural TTP Tail Tubular Protein UNK Uncharacterized Domain Unmapped

Taxonomy

Phage
Pseudoalteromonas phage KB12-38 [NCBI] · taxon 2024350
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Genbank protein accession
ASV43935.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MF098558.1 [NCBI]
CDS location
range 5699 -> 11713
strand -
CDS
ATGACAGTAGTGAAAACAAGCACCGGTGTGTTTGTCTCAGGAGCAGGTGGTGGCGGTGGTGGCAGCAATGATGCTAACACATTGTTTTCTACAGACGCCTTTGAAATGGTTATAGGTTTATCTGAAGGGCCTATACATGGCCTCGAAGGTGAAACTGTAAAAGAGCAGTTAGCCAATCTGTTTGTAAATGATGTTCCCGTTATGAGCCAAGCGGGAACAATGAACTTTCAAGACTCCGACTTTGTTATTCGCTATGAATCGGGCTTACCCCTTACAGATCAAGAAGACCCTGAAAGAGGACAGTCACCTATACGCTATATGTTAGGTGGCCAAGCTACGCCAAATAATGTGTCTGCGGAACTTCTACCCAGTGTAGAAATTATCCGCACTATTCCTAATGCAATCACTGGCCAGTATGACCGTGTAGAAGTTCGCTTATTAATCAACCAACTTTATAAAGCCACAAAAAAGGGAACTAAGGTAGACACCCTTCCTATGCGTTTACGTTGGCGTTATGCGGGCGAAACCTCGTGGAAATCTATTTTTCAGGGGTATATAAGCGGTAAAACTACGGTAGGGGGGTATGTAAAAGCATACTCATTCGCCGTAGATGATAAAACCCGTCAAGTTGAAATTTCCGTCACCAACACCCATTCACCTAATGTTGATGATGAAGAACACGTACATAGTGTGTCATGGTTGAACTACGAGACTGAAAAAGTCATTACGGATGAAAACCCTGAGTATCACCCTAATACGGCTATGCTGCACGTTGTGGGCCTAATCGGCAATGAAATCACTCAACTCCCCATTATATCCGGCGTATGGAAAGGTATGGTTTGTTCCGTGCCAAGTAACTATGACCCAATAACCCGAGAATATAGTGAAAACTCGCCTTGGGATGGTGAATTTGCTACGCAAAAGGTGTGGACAGATAACCCTTTTTGGATTGCTTACGAGCTTATAACTAACCCAAACTTTGGTTTATACCGTTATAACCCCCGTATCCGAGTTAACCGTTATTCATTCTATGCCTTAGCTAAAGATGCAGATGAATTAGTCGAAGGGAGTACAGGGGAGTTCACTCCGAGGTACACCTTTAACGCACTGCTAGCGGATAAACAGGATGGTCTTGACTTAATAAACTATATTCTTGGATCAGCTCAGTCGCGTCTAATTGATGGCCAGAACGGTGAGTTAGTACTAGTTTCGGATAGAAACACACCCGCTGTAGCGACAATTACCCCAGAGCAATGTCTAGCTGATGAAAACGAGGTGGTTTTCAACTACACCCATACGGATATAAAAGACCGTATCAATGAAGTGGTAACCTCTTATATAGACGAAAACCTAAGCTGGGAACGTCAAACAATTGGGCCTTTTTCGGATATTGAGTCACAGAACAAGTACGGTGTTAATACTGAAGAATACGACAGCATTGGTTGTATTTATCCTGATGAAGTAAAGCGTAAAGCCTACCTTCGTTTAATTGGGTACCAAACTGAAACAATGTCAGTTACGTTTAGAGTACCGGCTAATAGCGCTGTACTCCAACTATTCGATATTATTAACATTGTAGACCCTGATCAAAACTGGGGTATATCTGGTCGAGTACGTAGCTATGACACGCACTCACTAACACTCAGAGACCCATTATACTTTGAAGAAATAAATAACTACCGCGTTGTTATCCCGCTTAAAACGGGTGGTGAGTTTGAAGCTTATATAAATATTCCAAGTGTTGGCTTTCATAGTGAACTAAACCTTGCTTCATATACATTACCTGAGGGTGGGAGTACTCCCTCAAGCTTTCCTGAAGGACTAGCCACACACACACCATTTTCTATTCAGCGCTCGGGTAGTGAGCCAGGGCTGGCCAAACCTTTTCGTATACTATCGGTCAGAGCCAGTGACGAAAATAATTCAACATTCACTATTACCGCTATTGAAGTTAACCGTAATAAGTGGGCCGCAGCAGATAACTTAGAACTCGTAGGTTCACCACAGTACAGCTTTAAAATGCCGCCTATACCGGAGAAACCTAAGAACGTTACGTTATTAAAGCAAGAGTTTGAAACTGTTGACGAGAAAACAAAAATAAATCTTTGGCTAGGCTGGGATGAACCTATAGAAACGTTCCTTGGGCACTACTATGAAGTATCCCTAAAGCGTAATGCTGTAGACCTTGGCGTTGTGGTCAAAAGCTCAACTAATATTGTTGAAATCCCTGAGTTAGATTTCGGAGATTATGAAATTACTGTGGCCATGGTATTTAACGGCCAAAAGGAATACTCAGACGTATTTCGTTGGGAGGTCAAATACCTTTCATTTCTTGAGGGTGAGTACGCCCCTGAGCGTTTAGAAACCAGCTTAGAAGCGAGTTACAACGGTACGGATTTATATTTAACGTTTGGCGCTTGGTATTCATACAACCAAGGCTCAACGCTGTCCTTGTCCGACATAATCACCAACAAAGAAATTAAACATGCCCAGATAGACATACGTACTAATGTTGAAGGTGAACCCCGTCGGTTACTTAAAACGATTGAGACAACCCAGCGTGATGCAGTATTTACCGGTAAGGAACACTTAGAGGCCAACCCAGATGGGTATGTGGCCGAGCTTAGACTTGAGCTTACGTTAATTGATTTACAAGGCAATCCCTCACCTGTATTCGTCAAAGAGTTAATGGCCGACAACATACCCGATGTTACGGGGATTGTCGTTGACGCAACTTACAAGGCAGTCTCAGCAGCACCATTATTTGATGAAATGGACACAAATCAAGTCGATGTGGAATGGTATATTTTAGAAGTCCCTGAGTCTGGGTTAGGTGATGTAGATTTTAGTAGCGCCATTTTAGTTGAGACCGCCCCCAAGTTGCTTGACTACATACATGTAGATAACCAGAAGCAATACTGTATCTGGGCTAAGTCTATTAGTGAGTTTTGGCAATCAAGCCTTTACCCAGCAGCGAATGCCCCCGTTGCAGACCTTGTTGTTTTTGAAGTCCCTATTTTCCCGCTAGAAGAACTGGCGGGTGAAATTACAGATATTGGCTTAGCACAACTAAGCGAAGATGCACAAACCCTAATCGAAGATATAAACAACCAAGTAGACCGCTTACGCCCTGATACAGAGGATAACATTCCCGACGTACTGGCCCGCACCGTAAACGAGCTAAATTTAGAGCGCCAAGCCCGCACCGACATTGAGCAAGGCGTATTTGATTTATCAGCCGAGTACACCAACTGGCGTCAAAACTACGAGCAACGCCAATTAGGTAACGAGCGCTTAATTGATGCGGCCGTGTATATCGACCCTGAAAGCGGCACCATTGTAAACCGTGCGTTTGCTTACACAGACGAGGCTTTTAGCGAGGCTAACGTATTAATTGATGGTGTAAATGCAAGTATTGAGCTACAAGCAAACCGCATAACGGGCACTAATGAGCGATTAACGCAAGCCGAGTCAACATTAACGGTTCAGGCGGGGCAAATAAACCAACGCGCCACCTTTACCGAAATGCGCACCGAAATTGCGGGCGCGATTGAAGCGCTAACCCCTGCTTATAGCTGGCACTTTAATCACAACACCGAGGGCTTTAGCGGTGATGTAGCTCACAACCCGCAAGGCTTTTTAGTGATTACGGGCGTGGCCAACGCCGCTGCAATTACCTATGAAGCCGAAGAAAACCCAATGTTACGCCTACGTGTGCGTAAGCATGCTGATCTGCCATGGTTAGGTAATCTTTACTTTGGTGCCGATGAATTTTTAGTTAACGTTTTAGAGCCAGAAAGCGAAAACTGGGAAACCACGCAAATTGATTTAACAGGCATTGAGGGTTACACCGGCACCATTACGGCGCTAAAAATTGACCTAGGCCACGTTGATATTGATTTTATAGAAATAGGCAAACGCGGCGCAAATGACCTGGCATTAAATGACATAACTACCCGCGCCACCATTTTAGAAAATGATATTGATGCCGCCACAGGCATTATGGCGCAATATGCCACAACAACGTGGGTAAACGAGTTAGGTTATCAAACCCAATCAAACGTCAATGCCGTTATTGATAGCTTTAATACGACATATCAAATTAGCGCCACCCTGCAGGAATTTAACGACAACGGTACGCTAGAAAAAGCCAATAATGCACAGCAGTTTATTAATGGTGCTGAGGCTTATATAACAAGCCAGATCACAGCCTTTAATGCGGCTGAAAATGGCGTAGATGCTAAGTTTGCCAATGTAGACCAAACACTCGATGCGATAAACGGCACGATTAGCCAAAGCATAGTGCAAGTACAAGGTTTAGAGCTTGACTTGCAAGACGCAAATTTAAACGATGTTATCGCTGAGGCTAATCAGTTATTACTGGGTCACGATTTAGCACAGCAAGACGTAAAAGTGGCACTTGCACAAAGTAAACTGACAGCACACACAACAGAAATAGAATCCCTAGCGAGTTTTACATTAGACTTACAGGCTTGGTTTAATGATAGTCAGGCGGCATTTTCAGAGCTTGTAACTACTGTAGCTAATGACCAGCAAGCCTTGGTAACAGTAGAACAAAACTTACAAGCTAAAATCACAAACGACACAAACGCAGCCCTTGCCAGCGCTCAAGAATACACCCGCACGGCGGTAGGCTACTGTGTTGATGCTGAGGGCAATATAACCAGCGAAAAGGACGCCATACAATGTGTAACGGATGGTGGTTCATGGGTAGATGGCCCTTTAGCGGAGTACATTTCTAATTTACAAATAAGTGATGGCGAAAGTACCGCCAGTATTAAAGAACTTAAGCAAGTCTTTAAAAAGGTAAACGGTGAGTTAGTGGCCCGTGGCGGCTGGGTGCTTGATAACAACGGCCGCGCCGTAAGCGTGGCTGGTTATAACGATGGCGAAACGGGCAACTTAGACTTAGTGGCCGATGTGATCCGCCAAGGCGTTATGGTAGGTAATACCTTTGTGCCCACCTCGTATATTGATAACACTGATCCTGCAAACCCTGTGCATACCTTTAAAGGGCGCATGGTGCTTGGTGACGGCACCGCCATTGAAAATGCGGCAGACATACAAGCACAAGGGGGTGGCCGTGGTGGTGTTTATTATGTGGGCACCAGTACAGGTGCGTGGAGTGACAGCACCGCAAACAGTGCCGTGCCCGATAACACCCCGATTAAGGGTGATGTTGTTAATATTTATAAAACCAGCAACCCCAATGTAAACACCACCAAAAAATACACGGGTAGTGCGTGGGAAAGTTACGCCCTAGAAGTTAACGGTGCAATCTTTGCCACGGGTTCTATTGATGGCAACGCATTTAGAGCAGGTACCCGCATTGAATCGCCCCGTATAGATTTAATAGGCGGCGCATTTATGAAAGTGGAGTACGCCGCAGGGTTTGGCCCCAATAATTTGTGGTATTGGTACGGCCCTAAAATATTAAACAATGGCATGCCTGATCTTAACCTGTTAACTAAAAGCAACGCCACCGAATGGAAGGACACAACGGGCAATTCTTATTTTGGTGGCTCAATTGTCGCGGGTACGTACAGCACGGCGCTAACGACGACAGATTTATCAGCTGATGCCTTTGTCGAAATAGGCCCATTTGGCTCAAACGGCGGTGTTATTAATATCGTTTGCTCCATTCAATTAAGTTCAAGCGCCGCGGGATCAAGTGTAAACCCCGCGGGTAGACCTTCTGATCCTGAGTACACGATACAGTTATCAGAGTTAATTAATGATAGCTGGGTAGTTAGACAGACCCAAACATACAATGGTGAGGGGGTAATTATCCGCAATGATTACGACCGAGAAACTGACAAATATTATTGGTTGCTTACACAGTCTGCGTCAGGGTCTTTTACCTACACGGATAATAAGCAAACCACCGCGGATAGAACCTATAAACTGGCAATAACAAGTCGCTCAGGGGTCAATATTTATGGCTCATGGCAAAACCCGTCACAGCGTCTTTCAATAATTTCTCAAGAGGATTAA

Genome Context

Tertiary structure

ASV43935.1
ColabFold structure
Source ColabFold
pLDDT 66.4
Oligomeric state monomer

Literature

Title Authors Date PMID Source
Genomic characterization of an active prophage infecting a marine Pseudoalteromonas isolated from a marine flatworm Zablocki,O.D.J., van Zyl,L.J. and Trindade,M.I. 2014-12 GenBank