Protein

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Genbank accession
QRV71444.1 [GenBank]
Protein name
SPRY domain containing protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
Protein sequence
MFVGMGANGASGGYNLENSLRFRSSASAYLNRTPATAGNRKIFTISLWMKGDLVSSPALFQARAASPTGQPHFVLMGSNGSLYILDQNAGTQAQIITTAVLRDPSAWYHVVVAIDTTEATAADRAKFYVNGDKLESFSTLDTFPLNYDTAVNNTVRHLVGARMPNSSTALVSYLDNYLTEVNFVDGQALTPSDFGETNSTTGVWQPKKYTGTYGTNGFYLKGRGTDNSGNGNNFTETNFNTTNSALATYDIMTDVPTLTDEDTANYATLNPLDAGTLNITVSNANLKFAVSANSWTAIRATIGISSGKWYWEITPLTGPDGNYFLNGIKDVTESIPAGTSQYVGVTSGSYGYYGATGNRYNNGSNSVYGSSFGVGDVVGVALDMDAGTLTFYKNNVSQGVAYSGLTGTFAPAFSLKGNTQTNTEAVNFGQRPFAYTPPTGYKKLNTFNLPDSSIVDGSENFNTVTYTGNGTSGRAITGVGFSPDLVWQKSRSNTYSNKLHDIIRGASTYLQSNTTTADVTQAQTIDSFDSDGFTVGNNVSYNGSGVTFVAWNWKAGGTAVSNTAGTITSQVSANPTAGFSVVTYTGTGGTKTVGHGLGVAPQMVIVKGRNGGTNWVVYHVGMGATKYMLMNTTGAAVTDSTPWNNTSPTSTVVSLGTSSNTNGNTAPFVAYCFADVEGYSKFGSYTGNGSADGPFVYTGFRPAYVLIKRTNAGASWFLWDSARNSYNLLDATLYPNLNIAEYINSTRALDLVSNGFKLRGTDSQMNASGGAYIYMAFAENPFKNSLAR
Physico‐chemical
properties
protein length:788 AA
molecular weight: 83636,10930 Da
isoelectric point:5,93384
aromaticity:0,11675
hydropathy:-0,23744

Domains

Domains [InterPro]
IPR013320
15–191
IPR013320 IPR001870 IPR055906
IPR013320
263–443
IPR013320
IPR043136
264–464
IPR043136
IPR050672
277–414
IPR050672
IPR003877
306–432
IPR003877
cd11709
307–420
cd11709
IPR003877
308–430
IPR003877
QRV71444.1
1 788
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Methylophilales phage MEP301
[NCBI] 		2806696 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QRV71444.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MW452941 [NCBI]
CDS location
range 7172 -> 9538
strand -
CDS
ATGTTTGTAGGAATGGGTGCTAATGGTGCAAGTGGTGGTTATAACCTAGAGAACAGCTTACGCTTTCGTTCGTCTGCTTCAGCTTATTTAAATAGGACTCCTGCTACTGCAGGTAATCGTAAGATTTTTACTATATCTTTATGGATGAAGGGTGACCTTGTTTCCTCACCTGCATTATTTCAAGCTAGAGCAGCATCTCCAACTGGTCAGCCTCATTTTGTTCTTATGGGTAGTAATGGCTCTTTATATATACTAGACCAAAATGCAGGAACTCAAGCACAAATTATAACAACGGCTGTATTGCGTGACCCTTCAGCTTGGTATCATGTTGTAGTTGCTATAGACACTACTGAAGCAACTGCAGCAGACAGGGCTAAATTTTATGTTAATGGTGATAAGCTAGAATCATTTAGTACTTTAGACACTTTCCCTTTAAATTATGATACAGCGGTAAATAATACTGTTAGACATTTAGTTGGTGCAAGAATGCCAAATTCTAGTACAGCTCTTGTATCTTACCTTGACAACTACCTAACAGAAGTAAACTTCGTAGATGGACAAGCACTAACACCATCAGACTTCGGTGAAACCAATTCAACTACAGGTGTATGGCAACCTAAAAAATACACAGGCACATATGGTACTAACGGATTCTATTTAAAAGGTCGTGGTACAGATAACTCTGGTAATGGTAACAACTTTACTGAGACTAACTTTAACACAACCAATAGTGCATTAGCTACCTACGACATCATGACAGATGTACCCACACTAACCGATGAAGATACGGCTAACTATGCTACGCTGAATCCATTGGATGCAGGAACACTAAATATTACTGTTAGTAATGCCAATTTAAAATTTGCAGTTAGTGCTAATAGTTGGACAGCTATAAGAGCAACAATAGGTATATCAAGTGGTAAATGGTACTGGGAAATTACTCCACTAACTGGTCCTGATGGTAATTACTTTCTAAATGGTATTAAGGATGTTACAGAAAGTATACCTGCTGGAACAAGTCAGTATGTAGGAGTTACATCTGGTAGTTATGGATATTATGGTGCAACTGGAAATAGATATAACAATGGTTCTAATTCTGTCTATGGCTCTTCTTTCGGAGTAGGAGATGTTGTTGGTGTAGCTTTAGATATGGATGCAGGTACATTAACATTTTATAAAAATAATGTTTCTCAAGGGGTAGCTTACTCTGGTTTAACAGGAACATTTGCTCCTGCATTCTCTTTGAAGGGCAATACTCAAACAAATACTGAAGCAGTAAACTTCGGACAACGACCATTTGCCTACACACCACCTACAGGCTATAAAAAACTCAACACATTTAACCTACCTGATAGTAGCATTGTAGATGGTAGTGAGAATTTTAATACTGTGACTTATACAGGTAATGGCACATCTGGTCGTGCAATAACTGGTGTAGGATTCTCTCCTGATTTAGTTTGGCAAAAATCAAGAAGTAATACTTATAGTAATAAACTACACGATATAATCAGAGGTGCTTCTACATATTTACAGTCTAATACAACTACTGCTGACGTAACACAGGCACAGACTATAGATTCCTTTGATTCAGATGGTTTTACTGTAGGTAATAATGTATCATACAATGGCTCTGGTGTAACATTTGTAGCATGGAACTGGAAAGCAGGAGGTACAGCAGTATCTAACACAGCAGGAACAATAACATCACAAGTATCTGCTAACCCAACAGCAGGGTTTAGTGTGGTGACTTATACAGGAACAGGAGGTACTAAAACTGTAGGACATGGTTTAGGTGTTGCTCCTCAAATGGTCATAGTTAAAGGTAGAAATGGTGGGACAAACTGGGTTGTGTATCATGTTGGCATGGGAGCTACAAAATATATGCTAATGAATACAACAGGAGCAGCAGTAACTGATTCAACACCCTGGAATAATACCTCACCAACATCAACAGTAGTTAGTCTTGGTACATCAAGTAATACAAATGGGAATACAGCTCCCTTTGTAGCCTATTGCTTTGCTGATGTAGAAGGATACAGTAAGTTTGGTAGCTACACAGGTAATGGTTCTGCTGATGGACCATTTGTATACACAGGGTTTAGACCTGCTTATGTGTTGATTAAGAGGACTAATGCTGGAGCAAGTTGGTTTTTATGGGATTCTGCCAGAAATTCTTATAATTTATTAGATGCTACACTATATCCAAACTTAAATATTGCTGAATATATTAATTCAACCAGGGCTTTGGATTTAGTTTCAAACGGATTTAAACTACGAGGTACAGACTCTCAAATGAACGCTTCAGGTGGAGCATACATATACATGGCATTTGCCGAAAACCCTTTTAAAAATTCTTTAGCGAGGTAA

Tertiary structure

PDB ID
46a6db8bde019e4f419c49a8a4a90eac8090ed0b33cec694155e8c57165f8a4f
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2545
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Genomic characterization and distribution pattern of a novel marine OM43 phage Zhao,Y. 2021 33841378 GenBank