Genbank accession
ATE82645.1 [GenBank]
Protein name
neck passage structure
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,69
Protein sequence
MSLDNFRNRTILWDTVNKDYPQPIQIMQGDVNARTLLIKIVDNGTEIDLTGHSLKLTYQYTNSSNSGFVMITPKDLAKGEFILAIPTEMTATGVIEANLILLNKDKEQVIVSKNLTFISDSSTVSDLAQEINNNIDDFTKLLLEKMPQVLRSELNDLHAQTDSNKSNIELKANLADMTSLQSAMTELKNEVEAFGISPENLVTIKSLLDAIASNASESEVVELINSVKILTSNISLMSNGDYSPKANQTDLESLQHTVNNQSATISTKANQTDLDNLQATVDKQGVAISTKAEQSELSITNKNVTTAQETAKQAESEAKNAMAKATEAQANSLPLNGNAVSASKLETARKLGVNLQASAFQNFDGTADATNIGVSGVLPISNGGTSTSDGVINTIAYSNSADGTDGFTTVYPNLNLLDGTKDFSGDWINARAWDKNGTYKGLTVVSYNGAYNAGIAKGFTIPSDGIYSFSIIVKVKTGYVGQFIVETYKPTGVPAVTINVTDTGGKFVIQSYTGSFKAGQEIAMYFRFDSGATIKGGLEVAGHKIEHGETPTPYMPSASEVTVADYPKYVGFSNIIKPNKKSSDYKWLPMGLVAIDSATGSLKPAVIGIDYAQAHPVGSVVTNNSNLSSGYSTGKWENIGSAVIGLTTIYYWKRTA
Physico‐chemical
properties
protein length:656 AA
molecular weight: 70331,95740 Da
isoelectric point:5,00015
aromaticity:0,07012
hydropathy:-0,21768

Taxonomy

Phage
Lactococcus phage LP0004a [NCBI] · taxon 2027261
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Genbank protein accession
ATE82645.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MF775687 [NCBI]
CDS location
range 7321 -> 9291
strand +
CDS
ATGAGTTTAGATAATTTTAGAAATAGAACGATTTTGTGGGACACAGTCAATAAAGACTACCCTCAGCCAATACAAATAATGCAAGGCGATGTCAATGCTAGAACGTTATTAATTAAAATAGTTGATAACGGAACTGAAATTGATTTAACTGGTCATTCATTAAAACTTACATATCAATACACTAATAGTAGTAATTCTGGTTTTGTTATGATCACTCCTAAGGACTTAGCTAAGGGAGAATTTATTTTGGCAATTCCTACCGAAATGACAGCGACAGGAGTTATTGAAGCGAACTTAATACTTCTCAATAAAGACAAAGAGCAAGTTATTGTCAGTAAGAATCTTACATTTATATCAGACAGTTCTACTGTTTCTGATTTAGCTCAAGAAATAAATAATAATATTGATGATTTTACGAAATTATTATTAGAAAAAATGCCACAAGTACTGCGTAGTGAGTTGAATGATTTACATGCTCAAACTGATTCAAACAAGAGCAATATTGAGCTTAAAGCAAATCTAGCTGATATGACTAGCTTACAAAGTGCAATGACAGAGCTAAAAAATGAAGTAGAAGCATTTGGTATTAGTCCTGAAAATTTAGTTACTATAAAATCGCTATTAGACGCAATTGCAAGCAATGCAAGTGAATCGGAAGTTGTTGAACTAATAAATTCAGTAAAGATTTTAACAAGTAATATTTCTCTTATGAGTAACGGAGATTACTCCCCTAAAGCTAATCAAACAGATTTAGAAAGTTTACAGCATACTGTTAATAACCAATCGGCGACTATTTCAACAAAAGCCAATCAAACGGATTTAGACAACTTACAAGCTACTGTTGATAAACAAGGTGTTGCAATTTCAACAAAAGCTGAACAATCAGAGTTATCAATAACAAATAAAAATGTAACAACTGCTCAAGAAACAGCAAAACAAGCTGAAAGTGAAGCCAAAAATGCAATGGCAAAGGCTACCGAAGCACAAGCGAACAGTTTACCACTTAATGGCAATGCGGTCAGTGCAAGCAAACTGGAAACAGCTAGAAAACTTGGAGTAAATCTCCAAGCCTCAGCGTTTCAAAACTTTGACGGGACTGCTGACGCAACTAATATTGGAGTTTCAGGGGTGCTGCCTATTTCAAACGGTGGTACTTCAACAAGTGACGGAGTTATAAATACAATAGCTTATTCCAACAGCGCAGACGGCACTGACGGTTTCACAACTGTTTATCCTAATTTGAATCTATTAGACGGAACTAAAGATTTTAGTGGGGATTGGATTAATGCACGTGCTTGGGACAAGAATGGTACTTATAAGGGTTTGACTGTGGTGTCATACAATGGAGCTTATAACGCAGGTATAGCTAAAGGTTTTACTATCCCTTCCGACGGTATTTATTCATTTTCTATAATTGTTAAAGTAAAAACTGGTTATGTCGGTCAATTTATTGTTGAAACGTATAAACCAACAGGGGTACCTGCTGTTACAATAAATGTAACCGATACAGGTGGGAAATTTGTAATTCAGTCTTATACAGGTAGTTTTAAAGCAGGTCAAGAGATTGCAATGTATTTTCGGTTTGATAGTGGAGCCACTATTAAAGGTGGTTTAGAGGTCGCAGGGCATAAAATTGAACACGGAGAAACACCAACTCCATACATGCCATCAGCTAGCGAAGTCACGGTTGCAGACTATCCGAAGTATGTAGGGTTTAGTAATATCATTAAACCTAATAAGAAAAGTTCTGATTACAAATGGTTACCAATGGGGTTAGTAGCAATTGATAGTGCTACTGGCTCACTCAAACCTGCGGTTATAGGTATAGATTACGCTCAAGCTCACCCAGTTGGCTCGGTAGTCACAAATAACTCAAATTTGTCATCAGGGTATTCCACAGGAAAATGGGAAAATATCGGTTCAGCAGTAATTGGTTTAACAACAATATATTATTGGAAACGTACTGCATAA

Genome Context

Tertiary structure

ATE82645.1
ESMFold structure
Source ESMFold
pLDDT 69.8
Oligomeric state monomer