Protein

View in Explore
Genbank accession
QPZ53725.1 [GenBank]
Protein name
putative tail fiber
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,87
Protein sequence
MIIRNNNNIEKDNMTISSTTVKNSYSGNGTLDTFNYTFKIFADADIQVIIRDASATETVKTLTTHYTVTGAGSASGGTIVFTAGNIPSATETVVIRRASPQTQAIDYIANDPFPAESHEEGLDRSMMAIQQLQEEVDRSIKLSRTNTMTSTEFAVGSTARAGKIFGFDDNGELVVSQELGTFQGNWSASTTFSARDIVKDTSNNNIYLCNTGHTSSGSQPISTNTDVAKWDLLVDAASATNSQNAAAASAAAALVSENNASTSESNALTYKNDAETAKTAAELAETNAETAQTAAEVAQAAAEAALDNFDDRFLGAKASDPTLDNDGNALIDGALYFNTTDDVMKVYDLTNTTWRQIQLTTSDQANVNTVAADLSGANTIGTVAGSIANVNSVSGNATNINTVAGISADVTSVAGISAAVSAVNSNSTNINAVNANSANINTVAANNTNITNVGGSITNVNTVASNLSDVNSFAETYRISSSAPTTSLDIGDLYFDTTADELKVYKSSGWSAAGSSVNGTSARYTYTISGTPSSVSGADDNSLTLAYDAGFADVFVNGVRMSSADITITSGTSVVFASPLTDGDVVDIVAYGTFNVAAIDASNITSGTLDVNRISDGSITNAKLATPFNLTLPTISSISPDTIDNSEATITITGSNFVSVPQVEFLNPSTGIWYRASTITFNNSTSLTVTITLAVDAQYKVRVENPDGLAILSGTILTVSDAPTWNTAAGDLGTFAGNFSGTLATLSATSDSAITYSEVGSNLTTANVTLNTSTGALTTTDFGGTSTTATTYNFTIRATDAENQTADRSFSLTSFYSATGGGQFN
Physico‐chemical
properties
protein length:825 AA
molecular weight: 85386,71660 Da
isoelectric point:4,11193
aromaticity:0,06788
hydropathy:-0,09527

Domains

Domains [InterPro]
Coil
115–135
Coil IPR013783
IPR014756
633–710
IPR014756
cd00102
633–718
cd00102
QPZ53725.1
1 825
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Pelagibacter phage HTVC204P
[NCBI] 		2796524 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QPZ53725.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MW273926 [NCBI]
CDS location
range 15276 -> 17753
strand -
CDS
TTGATAATAAGGAACAATAATAATATAGAGAAAGACAATATGACAATATCTAGCACTACAGTAAAAAATTCCTACTCTGGTAATGGTACACTAGATACCTTCAATTATACTTTTAAAATATTTGCAGATGCAGACATTCAAGTTATTATTAGAGATGCTTCAGCAACTGAAACAGTTAAAACTTTAACTACACATTATACTGTAACTGGTGCAGGTTCTGCTTCTGGTGGAACTATTGTATTTACAGCAGGTAACATTCCAAGTGCAACAGAGACAGTTGTAATAAGAAGAGCATCACCACAAACACAAGCAATCGATTATATTGCTAACGATCCTTTCCCTGCTGAATCTCACGAAGAAGGATTAGATAGATCTATGATGGCAATTCAACAATTGCAAGAAGAAGTAGATAGATCAATTAAATTATCAAGAACTAACACAATGACTTCAACAGAGTTTGCTGTAGGTTCAACTGCTAGAGCTGGTAAAATTTTTGGGTTTGATGACAATGGTGAATTAGTTGTATCGCAAGAACTTGGAACTTTTCAAGGTAACTGGTCAGCTTCAACAACTTTTTCTGCTAGAGATATTGTAAAAGATACTTCAAACAATAATATTTATTTATGTAATACTGGTCATACATCATCTGGTAGTCAACCTATTTCAACTAACACAGATGTAGCTAAATGGGATTTATTGGTAGACGCAGCTAGTGCGACAAATTCTCAAAATGCAGCAGCAGCTAGTGCAGCAGCAGCTTTAGTATCAGAAAACAATGCTTCTACTTCAGAAAGCAATGCTTTAACTTACAAAAACGATGCAGAGACAGCAAAAACTGCAGCAGAATTAGCAGAAACAAATGCCGAAACTGCACAGACAGCAGCAGAGGTGGCTCAAGCAGCAGCAGAAGCTGCATTAGATAATTTTGATGACAGATTTTTAGGTGCTAAAGCTAGTGATCCAACTTTAGATAATGATGGTAACGCATTAATAGATGGAGCATTATACTTTAATACTACAGATGATGTAATGAAAGTCTACGACTTGACTAACACTACATGGAGACAAATTCAATTAACTACATCTGACCAGGCAAATGTAAATACTGTAGCTGCAGACTTATCTGGTGCTAACACTATTGGTACTGTTGCAGGTTCTATTGCTAATGTAAATTCAGTTTCAGGAAACGCAACCAACATTAATACAGTTGCTGGAATATCAGCAGATGTAACAAGTGTTGCTGGAATAAGTGCTGCTGTTAGTGCTGTAAATTCTAATTCAACAAACATTAATGCTGTTAATGCTAACTCTGCAAATATTAATACAGTAGCAGCTAACAATACTAATATTACAAATGTAGGTGGTTCAATCACTAATGTAAATACAGTTGCTTCTAATTTATCAGACGTAAATAGTTTTGCAGAAACTTATAGAATTTCATCTTCTGCTCCAACAACTTCTTTAGACATTGGAGATTTATATTTTGATACAACTGCTGATGAATTAAAAGTTTACAAATCTTCTGGATGGAGTGCTGCAGGTTCAAGTGTTAATGGAACTTCAGCAAGATACACTTACACTATATCTGGTACACCTAGTTCAGTATCTGGTGCAGATGACAATAGTTTAACACTTGCTTATGACGCAGGATTTGCAGATGTGTTTGTCAATGGTGTTCGTATGTCTAGTGCAGATATTACAATTACATCTGGTACTTCAGTTGTATTTGCTTCACCTTTAACAGATGGAGATGTAGTTGATATTGTTGCTTATGGAACATTTAATGTAGCAGCTATTGATGCTTCTAATATTACAAGTGGAACTTTAGATGTTAATAGAATTTCAGATGGTTCAATTACTAATGCTAAACTTGCAACACCTTTTAATTTAACATTACCAACTATTAGTTCTATCTCACCAGACACAATAGATAACTCAGAAGCAACAATTACAATAACAGGTTCAAACTTTGTATCAGTACCTCAAGTAGAATTTTTAAATCCTTCAACTGGTATTTGGTACAGAGCTAGTACAATTACATTTAACAATTCAACATCATTAACAGTTACAATTACTTTAGCAGTTGATGCTCAATACAAAGTTAGAGTTGAGAACCCAGATGGTTTAGCAATATTATCTGGAACAATACTTACAGTTTCAGATGCACCAACATGGAATACTGCTGCTGGAGATTTAGGAACTTTTGCAGGAAATTTCTCTGGAACACTTGCAACACTTTCAGCTACATCAGATAGTGCAATAACTTATTCAGAAGTAGGAAGTAATCTTACAACAGCTAATGTTACATTAAATACTTCAACAGGTGCTTTGACTACAACTGACTTTGGTGGTACAAGCACAACAGCAACAACTTACAACTTTACAATAAGAGCAACAGATGCAGAAAACCAAACAGCAGATAGAAGTTTTTCACTTACATCTTTTTATAGTGCAACAGGAGGGGGACAATTTAACTAA

Tertiary structure

PDB ID
4d6585388327a9dcfabe9d6e07c4bb934c08d6b5c22bb1f8f30a603778e3bcd0
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2839
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Genomic diversity, life strategies and ecology of marine HTVC010P-type pelagiphages Du,S., Qin,F., Zhang,Z. and Zhao,Y. — — GenBank