Protein
View in Explore- Genbank accession
- AXH71551.1 [GenBank]
- Protein name
- tail tubular protein B
- RBP type
-
TSPTSP
- Protein sequence
-
MGSVVSQSIPNFLNGMSQQTPTQRGINQGEDQINLQNGLVDGLSKRPPLDYVATVDNTNIYSNKTKFWQIQRDADNQYIVALYNGGVKVFGLDGTEKTVTVASGSGYLTSTNPRENFKLVNIADYTFVANTGTTVVADSTTSAAKVEEFLIVCKLTNYGREYKVALKHPSMAQELEVVFQLPSGNDASTDSKFRDTNKITDILLYGTSSTHWDSAANGIGFNVRRTDTNASVSTTQGLANYSGFTSYFTFEAYDSVIYGKPTDQNANYEITTSDGSGNTAMYSIRDEIQDFSKLPFYGKEGVIIKITGEEGDTLSDYYVKFSGKSGVWNETIAPATSIGLNNSTMPHALINNNNGTFTFQELDWTDRVCGDADTNPDPTFVGKKINNLTYYKNRLGILSGENLVLTENASFFNYFATTSTQVLDTDPIDIAASGTQVNTLKNSVGFNESLLLFSDTAQYKLDSSGETISPTSAILNQVSSFEHDDKVTPVSAGKFAYFAQARTNNTAIREYFADDDTLTNDGLDISVSVQNLIPSNCYQIISNTTEDTLIFLTSDTADTQTAPYSGTVSTTYANTMYIYKYFFDGGEKVQNAWSKWTFEGVKIIGAMSLESFIYVLASEGTTTKLLKIDLRNLKDTTIGHGVYIDLKTSVTGTYDSATDLTTFVSPYGVKTGLIAVDRTNGNNYVVTNTSGSTYTIAGNHTALFIGIPYESKYTMSTQYVRENTGRGLVAVTSGRYQIRNISFNFENSGYFQVEVTPTNRTTSTAIMNGYIIGTSTSIVGQPAIATGTLRVPVQCKNTDFTLDIKSSSHLPMYIAGAEVEGYYHNRARRI
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 830 AA molecular weight: 90824,50670 Da isoelectric point: 4,87857 aromaticity: 0,10723 hydropathy: -0,30253
Domains
Domains [InterPro]
IPR058003
3–830
3–830
1
830
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Pelagibacter phage HTVC201P [NCBI] |
2283024 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AXH71551.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
MH598802
[NCBI]
CDS location
range 21919 -> 24411
strand +
strand +
CDS
ATGGGAAGTGTTGTTTCACAATCTATTCCTAACTTCTTAAATGGCATGTCTCAACAGACACCAACACAAAGAGGTATTAATCAAGGAGAAGACCAAATAAATTTACAAAATGGTTTAGTAGATGGTTTATCAAAAAGACCTCCTTTAGATTATGTAGCAACAGTAGATAATACTAATATTTATTCTAACAAAACAAAATTTTGGCAAATACAAAGAGATGCTGATAATCAATATATTGTAGCGTTATACAATGGAGGTGTAAAAGTATTTGGTTTAGATGGTACAGAAAAAACCGTTACTGTAGCAAGTGGGTCAGGTTATTTAACTTCTACAAACCCTAGAGAAAATTTTAAATTAGTTAACATAGCAGATTACACTTTTGTAGCAAACACAGGAACTACAGTTGTGGCTGATAGCACAACGTCTGCGGCTAAAGTAGAAGAGTTTTTAATTGTTTGTAAATTAACAAACTACGGTAGAGAATACAAAGTTGCATTGAAACACCCATCAATGGCACAAGAGCTAGAAGTTGTTTTTCAGTTACCTTCAGGTAATGATGCGTCAACCGATAGTAAATTTAGAGATACAAATAAAATAACAGATATACTTTTATATGGTACATCAAGTACACATTGGGACAGTGCCGCAAATGGTATTGGATTTAATGTTAGAAGAACAGATACGAATGCGTCTGTGTCTACTACACAAGGTTTAGCAAATTATTCTGGTTTTACATCATATTTTACTTTTGAAGCATACGACAGTGTAATCTATGGAAAGCCTACTGACCAAAATGCTAACTATGAAATAACTACTTCAGATGGTTCTGGTAACACAGCCATGTATTCTATAAGAGATGAAATACAAGATTTTAGTAAATTACCTTTTTATGGAAAAGAAGGAGTAATAATAAAAATTACGGGAGAAGAAGGTGATACACTTTCAGATTACTATGTAAAATTTTCAGGAAAGTCTGGTGTATGGAATGAAACTATTGCACCCGCTACATCTATTGGTTTAAACAATTCTACAATGCCACACGCATTGATTAATAACAATAATGGAACTTTTACATTTCAAGAATTAGATTGGACAGATAGAGTATGTGGAGATGCTGATACAAACCCTGACCCAACTTTTGTTGGTAAAAAAATAAATAACTTAACTTATTATAAAAATAGATTAGGAATATTATCAGGAGAAAATTTAGTATTAACAGAAAATGCTTCTTTCTTTAATTATTTTGCTACAACATCAACACAAGTTTTAGATACTGACCCAATTGATATTGCGGCTTCAGGTACACAAGTTAATACATTAAAAAACTCTGTAGGATTTAATGAAAGTTTATTATTATTTTCTGATACTGCACAATACAAACTAGATAGTTCAGGTGAAACAATTTCACCAACTTCAGCAATACTTAATCAAGTATCTTCATTTGAACATGATGATAAAGTTACACCAGTATCAGCAGGTAAGTTTGCATATTTTGCACAAGCAAGAACAAACAACACTGCAATAAGAGAATACTTTGCAGATGATGATACCTTAACAAATGACGGCTTAGATATAAGTGTATCAGTACAAAATTTAATACCATCTAATTGCTATCAAATTATTAGTAACACTACTGAAGACACCCTAATATTTTTAACTTCAGATACAGCAGATACACAGACAGCTCCATATAGCGGAACAGTGTCTACAACATACGCTAACACAATGTATATCTATAAGTATTTCTTTGATGGTGGAGAGAAAGTTCAAAACGCATGGTCTAAATGGACATTTGAAGGTGTAAAAATTATTGGTGCTATGTCATTAGAAAGTTTTATTTATGTCTTAGCTTCAGAAGGCACTACTACAAAATTATTAAAAATAGATTTAAGAAATTTAAAAGATACAACAATAGGGCATGGAGTTTACATTGACCTTAAAACTTCTGTTACAGGAACGTATGATAGTGCTACCGATTTAACCACATTCGTGTCACCTTATGGTGTGAAAACAGGTTTAATTGCAGTAGATAGAACTAACGGCAATAACTATGTTGTAACTAATACTTCAGGTTCAACTTATACTATTGCAGGAAACCACACAGCATTGTTCATAGGCATTCCGTATGAAAGTAAGTACACAATGTCTACTCAGTATGTAAGAGAAAATACAGGAAGAGGTTTAGTTGCTGTAACGTCAGGTAGATACCAAATAAGAAACATATCATTTAATTTTGAAAATAGTGGATACTTTCAAGTTGAAGTTACTCCTACTAATAGAACTACATCTACAGCTATTATGAATGGTTATATTATTGGAACTTCTACATCTATAGTTGGACAACCTGCTATTGCTACAGGAACTTTAAGAGTGCCTGTTCAATGTAAAAACACAGACTTTACTTTAGATATTAAATCTTCATCTCACTTGCCTATGTATATCGCAGGGGCAGAAGTTGAAGGATATTATCATAACAGAGCAAGAAGGATTTAA
Tertiary structure
PDB ID
61604e70e7f119ce997d5be5f88f24b7c4cb3cd7f8556555f51053e08dd6b38e
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50