Protein

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Genbank accession
WCS67417.1 [GenBank]
Protein name
tailspike protein/preneck appendage
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,91
TSP
Evidence RBPdetect2
Probability 0,93
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MAIQDKFNKPNVIYKITKDIDLDGGTLTIPAGCTLDFQGGSFSNGTIIGNATKIRTGLRQIFATTITLNGSWDIRALYPQYFGAIVNSDIISNGYDSTNAIQAAITNGENLNKPVYFTPGYYAISRTLQVGSGKYTALIGTKSTIKAYIYALNTMDYLITSSGSSYARLEMHNLHLWGDNKVASVPDYQNFDSLVKYGIYFPNGYIYTDISNISFDFFSRWAIYVNEIYDVHFKQLYIRYCHNGIYLTGNTNGVSITECEFNSVQYVGVAFNPSHMVTVQRNIFERIGMAAIYVGVGDNFDISDNYFEAVSEVGFIPKYSDGTTVMPKKLHADIIINGASTSRIIDWGTPDEVPNATMFTRAWSVGGTIHNNSFQKSVFDGDFDCLIFASSLKYSRITDNVLWNYIDTTGIYLLGTSNNTSTVWINDVELTSNYVSATRLIDKIGLIEGVQTTGTFSYTYNIYSNDVIENRLRGNLANKLFIYGYDNLVVQKTTEKYQGLVVYTAPADGVVFLRETAGGTYTSFFEGIDKSKLLFEVTYSSKTTTGDWTTTRFLSTSIDYNFTVKSGDKFTIPQIRLCGGNILDKFEDTTITWRDTYSSYIRRVGFPVGDKIEMLNNTLVDAYISTGTGSSTELSNWLPSKSGITYGTTIDRPTLTSTNNGWLYRDDTLKKIIMWNGTAWVNMDGTPLA
Physico‐chemical
properties
protein length:689 AA
molecular weight: 76869,42740 Da
isoelectric point:5,34431
aromaticity:0,13353
hydropathy:-0,14369

Domains

Domains [InterPro]
IPR011050
77–342
IPR011050
IPR012334
82–346
IPR012334
IPR039448
193–316
IPR039448
WCS67417.1
1 689
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Bacteroides phage PhiCrAssBcn25
[NCBI] 		3023108 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WCS67417.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OQ221560 [NCBI]
CDS location
range 23657 -> 25726
strand +
CDS
ATGGCAATACAAGATAAATTTAATAAGCCTAATGTTATCTATAAGATAACTAAGGATATAGACCTTGATGGGGGTACTCTTACTATTCCAGCAGGGTGTACTTTGGACTTTCAGGGAGGTAGTTTCTCTAATGGAACTATAATAGGGAATGCTACTAAGATTAGGACTGGCTTAAGGCAAATATTTGCAACAACTATTACATTAAATGGTAGTTGGGATATAAGAGCATTATATCCTCAATATTTTGGGGCAATAGTAAATTCTGACATTATTTCAAATGGGTATGACAGTACTAATGCAATTCAAGCAGCTATTACTAATGGAGAAAATCTCAACAAGCCTGTATATTTCACCCCTGGATATTATGCTATCTCAAGAACTCTACAAGTAGGTTCAGGCAAATATACAGCTTTAATAGGAACAAAGTCAACTATTAAAGCCTATATTTATGCTCTTAATACAATGGATTATTTGATAACCTCATCAGGTAGTAGTTATGCAAGATTAGAAATGCACAACTTGCACCTATGGGGGGATAATAAAGTAGCAAGTGTTCCTGATTATCAGAACTTTGATAGTCTTGTGAAATACGGCATATATTTCCCTAATGGTTATATCTACACTGATATATCAAATATATCCTTTGATTTTTTCTCAAGATGGGCTATTTATGTAAATGAGATATATGATGTACATTTTAAACAATTGTACATTAGATATTGTCATAATGGTATATATTTAACTGGGAACACTAATGGGGTTTCAATTACTGAATGTGAATTTAATAGTGTACAGTATGTGGGGGTAGCATTCAACCCAAGCCATATGGTAACAGTACAGAGAAACATATTTGAGAGAATTGGCATGGCTGCAATATATGTGGGTGTAGGTGACAACTTTGATATATCTGACAATTATTTTGAAGCAGTATCAGAGGTGGGATTTATTCCTAAATATAGTGATGGTACAACTGTAATGCCCAAAAAATTACATGCTGATATAATAATTAATGGTGCTTCTACTTCAAGAATAATAGATTGGGGTACTCCAGATGAAGTTCCCAATGCTACTATGTTCACAAGAGCATGGTCTGTAGGAGGAACTATTCATAATAATAGTTTCCAAAAGTCAGTATTTGATGGTGACTTTGATTGTTTAATCTTTGCATCATCTCTTAAATACTCAAGAATTACAGATAATGTATTATGGAACTATATAGATACTACTGGAATATATCTTTTAGGTACTTCTAATAATACTTCTACTGTTTGGATTAATGATGTAGAACTTACTTCTAATTATGTATCTGCAACAAGATTAATAGATAAAATAGGCTTAATAGAGGGAGTCCAAACAACAGGTACATTCTCCTATACTTATAACATCTATAGTAATGATGTTATAGAGAATAGGTTAAGAGGTAATTTAGCAAATAAATTATTTATCTATGGATATGACAATTTAGTAGTTCAAAAGACAACTGAAAAGTATCAGGGCTTAGTAGTTTATACTGCCCCAGCAGATGGAGTTGTATTCTTAAGGGAAACAGCAGGAGGAACTTATACTTCATTCTTTGAAGGAATAGACAAATCCAAACTATTATTTGAAGTTACTTATTCAAGTAAAACTACTACAGGAGATTGGACTACCACAAGATTCTTATCTACGAGCATTGATTATAATTTTACAGTTAAATCTGGGGACAAATTTACTATCCCACAAATAAGGCTATGTGGAGGAAATATCTTAGATAAATTTGAGGATACTACTATAACTTGGAGAGATACTTACAGTTCTTATATTAGGAGAGTAGGATTTCCTGTAGGAGATAAGATTGAAATGCTTAATAATACTTTAGTTGATGCCTATATATCTACAGGTACTGGAAGTAGTACTGAGTTAAGTAATTGGCTTCCCAGTAAGAGTGGGATAACTTATGGGACAACTATTGATAGACCTACATTAACATCTACTAATAATGGGTGGTTATATAGAGATGATACCCTCAAAAAGATTATTATGTGGAATGGAACAGCTTGGGTTAATATGGATGGAACACCTTTAGCTTAA

Tertiary structure

PDB ID
92db4f98c4477bb0da448c1ba7bc581dac33e97668d5a169802dcacbef5bca0c
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,6818
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50