Protein

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Genbank accession
ASZ76627.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,86
Protein sequence
MPSTGKTPTLGLNKWELTDKPKMNDFNKDNENIENFAAEHKQKMTEVEKKSKSNENRLDALRVGTINRLEWYNSESYTGPGNITSITDAPTKRRGFKWSGMSTGPQTLEIKTLPIEPNSDYVLAFLEDIEGSFTSYEIKLAYTNGGQQYKSIVKQGSTPQSNGYNLKTHKFSIPSGATDTKIQFVVQGATSSTSLKVLNILLARGNVVPDYNLAPEDVLKRLDLLFEKDTSLQNQVNQKAAKTDVLLKVSAPLDRDCNSFKDINTFCTFDTGDGNFKNTPDGTLSQGSAQVFMVVNRGHHSTRLQQEFIYLYPKDSVARYKRNFDGTRWGNWYKEYDSANKPTAEELGVAGVNMPMADTDLNNHKNPGFYWGYQNMVNAPVPNGVAIMEVVKYNNDCVLQRFTSVRADSNHTTYIRTCYSNKWSSWKKIYDEGNKPTPADIGAIPQIPIRITQDLNTFTTPGLYIVDRATHAPQSYGRLLVLGWDNDQKWVTQVFYADITNKVYVRCSTNNTATEWTSWAEQYSTSFKPTPQDIGASPSNHNHNKVYYPIPKQAITDFNSGIAITEGQHLVSSSTAIPNSPPLYAQDGSSIYGILHVYVSVGDSYNGVNNWIWQDFHDTRGNHYWRYKINNADWSPWRAVYNSVNKPTPQAIGAVATEGDGVINGTLELRKADKLIRFATERGWILKQGGTAAETSLDLVSETDGKAFRVLEPSGKKGIYMWVSSGGTQFNVDGNSVYHQGFKPTPSDIGAASSSHNHDSAYLGKTATAANSNKLKNWDLAEGSNNFVGIPFIPHDGVMEVGRMVDFHEPGTNKDFNTRLESINGALKCWQDFSAENLWARKYMRVNDWYGGSEDGRFYYKQDGKGLYTENVENLYVKGSPVAKGDYWDVGDNTRVVSLGGGLRLVRQIVKTGYANSGGGVNYTIHFPKAWNWVLPISLVSHNYNDASNNTSGYCTIDYWNNSYLNGGCYQMVAGKPTQIILTYLATE
Physico‐chemical
properties
protein length:988 AA
molecular weight: 110347,54570 Da
isoelectric point:7,04732
aromaticity:0,11235
hydropathy:-0,59433

Domains

Domains [InterPro]
Coil
30–57
Coil cd19958 cd19958
ASZ76627.1
1 988
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Clostridium phage CP3
[NCBI] 		2025812 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
ASZ76627.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MF001357.1 [NCBI]
CDS location
range 23820 -> 26786
strand +
CDS
ATGCCAAGTACTGGTAAAACTCCTACTCTAGGTTTAAATAAGTGGGAGTTAACAGATAAGCCAAAAATGAATGATTTTAACAAGGACAATGAGAACATTGAGAACTTCGCTGCCGAACATAAACAGAAAATGACTGAGGTAGAAAAGAAGTCTAAATCTAATGAGAATAGGCTAGATGCTTTAAGGGTTGGTACTATTAATAGGCTTGAGTGGTATAATTCTGAGTCTTATACTGGTCCTGGTAATATCACATCTATTACAGATGCTCCAACTAAGAGACGAGGTTTTAAATGGTCTGGTATGTCAACAGGTCCACAAACTCTTGAAATTAAAACTCTGCCTATAGAACCAAATAGTGATTATGTATTAGCCTTTCTAGAAGATATTGAAGGTAGTTTTACTAGCTATGAAATTAAACTGGCTTACACTAATGGGGGTCAACAATATAAGAGTATTGTAAAACAAGGTAGTACACCACAGAGTAATGGGTACAACTTAAAAACTCATAAATTTAGTATTCCTTCTGGAGCTACTGATACTAAAATTCAATTTGTGGTACAGGGTGCAACCTCAAGCACATCATTAAAGGTATTAAATATCTTATTAGCTAGGGGTAATGTAGTACCCGACTATAACCTAGCTCCTGAGGATGTGCTAAAAAGATTAGACCTATTATTTGAGAAAGACACTAGTTTACAAAATCAAGTAAACCAAAAAGCTGCTAAAACTGATGTACTTTTAAAGGTTAGTGCTCCCCTGGATAGAGATTGTAATTCATTTAAGGATATTAATACTTTTTGTACCTTTGATACAGGAGATGGTAATTTTAAGAATACCCCTGATGGTACTCTATCCCAAGGAAGTGCTCAGGTATTTATGGTAGTTAATAGAGGTCATCATAGTACTAGATTACAACAGGAGTTTATATACCTATATCCCAAGGATAGTGTAGCTCGCTATAAGAGAAACTTTGACGGAACTCGCTGGGGTAACTGGTATAAGGAATATGATAGTGCTAATAAGCCCACTGCAGAAGAACTAGGAGTAGCTGGGGTGAATATGCCCATGGCTGATACAGATCTAAATAATCATAAGAATCCTGGTTTCTATTGGGGTTATCAAAATATGGTCAATGCCCCTGTACCCAATGGTGTAGCAATTATGGAGGTAGTTAAGTATAATAATGATTGTGTATTACAAAGATTTACCTCAGTTAGAGCAGATAGTAACCATACTACTTATATTAGAACCTGCTATTCAAATAAATGGTCTAGCTGGAAGAAGATTTATGATGAGGGTAATAAGCCTACCCCAGCAGATATAGGGGCCATACCCCAGATACCCATTAGAATAACTCAGGATCTTAACACATTCACTACACCTGGGTTATATATTGTGGATAGAGCAACTCATGCTCCACAATCATATGGAAGATTATTAGTTCTAGGTTGGGACAACGACCAGAAGTGGGTAACTCAGGTATTCTATGCTGATATTACTAATAAAGTATATGTTAGATGTAGCACTAACAACACTGCTACTGAATGGACTTCTTGGGCTGAACAGTACTCAACTAGTTTTAAACCAACTCCCCAAGACATTGGGGCTTCTCCTAGTAACCATAATCATAATAAGGTATATTACCCTATACCTAAACAGGCTATTACTGATTTTAATTCCGGTATAGCTATAACTGAGGGTCAACATCTAGTATCTTCTAGTACAGCTATACCTAATTCACCTCCTTTATATGCTCAAGATGGTAGTAGTATATATGGTATACTTCATGTATATGTTAGTGTTGGTGATTCTTATAATGGTGTGAATAACTGGATATGGCAAGACTTTCATGATACTAGGGGTAATCACTACTGGAGGTATAAAATTAATAATGCTGACTGGAGTCCTTGGAGAGCTGTATATAATTCTGTTAATAAACCAACCCCCCAGGCTATAGGGGCTGTAGCTACTGAAGGTGATGGAGTAATAAATGGAACTCTAGAACTTAGAAAAGCCGATAAGCTAATAAGGTTTGCTACTGAGAGAGGCTGGATTTTAAAACAGGGAGGAACTGCAGCAGAAACCTCCTTGGATCTAGTTTCTGAAACTGATGGAAAGGCCTTTAGGGTATTAGAACCTTCGGGAAAAAAGGGCATCTATATGTGGGTATCATCAGGGGGAACACAATTTAATGTAGATGGCAATTCTGTGTACCATCAAGGATTTAAACCTACTCCATCTGATATTGGAGCAGCCTCTTCTAGCCATAACCATGATAGTGCTTACCTGGGTAAAACTGCTACAGCTGCTAACAGTAATAAACTTAAGAACTGGGACTTAGCTGAAGGGAGTAATAACTTTGTGGGTATACCATTTATACCCCATGATGGAGTCATGGAGGTAGGTAGAATGGTTGACTTCCATGAACCTGGGACAAATAAAGACTTTAATACTAGATTAGAGTCTATTAATGGAGCTCTAAAATGCTGGCAAGATTTCTCAGCTGAAAACTTATGGGCCAGAAAATATATGAGAGTAAATGACTGGTATGGTGGATCTGAAGATGGCCGATTCTACTATAAACAAGATGGAAAAGGACTATATACTGAGAATGTGGAAAACCTCTATGTAAAAGGTAGTCCTGTGGCTAAAGGAGACTATTGGGATGTAGGGGATAATACCAGAGTAGTTAGTCTGGGGGGAGGACTAAGATTAGTTCGTCAAATAGTTAAGACAGGCTATGCTAACTCAGGTGGAGGTGTAAATTATACTATACATTTCCCTAAGGCTTGGAATTGGGTATTACCTATATCTCTAGTATCACATAACTATAATGACGCTTCTAATAATACCTCAGGTTATTGTACTATTGACTATTGGAATAACTCATATTTGAATGGTGGATGTTATCAAATGGTAGCTGGTAAGCCAACTCAAATAATACTAACCTATTTAGCTACTGAGTAA

Tertiary structure

PDB ID
dd75bd729108793d1ebcd8edb24d4181db16847a706918332bbc31293b9df188
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,6841
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Complete Genome Sequence of Lytic Bacteriophage CP3 Infecting Clostridium perfringens Isolates Kim,D., Kim,Y.J., Han,B.K. and Kim,H. 2012-03-15 — GenBank