Protein
View in Explore- Genbank accession
- QIN93309.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber protein
- RBP type
-
TSP
- Protein sequence
-
MLEENVFVGTNCQSFDPSKVQCDKEGNMPIHILDKYCEENDTRYEIYPLTIIQAIFDGTTGTRLDRILASCNSVYLTWEGTFADTVSKLDKIYRRKGYIITYRDDTNVNWTQRYNSDDISDEAWNNPNNWEGWSFDTVIKDLAEALEEIFTNIGDYKEFLNILTGFVNEFVINVFNNINNYPQLVEIIKNSTVESLPIIIKEIFNNINDYPEIKNVFNEYVKQWTETIFNNIASYPALSQFITNAINTHVENTINNIFNNLDNYPAVKNLIVNNTINKVIDIFKNIGQYPELQEAIQNNVNERVDYIFNNINQYPELIGILSDLVCNCVQNIFANINNYPSLVTCINNAVNSRTEYIFNNIDRFPILKNLIETKVESRVTYIFENINSFTELLNVIKGNIEDIFDNIDDHTNLKLVIENKVESTVEKILTNIDDYPIIKEKITQFCNEAIEAKRGVANGIASLDGDGKVPASQLPSYVDDVLEGYFIDDTHFAEKYVEDAPVYYTPEKGKIYIDISEDTEHSGKTYRWSGTKYSVISETLALGEVTGTAYDGGKGKKTTDIVNSLPKYIPSTQIKLSRSSGGNIIIGSHHYEFNNTTNVYESKPFNDSITFPIVSKTESGVMSAADKVKLDETLPNQITELSNNVYTKEEINNKFDNVPTVENTYTKAEVDKAIADAIKALIPDGYELVIKKKTT
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 695 AA molecular weight: 79107,58990 Da isoelectric point: 4,59415 aromaticity: 0,10504 hydropathy: -0,36691
Domains
Domains [InterPro]
IPR016024
120–436
120–436
1
695
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
CrAssphage LMMB [NCBI] |
2718472 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QIN93309.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
MT006214.1
[NCBI]
CDS location
range 75219 -> 77306
strand -
strand -
CDS
ATGTTAGAAGAGAATGTTTTTGTTGGTACTAATTGTCAATCTTTTGACCCTAGTAAAGTTCAGTGTGATAAAGAAGGCAATATGCCAATTCATATATTAGATAAGTATTGTGAAGAAAATGATACTAGATATGAAATATATCCTTTGACTATTATACAAGCTATATTTGATGGTACTACTGGTACTAGACTAGATAGAATACTTGCTTCTTGTAATAGTGTTTATTTAACTTGGGAAGGTACTTTTGCTGATACTGTTAGTAAACTTGATAAAATTTATCGTCGTAAAGGATATATTATTACTTATCGTGATGATACTAATGTTAATTGGACTCAACGATATAATAGTGATGATATTAGTGATGAAGCTTGGAATAATCCTAATAATTGGGAGGGATGGTCTTTTGATACTGTTATTAAAGATTTAGCAGAAGCACTTGAAGAGATATTTACTAATATAGGTGATTATAAAGAATTTCTTAATATTCTTACAGGATTTGTTAATGAATTTGTTATTAATGTATTTAATAACATTAATAATTATCCTCAACTAGTTGAAATTATTAAGAATAGTACTGTTGAAAGTTTGCCTATTATTATTAAAGAGATCTTTAATAATATCAATGATTATCCAGAGATTAAAAATGTATTTAATGAATATGTCAAACAATGGACTGAAACTATTTTCAATAATATTGCTTCTTATCCTGCTCTTAGTCAGTTTATTACCAATGCTATCAATACTCATGTAGAGAATACTATTAATAATATATTTAACAATCTTGATAATTATCCTGCTGTTAAGAATCTTATTGTTAATAATACTATTAATAAAGTAATTGATATATTTAAAAATATTGGTCAATATCCTGAATTACAAGAAGCTATTCAAAATAATGTTAATGAAAGAGTTGATTATATATTTAATAATATTAATCAATATCCTGAACTTATTGGTATTCTTTCTGATCTAGTTTGTAATTGTGTTCAGAATATATTTGCTAATATTAATAATTATCCTTCTCTTGTTACATGTATTAATAATGCTGTAAACAGTAGAACTGAATATATATTTAATAATATTGATAGATTTCCTATTCTTAAGAATCTTATTGAAACTAAAGTAGAATCTAGAGTTACTTATATATTTGAAAATATTAATAGTTTTACTGAATTACTTAATGTTATTAAAGGTAATATAGAAGATATATTTGATAATATTGATGACCATACTAATCTTAAACTTGTAATTGAAAATAAAGTTGAATCTACAGTTGAAAAGATTCTAACAAATATAGATGATTATCCTATCATTAAGGAAAAGATAACACAGTTTTGTAATGAAGCTATTGAAGCAAAAAGAGGTGTTGCTAATGGTATAGCTAGTCTTGATGGAGATGGTAAAGTTCCAGCAAGTCAATTACCAAGTTATGTTGATGATGTTCTTGAAGGATATTTTATTGATGATACTCATTTTGCTGAAAAATATGTTGAAGATGCTCCTGTATATTATACTCCAGAAAAAGGTAAGATTTATATTGATATAAGTGAAGATACTGAACATAGCGGTAAGACTTATCGTTGGTCTGGAACTAAATATTCAGTTATATCTGAAACTTTAGCTTTAGGTGAAGTTACAGGTACTGCTTATGATGGCGGTAAAGGTAAGAAAACTACTGATATCGTTAATAGTTTACCTAAATATATTCCTAGTACACAAATTAAATTATCTAGGTCATCTGGTGGAAATATCATAATTGGTTCACATCATTATGAATTTAATAATACAACAAATGTTTATGAAAGTAAACCTTTTAATGATAGTATAACATTTCCTATTGTTAGTAAAACTGAATCTGGAGTTATGTCTGCTGCTGATAAAGTTAAACTTGATGAAACTTTACCTAATCAAATTACTGAACTTTCTAATAATGTTTATACTAAAGAAGAAATTAATAATAAGTTTGACAATGTACCAACAGTAGAAAATACTTATACTAAAGCGGAAGTTGATAAAGCTATTGCTGATGCTATTAAAGCTTTAATTCCTGATGGTTATGAACTTGTTATTAAAAAGAAAACAACTTAA
Tertiary structure
PDB ID
252aa5a88ae5f120c9786cb06190a62ab1873698efbaf1d3fff6e06dbef3731d
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50