Protein

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Genbank accession
AIM50744.1 [GenBank]
Protein name
baseplate wedge subunit
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,60
Protein sequence
MKQNIKIGNVVDDGQGDYLRRGGAKINENFDELYYELGDGEVPYSAGAWKTYHSSDGLNLAAEWGKSYAIDTSTGRVSINLPKGTVEDYNKVIRARDVFATWNINPVTLIAASGDTIKGSSSPVEINVQFSDLELVYCSPGRWEYVKNKQIDKITSSDISSVARKEFLVEVQGQTDFLDVFGSVSYNVNNIRVKHRGNELYYGDAFSDNSDFGSPGANPGEIVALDGKNIRLRQPCNIGDTVQIETFLDGITQLRSSYSRRQIRILDSKLTTRPSLEGSVYVADLSTLKSIPFSAFGVNPSEPVNTNSLEVRFNGILQELAGTVGLPMFRCEGADAETSTECSALGGTWVTSNTDYSIEYDDNDATIARALVFDRKFEDQDIIDITWFNNDLGTLLSIDDILDTTDERYVAQGATVNVTGDVALTDFNNIGWPNVEPVPTYSREFSSIANIFNTIYPVGTIYENAVNPNNPATYLGFGSWKLWGQGKVLVGWNDDISDPNFALNNNDLDSSGNPTHTAGGTVGTTSNTLTNSDLPPTQTDEKVLISDENGTIIIGGCQYDPDAEGPIYTKYREGHATTNSTHVPPQVVNNIQPSITVYRWVRIA
Physico‐chemical
properties
protein length:604 AA
molecular weight: 66224,22240 Da
isoelectric point:4,46012
aromaticity:0,09437
hydropathy:-0,37566

Taxonomy

Phage
Shigella phage Shf125875 [NCBI] · taxon 1541825
Uroviricota Caudoviricetes Pantevenvirales Tevenvirinae Mosigvirus
Host
Shigella flexneri [NCBI] · taxon 623
cellular organisms Bacteria Pseudomonadati Pseudomonadota Gammaproteobacteria Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Genbank protein accession
AIM50744.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KM407600 [NCBI]
CDS location
range 90243 -> 92057
strand +
CDS
ATGAAACAAAATATTAAAATTGGGAACGTCGTTGATGACGGACAAGGCGATTACCTTCGTCGTGGTGGTGCAAAAATTAATGAAAACTTTGATGAGTTGTATTATGAATTAGGCGATGGCGAAGTTCCATATTCCGCTGGTGCCTGGAAAACATACCATTCTTCAGATGGACTTAATTTAGCTGCTGAATGGGGTAAATCGTACGCAATTGATACTTCAACAGGGCGTGTTTCTATAAATTTACCTAAAGGAACAGTGGAAGATTATAATAAAGTAATTAGAGCCCGTGATGTATTCGCCACATGGAATATTAACCCTGTAACATTAATTGCTGCCAGTGGTGATACTATTAAAGGTTCTTCTAGCCCAGTAGAAATCAATGTGCAGTTTTCAGACTTAGAATTAGTTTACTGTTCTCCTGGGCGCTGGGAATACGTTAAAAATAAACAAATAGACAAAATTACTAGTTCTGATATTAGTAGTGTAGCTCGTAAAGAATTTTTAGTCGAAGTTCAAGGTCAAACTGATTTTCTTGATGTATTTGGGTCTGTTTCTTATAATGTGAATAATATCCGTGTAAAACATCGTGGTAACGAATTATACTACGGTGATGCGTTCAGTGACAATAGTGACTTTGGTTCTCCAGGAGCTAATCCCGGAGAAATCGTTGCATTAGATGGTAAAAACATCCGTTTAAGACAACCGTGTAATATCGGCGACACCGTACAAATTGAAACCTTTTTGGATGGGATTACACAATTACGCAGTTCTTATTCTCGCCGCCAAATACGTATTTTAGATTCGAAATTAACAACCCGTCCTTCCTTAGAAGGAAGTGTATATGTCGCTGATTTGTCAACTTTGAAATCTATTCCTTTTTCGGCATTTGGAGTTAATCCTTCAGAACCGGTCAATACTAATTCTTTAGAAGTTCGTTTTAATGGTATTCTTCAAGAATTAGCTGGTACTGTTGGTTTACCTATGTTCAGATGTGAAGGTGCTGATGCAGAAACTTCTACCGAGTGTTCAGCTTTAGGTGGGACTTGGGTTACATCTAACACAGATTATTCTATTGAATACGATGATAACGATGCAACTATCGCACGTGCTTTAGTCTTTGACCGTAAGTTTGAAGACCAAGACATTATTGATATTACATGGTTTAATAACGATTTAGGCACTTTATTAAGTATCGATGACATTTTAGATACAACTGATGAAAGGTATGTCGCACAAGGTGCAACCGTAAATGTGACAGGCGATGTGGCTTTGACCGATTTCAATAATATCGGATGGCCTAATGTAGAACCTGTTCCGACATATAGCAGGGAATTCTCGTCTATTGCAAATATTTTTAACACTATTTACCCTGTCGGTACTATTTACGAAAATGCAGTGAACCCTAATAACCCAGCCACATATTTAGGATTTGGCTCTTGGAAATTATGGGGACAAGGAAAAGTATTAGTTGGATGGAACGACGATATTAGCGATCCTAATTTTGCATTAAATAATAACGACCTTGATTCTAGCGGGAATCCTACACATACCGCCGGTGGAACAGTCGGAACAACGTCTAACACACTAACTAATTCTGATTTACCTCCTACTCAAACTGACGAGAAAGTTCTTATTTCCGATGAGAACGGTACAATTATTATTGGTGGTTGTCAATATGACCCTGATGCGGAAGGTCCTATATACACCAAATACCGTGAAGGCCACGCCACAACGAATAGTACACACGTACCGCCTCAAGTTGTAAATAATATTCAACCGTCAATTACCGTATACCGTTGGGTAAGGATTGCATAA

Genome Context

Tertiary structure

AIM50744.1
ESMFold structure
Source ESMFold
pLDDT 67.8
Oligomeric state monomer
Download structure